SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp12706_c1_seq2
Scaffold_idBomo_Scaf476
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_deoxynucleoside_kinase-like_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0004797 F thymidine kinase activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0006139 P nucleobase-containing compound metabolic process
GO:0006165 P nucleoside diphosphate phosphorylation
GO:0006230 P TMP biosynthetic process
GO:0016301 F kinase activity
GO:0016310 P phosphorylation
GO:0016740 F transferase activity
GO:0019136 F deoxynucleoside kinase activity
GO:0019206 F nucleoside kinase activity
GO:0046939 P nucleotide phosphorylation
GO:0071897 P DNA biosynthetic process
Transcript
Level		FPKM:0.72 TPM:0.72
ORF EntryO_BomoSK11700_complete:A_BomoSK_comp12706_c1_seq2
Sequence
(Nucleotide)
CTTCACGGTAGGGACATTAGTAGTTTTTTTTTTTTTATATTGCATACATAGATGGACGAT
CTCACAGCCCATGTGGCGTTATGTGGTTACTGGAGCCCATAAACATTAATGACATAAATG
CAGTTAAGCTTTTGAAACAAGCGGTCTAAGTTTCAATTTTTAGTACAGCAACAGTCCCCC
CCCTTAAAAACCCAAACACATTACTGCTTGACAGCATAGTAGGTAGGGTGGTGGTACTTA
CCTATGTGGGCTCACAAAATGCCTTAGCACCAATAATAAATTAAATTTAAAATTAAAATA
AAACCAGTATTTCAAATCATACTGTTGTCAAGTTGTATAGGTTGAAAAAATTTTAAAAGT
CATAAACCATCTAACAATCACAGGTTATGTACAAGTCAATTAATTTGTATGATTTCCACC
CAGTATTTTGTATGTGTATCGATCTAAGTCTTCTTTGACTAGATCTAGAGGTCTATCAGC
GTCTATCGTCAGAACTTCACAGCCAACTTCGGAATTCAACCATGACTCATAAGAGTCGTG
AACCTGTTGTAAGTATTCTAAAGGAACTTCAGATTCTTCAGCTCTGCCTCGTCTCATTAC
ACGCTCCCACACTACTTGTGGCGATGTCTTCAAGTATACAATTAGGTCTAGGCTAGTATC
GAGGCACTTCTCAGTGTAGTCATACCAAGCTAATAATGTTTGATATTCAGGGTCCTCTAA
AAAGTTTTGCCTTCTAGCATTCTCGACAAAACAATATCTACTGTTTTGAACTGATCTTTC
AAACATTTTAACTGTTATATTAGAATTACAAGGATGGCTTGTTTGAATTTTAAGCCGACT
CAGATGTACATAGTGCTGGAATGTAAAGATCCATTTCTTCTGATCACTGTACATTAGGCT
AAGTAAGTTGTGGCCACTAACATCTCTCCATTCATGTAGAGGCTCAGTATGGTGTTCAAC
ATTATGAAACTTGTTGAAGAATTTTATACATGTTGATTTTCCAGATCCTATGTTTCCTTC
AATTGACACTCTAAAAGGTCTTTTGCGTACGATACGAGCTGTCTTGCTAATAGTGTTCAT
ATTGGATATTTGTAAAATTTATTTTTAGCTTAACTCTAAGGCCCATAATATCAATCGTAG
TTTAAACTAAAATCGAAGGTTTAAACTGTCACTGAAGATCAACTCGTAATTTCAATCAAA
GTTAAACTGCCCTTCAGAGTTTAAACTATCGCAAAGTTTAAACGACCATGAGGGAGCGTT
TAAACCATGAGTTGGGTTTAAACTGCTCTTTTTAAAATGGCTGCTCGAAATTAACAGCTG
TTGTTTCCTGTCAAAGTAAATGTAATATAAAGTTAGTGTCAGTAAATAGAGATAAGTATT
AGGTAAAATTAAGTAAAAATTTAATTGTTAACAAAAGTAGGCATTTATAGTGTTATAAAA
TGGCTGAGTGGAATGAAGACACTGATTCTGATATTGAAGATTTAGAAATTCTCAATGACT
TCAATTCGTATTTTAACAGACCTTATCTAGTCAGACCAAGAGAAAACAATTTCGTTAAGT
GGGACGATACGGAGTTTATACGTCGTTTTCGTGTATCTAAGAATACAGCTTTTACGATTT
TAGAAGAAATTGCTAATGACATATCACACCCCACAAATCGGTAAGGCGGACTTTATTTAC
AGGACTTTTTTTAAAGTACCCATTAAATATATAGTATTGAGTATATATTACCTAATGTTT
ATTTGTACTGTAATGTTATTAGGTACTTTTTTATTGCAGGAATCATGCATTGTCAGCGTG
TAACCAGTTATTATTAACCTTGCGTTATTATGCTACTGGATGCATGCAAATTACTGTTGG
CGATTTCAGTGGTGTTCACCAAACGACAGCAGGAAAAGCTATTAAAAAAGTTACCGAAGC
GATTGCATCAAGACGATGCCGATATATAATGCTGCAAGATTCTGAAGAAGACAAAAGGAA
ACATCAGAATGGATTCTACAATATGGCTAGGTTTCCTCTAGTGTATGGAGCCCTTGATTG
TACTCATATACGGATTCAATCACCAGGTGGACAAAATGCAGAGTGTTTTAGGAATAGGAA
AGGCTATTTTTCCTTAAATACTCAGGCAGTTTGCAATTCAGACTTGAAATTTTCGAATAT
TGTGGCTAGATGGCCGGGGGCAAGCCATGGCAGTACCATTTTTCAAAATAGCAGACTCTG
TGCTATTTTTGAATCAGGTCAGATGGGCCAACTAGTTCTTCTCGGTGATGCTGGATATCC
GAACAAAAAATATCTATTGACACCTCTACAAAATCCTGTCACAGAAGCTGAGAAACTATA
CAATGAGTCTCATATACGAACTCGGAATTGTATAGAGAGGGCATTTGGCATATGGAAGAG
ACGGTTTCCAGTTTTGTCATTGGGAATTAAGACCAAAGTTGAACTGGTACAAGATATCAT
TGTTGCAACAGCCATTTTACACAACTTGTGTATCAAGCATAATGATGTCATGCCTAACTT
AGATGTTAACTTAGAAAATATCATTGATGTAACTGGCAGTGATAACAACCAAGATACCAC
CCTCAGCAGCAATTACAGCAACAATAGTTATAGAAGGCAAATGTTAATTGACAATTACTT
TAGCAGTTTACAATAGCTGAATTCCTTTTAAAAAAAGGAAAATCAAAATATAAAGTAAAT
TTACTACTATATTTGAACTATTGTCCTTTATATGTTTAATAAAACCAATTTTTAATATGA
AATGAAAACAACCTCATCTTTTTTTATTACATTTAATTACACAGTTACAACAATTTACAA
TTACATATATATTTAATTACAACGCATTTTATCAATTAATTAAAACTATCGAGTACTTTT
TTTTTAATGTCAATTTCTAATTGTAGAAGTGTACATCTCAGTTCATGCTCCTTTACTTCT
TGTTCTTGTTTTTTATTTAAATTGTCAATTTGTGCGTCCAGTAATTTAATTTTTTTATTG
GCCAAGGCACTATAATTGTTCATTGTTTTATTGAACACTTCTGGATTCTTTTTGGTGAGG
GGTGTAGATATTTTTCTCTTTAATAGAAAATTACTGCTCTTTGGGGTTTCTGATTCAATA
ATTTTTTCATCAATCTAAGGCAAAGAAAATACAAATCAGTTTAATAAAAACAAATTTTAA
AGTCCTCCCAGCTTCAGGCTTTCAGATTAAGAAAATGAAACACTTGTATGGTTTGTGGTA
GTAACAGGCAGGACAGTGGACCTCGTTCTGGCACACATTATGTCTTAACACTTTCTCACT
AGCCTATAGACACAGGCCTACTGTGGTATATTCTGCAAAGCACTGTTCTTGTTAGGATTG
GGAATAGGCAGATTTTTTTTTATATAAAATTAATACACACCAGTATATTTTGATTATTTT
TTGCCGGAAGTGCTGTGTCTTGGCTGGTCTCGGCATATTTTTCCTTTGTTTCCTTTGTTA
TTACTATCTCATCACAGTCATTGCGAGATGGTAATCCCATCACACTAGTCCCAGATAACT
CCATTACCACTTCCTCTTCTTGACTGAAATTAATTTCAGCGGATGGTCCACCCCCTGTTC
CATACAAACTTCTCCGAAACGTACTATATTTGGTCTTGGCCCTCTTTTTTATATTGTCAT
ACTTTGCGCGAAGAGTCTTGTCACTTCTGAACACAAATGACGACAAACTGTTGAATTCTT
TGGCCAGCTTTGACCAAGTTTGCTCCTTCAGCTGATTATTTGTCATATCACTTTTTTTAT
TTTCCAATATATGGCTATATTGTCTCACCAAGCTTGTGAGCAATTCTGTTTCCGATTTTG
AAAAATTGGGAACGCGTGTTTTATTTTCGACGGACATAACGAATCATTGAATTTTATTTG
GAAAAACGATGCAACTGTCAAATACAGATGTGTAATTTTAGCTTGGGATTGTTAAAAGAT
TGAAAAGAATGAACGGATCACAAAATGTTGCCACACGTCATAACATTGTCACAGTTCAGC
TGATCTCTGTTTGTTTTTGTATTGATATTACGAAAGTAGTTTAATCTATGGATCAAATTT
GAACGAAGTTTTGTTGATCCTTAGTTTAAACCCTGAATGATATTATGGGCCTTAGATGAT
TTTTGAAAGTTTTGACGAGAACGACTCAATGTGGGAAATAAAAATTGAAA
(4190 bp)

- SilkBase 1999-2023 -