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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoOtmSK_comp14789_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr21
NCBI non-redundant
(nr)		arrestin_domain-containing_protein_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005768 C endosome
GO:0005769 C early endosome
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0016020 C membrane
GO:0016023 C cytoplasmic vesicle
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0051443 P positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity
Transcript
Level		FPKM:8.77 TPM:9.46
ORF EntryO_BomoOtmSK13782_complete:A_BomoOtmSK_comp14789_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GTCCATATCAAAAGTAAAAAAAAAAACTTCAAAATTGTTATTAGAAATATAAATTTATAA
ACAACTGTATAAAAAACCGTGACATCAATATTTTTCACTTAGAAGCCTGGTTAAATAGAC
AGGTCTTCACAAGTTCCAGTGTCTCGTTAAAAGCTACTTTTATCCGGGGTAAGCGTCATC
TTGAATAATCAAACGATTATAATAAAGTAAATTATTATAAACACTCGTCTTGTCTCCACA
ATCAGTATAAGTACATAAATATTTCAAAAATAGATTTAAGTATTTTTTACCCTTATGAAC
TAAATCAGCTGGATCGATTAGCACCCTTTTATGGCAGACACGGTTCATAACGTTTAAATT
AATTATGAACAAAAACATTATATTTATATTTCGAATTACGTTGGTGTGTATAGTGATGTA
TTTCTAGTATCAAAGGCGGATTTGTGTGTATATATTGTAAGTAATATACCCAATGAGTTG
AGAAAGAAATCGCTACTTTTGGAACTTTGTAAGCTCTCTTCGTATTAAATTGAAGGATCC
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ACAGCTGTCAGTTGATACTTGACAGTAGTGACAACAAAGTTTTAAAAGGGGTCTAACTTA
TTCATTTGCGAACAATAAGTCCAAGCGTTTGTGATGATTATAATAATAATAATAATAATA
GTAGTGATGAAACAAATTAAGCCAACATCCACATCTACATAGTGACGAACTCACAAACTA
CAAGCTGCCAGTACAGATTTACACTACAGATTACATTCACATACAAAGTGTTATTTTACA
GTGCTCTGTGCGTATTCTGTTTTAATCTTTTTTAAGAAGATGGCGGCGGCGCCGACGGCT
GTATTGGAGATGAAGTCTGTGGCATCGTTACGTGTAATGGATATCCTGTTGACGCCGGAG
TCGGTCCAGGATACGGAGTGTAATTTTGGGGCATATTATATGGTGCTGGATGAGATGTGC
CCTGCGGTCCTTGAAATCCAATTTGATAGTCACAAAACGGCGCCCTACCTGTCGAAGCTT
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GGTATGGCACGTTATGTGCTGGATAAGGCACATTTTGAGTCGGATAAGAAGACTGGACGT
GAGATACTTGACTAGTTGTGTAGGGACTATTACTCGGTTCGATGACGCCAGAATTAATAC
CCACAGGAGCTTGTAATGGATCCGGTATGGGCCCGTCGGGCAAACTGTGAGCCATTGGGT
GCTTGTACTCGTCTTGGGTGAAACCAATAAGAGGAATCAAGCCGAGACAAATTTCGGATT
CATCTTCTAGATCGTCATCGCAGCCTGACAGTTTTACTCTCACCTTAAAAAAATACCCAA
TATCGATGATCGTACAGTTTTCTAAGTTCGGGACAATCAGATCCGGCACTTTGAGGTTCA
CAGTGAAGTTCCTCGTGGTCTTGCCGAGCACCGCCCCCGACTTCACGGAGGCCAGGACCC
TCTCAGGAGGCATGTACTCCGCCATCGGTTGCTTGGTGCGATAGCATTCTTTCACGACAA
GCTGATAGACAATCTTCTTTATTTCATTGCCGCTTCGGTTTTGTGCCTGCACGGATATGG
GTATTATCTGCCCTGGGCAGTACCCCGTCACTGGTAATGTTATCTTAACACTTATTTCTC
CTGAACCACAAAAACAGCTGCATCCTGCGTCAGTCTCCTCTAATTCAAAGTTTACGGGTT
GCTTAACTGTGTCATTTGCAAGGTTCAAATCAAACGGAGCAACTACTTCAAAGATTGTCC
CCAGTTCTTCTGCAGAATTATTAGCTTGAATAAGGCGAGCAGTAATCTTGTAATTGATAT
TGCCTCGTTCACCTGCCACTGTTGATGGTGCTGTGTGTGGTATTTGAAATCTGAATGGTA
AAGATTGAGGACCGGCTGGAAGCTGAATTTGTCCATTGTTTGCGACTAGATGTTGAGTGT
GCCTCAAATACGCCTCGTTGCCATAGTATCTAACTTGTTTGTATTGTTTAACACCATTAT
ATGTTTCAGTTTCTTTTTCGATCCACTCTACAACAGCTTCACCAGTTGCCTCAACAAACA
AAGCTTGAACCGTAATTGGTCGATCTAACGTAAAATTTACACTTCCCGTTACAATTTGAC
CAGAATAAAACACATTTCTTATTGAGTCCAACTTTATGGTGCCTTTTTCGAAACCACATT
CCATTATTTTATTTTAATGGTTAAACAATGCTGGTTTTGAGAGGAATAGATCCTTAATTT
GTTAAATTGAGTGTATTTCTACGTACAAAAACCCAGCGAAAACCTTATTCCCTAAATGTT
T
(2401 bp)

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