SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoOtmSK_comp14780_c0_seq5
Scaffold_idBomo_Chr13
NCBI non-redundant
(nr)		acyl-CoA_synthetase_family_member_4_homolog_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0006631 P fatty acid metabolic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016874 F ligase activity
GO:0016878 F acid-thiol ligase activity
Transcript
Level		FPKM:0.73 TPM:0.79
ORF EntryO_BomoOtmSK13757_complete:A_BomoOtmSK_comp14780_c0_seq5
Sequence
(Nucleotide)
CCTTTGATAATAGTCGACTCATATCTAATATATAGCTATAATACATCTTATTTTGTATCA
ATTTTGAGACTGTATAAGAGATCATTCCTGCAGCCAATAAATACATGATCATCACATATT
ATGGGAGAAGAAAATGTTTCTCCTGGTAATTGGTACTGGGCAGTTACAGTTCCAAGCTCT
GAATGAATTACCCACAACTTTCCATCAGTAGAGGCAGCCAATATTAATTTATCATTGAAT
ATAGTTGGTGTTGAGTAAACAGGGGAACTAACTCTTGTCTTCCAGTGCAAGCTTGGTTGA
AAATTTGTAATGTTAACACTATAGACATTATTGTCATGACATCCAAAGTACATCTGCCAC
TTAAATTTATTTATTTCTTTTACACATAATGATGAAAATATGTTTCCTTTTGCTCCATTG
TATGTCCATATCTTAATACCCTTTTCTACAGTCCTGCAATGTATTTCTCCATTTACTTCA
GCAAAAATTACATACTTGTCATTATCATATAGTACAGGACATGCGAAAATGGGACCTTTC
AAGGAACCTTGCCAAATAATAGTCTTGGTATTGACGTGCAAACAAGCACACACACCAGAA
AGTGTACCGAAGAGAATGAATTCATTTTTAGCTAAGACTAGATCTGCTGATATTGCTTGG
TCTGAGACATGTACTGTTTCTTTAATGGTACTAGTCATCGTATGTGCCAACAACGCCGCA
AGGTGATGTCACGCATTCATCGTGCACACACAGGATCGGAGCTTCAATTCGTGATTTCAA
CTTAATCAGACCTTGTATAAAACCGGTGTTAGCGTTCATAACCACGATTTTTCCTGAGTG
GCTCCCGACGGTGACATACAGCACACTTTCACTTTTATAGAGTGCAGGAGAAGCATCAAC
ACATTTCCCAGTATCAAAAGTCCATTGGACAACAAACTCCACTGTATTAGAATTTCTAAT
GCCACCGGCACCTTTTTTGTAAGATATGCTATTTTCACCATGGCTGCTTGTAGATCGGTT
TCTTTTGATACTCTTTTTGAATTTATTTTCTAAGCAGTTTGTGTCTTGGGTAATAGTTTT
TAAAACATCACCAATACTTTTATTATGTGATAATAAATGTGGTAAAATATGTTTTCCTAC
TTCAGGGAAAGTTAATGAAAGTTTATTGCAAATTGTTACTGCTAGGAATGACGTACCACC
AAGTGAAAAAAAACTTTTACTTTGAAGATCTTCATAATTCAAATCTTTATTTACTAAAGC
CTTTAATTCTTTAAAAAGATATGATTTGATATTTTCCACATTTTGTAGTATGTTTGATTT
TTTATAGATATTGACTAGGATTTCTTTAGAAGTCTTTCCATGAGCATTAGTAGGCAAAGT
ATCCACTCTGATCACCTTATCTGGCCAGTATTTTTCATCAAGCTTACATTTAAGGAAGTC
CAATAATTCCTGACTGCTCAATGTTTCAGCTGAGAAGTATACAATGAGGAGGAGAGGGGT
TTGCAGCCACACACATGAACAAGACCTTACTCTTGGACACTGCATCACAGTAGATTCTAT
AGAATGTAAATTGATTTTATGACCAAATCTTTTTATTGTGTCATCTACACGGCCTCTATA
AAACACAGTCCCATTCCTTATCTCACCAATGTCACCTGTGTCAATAAACTTTATACTATT
TTCTTCTTTGTTTCCATTCTTTCTATTAAGAAGAATACATTTTCTTGTTTTGCTAGCCAA
TATAATTTTACCCATAGTATTATTTTTCTCATGAGGTTGAACAAATAATTCTGTTTCCGA
TAGGCAGTTTCCCAATGGCACTTCCTTGTCTCCTGTAGTAACTTTATTTAGATCAAGTTC
TGCTACACTTGCCCAACATGACATCTCTGTAACTCCATATAATGTGAATATTCTAGTTTT
ATTATTCTTATGTTTTAGCTCTTTCAGTATTTTAATTCCATTAAGCGGTTCACCTCCTAA
AGCCAACACTTTGAGTGTAGATCTAGCACATAATATTTTATTCTTGATATTTTCATTAGA
ATGTTGAAAAAATTTTGATGGTGTTGTCTGCCAGAATGTTACAGAATTGTCATTGTCCTC
ATGAAATAATACTTCTGTGAGGTCTGGTGCAATAAGAAGTGATGCTCCATTTGTACATGC
AAGTAATATTTCAACCATAGATGGATCAAAGGTCAGTGGAGTTGAAAAATAGATAACATC
TTTTGAGGTAATGCTAAATAGTTTAGTTAAATCATCAATGTTTGGTTGTAGGCATTGTAT
TGGCACTTGTATGTGCTTAGGTTCCCCGGTGCTGCCTGAGGTTGTTGCTATAAATGAGTG
TTGAGATACAAAATTATTTTCAGCAGTAGTATCACAACTGTAGAAGAGTATGTTCAAATC
AAACATTGAAGCTGTTGTGTCAGGTTTTTTTCCAAATAATTCCAATTGAACATTATCTCT
GTTTTTGTTGATCACAATTACTGCAGACAATTTGATTTTCCCAGTAATAATCTCTATGTC
TTGAGGAGAATTCAAAAATATAAAAGAGGTACAACATTTGTGTGCCGCTGCTATAACCGA
AGGTATGATTGCATTCTTTTCCGAAACCAATGCTATGACACCTTTGTTGCATTTTAACTG
TTGCAAGTTCTGCGACACGTATTCGCAAACTCCGTATAATTCTGAATAAGTATATGTATG
ATATTTGCCGCATTCGTATTGTCTAATGGCAACGTTACCGGGACTTCTCGCGCAAGTTCG
CATGAAAACATCATAGTAACCGCGATTCATTGTCATCATGTATAGACAGTTTAAATCTCA
TCTTTAAAATTTTTCATTTAATTATCTTACGATTTCATTTGATTTAAGTGGCGGTCTTAG
TTGAAATTTATGATTGATTGTGTCTATCAAAACTACTTTTTGCTATGTAACTTCTGATAA
ATATTATGTGTATTATCTATGATCTGTCGAGCGACCAGTGGTGCATGGACCACAGTGACA
CAAGCCACTCTTCTATCATTATAAAATGTTACCACATGCTTCATTCATTCTAAATTATAA
AGCAACTGTAATTATGGGGCACGTGTACTAAATTAAGTATCAATCAATCGGTTAGTTGCC
CAAATTGCTATTTTTTGACATGTCAAAATATGATGAGAAAATATATATTTTTTGACACAA
GGAATGATGCCAATAAGAGCTTACACTAGTGAGTTCTTATTGGCATCATTCCATTTTACC
AGAACGATGAGAACAAAAAATAGCATGAATAATAATAGTATGA
(3283 bp)

- SilkBase 1999-2023 -