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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoSK_comp10335_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr11
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_pentatricopeptide_repeat-containing_protein_1,_mitochondrial_[Plutella_xylostella]
Ontology
GO:0000049 F tRNA binding
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0005759 C mitochondrial matrix
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0042780 P tRNA 3'-end processing
Transcript
Level		FPKM:4.90 TPM:4.93
ORF EntryO_BomoSK7078_3prime_partial:A_BomoSK_comp10335_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GACGTTTTCTAAAAATTATAAAAACAAGGTGAACACTGAAGAAGATTAAGCTAATAAATA
ATATTTCTAAGATATGTACTTTATTGTACCTACATAAAACAGAATCTGAAGGTCTTTGAA
ATTTCTCACACATTACATTAAATATTTTGTAATCGACAATTCAAAATGGCATGTACTAAT
CTGCTGAGAAATATTAAAACAATACATTTTATTCGACGTAGCTTTTTCTCAACTTCGATT
ATACAAAATAATCAATCTAAATATCCCAAACATACAGAATTCCGAACAGAACACAATCAA
TTGGTGTATTTAGATGATCCTGATAAGTTTGGGACATTGTCCGGTTTCAAAATACAGGAC
GAAAAACTTGTAGATGCTGGAGATATAAAAGAAGAAGAATATACACAAAATAAACCCTTA
CCTGGTAAAAAATTAACCACTAGACAGTATGCTGATTTAATTAAACAATACATAAAGCAT
AAAAGATTAAAAGAAGCTATTGATGTATTGGAGGTGAGAATGCTACAGGAAGATAAAGTG
AAACCGGAAAATTATATATTCAACATATTAATTGGTGCGTGTGCTGATGTAGGTTACACA
AAAAAAGCATTTCGTTTGTTCAATGAAATGAAAGCACGAGGACTAAAACCTACAGGTGAT
ACTTATACCTGTTTGTTTCATGCATGTAGCAAAAGTCCATGGGCATCGGATGGTTTAAAA
AACGCTAAACATCTTCGAGAACATATGATTTTAAAAGGAATAGAACCAAATCTGACGAAT
TATAATGCAATGATAAAGGCATTTGGATGTTGTGGTGATTTGGTTACGGCTTTCAGAATA
GTTGATGAAATGGTAACTAAGAAAATAAAAATTAGAGTTCATACTTTTAACCATCTGCTA
CAAGCTTGTATATCAGATAAAAATAATGGACTGAGGCATGCTCTGATTGTATGGAGAAAA
ATGTTGAATGTTAGAGAGAAACCTAATATTTACTCTTTCAATTTAATGCTTAAATGTGTG
AAAGACTGCAATTTGGGAACTAAAGAGGACATTGAAGAATTAGTTGGTGCTGTCAAAGGA
AAAACATTAAAAGGAAGCAAAAATGATATGCTAGAGACGCAAAATATTGACTCGCAAGAG
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TCTCAAAAAAGTATTAATGGTAGTAACAAAATGAATATGCAAAATTCAGATGCAGTAGAA
ACAACAGATTTAATGATTACAGAAAACAAAGCAAAGATAACAATACAATTAGTAGATAAT
TTAAAAAATACCAGCAAAGAACAAAGAAATGTACCTAATTTATTGTCAAAGGAAATTAAT
ATGCACCATATATTAGCTTTACAAGAAGTGCATTCATTACAAGATAAGTTTACTGTAATA
GGTGGACAAGAAGATTTCCTTGAAGAAATGAGTGCTTATTCAGTTAAACCAGACATTAAA
ACGTTTACACAAATGCTCCCATTATTGGATAATACAACAGAGGCTGAAAATAAACTACTT
CATACTATGCACAATATGAAGATACGAGCAGATATTGACTTCTACAACATGTTAATAAAG
AAAAGGTGTTTAAGGCTGGATTATGATGCTGCTAAAGCTGTTAAAAAGATAATAAAAAAG
GAAAGTGAAATTCGGAAACGTTTGTATCCAGATAATAAAAAGAAGAGACTAAATCTTAAT
ATAATGTCTTATGGCGTCTTGGCAATGGCTTGTAAAACTAAAGAAGATGCAGAAATCCTC
CTAGCTGATATGAGACAAGAACAACTTAAGGTGAATATAGAAATTCTTGGAGCTCTATTG
AAACATGGCATCGTAAATTATCGATTCGACTACGTTCTGTACGTATTGAATATTGTAAAA
GACGAAAAGGTTCCTGTTAGTGATTTGTTTTTAAAGAATTTAGAGGACTTCAATGAAAAA
TGTATGAAAATTATACAGCAGAATGAAAACAGTCATCGCAAATATTCCAATTCTTTCGAA
ACAGCTTACAATAAATTCTCGAAGATTTATACTAATTGGTTAAGAGAAGTAAACATTCAT
GAAGCTTTGAAGCAAGAACATCCTTGGGAACAATTTAAGACTTCCAGCCCAGAAACAGTG
CAAAGGCAAAATATTAAAATCATCGAACCAAAGAGATTTAACAAAAGAAATCGTAAA
(2217 bp)

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