SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp12828_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr6
NCBI non-redundant
(nr)		Uncharacterized_protein_OBRU01_01978_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:4.40 TPM:4.42
ORF EntryO_BomoSK12068_complete:A_BomoSK_comp12828_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
CAGTCTTTCAATAAATATTCACATTATATACAAATTATATCTTATATGGGGGCTTCTATT
AATTACGTAAGATATTTTTCTTTCAAAATGAGATTTTCAGTTATGCCTTTTCCAGTTTCA
ATGAGATTTGATGACAGTTTAATAGGCACTTACTTCGAACTAACATAATTAATGGATGCC
CCTAGAGTGAAGGTGTGATCTAGAACCAAATGGAACATTAAAGGCATAAATATCATTTCC
TACAAATAAAACTTAATTCTTCATAAGTTCAATGTTCTTTACGTTTATTTTGTTAGTCGT
TTGTCGCACTGACGTGTTCATCATTGGATCGTTTTTCCCTTGAATAAAATACACAAAATC
ACCATTCGCAACGTCATTCGGAATTTTTGAATTGTCTTTTTGATTTATGATCGGCACCTC
CTGTACCATTCTATTCATGTCGGCCACCGTCAGATCAGCGGGAACCTTGTTCGGACCGGA
CTCGCTTTCCAAGAAATGATAATCGTTGTGCATAGAACACAAAGATTCCAAATGGAAATT
GTTCATGTCGAAACGCGGGAGCAATTTGTTGTCGTCAGAATTGTCGTCTATCTCGATGAC
ATCATCTTCCAATTCAGGCAAATCCTGTATCAAGGTGTTTGGTAAGTCCATATGTCCAGA
GTACTGTTCTCCCATTATATTGTCTATAAGAAACTGTTCTATTATCGGTGGATTTACTGC
CGTGGTATTTAGAGCTATGTTGTAAAATGAATCCGATTTCACTTCGTTTTTTATCTCATT
CATGTTCTTGTGTATATCTTCTAAAGGCGGAGAGGCTTTGTACTCTCTGGTCATAGCCGG
GTTATTAAGTATATTAGCGTTGCACATGCGCTCTAAGCTAGGAGATTGCGTGTTCTGCTT
AATAGTTGCCTCCAGTTTAATGTAGCTCGGATCGCTGTTTTGAATCTTTTCAGAGGTCTG
AAGCATGTTAATGGAATTAACGTTAATTGGCGAATTAAATGAGAACATTTGAGAGTCTTC
AGCTATACCAGAATCGCTTGGCGTGGGTGTCGAATCTGACATTAAACCTTCTTGAGGATA
CGACATCATATCCGTCGCTGGCTCGCCTAAATTGGACTGCGGTGGTAACATAAACTGTGT
AGTAATCAAGTTATTAAAAGTAACTGGCCCTCCAAGGCCGTATCTCTCATTATCTTCTAG
CCTTCTAAAGGCCATCTTCTGCTGTGAATGAAACATGTTCACTTGGTCCGGACCTTTTAA
TATTAAATTGCTTTTTACTGATATTTTGGGCTTTTTCCGTGGTGCTCCCTCGTCAATGGA
CATATTCACAGGAGAGTTGCTTAAGACAGGCACCGGAAGAATTTGCGTTGGTTTTATTAT
TGGCCCGGTTACTTTAGTAGGCGGAAGAGATATTTTGTTGACCGGTTTCAGCATTATATT
ATTGGTTTGAGAGCTTTGAGGAATAATTGGTAGCCGTATAGGAAAATTACTCATAATGTT
ATTGCTCAAGTCATTGGCTAATGTGATTGGCGCAAGCGAATTCACGTTGTTGTCCTGTAG
AATGCTTTGTTCCAACGAAACGGACGGATTGAGGAAGTGCAGATTCGAGTCATTGTTCTC
GAACGATATCTGCAAATGCTGCGGCACGTATTGATGTCTATTGACCACAGTATCGTTTGA
GCTTTCGGATATAATGCAATCAGAGTTATTGTCTTCTTTGTTTACGTGCGATCCCAAAGT
CTGAGTGTCGTAGCTCGATGGTTCCACTTCATTTGTAGCCGTTGCGCAGTAATTCTTCGA
ATAATCTTGCGGTATACCTTCGGATAGACTGTCACAATCATAAACTTCTATAGGAATTTC
GTTAACCGTTTTCGAAGCATCGTTCAAACCTTCATCGTTCTCTTGGACGTTTTTTTCCGT
TTCACTTGGTATGGTCCAGCTAAGTTTGTTCGATTTCATCCCTTTCGCCATTTCTAATAA
TAATTGGACTCCCTCTTTGTCGGCGTGGTTGGTCAAATGCGTGACATACTTATCCTTGTT
TATTGATTTGAAAGAGCAGTAGGGACACCTATGTAATTCTATCGAACTTAATTTGGGGTG
TCTGGACATCATGTGGTAGGCAAAAGATGTAGATTGAATCGATGTATAAGGGCAGTGCTT
GCATTTGTAGACGCCTTCTTTAGAATGCATTTTCTTGTGTCTGCGCATTGCGTTGTGGTC
CGCGGACCTGTAGCTGCAAATGTTGCAGGAGTACGGTTTGTCGCCTGTATGAGATCTCAT
ATGTAACTTCATCTCTCCTTTACGAGCTGCAGTATAGTCACAATGTTGGCATTTGTATGG
CTTCAGTTTTTCATGAACCGCTGTGACATGCTCTCTTAGTTGCCTGCCGTTGCTGAACTC
CCGAGGGCATATCGGACACTTCAGGGGCGATGTGTCTTTTTTGTGTGTTAATTTATGTTT
TGACAATTGATTTGCATTCTTGAATGATTTCGAACATATTGGACAAAGACACAATTTTAA
TTTCCCATGGATTTTCATATGTATATTATGCAATCTATGTTTTTTGTATGTTTTAAAGCC
GCATATTTCACACGTCGGCAGCTCCAAGTCTATTGTGTGTACTTTCCACAAGTGACTGTG
TAGGGAGTCTACATTGAGGAATGTTTTCATACATTCTTGACATATTAATTTCCCGCTCTG
ATGACTTTTCCTGTGGTATGATAGGTTATTTTCATCTCTTAAACGTATTTGACATCCTGC
GATTGAGCACATTGTGCCTAGTTCCTTCACTGGTTTCTGTTGCGAGTCCGACTGTTCTCT
TAGCTCTTCTTGTCTGATATGTGGTGGTGTAATTGTTTCTGCTTCTCGTTGAGGTTGGGG
TATTTTTGCACTATCTGTAGTTTGTATTCTAGGTTGTATTGACGATATCAAATCTGGGGG
TACATTTGATACTTGAATGACATTACAAGGAGAGTTTGATGTGCCATTTTCAGCTACGTT
TACATACTGCGTGGATACTTCATTAGTATATACAATGTTAATGCTTGCCTCTTGAATTAT
TTCTTTAGGATCTACATTCTCGAAATTTGGCGTGCTCATTTTCTGTAACTCATCGACTGA
TATGAAAGCTACAGCTTTGGGTAGGGCGTTTGCGGAGTTGGCATCAGAGACTATTTCGAA
TACTTGTGGTATTTTAATGTCAACACTCTGGGTGTTTGCGGACTGTGATGTATCGTTATT
TTCCTTTTTTAATTTCGCATTTTTTAAGGCAATCTGTACGAGGCTTTTTATCATTTTCTT
TACGTCTTTGATTCCCATTTTGTGATGGTTACGTAGGTGCGTCCGCAATGTTTCTTCGGT
TTCGAAGACGTCAGTGCAGCCTGGGCATTGGATATGTATGTTATCCGCAAGACCGTTAGT
TTTCGCGAGCTCCGGGTGCACAGTGAACAGATGAAATTTAATGTCGTCTTCAGCTAGAGC
CATGTAAGGACACGCTTCGCATTTGAAAAAGGGAGTGCTACCTACGGTTTTCTCCTCGTA
AGCCATAACTTTTTCTTTAACCGCAGGCGGCTTCGAATCGTTGCCATCACACTTCATGCT
CCTTAAAAAGCACTGAGACATCATTTTTGTGATTGTATAGTCAATTTAATATTTCATTGC
GAATTTCCTCATAGTGTTCTTTCATTTTCCACCTTGGTTAGTAATTAAACTATTTGTTTT
AAATTTAATAAGGATATTTGTGTTACATTTTGAGAACACTAAGTATTCATTTTTATCATT
TTATTAAGATTTGGTGTTAAAACGTATCGTACATTAAAATAAAAACAGCTGTTTTATTTT
TG
(3842 bp)

- SilkBase 1999-2023 -