SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoOtmSK_comp14772_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr17
NCBI non-redundant
(nr)
Ef1alpha-like_factor_isoform_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0000184 P nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0002184 P cytoplasmic translational termination
GO:0003747 F translation release factor activity
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0005525 F GTP binding
GO:0005829 C cytosol
GO:0006412 P translation
GO:0006479 P protein methylation
GO:0018444 C translation release factor complex
GO:0044822 F RNA binding
Transcript
Level
FPKM:5.52 TPM:5.95
ORF EntryO_BomoOtmSK13732_complete:A_BomoOtmSK_comp14772_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GTCAAATAACATTTTTGGCAATTTGCCATGAACTTCCGGTTCAAGATAAAGACACACGCG
GATCTAGTGGGAACAGAATCTAAATAATTTTAATTAACCGGGAAAGAAGACCAAATTATT
TATTTTACGCTCTGCAACTATAATGTCCAATAACGGTGCTCCGGATTCATGGGAAAATGA
AGCGGAAATAATAGGTGAAAAAGGATGTGGCGATGGAGGCGGAGAAAGCAGTGATGGTGG
TGCAGCATCTGCTTCTCCACGTGTTGAAGAACCACCACCTACTACTGCATCTGTCCCGCC
CGATGTCTCGCCCACTGCAGACAGCTGGGAAGTTGAGGCTGATGATGCACTACTCACACC
TGAAGAAAACAATGAACCGGAAGAAGAAGAATTGGATACACAAGTAGGAAACACAAATCC
TAACGAGGATGGTGAATTAACAAAAAAGATTCCAAAGAAAAAACCACCACGAGTAGAAGA
TACACGAAGCAAAAAAGAACATGTAAATGTAGTATTTATAGGACATGTAGATGCAGGAAA
GTCGACTATTGGTGGTCAAATAATGTCACTCACTGGAATGGTCGACAAAAGAACATTAGA
AAAATATGAAAGAGAAGCGAGAGAGAAATCAAGAGAATCATGGTACTTATCATGGGCACT
GGACACAAATCAAGAAGAACGAGACAAAGGCAAAACAGTAGAAGTTGGAAGAGCTTATTT
TGAGACTGAAAAGAAGCATTTTACAATTCTTGATGCCCCTGGACACAAAAGTTTTGTTCC
AAACATGATTGGTGGGGCTGCTCAAGCTGACCTCGCTGTATTGGTCATTTCTGCACGTAA
AGGCGAATTCGAAACGGGTTTCGACAGAGGAGGACAAACTCGTGAACATGCGATGTTAGC
TAAAACAGCTGGAGTGAAACATTTGGTAGCACTTGTAAACAAGATGGATGATCCAACAGT
TAACTGGGATGAGAAAAGATATAATGAATGTCGAGAAAAAATTTTGCCTTATCTTAAGAA
ATTGGGTTTCAATACAGCGAAAGACCTATCCTTCCTTCCTGTTTCCGGCCAAACTGGACA
AGGTTTATTAGAACGACTAACTGAAGATGTATGCCCATGGTACCGTGGACCATCTTTTAT
CCAACTCATCGACGAGCTTCCGTCTCTAAACCGTAAGATCGATGGTCCATTTATTATGCC
TGTTGTTGATAAATATAAGGACATGGGAACGGTCCTCATGGGCAAGGTGGAAGCGGGAAC
TACACGTAAATCCAGTACATTATTTCTGATGCCAAACAGGGTGCAAGTAACAGTTGATCA
ACTTTGGTCCGATGACATTGAGGTAACCTCTATTGGGCCTGGTGAAAATGTCAAAGTAAA
ACTTAAAGGAATTGAAGAAGAAGATGTATCTCCTGGTTTTGTTCTTTGCGACGTAACCGA
ACCGATTACGACAGGAAGAGTTTTCGATGCCCAAGTTGTGATTCTAGAACACAAATCCAT
CATTTGTGCTGGTTACTCTGCTGTTATGCACATACACTGTGCTGCTGAAGAAATTACTGT
TAAGGCTTTGATTTGTTTGGTTGACAAAAAGACTGGAGAGAAGTCGAAAACGAGACCACG
CTTTGTGAAACAAGATCAGGTTGCTATTATGAGGATAGAATGTGCAGGAGTTATATGCTT
AGAACCATTCAAAAAATTTGCTCAAATGGGCAGGTTCACATTAAGAGACGAAAATAAAAC
CATTGCGATCGGAAAAGTTTTGAAGGTGATTGAGTAAATCGGCACTACATTGTAATTTAG
CTAGGTTAGGCCTTTTGAGAACCTATTAATATTTGCAAAGTGCATGTAAAATGTATTCCA
GGGTCTCAAAATCCTGAAAAAGCTCGAGTACAGCTTGTTATATTATTTTTCATAGGAAAC
AATATATTTTCTGCATATTTAGTTGTCTATTATTATTATATTCAGTTAGATCGTTTCAAA
TATTTCTTATTACATGTTGTTGATAGTAACTTGTAAAAGTTTCAATTAACAACATATGTA
AAATTACAAACATTCTCAATAAACTTTACACAACTGTGAAATAAATGTTTTTTGTTTTTT
GATAAATTTATACTCAAAAGTTAAAGGTTTATATAAAAAGGTACTAACTAACACTACAAA
ATAAAACAAAAAAAGCTAAATTATTGGAGTTGTAATGTCATTGTAGTTGTCGATGGTGAG
ACTCTCACTCTTCATGCTGGAGTGATCTCTAATAAGTAACAAATTGATGCCATCTAGAAA
TTGGTCACTCTAATCTTATTAGTCTAATTGATACTTATATAAGTATATGATTGATAGTAA
TTACGATATATTTTTACATAATAATATCAGTTAATTATATAGTGCTGTTTATTTTTTAAA
TATTCTTTATATTACATACTTTTATTCCCGCTTATTACTTTAATTTGCGTTCAATTTCAC
TTAAATACATATTGAAATTGTAGTTTCTTTATATACACTGCAATGTGTACTTGTTATGTT
GAATTATATATTTTGCAATATTTTATTGTGGTAGATTTATAGTTTTTACATTTTAAGATT
CTGATTGAAACTAAAATTCAGTTAATCATCTTAATCACAAAAAGAAAAGGAATATAAGGT
TTGTTTAATTAAATTCATTCTTATTTGGTCACTTGTATTTTAGAATTATAACTTGGTTGG
AGTAGAATTTGGTAATTAAGTTGTGTAAAAATATTGAAATGCCTTGTTGATCGTAATTTA
CACATAGTACTTATATCACTGAAAATAAACACGGCGGTGCGCATTAATATTAATTCCACC
ACAAGATATTAACCATGTTTATTATGAATTTTATAAATTGTCAGCTTTTAACAATACAAT
AAAATTTATACATTATAAAGTTATTGTATATGATTTTATTTATTTATTTAAATGAGCGGA
AGAGCAGTGAGGTGTGCATATCTCGTTACAGTTTCCTTATGATTAAATTTATTTAAAATC
CTTGTTAATGATTGGAAATTGGGCCCAGAGATCTGCACCTCTCCACGTCACGCATTATGG
CGTCTGTCAGAATGTCTTAATGTAGGTTGGAATTCGATTCGGCTTAAAATAATTTTTTGC
ACATTGTTTGATTTTATCCTAGCGCTTCTCATTGCGATTTAGTATAAAATAAAATTGAAA
ATTACACCACAAATCCTAAAGATTAATTTTCGCGTATAAATCTGTATCACGAATTGTCAT
AGAACAACAAACTGGGGCTAGCAGTTTTTTTTGTACCTAAATATTCTCGCTAGATTCTAA
GATTTATTCGACTGGAGATTGGTGTCGAAAAGTTTTTATATGGGGAAAACAAATAAAAAT
CGCGAAACAGTTAAATCACCTGAATATTGCAATCAAAATATTAAAAAAAAAAGTTCGCCT
TAAATACTATTATTTATATTTTACAAGCTTATTGGCGCATATTTCGTCTATTGTCGTTCG
TCGTTGTTAATGGCCAAGGTTACAGACAGTGTTATCTGTAGGGAATAAATAAGATGCGTT
AATATATTACTAGTAAAATTGAACGAAACAACAGCTTAAGCATACCTAGTTTTATGTAGA
TAAGTAAT
(3608 bp)

- SilkBase 1999-2023 -