SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp13283_c1_seq1
Scaffold_idBomo_Chr11
NCBI non-redundant
(nr)		DNA_cytosine-5_methyltransferase_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0008168 F methyltransferase activity
GO:0008175 F tRNA methyltransferase activity
GO:0016740 F transferase activity
GO:0030488 P tRNA methylation
GO:0032259 P methylation
Transcript
Level		FPKM:4.77 TPM:4.80
ORF EntryO_BomoSK13445_complete:A_BomoSK_comp13283_c1_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAACGATTAATAAATTGAATGTGATATAACATTGTAGATTATAATTTATTAGCAACAGTC
ACAAATTATTTTAGAATTTCATGGAGTTTGATGCCTATGAGAAACCAAACATCAGTTTAA
AAGCAATATAACACTTTCTTAAAAATATTTAGTTTGCACAGAAATGGTACATCTCTTTTC
CTATTAATATGATTTTATACTTGCAGATTACATGTCTTCCAAAAACCTTTGCAAAACCTC
ATTGCCTTAAGGATATTATTGAAAATAATGTGCCTGATGATTACTTGGTGCCAGACAAGA
TGTTAAGGAAAGCAAATATATTTGACATTTGTTATGCAGATTCTAACAGGTCATGTTGTT
TTACTAAAGCATACACACATTATGTAGAAGGTACAGGCTCTGTGTTCACTGAAACAAGTT
ATGACATAGTACAGAAGTATTTAAAATTGGCTAATTATTTCGAAGTAGGTAGTGATGAAT
TTCTGCAAACCTTAAAAAAGCTTAAACTTAGGTTCTTTACGTCTAAAGAAATCTTGCAGT
TAATGTCATTTCCTAGTGAGTATAGTTTTCCTAAGACTGTTACAAGGAAACAATGTTATA
GGCTTCTTGGAAATAGTGTAAATGTTAAAGTTATCAGTGAATTATTACAAATTTTGTTTG
ATGAATAAGAGTATAATAGTTTCTATAAATGTATTGAAGTTTTTTTTTGTATTTGAATTG
AAATGATAGTAATAGCATTTTATTAATTATAGTGGATTAATGTAATGTCAAAATGTTTCA
ATTACATATTATTAGATGCTATATTTTTGCGAATTTCTTATACAAAAAAAAAATTGAGGA
GGGTGAGTGTGCTATCATAGGCACAAGGTGTACAAGTTACATGCTCTACATTGAGTGATA
TCACATTACAACTTCTCTTGTGTTAAAACTGTTTTCAACCAAACTGCGGAGGACTAATGT
ATGAGAGGGCAAACACTTAGTGTTTTGACCAATGTAGAGAAGATATGTGAAACATACACA
CTCGAGATTTTACTTAACATCAGATTAAATATTAATTACACTGAGAAAAAGTAAGTACAT
AGAGACCACAATGCTAAATGTTAGTTACAAAGATAATTGAACTAACTAGTGACTCCTTAC
TGGGAAGTCTATAATAAATACAGGAACTACTAGATCCAACCAAAACAATATGCAGCATTC
ATATTTGAAGCACGCTGCTGTTACCAACATAAGGAAACCTAGAACCAAGAACCTATTTGA
AAATTGGTCTATCATTTGGGATCTCAGTTTAATTAAAATATTAAATTTAAAATTGAAATA
AACCTAATAATAGAAGGCCATAATATGAAGTTGAAACGTTAGTTATTTTTCCAAAAACAC
TAAACGTTAATATTGTATTGTGCTGATTTTATTATCCAAGTGGCATCTTAAAATTTTAAA
CAATATTTTTTAAAATGTATTTTTACATACTAATTGGCATGGTTTGTTTTTATTTTCCTA
TTGTACTTTAGAATTTATATTATGAAAGTCATAGATTATTATTTTTGTTGTTGGAAAGCA
TATTCTAATCTACTGTTTTTGTAATTAATAATCTGTAAAAATAATAAATTTATTTCAATA
ATAAATATCATATGTTCATTCATTTTTCTAATTAAACAAATTAAAGTTATATGCAGTATT
GTTCTTTGTTTTTGTTTTATTAAATCGCTCCATTACTCAGGATTTGTCGTGCTCTTCGCT
TAGCTCGATAATTGAGAACTCTCATTCTGAGCATCACAGCAATAGAGGATGCTGCACCAA
TGACAAATGACCAAATTGTGAACTTCCAGTAGGCCCACTTCTCTAAATAGGCCACTCGGT
CGCAGCTTCTTGTCACAGTTTCTCCATTTTCACACTTCAAAATTTCTTTAAAACTTGTAT
GTATACATACTCCTATACTCTTACTTCGAATCTCAAAATCTGAGCAAGGATGACATTCAC
TAATAACTTTGTATGGTTGATAAACCCAACAGGTTGAGTTGTTCTCTGTTGGGAATGTTT
TGTTTTTCATTCTATGACTGCTTGATAATCTCTCAGCTAGCCGTGATTCGACAATGAGAA
CTATTACAGTTAACATGCCTAGGCACAACGTTCCTAGAAGCATACATCTTTTTGAACATG
TTTCTATCATTTTAGGTACATTTAAAATAGCACAGTTCTAAGTGTAGTTATCGCTAATAC
CAGAAAGAATATAATAATCAATTTGTTTTCCAGCCAATATCATTTGTTTTCTTTGAAGGA
ACACAAATCTGGGTTTCATACTTCAGTGACGACACTGACAAG
(2322 bp)

- SilkBase 1999-2023 -