SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoOtmSK_comp14199_c0_seq5
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		protein_crossbronx_homolog_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0031625 F ubiquitin protein ligase binding
GO:0061630 F ubiquitin protein ligase activity
Transcript
Level		FPKM:5.06 TPM:5.45
ORF EntryO_BomoOtmSK12110_complete:A_BomoOtmSK_comp14199_c0_seq5
Sequence
(Nucleotide)
GCAACATCTTTAGCAAATGATGCACGATTTTTTTAACAATTAATCATAAGTTTATATATT
ATATAACATAGACCTATAGTAATATGATATTGTACATGCATCCATAGTTTAAACACTATA
GAATTTGTACTTTGTACCAACCTACCAACCATATTTGCGTCGTAATTTTATACTGTTCAA
GAAAGTGCCTATCTTAATATCACTTAATTATGTGCTTATTATCGTGGTTTAAAGTTTAAG
TAGTTAGTAAAGTAAGTCAAAGTTATTGTTTGTAAAAATATTTAAAAACAATTTTATTTA
GGGGTCGTTTAAGTTCAACAATGATGCAACGTAATATGATAAAGATTGCTAAAATCACAG
ACATAATACCACAGATTTGTTCGCAAAAGAAAAGCCTTCACTATGTTCAGGGTCAGGAAC
CTGAACCGAAAATCAGAGAATACTTTTATTATATTGATCATCAAGGCATGCTATTTTTAG
ATGACGCTAGGATAAAAAATTTTACTTCATGTTTCAAAGAAAAGAAATTCCTAGAATTCT
TTTTTAAACGGATCAGACTAAATAAAACTGGCAAATATGAAGCAGAATTTCCTTTTGTGT
CTCATTGTGGAAGAGAGCGTAATTATATCAGATGTGATGATTTACCAATAGTGTTTACAC
ATATATTTCATGAAGACAATGTAGATTTTCTTAGTTATGGATATGCCGGTGACCTATTAC
GAACAGTGTTTATCCCTGATAAAGTTTATATGCTGCCATTAACTGGCAGAGTGTACCATG
TAGCTGAAGAAAAATTTGGAGGTGTGGGATTGATTAAATCTAAGCTAGCTATAGAATTAA
GTAAGTATTTTGAATTTCACAATGGAGACACGAGACCACCCACTCATCTGACGTGGCACA
ATAAAAAATATGAATTAGATTTGAATTGGTTTGATGAAAATGTTAAAAGATTTAATTTAA
AAATAAACAGTGTTGGAAACTAAGTTTTTATTTGTTTTTGATTTATGTATTGTTTGTTAA
ACTAAACATTCTAGATAACAATCTTAAATAAAGTATCAAGTGTATCACTTACTCACTTAT
TGTAAATAATTGTTACCATAATATATTTATTACAATGTTTAAAGGGTTTTTAGAGGTTGT
TAAGCCAAAAACCCACTTGGGAGTTTAGTAATGATGGGGGCTTATAGATGGCATAGACTT
ACCACAAGGCGATATATTTACACACAAAGTCTTTTTGAAATCTCATTTCTTATACACATT
TGTCCCATATCTTCGAACTACTTAGATAGTTCTTATTCACTTCTTTATTCAATTTTTCTT
GTTTGTCAATATCACAGGGGTAATGGCTATTTTTAATAGTACTAGATAAAACAGTAAAGG
CTATGACATTGTTTCTTCTTTTGAAAATGGTTGGTAGCATCCTTGTTGAACCCATGACAT
CCCTTGAGTGGCTCCTTCAGTTGGTTTAAAAGCTGTAAGCATTATGTCCTTTGCTTTTTC
ATGTATATCAGGATCATAAGGTTTAAAAGTTATATAATGTTTGTCTTCTGTAGGTGGATC
ATCATATATGTGATCTATGCTAGTAACAACGCATTCTCTAACTTTTTGCATAAAGAATTT
TCGATTTGTTTTGTACATACATGCTGCTTCAGTATTGGCAGGTACCTTGATGCTTAAATT
ATCAAATATTATATGTAAATATTTGAGTATTTGCCAGACATGGTCACGCTTTTTGTCCCA
CATTGGAAACACTTCTCTCAGACTTAAAAGGCCAGTGCTTGCGTCAATAGCAGGATGATA
TAAGTTTGACACAAAAGTCAAAACAGGTGTTTCATCGTCTGGAAATTTTTCAGGCAATGT
AATTGTAAATCTAAATACACCTCCTTCGTAGAGACCAGATCGAACAAAAATCACGCCGTA
CCAAAGAAATGAACTCTCATAAGAAGGTATAACATAGATTCCATGTAAATTTTCTGTTTG
CAACATACGGTATTCTGTCATTATTGTATACTCTTGGTGAAGCATAGAATAAAGTTCTCG
GGTTTCTTTATTACTAGCACTCTCTTCAGTCATTATTTGTGTTTAAAATTTCCTATGTTA
ATATCTAATAAACTATCAAAATTACGCCGTTCTTGGTGGGCGCAATATTATTATTATGAA
TAAAAAATTAGAGAACTATGTAAATTACTCCTATTTGG
(2198 bp)

- SilkBase 1999-2023 -