SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoOtmSK_comp14090_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr5
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC106719761_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0006313 P transposition, DNA-mediated
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level		FPKM:1.98 TPM:2.13
ORF EntryO_BomoOtmSK11852_complete:A_BomoOtmSK_comp14090_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
CATTATTATTAGGGAGTCCAACAATTGGACTCGCACGCACGTTTGCAATCGAACGACACG
TAGTTATTTTGCACCAAGATATTTTAAAGTTTTACTTGTTAAGAGTTACAGTTTCATCTA
AATTTTGTTTAAGTAGACATTTCAAGTGACAGCCAATATTATAATTTAATTGTATTTAAA
TAATATTAGTCAGTTTAAGTAGAATTTGTGTATAATATTTTATAATTTTGATTTAGCATC
TTCAGTAGTGAACAGTGATAAACATCGCGGTAAAACGCGTAAGTGACGGCTGCTGCCCGG
CGCTTAGGCCCTTTTAATCGCAAACTCGAGTGACTAGCGTTGCATATTCGTTTATAATCG
TGTATACCCACACGATGAGTTCGTGCTTTGATTGTCAACAGCTCATCAGTGCAGCGGATA
AATTATGTTGTTATGAATGTAAAAATAACTACCACTACGGCTGTGTTGGATACACAAAGA
CCTCCTTCGGTAAGCTTGCGGCTAAAGCTAAGTCAAACTGGAAGTGTCCAGCCTGTAAAT
TACCTCCAAAAAACGACGCTATTACTTCTGTTAAGTCAATATTCGACAGTCCTCCGCCCC
ACGCACCCTTACCGTCGGTGGCGGGTAATTTAGATGAATATTTTAGAAACATGGAGTTAT
CGCTTTTGTCGAAACTTAAGACTGAGTTGGTCTCTTTAATTGAAGAAAAAATACTTAAGG
ACATCCAGAAAAAAGTAGGTGCAATACCGCAAGTAAAAACACACCTTGATGAAATAACGC
AAAGTCTGAGCTTGTTGTCGGATAGGTACGATACAATAATTGCAGAAAACCAACAATCAC
GGGAAAAGATCAGTAGATTGGAGAAGACAGTTTTAAATATTAACAATAAGTGTGTGTATT
TGGAAAAGTGCAACGTTGCGCTTGAACAGGAGATCCATGAATTCGAGCAGGCTTCTCTAA
ATGACCGCATAGAAATAGTGGGCATCGAACAACTACCAGGTGAAAATCTCAAGGAGGTTA
TTTCTAAGGTTGGGGACATAATTAATGTAAGTACATCAGAAATCGAGTGGGCCAGGCGAA
CCACGACCACCCGCCCTCTGAAAACTAGCGCAAAACCGGCACCTATAGTGGTGAAATTCA
AGGCCTCAGGAGCTGACTCCCGTGACACCTGGTTGGCGCAGCGCCGTAAAATTATGGAGG
TGACGAGTGACAAAATCACAGGTGGATTGGCCACCAACAAAATATACATCAACGAAGCAC
TTACTAAGTTAACTAGAACCCTGCTGTGGAACACAAAGAAGCAGCTTCATGGCGTATACA
AGTACATATGGGTATCTAGTGGTAAAATTCTAGTTAAAAAAAGTGAAGGTGAGAAGTCAA
TATGCATCCGTAATGAAAGTGAAATCGTGACCTTACTTAACATAAACTGAAGTATTTTTA
TTTTTATTAACTACCTAATAACTGGTATGTTTGTGTTTAACTATTCTTATAAAATTCAAC
GATTCATTTCAGTTAGACATAATAATTGATGATGAATCTATTAATTATGTATGTACTGAT
AGCATAGATAATTGGATAAGTCAAAGTATCTACAAAAAAGAACTATGTATTATTCACGTA
AATATTCGTTCTATAAAAAAACATTTTTCAGAACTTTTAGTAGCGCTTAACGACCGTCTT
AATTATATAGATATATTAGTCATAACTGAACCTAACGTCAATTATTCTTTGTTACCATTT
TATAGCATTCCTGGATTCGATGTTAATGTACACACTCGTTGTGGGCGTAGAGGTGGAGGA
GTGTTGGTTTACTCTCGCGCGGGGTTGTGCGCGCGGCTTAATCCTATCCTTGTGAATGGC
GAGCGCGCAGCCGAGTTTGTTTCCATTGTTTGCGACTGGCAAGGTGAGCAATTACACGTC
ATTTCAATATACCGTCCACCAAGATATAATAATCAGAATAAAATCCAAGAATTTTTAACC
TACTTTGAAAAACTTTTACAGTCATTATCTACTAGTGACAAAGTAATAATATGTGGGGAT
ATAAACATAAATTTATTAAAAGATACAGAGAAATACGTAAAATGTTATGAAAATTTAATA
GCCGAACATGGTTTTACAAAATGTATTAAAGACGTGACAAGAAGGGAAATTTTAATGGGT
AATGTAGTCGAATCATGTTTAGATCATATATTTATTAAATCATCCTCAGCATTAATCGAT
TCTGCAGTAATAAAACATAAAATATCAGATCATTATTTGGTCGCGGCATCTGTACAATGG
AAACAGACCCCGAATGTAGCTCACTCGGGCGAGGTGTGTGAATCATGCGCTGCGCCCGCC
ACTACCACGGCCCAGTGCCACCGCCATGTGCTTGATAATAGATTGGTCAGAGAAAAATTA
TTAGAAACTAACTTCAATCATCTCTTAAATATTGATTGCCCATTTAAATTATACGACGAG
CTATCAACTTTATTTAGAGACATATATAACCAATGTTATAAAGTAAAAAATATGACTGGA
AACAGAGACTATAGAAATGAAAAGTACTGGATAAACAACAGCTTAAAAAATATGGTTATT
GTAAAAGATAGATTATTCAAAATATGGTGTAGCGATCCAAAGAATATGGTAAAAAGACTA
ACTTATACTAGGTACAGAAATAAATGTCAAAAGGTAATTTTTAAATGTAACGTAGAACAT
GATAAAAAAACAATTTTAGATTGTAATAATAATATTAAAAAAGTTTGGGATAAAATTAAT
GAGTTATTGGGTAAAAATAAGCAGTCTTTGGATAATCTAATCTTAAGTAACATAACTAAA
CAGGACGGCACGCAGGCAGTCTGTAATGAATTTGCTGATACATTCTCAAAGGAAATTGAT
CAAATAAAGCACTCCTGTGATGAAAAATGGCTGGAAAGGAAGACTTATGTTAAATTGTCT
AATGTGTGTATGAGATGGCAACCGGTTAATGGCAAGGACATAAAACTAATAATTGATAAA
ATGAATAAAAATAAATCACCGGGAAGTGATCTTATACGCATGTCTGATTTGAAAATAATT
GTTGATAAGATTAGCCCTGTTTTATCTAAGCTGATAAATCTATCTGTAAAATACCACAAA
TTTCCACAAAAATTAAAGGAAGCAATCATTCGTCCGGTCCATAAGAGAGGTGATCGTAAA
GTATTTTCGAATTACAGACCAATAGCTATACTATCAAGTATTGATAAAATTATGGAAAAA
TGTGTTATCAATCAAATAGGAACTTTTTTACAAAAAAATAATATCTTAACGGAATGTCAA
CATGGCTTCCAGAAAAATAAAAGTACCAACACCTTATTATCAAATTTTACGGACGAAATT
AATGCACATTTGGAAAATAAAAAAATTATTGTAGCTATTTTTTATGATTTTAGGAAGGCT
TTTGATACCCTACAGACTGAAACCCTCTTAAATGGAATGGAGGAGTGCGGCCTGGGGCAG
CCGCTGAACCCTTGGTTCAGCGACTATCTCAGGGCGCGCTCTTATCGTGTGAAAGTCGGC
GATGCGTTCAGCGAGGAGAAACAAGTAAACTGCGGAGTTCCCCAGGGCTCCGGATGTGGG
CCCGTGTGTTACCTGATGCACGTAAATAGCCTCTGTGGAGTATTACGTCACTGCTCCGCC
CACATGTTTGCCGATGACCTTTGTACTCTGAGCGCTAGTACCGACCTCGCGGAAATGTGT
CGCCGGGTTCAAGAGGATGTGGATGCGGTAGTTAAATGGTCACATGATAACGGCATTATA
TTAAACGCTGACAAAACAAAGATGATAATTATTCACTCCCCGTATTTACGTTCTATTGAT
AATCCGCCTCCTCTGATTGCCCACAGCTTTGATTGCTTCCACAATAAGAAAATTAACTGC
ACGTGTAATCCTATCGAAAAAGTTAATTGTGTAAAATACCTAGGAGTAAAAATAGATACC
TCTTTTTCCTGGGATTCCCACATAGAATACTTATGTGGAAAATTAAGAATATTACTAGAA
AAGTTTTATTATTTAAGTATTAAAGTTCCATTGCCAATACTAAAATGTTTATATTTTGCA
CTAGTGGATTCCATAATAAGTTACGCTCTTGATTGCTATGGATTAACATTTAAAACATAC
ATAGATAAAATAGAATCATTGCAAACAAGATTTTTAAAATTACTCGTAAATAAAAAGACA
AAGAATCAATGTAAAGGAGATTACTCTAAACTATATAAAATATGTAAAATTATACCGGCT
AGCCTGAAACATAAATATCTTCTACTTGTAAACAATCATAGTAAACAGGATCGTTTAACT
AACTTGGTGCAACATAAAACTGGCACAAGGTCAATGTCCAAAGGAAAATTTGAAATACCC
ATGGTACAAAATTACTATGGAGATAGAACGTTAAAAAAACGTGTTCCATACTTACTCAAT
AGTTTACCCGAGGACATAAGACGTGAGCCTATACTTGCTAAATTTAAAAGCTTATTAAAA
AAACATTTGTTAAATACGTTATAACCATTTACGTAAATTAATTGTGTTATTATAGTATAA
GCTAGTTGAATGGTTTATACGCTATGTTTGTATAAAGCGAGTTACCTGCAGTCAAACTGC
GTAAGCAGTTTTGCGGGGCATGTTTTGAATGTAAGTGTAACTTCTTATGAATAAATATAT
TACATACATACATACATACATAAACTTATCAACTATCGAATATAATCTGATGAAAATCTA
AGCAAGCAATCAAGGACAGCAATAATGAGCTGACCTTGTTAATTGAACATTAGTTAAACG
AATTGGAAAGCTTCTGGGGTGGTTAATCTATACATATAAATAAAA
(4845 bp)

- SilkBase 1999-2023 -