SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoSK_comp12540_c0_seq19
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_chitin_synthase_A_isoform_X3_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0008150 P biological_process
GO:0008180 C COP9 signalosome
Transcript
Level
FPKM:0.14 TPM:0.15
ORF EntryO_BomoSK11203_complete:A_BomoSK_comp12540_c0_seq19
Sequence
(Nucleotide)
AATGTTAAGGTGAGAGTTAGAGTCCGCGCGCCGACCGCACGCGCCGCACACGAGCGCGCA
ACATGCGCACCGACACAGCACCGCGAGTGTACTCTAACTCTCACCTTAACATTGTGAAGT
GACAGACTTTCAGGATTACACACAAACCTATACTCAAACGAACTTAATTCAAGATGGCGA
CGTCTGGAGGGAAACGGCGAGATGAGGGTAGCGATAACTCTGACGATGAACTCACACCCC
TGGCGAACGAAATATATGGTGGAAGTCAGCGCACAGTACAAGAAACGAAAGGATGGGACG
TGTTCAGAGAATTTCCGCCGAAACAGGACAGTGTGTCCATGGAGACTCAGAAATGTTTGG
AATTCACAGTGCGAATGTTAAAAGTGGTCGCTTACCTGGTCACCTTCATCGTGGTCCTTG
GATCAGGAGTTATCGCAAAGGGGACAATTTTGTTCATGACGTCACAAATTAGGAAAGACA
AGCGATTAGAATTCTGCAATAAAAACTTAGGTCGAGATAAGCAGTTTGTGGTGAGTTTAC
CAGACGAGGAGCGTGTTGCCTGGATGTGGGCTATCCTAGCTGCCTTTGCTATTCCGGAAT
TAGGAACGATGATCAGGTCTATAAGAATATGCTTCTTCAAAACATCAAAGAAGCCGAGTT
TTGTACAATTTTCTGTGGTCTTTATCGCTGAGTCCTTACATACCATAGGAATGGGTTTAC
TATTCTTTAAAATCCTGCCTGAATTAGATGTAGTCAAAGGAGCTATGATAACGAACTGTC
TCTGTATAATTCCCGCGGTGCTCGGTCTGCTGTCAAGAAACTCTCGAGACTCGAAACGAT
TTGTCAAAGTCATCGTCGATATGGCCGCTATAGTTGCGCAAGTGACCGGTTTTATAGTTT
GGCCCCTGTTGGAAAACAAAGCTGTTTTGTGGTTGATCCCGATCTCTGCTTTATGTATTT
CGTTAGGTTGGTGGGAAAACTATGTGACACGACAAAGTCCAATAGGAATAATCAAAAGCC
TGGGGAGACTAAAAGAGGAATTAAATTTTACTCGCTACTTTACGTATCGATTCATCTCCG
TGTGGAAGATTTTACTGTTTCTTTTCTGCAATCTATTCTTCATGTGGTTGGACGGAGATG
AACCGGCAATGTTTTTCCAACTTTTCAATCCTGGATTTGGGCCACATAGCATTGTCGTTG
AAGAGGTTCAAATCCAACTCGGGGGAACGGTTATTCCAGATTTGGCAAACATAACCCTTA
CAGGAGACTCCGTCGAAATCGCGGCTGTACATAAGTCCGCCGTCTACGTCATGATGATCC
AAATATTTGCAGCCTACATCTGCTACATCTTTGGGAAATTTGCTTGCAAAATTGTTATTC
AAGGGTTCAGTTACGCTTTTCCGATAAACTTGGTCATACCTTTGGTGGTGAACTTTTTGA
TTGCTGCTTGTGGTATCAGAAATGGCGACACCTGTTTCTTCCACGGAACGATACCGGACT
ACCTATTCTTCGAAAGCCCTCCAGTGTTTACGTTGAGCGATTTCATCTCTCGACAAATGG
CATGGGTTTGGTTGTTATGGCTGCTATCACAAACCTGGATCACTATTCATATTTGGACCC
CCAAAGCAGAACGTTTAGCTTCCACTGAGAAATTGTTTGTGTTGCCTATGTACAATGGTC
TACTCATAGACCAAAGTATGGCACTGAATAGGAAAAGAGATGACCATAAGGATGTCAAAA
CAGAAGATCTTGCCGAAATCGAAAAGGAAAAAGGTGATGAATACTATGAAACAATATCAG
TACATACAGACAATACTGGATCTTCCCCAAAGACTGTGAAATCATCAGACCAGATCACGA
GGATTTATGCTTGTGCTACTATGTGGCACGAGACCAAAGATGAGATGATGGAGTTCTTGA
AATCTATTCTTCGTCTCGATGAAGATCAGTGTGCTCGCCGCGTCGCTCAGAAGTATCTTC
GTGTAGTAGATCCTGACTATTACGAATTCGAAACTCACATTTTCTTGGACGACGCTTTCG
AAATTTCGGATCATAGTGACGACGAATCTCAAGTAAACCGGTTTGTCAAGCTTCTGGTAG
ATACCATCGACGAAGCTGCTTCTAATGTACATCAAACGAACATTCGTATACGTCCACCGA
AGAGATATCCTGCGCCATACGGAGGTAGACTGACATGGGTGTTACCAGGAAAGACTAAAA
TGATCTGTCACTTGAAGGATAAGGCAAAGATTCGACACAGGAAACGTTGGTCTCAGGTGA
TGTACATGTACTACCTTCTCGGTCATCGTCTAATGGAATTGCCTATTTCGGTTGATCGTA
AAGAAGTTATGGCTGAGAATACTTACCTGCTTACACTCGATGGAGATATCGATTTCCAAC
CTCACGCTGTACGATTACTCATTGATTTAATGAAGAAAAACAAGAACCTCGGAGCTGCCT
GCGGGCGTATTCACCCTGTTGGATCTGGACCTATGGTGTGGTATCAATTATTCGAGTATG
CTATCGGACATTGGCTGCAAAAGGCCACCGAACACATGATCGGCTGCGTGCTCTGTAGTC
CCGGATGCTTCTCGCTGTTCAGAGGAAAGGCTCTGATGGACGACAACGTTATGAAGAAAT
ATACTTTGAAATCTGACGAAGCCCGTCACTACGTACAATACGATCAGGGAGAAGATCGAT
GGCTATGCACTCTGCTACTTCAACGTGGCTATCGTGTAGAATATTCAGCTGCATCGGACG
CCTACACCCATTGCCCTGAAGGTTTTAGCGAGTTCTACAATCAACGACGTAGATGGGTGC
CTTCGACCATTGCTAACATTATGGACTTGCTTGTGGATTATAAACATACCATTAAAATCA
ATGACAATATTTCCTCACCGTACATCGCATACCAGATGATGTTGATGGGCGGTACGATTC
TGGGACCTGGAACTATATTTCTTATGTTGGTGGGTGCTTTTGTGGCCGCTTTTAGAATTG
ATAATTGGACATCCTTCGAATACAATCTATATCCTATAATGTTGTTTATGTTTGTTTGTT
TCACAATGAAGTCAGAATATCAATTATTGGTCGCGCAAATATTATCAACGGCCTATGCTA
TGATAATGATGGCTGTAATTGTGGGTACAGCACTGCAATTAGGCGAGGACGGTATCGGAT
CCCCATCCGCTATATTCTTGATTTCACTGTCAAGTTCTTTCTTTATAGCGGCCTGTTTAC
ATCCCCAGGAGTTTTGGTGTATCGTTCCCGGTATCATTTATCTATTATCTATACCCTCTA
TGTACTTGCTTTTGATTTTGTATTCTATTATAAATCTGAATGTAGTATCGTGGGGTACGC
GAGAAGTGCAAACCAAGAAAACAAAGAAGGAAATCGAGCAAGAAAAGAAAGATGCCGAAG
AGGCGAAAAAGAAGGCGAAACAAAAGTCCCTTCTTGGTTTCCTGCAGGGTGTCAATTCTA
ACGAAGAGGAAGGCTCCATAGAACTATCGTTTGCTGGTCTTTTTAAATGTTTACTGTGTA
CTCATCCTAAAGGAAACGAAGAAAAAGTACAGCTCATGCATATCGCTTCAACACTTGAGA
AATTGGAAAAGAAAATTGAAAACGTCGAGAAGGCCGTGGATCCGCACGGTCTATCCAGAA
GTCGCAAACTATCGCTAGGCCCTCGTGGTAGCACTAACGGAGACCACCAGTTGGACGCTC
TTAATGAGGACCCCGAAGAAGAAAACGATTCCGATTCCGACACCGGCACTCTATCCACTG
AACCAAGGGAACGACGAGATGATCTTATAAATCCATATTGGATTGAGGATCCCGGCTTGA
AAAAAGGCGAAGTAGATTTCTTGAGCCCGCCCGAGGTACAATTCTGGAAAGACCTTATTG
ACAAGTATTTATATCCTATTGACGAAGACAAGGACGAGAAGGTAAATTAGAAAATTTTTC
GAGTTACGAACATTAATAAAAAAAAAAACAATGCAACTATGCATGTTTCTGTCTCTGGTG
TCTCATAGTAAACAGGACCCTAATTAATTAGGGGCCAAATTACCCTGTGTTATTTGTCTC
CGATTGATTACATATTAACAAAAATAACATTAATATTTTCTTTCAGAAAAGAAGCCGACG
CGTTTTACTCTGAATCTATTAATATGAATGTTTGGTACACACACTAATGCAAATTTTATT
TCAGGGAAAGAAAAAAAAAACCATTTATTGTATTTTTTATATTGACCTTCCCCTAATTTT
AGGCACGTATTTCGAGAGACTTAAAAGAACTGAGAGATTCTTCTGTATTTTCATTCTTTA
TGATCAATGCTCTTTTTGTGCTCATTGTATTTTTGCTACAATTGAACAAGGACAACCTTC
ACATTAAATGGCCCTTCGGAGTTAAGACTAACATTACCTATGATGAGGTCTCACAAGAGG
TAACGTCAAACTCCACTACACAGCGATCATCATTCAACGATGACTCGGGACCAAGACTCG
CGACGCCTCTCTCAAACCTTTGAACTGCCCGAACAAGTTCCAATCCCAGTCACCCTTGAA
AGTTGATTACAATGTATCATATATTTTTGTTTTATTAAATTTTACAGGCTCGCATAGCAG
GCGATCTACTAGAACTTCGCAATAAATCAGTTTTCGCATTTGTTATGTTCAATGCTTTAT
TTATATTGATAGTATTTTTATTACAACTCAATAAAGATCAGCTTCACGTGGTCTGGCCTT
TGGGAGTTAAGACAAACATTACGTACATGGAGGAAACAGGCCAGGTACAGCCGAATGTTA
CCACAGAATGTGTGTCACTTCACACGTCTAACGACCTTCTTCTAACCGGTCTGGTCTGTC
TTTGGATGGCACAACAGCATGAAATCCCGAAGACACGAAACCTAAATAACTTTGGCTACA
CTATTGGTTTCACATTTTCTAATAATACGAAAAATTCTTTAAGTCCCACTCCTATTGTCT
GAATAATTTTGATTAATAACAAACATATTTTTTATAAAATGAATAAAAATATATAATATA
TCTACACTTATTCCTTTAAAGGCAGTATTCAAATAGCAGAATTACAACAATTTTATCAGT
GAATACTCACGCACGTTTATCCAATACTATGGACTATACCTATACACCCAAGAGTCAAAA
TTAACGACTGTACTGTTTATTAAGGTGGCGGTGTCTTTTCTATTAAACGAGGTGACAGGT
TCACTGGTGTTTTATGTACAATAACTACACACATCCCTGAAAAATGGTGGATTGTTTAAT
TTGACTGCGATTTATGTGTTCAGGTTGTGTTTGATGTTGTTGTAAATCTTTGAAATCCTT
TTCTTGTGAATGATAATTACGTGGAAACACTAGATCACGTATACTTACTCACTATCATCA
TGATGTTAGTGTACACGTACAATGTCTTGAATTTTGTATTTAATCCAGCACTTGCACGTC
ACGTAATAACTATTATTGTTTTTTAATAATATGGTATATAAAACGAACTGATTATTTTGA
AATTTGAACTTTATTATTAAGGAACAATACGAATCATTGGCATTTTTAAACATTCTAAAT
TTATCTACTTTAATGTGATTGCAAGTTTTAACATAATAAAAAAAAAACGTGGATTAACAT
TTATTTTGCAATTTCAGCTTCTCATCTCGAAGGAATACTTGCAATTAGAGCCTATCGGTC
TGGTATTTGTGTTCTTCTTTGCCTTGATTTTGGTCATACAATTTTCGGCCATGTTGTTCC
ATCGATTCGGAACTATTTCGCATATTCTATCATCGACGGATCTCAACTGGTTCTGTTCAA
AGAAATCGGAAGATTTGTCACAGGATGCGCTTTTGGATAAGAATGCAATAGCAATAGTGA
AAGACCTTCAGAAATTAAACGGTCTGGACGATGATTATGATAACGATTCAGGATCTGGAC
CACACAACGTCGGCCGAAGGAAGACAATACACAATTTAGAGAAAGCTAGACAGAAGAAAC
GTAACATAGGAACACTAGATGTGGCTTTCAAGAAACGATTCTTCAATATGAATGCTAATG
ATGGTCCGGGTACCCCAGTTTTAAATCGTAAAATGACATTGAGAAGGGAGACATTGAAAG
CTTTAGAGACCCGTCGTAACTCTGTAATGGCAGAAAGAAGGAAGTCGCAAATGCAGACAC
TTGGCGCTAATAATGAATACGGTGTTACTGGAATGCTCAATAATAACGTTGGACCTCGTC
ATAGAGCATCGAATGCTAATATTTCAGTGAAGGATGTATTCTCGGAGCCCAACGGAGGAC
AGATCAACAGGGCCTACGAAGCCTCACTCGGGGACGACGATGACTCAAATTCCATGCGAC
TTCAGCCAAGACAAAACCAAGTTTCATTCCAAGGGAGGTTTTAACTAAGAGTTGCCAAAA
CAATCGTCCCAAGTGACTTATTCTTACTTTAAAAAAGGATAGGAGTTATGAGATTACAAT
TAAAAATAACTGCTTGTGATATTTTAAAAATCTTTTTGAATTTACTAGTGTGACTGGAGT
AAAAAGGAGTCACTGAAAACTATTTTAGAATTAATAGCTTTATTTTAATTAAGAATTTAT
TTAGCTCTTTCAATTTACACTGCCAACTTATTTTACGTTTTTTTTTATTCCATTATAATC
TCAGTAGAAGTTAAGAAAACCATTTTTTTTTACCAATTATAGACTTCCAATTTTGTTAAT
AAATGAGATTAAATATAAATGACATTCTTTTATTTTAACCTCTAAGTTCTTTTGGATATT
GCAATCGCAATTGAATGAACTGAAGACCAAATTTAGTCTCAAATTCGAAATATTTTCCTA
AAACCAGAAATTTTAGTTAAAATGTGCCTTTGTTGTAACTACATTTATATATTTGAATGA
TTAAATAGCTTTCGATTAAGAGCAGGCTTTGAAGTATGCAACAGAGAACCGTCTGCTTTG
TGTGCAATTATGTAGTAATTTTTTTATCCAAGTTTCATTAGCTTTTGATGAATATTTGGA
TTAGTGTTTTATTTTTCTGTATTATTATTTGGGTTTCAGCTAAAACTTATAGATCTATTA
TTTAATACAATATTTTCCTAAAAAAGATAGCATAGATATCTGATCTATGATATATTATTA
TTAATACCAATTACAATTCAAAATGTTCATATTGAAAAAGTTTATGGGTATTTAGAAACA
CACCACCTACTTGCAAAAGATAACTTGCAAAACAGAATAGTATTGCAATTTATATAAGAT
GTTTTATTTTAACAAATTATCAATTAACTTATTGCAGTTCTTGAAGTAATTTGATGACAC
AAAATGGAGGCATTTAGTATTATTAACTATCATAGCTAATGCCACTTTCCCTCAAGGGGT
TGAGAGTTAAGGTTTAGACTCTACAGGCTGAGTTGCTTACTTCAAAGCCAACTTTGGGAT
TTTAATTAAGATCTAATCTAGAAACTGATTTATTTTCGAAACTTACTTAATTTTCTAAGA
ATGACACAAATTCTGTTAGTTTGAAAAGTTGATCTTCACTAGAAGTATGCAATGGGGCTG
GTTGTGCTGGGGGTAAGGGATTCACTGTCATGCCATCATCATGTAGAGTCCACCTGCGAT
CTTGACAGACTTGTAATGTGGCTTCCCTGCTGAGACCAATCATTGAGATCAGTTTATCTA
TTTTTATGGAACTGTACGATCTTCCGATAAGGTTTAGAGTCCTTTCTCGAACATTTTCTT
CCAAAGCTCTTATAATGTTGGAAACTGGTTCTGTCCAAGAGTAAGCTGCTAATGCCTCAT
ATGTACCAGGTAAATCTTTTTTCCACAGTTTCTGTCCAATAGCCCATATTGCAACTATTT
CAGGGGAGCTACTCATTACATTTTGTGGTATTCTCTTCCATAAAAATTTTGCATTACACA
GATCATTTTGATACAAATAAATAGCTAATAGCTGAGCGTAAGTCGAGGGACTGGCTATTC
CATTTGGTGTCTCAAGTTCTTGCCTTTCCAAATCAGCACAAAGTTTATCGAAATTCGTAA
TCATTTTGTCTCTATTACTATCATGCAACACTAGAATTAATACGAATTGATATTTTAATA
ATGCACCAGTTAAGAAGTCCTAATAGAAAATTGTTGAAAATTGTAAACTTCTTGTTGCCA
CTCTAGAAGTAGAACATGATAAACATTAACCACAGAGGCTAATAATAAAATTAGAGATAC
AATACTATTCAATAACCTCACAAATTCCAAAAAACCAAGAGGTACCAAAAATACAAACAA
AAGTTTGTGGGGCCATAGCTTCAAGCTTGTCTTTAACTAATCTACGTTTATAACATTGAA
GATCGAAAAAAGTTAGATTCATTAAATGGAAGTGAATACACGACAAATATATTTACTTTA
CTTATTATTAAATTAAAAAGCGGTCTTTTAATATTTGCGTAAGATATTTGTGCATCTTAA
GTGATGATAAGTGTGAGAAAATTAAACAGTCACTGGATGTGACTTCTTGGGCTCTTGCCC
AAACACCAGTGAAG
(8534 bp)

- SilkBase 1999-2023 -