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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp12674_c0_seq3
Scaffold_idBomo_Chr13
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_prenylated_Rab_acceptor_protein_1_isoform_X3_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0008021 C synaptic vesicle
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030054 C cell junction
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0045202 C synapse
Transcript
Level		FPKM:2.44 TPM:2.46
ORF EntryO_BomoSK11621_complete:A_BomoSK_comp12674_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
AGTTATAAATACGCCAGCTCCTAAAGCGGAAAAAACCCAAGAAAAAATAAAAAAAATATT
AAACAACACATACAACCAAAATAAAATAATAAATAGTGTACCTACTAAATAATACTTATA
TACTGTACACAAAATTAGAAAATCCCTAAAATGTCTGAAAATGTAAAGATTGATCTGTCA
GGTGAAATAAACGCAACAACAGAAAAGAAAGGTTTCCAAAAGTTGTTGCAGCATGTACGT
AGTGGTGCGGCTCCTGCATTGTTGATGGGAGTTTTATCTTCACGCAGGCCATGGACACAA
TTTGTTGCCACTGACAACTTTAAGGTACCAGTATCTATACCAAGATTGTCTCGAAGATTC
TATCGTAACATAGAATATTTTCAAGCTAATTACCTAATTGTATTTCTGGGACTATTTGCC
TATTGCCTCATAACATCACCACTGTTGCTGATCACTATGGTGGCCAGTTTCTTTGGATAT
AGAAAATTAACTTCAGGGCCGAATACTTGGAAGATTGGTGGTTGGGAGTTAACGAAAACA
CAGCAGTATGTTATAGCTGCTGCCGGATCCATGGCACTCTGTTGGCTTGCTGGAGCTGGA
GCCGTTTTATTCTGGGTTTTAGGTGCAACGGTAACCGTAGTCGCCCTTCATGCAAGCTTC
TTCGATGCAGAGGCACTACCTAATCTTGAAGACCCGGAGCAGTTTCCGATGATTGAGCAA
GTGTGACAGAGCTATCTTCCTTTATTCCTTCCGCCGCCTGGCCGGTTCTCTCCTCACCAC
CGTATAACTGAGCTTAATAATTAAACATGATTAAATTTAACGGTATTTAGGTACTGATGG
TAGGGTGTATTACCGGTGCTAGGGCGCATTTCTAAGCCACGCACAAGTAAGTGCCACCAT
ACTGCCTATTTCTGCCCCGAATCAGTCCTTAGTTCCGGTTTTAAGGGTGGGATATCGACC
TCGTGTTGCAAGGTGGGTGACGGTGTTCACTTTGTGACTTCTATAGGCTTCTCTATACAC
CAGAAGGGCCGTAAGCTCGTTTACCCATGTAATAAATAAAATAAAGAGTGTATATTGTAT
AAAATATTTATTAATACCTTTTTTGTTTGTTAATTAATTATTAAAAAGGTGTTTTCGAAT
TTATTTTAAACTTTTAATTCATTCAAGTAATCAACATATTAATTATCATCGAAAAATTGC
CATATTATACATAAGCACATTTACTACATATTGCCTGTGTATTGTAAAAAATAAAACTAA
ATTACTAAATAGTGTTTCTGCATCAAAGATAAATAAAACATTAGTCTACATGATATACAG
AGGCTTACATTGTTAACATTATAAAGTTGAAGATTAACAGTATAAATAAATAATATTTAT
TAAATAATAAATGATATTTATTTACGTGTAAAAATAAGGGTTGTCAGCTTAACCCAGCAG
TGTTGCTTATTACAGCTATATGACGCTAAGCATAAGTGTATTATCTATGCGCTATGCAGT
ACTGGTTGGTTTCGACTGTCCTAGTCTGGCGAAGTTATTAGACAATGCTGACAGCCTATT
AGCAATCATACAGAACGTACCAGCCTATAGAAAATGATTTTGTAGAATTAATAAATGAAA
ACCAAATATAAATAACATTTTTATTCATATATTAGAGGAATTTATTGTACTTTATCTTAA
AGATTTAAATA
(1691 bp)

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