SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoSK_comp13058_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr5
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC106135505_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005125 F cytokine activity
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005615 C extracellular space
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0006935 P chemotaxis
GO:0006955 P immune response
GO:0016032 P viral process
GO:0030595 P leukocyte chemotaxis
GO:0050930 P induction of positive chemotaxis
Transcript
Level
FPKM:23.34 TPM:23.47
ORF EntryO_BomoSK12722_complete:A_BomoSK_comp13058_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GCATAAAATAGTCACTAGCAAAATACAACAATTAGTGTTTTTTCGACAAAAAATTAGGTT
TATATTTTTTTATTATTAGTAATTTCGATAAATATTATTAATGAGTAAAGTAATTTAAAG
AATATTTACAAAAATGCTTCAAAAACTAAAATGTATTGCATACAATAAAATATGTTTAGT
GGTAAGATAAGGCTATTCACAGACGAATATAAATGGCAAGCATTGCTCATATACATTACA
GATCGTAATAAAATAAAAAAAATACAACAAAACAAGAGGTTCAAAACTAAATAAAACGTA
ACTTGGTTATACCGATAGCATCTAATATTATGCGCATGAAAAGCAGAATTATGTTAGTAC
TTACTAAAACTATCTTAAATTTAAGATTACATAACAATTGAATTGACTGTTTTATAACTT
CGATCTCGGCATTTTATAATGAAAAATTGCACTCAGGAATACACGCTGCCTAAATGCCTG
CATTAACGCATAGAACCAACATAATGCTTTGAGCATACCTTTGATCACGAAATAAAATGC
GTCGTTCTTAACCAGACATTATTAATGGCACAATATTAAATAAAAATGTCATTCGTAAGT
ACAAAATTTGCACAGTTCCGAACTGTACCACCGCAGCGTAGGCGCTGAGACTAGGATTAA
TTAAATCGAATCAATAAATAAACAATTTCAACAATACGAATTGCAGTCTTAATATTCGAT
CGTGTATTTACAAATACGCGCTCAGTGCAATTACAGTCTAAATTTATTAGAGCTGTATTT
ATCTTAAATGTCAGATCGTTTACGTGGATTTGACGTTTATGTTTGTTTAGGATTTCTGAG
AACCAGCGTAACAGGACCGGCCGGTAAAGATTTGAGTGCGGCCCAAGCTTGTGTACGAGT
GAATCCTTCGACTGACTGCCCTCCAGCCGAAAGTAGCTCGGCACCGACTAGAACACGCCC
ACTTAACGCTGCTGCACCACCAGCAAAAAGCTTCTTAATGGTAAGAGGAAAATCACCCCG
TGGAGAGTCTCTGCCTCCATCAAGACCAAAACCTAGACCCGCTCCTCCGCCAGCCTTTTC
CAGCACCACAGACACCACAGCGTCTGACGTTTGATTATTGTTTGCTACCTCTTTTTCGGT
ATGCCGGACATTCGACTCCGCTTTGTCAGAGCCGCCTCTTACAGTGCTAGCACTTTCTTG
AGGTTCATTTTCAATTTCAATAACAACTTCAGAGCGTTGCTCCTTTAAAATACTGACAGA
TTGCGCGTGTGTCAAACCAGACGTAGCGCACCCATTGATGCTACGTATCTTCATGCCTCG
TTTTAATCCTGCTTGTGCTGCAACACTGTCTGCTAATACTCGATGTACAGTAACGTCTTT
AGCTTCACAATCAATACCACCAGCTAAAATAACTCCAACTCCTGCACCAGCTCCACGCTT
GAGTCGAATGTATTGTGTTGTAATTTTAACATCTTTCACAGGTCTAACGATGGCTTGACT
ACTTAACTCATCTTGACACCCATTTGTTTTGTTAGATGATTTTTCTACTATCAACTCCTT
ATCCTTGTTAATTTTTATTTCTTTATGTTTAAAATCAATTTTACTGTTACGATTTTCATC
ATGTGTATCCAAAATATTTTCAGTTTTGATAACATCAGTTTTACTTTTATCAAGTATAGA
TTGAGCGACTTTAGTATTATTGTTTTTGTATTGATCAAGTCCAGCCTTCTTAATTTCTTT
TATAATTGTTTCAGAAATGAGTTTAGGAGCATCTTCTGATTTCGGACTTTCTAAATTTGC
ATCATTTTGCTTCGTTTTGTTCGATGAGCTCGAGTTTCGTTTCAATCTCGTTATTTTATA
TTCAGCTTTCCTTACCCTTAGATTAGCATCGCTGTCACTATCTGAGTCAGTTTCAGCTAC
AATTTTATTACGTCGTCTGTTTTCACCTTTATTCGATATAGCGCTCACCACTGGCGTGAG
CGTAGAAAGGCGTTCAGACGTTTTAAATACTGGACTCGGAGACCTGTCACCAGACTCGTG
AGAGAATTTAGCTTCGACAACGGGCGATTTAAGTTTAGCATCTCGTCCACTTCTGCATTT
CGCTGAAGCAAGAATATTTCGCCGATTAATTGTATCAATATCGTAGGTCTTCGAAGCTCT
TCTTTTATCTGAGTCGGCAACAGAGCTTTCTAGAGAACTGCAACTTGCTTGTGACCCTGA
TGTTGCTGCAGAACCCGCTGAGGAGCTCAAGGAAACATTGGTGTCAGACGACACGGAACG
GCATATATTTCTCTTAACATATTCATCACAAGATCTTTCTAACTGTGTAGGCTTTGTGCC
TACATCAGATTTTATTACCGAATAGGTGGAATAAAGTGATATTTTTGGGGATAAACGTGC
ACCATCAGATTCTATATTCTCGATTGTATGCATTGGAGAGGAAGCTGAGGATCGATAACT
TGACTGAGTCGAACTCATGGCAGAATCATTATCGCTATCCACAACGTCCGTAGCAGTACA
CATTTTAATTTCAACATTTTTGAATTCTCTGGCGTAATTGATAACTTCTTTGTAATCCTT
TTTCATATAATCTGTAGCGTTTGATAAAGTCCTGGAAATTACTGAAGACGATAAATGGCC
GATTCTTATATCAGAATCGAGGGAAGATCTCATTGAATTTAGTGCATTCGATTTTACATT
AATTTTATTAAATGCCTCAACTCGCTCGTTGAAATTACGTTCAGGAGTAGATTCTTTAGA
CAGTGACGAAGGAGTGTATACTTGTAATGATTTTCGTTTGAAGGCTGGCGAATACTTCGG
TATGTTGTTCGGTAAAAGGTTAACTTTCCATTTATTGTCATTAAGGGGCACAATCTTTGT
ACTATTTGTTTTATCCAATTTAGAGCTGTTCGAATTTTTTTCTGATTTCAAATGTAATGA
TTTTGTAAGAGAATCTTGTACCTTTATTTCTGGTAAATCAACAATTGGGCCGCGGACTTC
AGGAATAACTAAGTCCTTTAATTTGGACATTGATTTCTTTCTTTGTTCGATGAGATATTC
TAAGTTTGACTTATGATTGGACTTATTAACTGTACTGCCATTATCATCACTAACGCTGCG
CGCATGATATACATTTTTTACAAATGATGTTTCCGGCTTAGATGATAAAACAGTACTACT
TCCATAAAACAATGGTTTATTGTTAGCTTGGAGGGGCTTCATGTTCATGTTCGTCGTGCT
ATAATTAGAATAGTTCACACTTTCAACACCCCCTAAAACTTCTGGTCTTTCTGTTTGTCT
CTTATAAGCACGGGGAGTTTCATCAAGATTGTCTTGTGACTTGGTTAGACGTCTATCCAA
TGAAGAAACGTCTGAAAAACTGCCAATGTATGAGGTACTGTTCTTTCTCACAGCTAAAGA
ACTACGCGTTGGAAGGGTACCGCATTTGTCTATTCTTTCTGTAGATGTAGATTTGTCATT
TGAAAACATTGCAATTTTATCTTTAACACTGGCTTCACTCCTAGCATCCTGTGATCTCGA
TGAATACGAGTAGCGTGAACGCGCGCCAGGCCAGCCGGGAGGCAGCCGTGGTGGCAATCG
TGAGGGCAAATCTGGAACTTTTTCTACTGCATCGCTTGGAGTTTCAACGCCATCTGGTGG
CTGCCTCGGGCATGAAGGAAGTGGCGTTTCGTCGTTAGAAAGACTTTTGTCTTCAGCATC
ACTTTTATTGGTACGATCTTCCCAAAAGGTTCTTTCAAACGACGATTTTCGCTCTTTTGT
CTCCAGGACGACTATTGGTTTGATGCTGTCCGTGACGTCGGTTGATTCGTCTAATTCTCC
GATAGTGTCAAGTGATGCTCCAGAGCCGTCTTCTCGTGTTTCAGTCGGCGGCGGCGGCGG
CGCTGTAGTGGGTCGCGTTAAAGTTGGCGAATCATTGCTGCTCTCTTTAAATTGAGACTT
AGGCACGAAATCAATTAGTCGCGGTAGCACCTCTTGTGTCGTAGTATCTTGAATTTTTTC
TGCGTTTGTGTTATTCATTTCAGCTTCAGAGCGCTGCAACCACGTTTCGATACAATTCTT
TTTTGTTGGTGTCAGTAATGATTCGGGCATGGGTGGTGGCGAAACGTCTGGCACCGGAAT
ACGTTTGGGTCTTCTTTCACTAACCGATCTCTCTATTTTCGTGTTCCGTGGCATGGGTTT
GGGTTTTTCTATAATCTGATCGGAATTTTCGTTATTTTTTAAATGATTTGTGTCGATATT
CTCATGTTTAGTTGCAAGGTTTGTACTATTGTTATTTTTGTCACTGCCAAAAAATCGTTT
TGTCGCTGTTTGTTTATTTTCCTCGCTAGACATTGACGTTGAAACGTTTGTATTGTTGCC
ATGAGTCACCTTGTCTACATTGTTTGACTCTTCTCGTTTTTCATATTGTTTCTCCATAAA
TTGTTTACTTGTGATATCTTTAAGAATATTAGTATCAATATTTTCAATACAATTCAACAC
TTTTTGGATATCAATAGTTTTTGGTTGCATTATCGGTGTAGAAGGAATACTATTTTCGAC
CGAGCTCGCCATCGACCCAAGTCTGTCTACTACTGTTGAAATGGAGCTGCCTGTGTCATC
AGACTCTGCATCAGCCAATACTAAGCAGCGTTCCCAATCGGTTGATGACAATAAATCTAA
ATATACTTCGGCATCAGGGGGCACTGCTTTACCGTCTGACAATCTACGTACTAGTCGTCT
TACTTCTTCTGGTGAACCTTTTTTAAAACAAGCCAAGCTTTCTTTGTTTTGACGATGAAT
ATGACTATCAAAAGACGACTTACGAGATAACTTAGTAATAGTAGAAATTCCGTTGTGCTT
TCCGTTCATAATATCCTTATCGTTTGTATTAAAATTTGGTGGGTTCACATTGCCACTACA
ATTCTGTTCTCCAAAAGTTATGAGCTTATCTTTAAAGGAATTCTTTTTCCCTAACTTTCT
TGGAGGCACTGGCGGTGGTAAAGTCGTTGGTCGAATAATATCAGTTGATTGTTTCGATGT
CGTTTTAGATTTCGTCGTAACACTATTTTCTTCTTTGTCGTTCATTTCGAAATGACGCAC
TAATAATGTTAATGTTTCATCTGAATCTTTTAGGCGTCGCACACAATCAATTCTAGTTAG
TTCTGAAACGGGAACGCCGTCGATAGCTAAGATTTCATCGCCCGGAATCAATTTTCCCCA
GGGTGCCTGAGCATTTGCTGCTGGACTATCTTCTGCACATGATTGCACCAAGAGTCTTCT
AACTTTTTCTGCAGCGGCTGATCCACCTTCAAATTTGAGTCCGAGGCCAAGTCTTTCTCC
ACGTGGCCTCCGTACAATGACCTCCGAAGCGCCAGTCGTAGCACCCACAGTGAGTACGGT
AACGAATGATGGATCTTTCGGAGATGGCCGACCTTCACCGACCGGGACAATGGTGACAAA
ATCCTCGACGGCTATTTCTGCCGCCATACCGCGAAATACGCACACTCGGCGGAGTAGATT
CCGCGGGATCAGATCCCAACAATTCGTAACAGTTTAAGTTGTTTTCGTTTCTCGTCACGT
ACAATAATAAAGTAACCACTTTGTCAGCAACGTCCCACACTTTTTCAACGTTCAAAACAT
CGTAGTTGCGTGGGTTCCGCGGGGCTTTTCATTTAAAATCGTAATTTGTGAGATGTAGTC
TACGAGATAGCGCTCACGGGCGCAGCGCGAGCGAGCGTCGCGACGTCGACGGCGC
(5755 bp)

- SilkBase 1999-2023 -