SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp12993_c1_seq4
Scaffold_idBomo_Chr15
NCBI non-redundant
(nr)		hypothetical_protein_OBRU01_20383_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0001817 P regulation of cytokine production
GO:0004871 F obsolete signal transducer activity
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0006915 P apoptotic process
GO:0007165 P signal transduction
GO:0007568 P aging
GO:0016020 C membrane
GO:0032496 P response to lipopolysaccharide
GO:0042347 P negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling
GO:0043123 P positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
GO:0043231 C intracellular membrane-bounded organelle
GO:0050699 F WW domain binding
GO:0071222 P cellular response to lipopolysaccharide
Transcript
Level		FPKM:3.79 TPM:3.81
ORF EntryO_BomoSK12551_complete:A_BomoSK_comp12993_c1_seq4
Sequence
(Nucleotide)
GAGACTACGGAGGTCTCTCTTGTACAATCATGACGCAATAATGCTTACGCGCATAGCCGA
CGAGTGCATTCACTCTTAAGCGTGTCTCTCGCTTACAACGCACAACAACTTAGATACATA
TAATTTGTAAAACTTAGAAATATTTAAGGGTGTGTGATATTATTAAAACAAGATACGAGT
GTTGTGTTCTACAATATAACTCAAGACTTAAACCTCTGTTCGAAGGTTAATTTCATCACT
GACAATGGACGCGACGAGTAAGTAAAATACGTTTAGTAGTAGGCATAGAAGTAGTACGTA
TACTAAATGTTGAATCTTTTTAAATCATTGTAAGAAATACGTACCTACCGCTTTAGCTCA
TAATGTTTTGTCTTTGTGAAATCTTAAGCTTTCTAATAGCATTACTTTGTTTGTTATTGG
TTGTTCTGTCTCTTTTATTTCTACATCACCTTGCGAATAATTAACCATAAACACAATCTA
ATGATTTAAGTTCACCTATCTGATTATAATATAATATCGTTCTCCTCATTATTTTTCTTC
GCAACGATGTTGAAGGCTGTTTAATAAAGAATTTCATTAAAATATTTTGTCGTCCGAAGC
AAGGTTCAGATTCAAGTTGATCTACCCGCTAAAATTTGAAATAACATTGAAAGTAGTTGA
AATGTACTTGAAATCATGTTTGTTGATTGCTCTTAGTTGTACAGAAAAGTGGATTAACAA
AAATTATCGCCTCTGGCCCTTCTCTCCGTAGTTAAACGTTTTACCAATTTTTATGTCTAA
TTTGAAATGTTTTAAATAAATTTTTTCGTCGGGAGCGGCCAGTTAGTTTTTGTGTGATAT
TCAAAAGAAATAATAAACGAATATCCAAGCCCATAAACAAATAACAAATGATTTATTTGT
ACGATTGTTGCACATATTTCTTTATTATCTTCTCAAATCTTCTGCATTATAATAAAAAAA
TATCTGTCCCTTTTTTACGCCTTGCTCATTCAATCGTCTTTGCCATCCTTTCTCTGTCAA
GTGTCATTTCTGCTCTGTTTGTCATTCTCTTTTCCCTTTCTTACCGTTTTCTCTCAGTCA
CATCGTAGCGCTCTGTTCATACTCTTTTATACGTTCCATTCTTACAAATCCTACATAAAA
ATATGTTTCGTAAAAGAGGACGATTCTAATTGAACAAAATGTCTACCCTAAATTATTCAC
TAAATGTCGTAAATAAGTGCATATTATATGGATTATTAAAAAAATATGCACATTAATATT
ACAACCATGACATAATTCAAGAGAGTATTGATCAAATGACCATAAAGTGTAAGGTATTTG
TAATGCTTACTTAAATTAATAATATAACACATTCCTCGCGTAAAGTTAAAGCGTCATAAA
ATAATGAAGTTATAACAACGAAATATCAACCGTCCACGTAAGCACAATTGAAATAAAAAA
CCTTAATAATGTCGATATTATGTTGAATTTAATATGATAATTTTATTAGTCTGAATAAAT
TTAATTAAGGTCAAATTATTTTCCATAAAAAATACGTACGTATTACGCATCTACCTATTC
TAATTTACATGCGACCTTCGGATTACCCAATGTCTGCATAATTTAGAAAATAAAATGGTT
GTAGAACCAGCTAATCCGTGTCTAGAAATAAACGATTACTATATGTTATAGGTTCTGTAT
AGATTTATACGTGTCACGTTCTAGTTTCAGTACGATGTTCCCTTTTTAACGTGATAACAT
AGCGCAGCCATTATTTTGATGAGTTAATATTACACAAACAAATAGATTTATAATTTTAAA
ACATAGACGCTTTATCGGAACTTCCAATACTTCCAATACGCTGTACATTCGAGTTGCAGT
GGTTATTTTCAATTCTCACAGAACCTTGTACGATTATTGTCACGCCCTGAATAGCACGAG
TTTGATTTCAAAATTGTTCGTTATAAGCATTTAAAAATGAATATTATCACAAAACTGTTC
TATACTATTCTGTAATACCGTACAAACATTAATGTTCACTAAACTGCTAACCTTACATGT
ATATAAATCGTTAAATATACATATAAACATTGACCATATATTTGAGCGCTAACATTTTCG
GAAATCTCCGGAAAGATATTACAAATTAACATTTACAAAATTCTTCCTAATATCTCGATG
GGGCTTACTACTAACCTTTAACGATAACATATATTTTAGTCAAAGCTTCACAATTGCAAT
GAATTCATGGGAAAGGCTTCATTAGAATTAACAAAAAACCTTCAAGCCTTCAAGTTAGTC
TTGTTTGTTTGTAGAACTTTAAAATGTATTATAGATTCGCATGCTCGTAGTAGGCACCAT
GAACGGCGAGGAAGACGCCATCGTCAACGCAGACATAACCAACAGCCTCACAGCAATGTA
CCAGAGCAACCCTCAAACTGTGTACCGTTCCACGAACGCGAATTCGGTAAAACAAATCAT
AAACAAAAATTTCAGACCAAAGTTCACACTTTCCGCCGAACGAAACCAATTTATGAATTT
CCATTTTGATGTGATATTATATTCTAAGTGCTTAACGTTTTATAGTAAACAGTAATATTA
CGATTTACAGTGGAAAATAAAATGGGATTACCGCCACCATATGAACAATCGGTACCGAAT
CCAGCTCCGCCTCCTTCGTACTTTGGCAATAATCCACCACCGCCTGCCGGTTTCGTTGCT
CCCGAAGCACCTCCGCGTACTACAGTGATAACATCACCCCAAGCACCGGCAGGACCACCA
GGAAAGCTAGGCCCAGGGCCAACGGGCACTACGTGTCAAACGTGCAACAAAACAGTAGTC
ACCAGAGTGGACTATGTTCCAAATAACAGAACACACATTATATCGGCAGCTCTCTGTATT
TTAGCTGGATGCTGTTGCGGGTGTTTCGTTCCGTATTGCATGAGATCGTGTAAAACAGCC
AATCATTACTGTCCTCAATGTAAAGCATTCGTCGGTGCTTTCACCCCATCTTAGATTTAT
TTGGCAAAAAATATTCCTAGATCATTATTCCGTAACACTTGTAAGCTAGTTAAATATTTT
CATATTGTCCTCGAAATACAAGTTAATTTTTGTAGGATTTTGATCTCGTTGATTTGAAAA
TAAAAGATTTAAAGGTACGTTGTTAAAAACAAACAAGCTACTAAAGTTTGGCGGATGTTT
TTCTTCATTTCCAATATCATCGTAAATAAGTTGGGTGCAAATTAACTTTATGCAAATGTA
ATTTAGAAATATGTATTTTAATTTTCGCACGTACACGTATAGCAAGGCGTGCTGTGAACT
ACGACAATAACCTAAGAGCAGGTGGCTTTTGAGTGATCTATACTGGCAAAAGTATCAAAT
TCCGTGACCGAATTTTTTTCTTTCAAACTTAAAACAAATAATAATTTTCGGGAACACGTC
AAGGAACGAATATTATATGAAATGAATGAAATGATATGAATATTACAACACTACTATTTA
ACAGTGAGGTCCTCATATAGCCAATTAAATTTTATTCTATTATTTAATGCGTGGTTACGA
ATTATCATTATTGTAGCGGTCGAATTTTATTTTATTTAAAAGTAAGTAAATTATACCTTA
GCCTTTAATGGTTGGTTGGTTGGTTCAACGAAGAGGGAATTAATTGAAATAAGAATAAAA
TTAATGTAACATTATAATAATCCATTAGTTAAGCGTTTGTTTATTATCTGTGATACTATT
TCTCAGACAATGTAATTTTGTAACGGTCATTTTAAATAGAATTTTTAGATTTATACAGAA
TAAATACATTTGTTTAAAAAAAAAAAA
(3807 bp)

- SilkBase 1999-2023 -