SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp12814_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr15
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_mucin-5AC_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0004252 F serine-type endopeptidase activity
GO:0005044 F scavenger receptor activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005903 C brush border
GO:0006508 P proteolysis
GO:0006898 P receptor-mediated endocytosis
GO:0008233 F peptidase activity
GO:0008236 F serine-type peptidase activity
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016787 F hydrolase activity
Transcript
Level		FPKM:52.01 TPM:52.31
ORF EntryO_BomoSK12031_complete:A_BomoSK_comp12814_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
CATGTATCTATATTGGGGATCTTAGTTATATAATTTGTCACTAATTCAGTAATTAAATTA
AAAACTACATGTACAAAAATTGGTTTTATATACACAAATTTTCATGCAACTAATCTTATT
CTAAATGGTAAGTAGGTATAATATATTCGCAATATTCTCAGAATTTACAATACAATCGAC
ATCCATGATGTAATTTTTGACACAATCAAGAAGACATACATTTTATTAAATATTAAAACC
TCATATACGTTAAAGTTTACACCGCGAAATCGCTATTAAAATTACAAGTAACAAATTTAA
CAACTACTCATTTGCGAATTAATAAAAATTGACAATCATCAATGTAAAATTTCGTTCATT
ATTTAAATACATTTGAACAAAACTCCTCGATAGTGAGATGTTATGTAATTATTTTATGTA
TCAGCAAAACGGGACCTCTGATATGATAGTCTCCAAATATTTTGCTTGAACTTCGTTCGT
AAATTGAACGTGGTGCGTCTCCGGTAGAGGCGACGCAATATTGGCACCGTCCTAAGATAA
CATTAACACTATACGATATTAAGTATTGTTTATATTTACACACACACACAGACGAATGAA
CGTTTGGCACACATAGGCGTTTCACGCTTACACCCTGGCCTTCATTCAAGACTACAGTTT
TCTGAGCAAATATAGGTATGCAAAGAGTTATCTACAGAATTTCTCGTAGCCTCACCTACG
ATAACAGTCGCTTATAATAAGGTGAGTTCTTATCCTAAATATTTACATCTCACAATCAGT
CGTAATTTCTTTTATGTTTGGCAAATCGATCTTTTCTAAGTAGTCAATTTAATTACATAA
TAAAGCTTTCGTAAAACAGAATGTATAAAATTGCAAAGGAATTGCTTGTTTGGCACTGCA
CGTCCTAAATAGGCCGGACTAATTGATATTAAATTTCTCATACAACACTCGTACTCTATA
AGGAAAATGTATATGATGATAAAGTATTTCACAACCTGTCTTTGATGTCGGTGATAATTT
TGATATTTATACAGTGTGAATTGAAACAGATCTAAACGTACTAGAATCAAGACTTTAAGG
GTATATTGTCAAAGTTTTGTCAAGTCTCAGTTAGCAATATTTCTAAAGAAATCTAGAAGT
TGCTGTCGTAGTCGGAGCGTCGTCGCGGGTAGTGAGCACGCGGGTATTCGCCCGTGTAAC
CGTATATTTGGGATCCGCCTCCTGTCTGTCCATATATTTGGGAAGCACTGAATCCATAAC
CATTGTTCGTTGGACCATAAGTTTGTGATCCCCGACCCGAATCTGGCGTATAATGCTGCA
TATATTTCTGTAATTGCGGCGTCCACTCCGATCGCCAAGAGTCACCAGGGTTCGGGTATG
CTAATTGCTCAATGAAAGCAGTTGACATACGCTTTCCTGATGGAAGATAAGGTAAGTCCC
GTTCTTTTAACTGATGCATGTCATCAAAGCCACCCATATGACTTTTGTCTAAATCTCGAA
GCATCTCTTCACTCAACGGTATAGGTGCTTTTGCCTTGGCACTTTTTTGCCGATTCACCA
AGACTGTAACTCCAAAAATGACGACGAATAGCAGGGAGGCTAATGCTATGACAATAACTG
CAATGCCCCATTGAGGTAAAAGTGATTCTTCATCAGGAACCACCATTGTAGGCTCATCAC
GCTTCGGTAAAACAATGAATTCCGTATATGCAGGATCCATAACAAATTTACCTATCTCTA
ATTTTCCTGCCGATTTATCTATTGTTTTTGTCATTTTTTCGTTACTTTTTTTCATTCTTT
CTTCATCTGGTTGATCTCCAAGCATCACATCTGGATCAAACTCATCATCGTTTCGTGGTG
TTGTTACCGTTTCGACTACTGAGCCTGGTCTAGCCTCATGAAGTGATTTATGGAATATTT
TCTTCAAATCTAGCGTGTTTATTCTTTCTTCTACATTGTTCAGTTCAATGAAATAGTCAA
CCAGAACAGAACCCTCACTGAATCCGTCAATTCGAATATTTTTATACCATTTTCTTAAAT
TATCCGATTTCGAATACACAGAATTGAGCTCTTCTTTGACATCTTTTGCAAGATTTTGCC
ATTCGTCTGTATGGTGATCTAGTAGTTCGGGTACCCACTTGACTCCTGAAACAATTTTGA
TAGTAGCTGCTATATCACATTCTTTACGGCATACACCGGGAGTAGTCGAAGGTGGCGGTA
CTGGGGTCGTAGTTGTCGTAGTCGTGGATCGTCGTGTCGTTGCTTCAGTACTAAATTCAG
GTAGTGGACTTGTAGCAGTTGCATTTCTCTGAGCTTCCAAGAGCTTTTCAATCGAAAATG
GAGTTGTCGATGGTGAAGGCCAGCCCGTGAATTCAGTTGAAGCCCTGGTGGGCCATCCCT
TTTGTATCTTTGGTGTAACGGGTGATGGACCTAATGATTTAGGTGTAGTAGTTTTCCTAT
TGACTTTTCCTCCTGGTCTTGAAGGGAAAACTAATTTGATACCCCCTGGTGCTTTGGTTG
TAGAACTAGACGAAACAGATTCTGTATCTGTATCATTTAATTTAAACCCTGGTGGTAATA
AGTTGGAAACGTCGGCAACGGTCAATTTTACAATTGGACTTTCGTCTGAATTATTTTCTG
TTCCGTTCAATTTGAAACCTGGAGGTAATAGCGCTCGGATGTCGACAGGTACTGCTATAG
GTTTTATGACTTCTTTTGGTTTTGTCTCTGTTGTGGCGCTTAAATTAAATCCTTTGGGCA
AAAATGCTGATATATCCACAGTATCTATATTATTCAACAAACTAACCGTTGTCGTTTGAT
TTATTAGTGGTGCTTCTGTAGGATTTTTATCGCTAGGTGGTAGCAATGTACTTGAATCGT
GCTTTTGGATTTTTTTCACCTCTTCTTGTGATTTATGGTCTTTCGGTCTGTATTCTTTAG
GAAGGAGTGATTTATCATCTAGAATAATAACCTTATTTTGACTATTTATTCCAGATGATC
GTGCTTGCGTACTATTTATAATTGGTGCTCCATTAACACGAGGTCGAGATGTACTTGTTG
TAGTCGTGGTCGAAGTAGTTCGCTTATCTTTGAACGACGACCTAGGTTTATATCCAGCAG
GTAAGAGACCCACAGGCAATTCATCCATTACTGTAACTAATTTTTTCTTTGGTTTCGGTG
TTGTGGACGATGTTACTCTAGGTGCAAACTTTTTGACCATTACTGGTAACGGTTCTGGTG
CAGATCTAACTGTTGTCGACGGTGGCTGAGTACTCTTCAAGGTGAAAACATTTGGAACTG
CAGGCGTGGTTGTTGTTGTTGTAGTAGTAGTAGTAGTTGTTGTTGTGGTAGTGGTAGTAG
TAGATGGTGTTGAAGTTTTTTCAGTTGTAGATTCTGTTATAAGTTCAATATTTTTGTTCT
CGTTGTCTAAACTTCCTGATAAAACAGCACTAGATAATTCTGACTGTATACTATCTAATT
TGTCATTAATGTTTTCTGTTGATGAACTACCACTGCTAGCACCAATGTCTTGTTTTGGGT
CTCTGGTTACATTTTCTTGATCTTCTTCATCACTGTCATCGGCTAAGACTTGTTTCTTTT
CTTCTTGTTCGACAGTTGGGAAAGGTAAAAATCGAGCACCGGAGACACTTCGACTTGTTT
GCACTGAAGCAACAACAATCCAGCTTTCTGTTGTGATCGGTGATGAAGAATCATTCTGAT
GATTCTTAACTGTGGATAACATAGTATCAGTTTCTGTATTAATTTTTGCAGTACTAGGAG
CATATGTTACATCAGGAATAGATATAGTACCATTCACAACACTTTTCGTAGTCACAACTG
AAACTACTTCTTGTCCTAAAATAGATGGTGGCTCAATAGAAGTTATTTCTTCCGACACTG
GTATATAAGTATTAGGACTTGTCAATTCTTTTTTACCATCTAACTGGTCTATTACTGTTG
TGTCAACAAAATGCTTAAAGTTATCATCTTTAACCATTGTATTGTTAGGATTCGTTACAA
GGACATCGAAAGCCTTTGTCACGTTTGTTTCTACACCATCTGTGGAGCTTTCAGGCTCTT
CCGTAGAATCGTAATCATCATAAATATCGGTTACATGTTCAGAGGAATGATGTGGCGTCT
GCACAGTTGGTTTGACTTCCGAACTATCTACATCATCGTAATACTCAACAAATTCCTCGT
CATCCAAGATATCATCATTATCCTCATCAACGTGTGTATTACTAGCAGTGGTAGTACTTG
TTGATATAGTTGTTGGAGCAGGTGATGAAGAGCTAGTTGTTACTTTAAGGAATTGGCTTT
TATCTGAATTAGGTACATTATCGGTATTCATATAACTAGCATCAGGCTTACTATCGTCAA
ATGCTTCAGAATCATCAGTTGTATTAGGTTTTATGACTTGAACGTCATGTGAACCCTGTG
TGTTTTTCATTAATTCTCTAAAGGTACTTAAATCGCTAATTTCTTCTTCAAGAAGTGGTT
CCAAATCTAATAAAGCTTTATATTCGGTAGAACTATGATATAATATGTTAGCATTCGTTT
TTACCGGTGTCAAATTGTTTCTTGTGTGGAAAGGTGTATTTTGTGAATTCGGTTTATTAT
TGGCTAGCGGAGGAACAAAGTGCGAAAATCTTGCAGGTTTGCCATTCAATTTGGGCTTGC
TAACAAGCTTAGTAGGATTGTAGGTTGTAACTCTGTGCTGCTCGAATAGGTCTTGGTTAT
CAGTGTCAATATCTATGTCATCACGAATTAAATGTCCATTCTGAATGCTGGTTTTTAAAC
TGTTACTACCGTCAAATGGAATGTTTTTGAATCTATTATTTTGTAAGTAATCTATGTCGG
GATTGTTTAAAGTTATTTGACCCAGAAACGTTTCTGGTTTCGATGGATCGTTTTGATAAG
CGACCGAGTGGATTTGTGAAACTTCAGGTCGTTTTGTAGAAGCTGGATGAAGTTGAAAAT
TATAAGGTAATGCAGGTCTAAATCTCTGCCGCTGCGGCGTGAATTCTGGTTGATTAATAT
AGTACTGGGCTCCAGACTGACTCCTTCCTGTAGGTAGTTGAAACGGTGATGGATTTTGAT
TGTAGTTTGGGCTAGGAAACCTTACGTTTCCTTGATTATAAAGCGGTTGTTGCGAGGGCC
TTGGGATTCTATAACTGTCACCGTGTTCAAAAAATGTCGTCGGTCGAACATTTGAAAATA
AGGGGGGTTGAACTTGAGCAAAACTTCGTTCCACCAGTGGATAGTCGAAGTCATTTTCAT
CTTGACATTGCGTGTCTTTTATAATAAACAGCAAGAAGGCTGCGATCGTCACGAACCTCC
ATCGTCGCCGCCCCATCTTTGTTTTAGATCAATTTTCACCGTTTCATTTAAAATAATGTT
TTATATCGCTATAATAGCGAATTTTAATGAATAACTTTCAATGTATCTTGCGGCTTTGCC
ATAATTGGCATCAATGAAATCGGTAAGCTCATTGAATATATGTCACGGAATGCTGTCACA
CCTTAACAAACGTGACAATCCAATGGAATTTCGAAATAAAAACACAACAGAACCACCAGA
ACCAGAAACTTAAGTTGAAGAAATACACCACAAGAGGGGAGATTACAAAATAATATTATA
GTAAAATGAAATCACCAGGGTCAAACATCAACGCACGATTCTAACAAAACGCGTTTGGCA
CACCATACACTAGAGCAACGTGACCCGTTCAGGAATCTCGTATCGAACCGTACTGCAGCA
TCGAGCCTTACAGACGTTTCATAATCAATGCGTGACGGTTGTAATATTTACGTAATTTTT
TTTTCAGTCAGCGGTCGCGATGTTCTCTGTCTCCACAACCAAACGTACCACTC
(5873 bp)

- SilkBase 1999-2023 -