SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoOtmSK_comp13929_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		protein_phosphatase_1L_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000165 P MAPK cascade
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0004721 F phosphoprotein phosphatase activity
GO:0004722 F protein serine/threonine phosphatase activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0006470 P protein dephosphorylation
GO:0007178 P transmembrane receptor protein serine/threonine kinase signaling pathway
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0030148 P sphingolipid biosynthetic process
GO:0043169 F cation binding
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0070062 C extracellular exosome
Transcript
Level		FPKM:6.50 TPM:7.01
ORF EntryO_BomoOtmSK11496_complete:A_BomoOtmSK_comp13929_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GGACATTGAATTTGATTTTGATTGGGTGTATTTATATTGTATACAAAAAATACTGCTGAT
CAAGTGTAATAAACGTGTTTAATTAAGCCTTCTACTGTGTAAATAAGTAATTCTGACGGG
GACATGGAAGACGAGATAGAAGACAGAGTATTACATCAAACATACGTTTCTTTTGTAAAA
ATATTGTCTAGATTCACCAGTAGCACTTTTCTTGACGCTCCTGTGAGCTATTTATGGAAA
ATGGTGCGTCTTTATTTTCTGCGATCTGAAGTAGTTGTGATCACACTAGCTATTGTGATC
TTCTTAATGTATCTTCAAAGTATAGAATTATGGAGTCGAACAATGCTAAGCAGACTGTCG
CAAGCCATGAATCCTATGAGCGCTGTTCAACGAATGAAACTCATGGAGGGATCCGATGCA
GACAAGCAAAGTTGGGAACTGAAAGGCACGTTAAGTGCTGCTTACGCAATCAAAGGTAGA
AGAATGCACATGGAAGATAGATTTATAATAAACGAAAATGTAAACAACACAGGCATATCA
CTATTCGCTATATTCGATGGACACGGCGGAGAGTTTGCTGCTAACTATGCCAAGGACCAT
CTTATACAGAATCTTTACAACAAAATTGTTGAACTTAACGCTTTCAAAGAAGGTAAAATA
TCTGATATATCTAGAGAAATTATTGAGGAGTATGCACCTAAAGAGGAAAATGTTGAACGT
AAAACAAGCTTCAAAAAGTCAGTTAGTACTGCAGATGATACATCAAAAAAAGAAATAACA
GATCCTGAATTGCTTGCCCAGCTTTCTAAAGCAAGGCCAATCATTACCCGAGAAGTGCGG
ACCACAACTAAGCCAGTTAAGAATATCAATATACCATTATCTAGTTATATTGACAAAGGA
AAAATTAATTATGGAAAATTATTGACTGATGAAGTTTTAGCAGCAGATAGATTACTAGTA
GAAGCTGCAAAAAAGTCTTTGAATGTTGCCGGCACTACAGCCCTTATTGCAATAATGGAA
AATAATCATCTGATAGTGGCCAATGTTGGTGACTCCAGGGGAGTCATGTGTGACTCGAGA
GGCAATGCTATTCCTGTCTCGTTTGACCATAAACCACAACAGGTAAGGGAACAAAAAAGA
ATTGAGGCAGCAGGAGGTTACATTGCCTATAATGGAGTTTGGAGAGTTGCGGGTATCTTA
GCTACTTCAAGAGCTATGGGTGATTACCCACTCAAAGATAAGAAATTTGTCATAGCAGAT
CCAGATATACTTACTTTTAACTTAAATGATCATAAACCTATGTTCTTAGTCTTAGCCTCT
GATGGTCTCTGGGACACGTTTACCAATGAAGAAGCTGTGAAATTTATTAAAGAAAGACTT
GATGAACCAGATTATGGGGCAAAAAGTTTAACACTACAAGCATATTATAGAGGATCAGTT
GATAATATTACAGTTTTGGTCATAAACTTCCTAAATACCAATATAACCATCGCAGGAGTT
CAGTAGAAATTATAATTTTATTCCTTAGTTTAGATCTTCATAAGAGATTTCAAGGTACAT
TTTTCACAGTTTTCTAGAAATTTTATGCCTGATAACAATTAGGTCTCATACTTGGAGTAA
TTTGAACAATTACAGCAATTGAGAGCCATGATAACTTATAAAGAATACCTTCTGAAAAGT
TAATACAGAATCTTACCATGAATACATAGTGCATTTGAAGAAGTATTTATTTGGAATCTT
TCCATCCAGTAAAAAATTTATACTATTTTCTAAAAGATTACCCTAGTGTTTTTATATATA
CATATATTGTAAATAAATAAATATGCGCAAGACAAGTAATTAATGACTAAAAACCCCAAA
ATTAAAAACATTAATGTGGCAAATTTTCTTTTGTGTGAAAAAACAAATTAATAAAATAAC
AAGGATAATATACATTTAATGTTTTATGAAGTTGAGGGAGGATAAATGTATTTTTACTAA
AGCAACTATTCTGAAAATAAAGTTTAAAGAAAATGTTTTTAACTAAAAAGTAAATTTGTT
ACTTAGACCAAAGTAACTTATATTTTATAATGTCGGATGTGCATGTACCTAATTATATAT
TTTTGAAATTTAATATTTGAATTTATGGATGGTTGTGAAGTGTATGCAGATTTTCATAAA
TCTATTTGATGTTATTGATGATAAGATATTCTGAAAAAAAAGTTGTTCAACAACATTAGA
GATAAAATTATGAACTTATCAGGTGTCATATTTGTGTACAAGTAGTTAATAATATATAGT
ATGAAAACAGTTGTATGATAAATATGAATGTTGTAATAGATATTATAAAAGAATGCTATA
AAAATGCACTTTTTCCTAAATTTATTTCTTATATAATAAATATTTTGGACGTTTATATTC
ATGAAAGCCTCGATATTTTTCATCTGATTGTCTGAAAAGTACTTACATTAACTACAATAT
TCAGCTTTATTTACAATATATAATGTTTATATAATCGTCTGAATTTGCTAAGATAGGTAA
TTATTTTTGTTCTTTACTAACACTGTTGTTATGTTGTTGAACTGTAGTTATTATTTTGGC
TAAGTAAAAACAATGCCCCCATAATTATTATGTTGCCTGTGGTGCTAGTCATTTTTTTTT
TGTTATTTTTGTTGTTTGTAACTTTATGCAAATATACCATAGGAATAGTAAACAGTGTGA
GTAAGATTTCCATAAAATCTTAAATTACTTATCTATGTTGTCATCTCAATAGGATTATGA
AATTCATTGGTGTCAAATAAAAAAATGTATACTGCTAAAATTATTTTTGTACTGCAAACT
GTGTATTGATTATTGCTGACCTCATTGGAAAACCTACAAGTGTTGCATGATCAAAAGGTT
ATCTATGACTTTTTTATCTTTGGCATGAATCATACATAAAATATATTAATTCCTCTATCG
CGGTAATGAGATGTAATTTATGGACTGCAAATTAATACTAGTTGGCTGCGGTGCGGATTT
TGTTCCCCGTGACTAGTTTTTCATAAATATTTTATTTTCTATTGTGGACTTATCAAAAAC
ATTACCGAATCGCTTAATCGTGGACAGATTTTACACAACGAATTTTTGGCGGATATTTGA
TTTAAAAAGTACCTACATAAAAAGAACCAGTTTTTTTTCTGATCTAATAATAAAGTAATC
ATCTTAACGCGCTACATGGAACTGGTTAAATTTTATCAAACTTCTCTAGATACATGCCAT
AGGTACCGCACCTTGCCACTTATCTACGCTGGGTTTTACTATGGATTAGTTCAATCCTTT
CGACAATATTGACTAAAAAGCAATTTTTATACCCAACGCCTTATCGCCATCATCATGTAC
ATATATGTTGGGAATTAATTTACTTTTACTTAAATTTTATCCTTAGCAATTAAATATTAC
AGGCTTTTACTCCAGTACCTAATTGACGAAAATGGAAAGTGTGCAAGCGATCTATCGGTT
GGTAGGTAAACTAGGTGAGCGCAAAAAAAACCCATGTGCGTACCCGCATAAATATATTTT
TTTAAACTCAGTTTTATCTATAAAGACCAA
(3570 bp)

- SilkBase 1999-2023 -