SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoOtmSK_comp14904_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr11
NCBI non-redundant
(nr)		uncharacterized_protein_LOC101742952_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0008152 P metabolic process
GO:0035064 F methylated histone binding
Transcript
Level		FPKM:4.29 TPM:4.63
ORF EntryO_BomoOtmSK14237_complete:A_BomoOtmSK_comp14904_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
ACGAAATAGACAAGTTAAAGTAGATAAACGACGCGTACTTGACTTGGTGCGACTGAATAT
ATTTAAGTTAGACACTTATAAACCAATGTTATTTTCTTAAAAGTCAAAATGATAAATAGT
TATGACAGATTACTTAAATCGTAAAGCCTAAACCGTAAACTTCATCAATTACCATTTAAT
TTTATGGAGGTTACCATCTAACGTAGCGCAAATATAAACTTTTCAATAGTATTTCGGGCT
ATCTCCAACTGCGAAATGGATGTCGTGGAAAACTCTGTGTGTTCTACTGTAGAAGATAAC
GAAAAGATTAAAAACACTAATACAGATAGAGAAGAGATCGTCCAAACTTCGGGAGGATCT
AATGTGTGTCAGAAAACGAACGGCGTCGCTGAGACCGACGAGTCCGCTGTAGATTGTTCA
GTTCCTGCAGAGGTTTTAGAAATCGCTGTGATTAACCCAGACATTGAAGTTCAATGTGAA
AATAATCAAGATGAAGTCATTCCAGAGCCTGGCAATTCAGAATCAGTCATCAATGACACA
AGTGCTTCAGACATAATACCATGCGAATGTGATCCTGCACCAGTAGTAGCTGCTGCTATT
CCTACAGATACAGATTCCAATGAAAATAATGTTGAAAAGTCACTTTCTGAAGTACTGGAT
CAAGAAGTAGAGAGCACAGTTGAACTGGAGAGTGTGGTAGATATAGGCTCTGACAGGGTC
GCTTTTGAGACTGAGATCCTAGTTGAAGAAAATGTAAATGATTCAAATGAATCTAAGATT
GATGAAATTGTTAAATTAAGACAGGGAACACCTGACCTTTTGAATGAATTAGATCAAAAT
ATTGAATTTAGTGAAGCATTACGCTCAACTGACATTACTGGAAATGGAGTCAATAATAAT
ACTACACCTGTAGAAGAAGTATATAATAAAAAAGAGTTATTGGATATTTTGAAGGGTAAT
GATGCTGAAGAATGTAAACCTGTCATCACTCGTGTCAGTGTAGATAAATTGACTGAAACA
GAAAAAGCCCTTCAACAACTGTCACGTCTTAAGAAGCAAAAAAAAACTAAAAGTAATGTG
AAAGTATCAATCAGGTGCAAGAGTGAACGCAAAGAAATAGTTGCTAAAAAAGAACCAGAG
GTAAAAAAAGAATACAGTATAGTCAAAGCCCTTGTTAAAGATTGGGATGATGAAGAACCA
CCCGAAGGTGAACAGTTAAATCAAATAATAAAAGAGAATCAAAGTTTAGATGTGGAGCCC
CAAGATATTGTAGTCATTGAGGAAGAGGAAACCAAACAAAACCAAACTGTGTTACGAACA
TCAGTTGATTCTGCTGAAGAGACCACAAATCTTAATCCCAGCAAGAGTGGTGATGAAAAT
TCTGCACAACCTCAACGTAGACTAAGCAGAATCATTAAGAAAAAAGTTATTTTTGATCCT
GACAATCCAGACACATTTACAAAAGTTAAATCATTATCTAAAAACAAAGAATTGTCAGCT
GATAAAGATCAAATTGTTGTTAAAAAACCGAAAATGGATATTGTATACTCTAGACCAAAG
TCTAAATCTCCAGTTTCTAAAATGCAATGGAAAAAGCCATCTTCTAAAAATAGCAAACAA
TGTAAGAGGCTGTCAGAAGTTGATAAATTATTAATGGATGAAGGTGCAGTTAACATGATT
TATCAACTGACTCCTGAAGCACCTAAAGGCAAAAAAAACATGAAAACAAAAGCAGAATTC
ATTAAGAAAATACAGAGTACTACTCCTGACTCTAAGGAAATGAAGTTTAGAGAAAGAAAA
AAAGAATTGAAAGGAGAAGTAGGTGAAGCCAAGAAGATATTAGGTGGCAAATATAGGAGT
TCAATCGGCAGTTCAGTCAAATCTCCTTCAATGAATGAAGATTTTGAAGCACACAGTGCT
GACGATTCCATTATTTATCGCCGACACTCATCTAGCTCTTACTCAAGTTCGTGTATGAGC
CCTCGGAGACTTAGTGACGTTGAGGGAAGTGTTATACAAGTTACAACAAGCCATTCAATG
CTGCAACACACTGAAACTGAGACGCAACCAAATAATGATGCAGAAAGCAAAAACTCTGTC
TCTGAACCATTCTTAGAAGATCAAAATGTCATTCCAAAACAAATAAATAAAGATGATTGT
TTGTCAATTAAAGAAAAACTAAATACCAAATTGTCCCTTGCTTTGAATAAGAGAAAAAGA
GAAATTGTTAAAACGGAGAAACCGAGTAAACAAAGAAAAACTATAAAAAGTCAAGAGAAA
GTCATAAACAGGGAAATAGTCCATAGCTTTAAGTATGTCTCTGTTCAAATTGATCAGAGA
TTTGGTGAAATATGTATCCTTGATTCCGGGACCAATTTTAATATAGAGGTAATAAAAGAA
ATAGAGAAAGCTTTATTGTTTTTAGATTCCAGAGAAGATATATCTGTAACATTGTTATTG
TCCACTAGTGGACAGATGTGCCTAAACTTAGATTTAAACCTTCTATTAACTAAGAGTCTT
GATGACAGAACTAATGATGCTCATGAAATTGCTGAAACTATCAGATCCTTACTGTGTACA
ATTCTGAACCACACAAAATTGTTGTGCACAGCTGTAGAGAGGGGATGCACTGGCCTTGGT
TTCACATTAGTGGCATTAAGTGACATCACTTTTGCCTCTGAATTTGCTACTTTTGCACTA
AGTAATGCCGAGAAAAATGCAGAATATAGTTTGACACCTGGTATCGCTATACTTAGTTAT
TTATTACCACAACCATTGCTCAACAATATTGTACTATTTGGGAGACAACTGTCTGCAACA
GCAGCTGTGCAGAGTGGCCTTATTAGTCATTGCCTCTGGCCGGCAAGCTTTATAGAACAG
CTACGAGTTGTCATAAAAGATATAGCTGCTCAACCTGCCCAAGACGTTTTACTAAAAAAG
CAACTTTTAACCCTGAAGAAGACCGAATCAATGGATTCAATTAAGTCCAGCCTTGAAAAA
GAAAAAGATATGTTTGTTAAATACTGGACCACCGTTGAGAGAAATGACGAATCCCATTAA
ATCCACATTGTATTTGAATCATAACAGTTACATTTTTTTAAATTATTATCATTATCATAA
AATCTGGTAACAAAAAAAAAACGACAATAAATTAGAAATCATATAATGACAACACATACA
CAATAGATTACGTAGATCTTGATCTCGTATTTCATTTATTTTTGCAAATTATGTGTTTTA
TTCTATGAAGAACCGAACTTTTTTTCGTAATACGTTTGATGAAATGTTCATGTCATTAAA
TTAAATCTAAGTCTTTGAAGTTTGCATAATGCACGTACATATATGGTCACTATTGTGAAG
TGTTCCTGGTGTGAGTAACTGCGTCGTTATAATCGAATTTCATATAGAACGCTATCGACT
AGTGTTTATTAAAATTAATTTTGTGGTTTACATACGGATAAAATAAAATAAAATGTTAAC
TAATTTGACTGACTGACTTCAAAATTACAGGCGAACATTGTGTTGCCTTTTGTTATACTA
TTTTTATTGCGTAGATATTACTTAAATGTCTTTAATAATAACTATAATATCGATGTGTTT
TCATATTGTGAAACTGATTTCGATTGATGTTAGGCGTAGTTAGTTCTCGACTATGTAATG
TTATAGATGAAATTGTTTATGTATTTGTTTTATATTAAATGAGTTTATGTTTAGTTGTAA
TTCTAATTCTGTACACATAGCCAAAGTATTGGGGTAATGGCCACATGTTAAAAGTATGAT
AAAAATGACAAGGTCGCAGGTTTCTGAAAGAATATTAAATGGTGGTTTATTAGCAATTAA
AATCAATTACGAAACACGTTCATTCCCATTGTGTTAACTTTTATCTCTTTCAAAGAACCT
TATTAATAATTACGCTAAGAAAATAGATTTATTTAGCCCTAAAAACATTAATGTTTTAAG
TTAACTGTAAGTCGAGGAATAAACAATTCCCATTCTGTTTGAAATAAAGTGCCTTTGAGA
ATAAACTCCTCACTCTGGTTTTAGTGTATAAGACCCATATTATTTAAAAGTAGGAATACG
TTTCTTTAATACATTCGACTCTAACAAGTGTAATAAAGTTTCAGGAAAACCAAAGTAGAG
CATATTTATATATTTTTGTTGTAAACGTTCTGTACTCTCTTCTCATCTACTCTCTTATAC
TTTTCTGATATTGGAAAAAATGTATTGGGATTAAATAAACGTTCTCCAATGTATTTCCCT
TTGTGATATATTTTCATTGGTATTTGGTATGCAAAATGGCCTAATCTACGTTGGATAATT
ATCGTTAACGTCAGCCGTTATTATATGACAGTAAATAGACGAATAAAAATTGATCCATTT
AATGATTACGATGCGATTTTGCGCATAGCGCACTCAATATATTTTCGTTTATGGTCTTAG
ATTATTAGTTATTTTCTGTGACATTGGAGAGAGTAGGGTCACAATTCACCCTTGATGCGG
TACAAAATCATTGCCTTAAACGAGAATACATAGATGGAAGAAATAATTATATTGGAAACT
GAGTAACATTTTGTCAACTCTGCTAACACAAGTACACTGTATTACTACTATTATTATTAC
ACATTATTACTATACACTATTTTTATCTCGACGAAAATATATCTCTGTTTAGCCATAAAT
CAAAGATGAATATATTGTTAGTATATGTATACAAAACTTAAATTTTAATGGATACGAAAA
TAA
(4743 bp)

- SilkBase 1999-2023 -