SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoOtmSK_comp13578_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr26
NCBI non-redundant
(nr)		equilibrative_nucleoside_transporter_2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005337 F nucleoside transmembrane transporter activity
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005768 C endosome
GO:0006810 P transport
GO:0015858 P nucleoside transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0031902 C late endosome membrane
GO:1901642 P nucleoside transmembrane transport
Transcript
Level		FPKM:10.61 TPM:11.44
ORF EntryO_BomoOtmSK10590_complete:A_BomoOtmSK_comp13578_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AGTAGATTCATTCGCGAAGCAGCTACTCTTGAGTTTTTAGATCTCTTTTGGAGGTGCTCG
GGTATCTGTTAGAAAGTCCCACCCCTCCTGACTGAGCCTTTGATCGACTACCTTATCTGG
TTAAATCGAAAAGGTCTCCGAGCTACCAGTTAACCATAAACTTAAAATTTTTTTACCAGT
CACCTAGTTCCTACACTATCAGTTTATGTTATTTATCAATGTTAACTTCAGTTCCCTTCT
ATAAATATAGTTTAATTTTAGCATTTGTAACGCATTACACAATTAAACAATAAAAAGAAC
CCGTCATAATCGACTAAACTGTTGTTTACAATATCGATATCGATATGAATTGATGGTAGT
TTGAAGAATCGATTTTTTTTGGTTGTAGTAGAAACCGTAAACAAAATTATCGAATATATA
CGATTAATAGGATGAACTAAAGAGATCGAATTTTAATTTTGTTATACATAATAATATATC
GTCCATAAATTTAGTTTAGCATCACGTATGTACTATGTTACTAAATACTTAACAATGCAA
CAAATTTATATCGATATCGATAAAATGACTTTCTAAATTAATGTTACGTTTACATAAAAA
GTTATTTTAAATTAATTCAAACAATTCACCAACAGAATATTAGTCGCCTCAGTCTGTTAA
ATCTACAATACGATAAACAATATTCTTTCGATATCAAAATTTGGATAAGTCAGAATACTA
AATAAAATCACGTCCAATACTTGATTTCAGATTACTATTGCACTCAAGAATATAGGATAG
TTAGCATATTTTTAATTAGTAAAGTAATCAATTTTACGGCAAAGATTAACATAATTTTAC
TTAAACTTTTAAAATTGTAACAAATTTATAAAACACTTAAACAATGACATGTTTCAAGAT
AAATTTGGCGATACTACAGTATTTAAATTTTAATCAAAAAATATTTTGAAGCTAGTTAAA
TTGCTTACTAACTCGGATTAACTGTTTTTTGTTTCATGATAAATAACATTAAATTTAAAC
AATTTTTAATAAAAATCTTTATCAGACATTCTAATTTGACAATTTTTAGCAAAAATACAA
ATAAATATAATCTGATAAAATCAACATGAATACATTAATGTAAAATTTTACGTAGTAAGA
TAATAAGCTGTGTTACTACGTAAATAATGACCATTTTCAGTTTTCTGACAAACATGAACT
AATTATTAATTTAGTAAGTATTAATTTAGACTCACAATGGTAAGGCAAAAGTTTTGCTTG
TCATTTTGTAGTGTCAGTCTGGGCTTAAGAAACGAAATTCGAAACGTTGTCATGATTGAA
GAAATAAATATTCAATTATTGAGAAAATTTTGAACAGAAATTTGTTTAAATCAAAGGCAC
TGATAAAACATTTTAAATAATTAAATGTTGCATTCCTTACTTTTAATTAAAACGAAAATA
ATTACGATTATACATTCCTTATCTCATAACCAAGGTACATTTTGAAAGCATAACGAAATA
AGATTGATTTTTATTCATTATGCAATTGCAATTACTTGAAACAAACAAGAACAACCATAC
TTAAAAAATTATATATACGTAACATACTAATGTACATTTTATTAATTTGGTTTTAGATGC
AGTTTCCGTTACAAAGGTTTTTCTATGTTGATATTTTTATACACAACATAACGTTCAGCA
TTTTCTGTCTAAAAAGTATTTGAATATAATCTATTTTAATATCTTTCATCATTTTTGTCA
ATCATAAATTATTCTAGTAAAAAAAAAATACAAATTACTAATTGTCATTATTACATGCAA
GTTAACCATTGTATCAATAAACTTTATAAAAACTTAAAACATATCAATGATTCCACTTTA
ATCATACAACATCTCACAATCTTCACACGCAACTCTCAAATAATGCAGTGTCTCAAAACT
GCACTCGATTTTACACTTTCACAATTCGCGATATAAGTCACAAATTGCATTACGTTGATC
TTCAAACACAATAACAATATTTCTCAATAATTCCAACTATCGATATCAACTGGAAACACT
TTATTGTACGTCACAAATTTCACTGCACCAACGATTCGGACACCGAGCACAGTGAGTCTC
AATGTTTGTAATAATCTTTGAAACACACCAAGCGAAATTGCACTTTGACAGCTTTGTATC
AGGGTACAAATTCCAGCGGCCCAGAGTTCAGAGGCCGAACCAATCGGCGGGCAGGGTCCA
GCGGTAGTTGGCGTCCGTGAACATGTGCTAGATGCTCTTCCATAAGTCCATGGTGACGAC
GAGCGGACACAACCAGCTGAAGGTGATCCCCGACACGATGCCGGTGACGAGCATGGCGCC
GCCCACCATGCCCGCAGTGGACGCGTGCTCCGGGGACACCGTGCCGCTGACGTACATCAT
CCCCAGGCTGCTGCCGTGGCCCGAGCTCCAGCCGAACAGCACGGCGATGAGCCAGTAGGC
CCAGTCCGCGCGGACGAGCACGGGCAGCGTGCGCGTCAGCGGCTTGTAGTTGCACACGAA
GTACAGCGGGATGAACAGGAACCGTAGGGACGTGAACAGCGCCAGCCAACGTTTGTTTGG
AAATTGCCAGAGGCTGGCGGTGATGTTCCCCAGCATGGCGGTCACGTTGAACGTTATAAA
GCACGTGATCGAAACGAAATTTTTACCGAGAAATCCCGGAGTCACTGGATCAATTTCCGA
ATGCAAGCCGGGGTAGATCGCGAGCGTCACAAAGAAGGTAACGAATATGTTGTAGAGCTG
AACCCAGGATTGTGCGAAGATCGTTCCGTACGGTATGCTCCTCTTGTTCGGACTCGAATT
CTGATCGGTGGCTGCGAGGGCAGGGTTCACTCGCATCGTCCTCTCTTGCAGAGTATCGTG
ATAACGATAAAACCTATTAAGCGGCAATGCGAAATACGTGTCGAAACATATGAGAAGAAC
GAACATTCCAGCGATGAAGTAATATATGGCGGATGTACGTATGTTGCCGAACATGTCCGA
GGCCCACTGCAGTATCGCGACCAGCGTCCCGCATATGTTCGAGCCCAGGACCACGGCACC
GGTATACTTGGGCGGGAGCTTCGCGGCCAGACCGTAAACTGAATTTTGGAACACCGCGTT
GAATGCGTTCAAAAAGAACACGGATGCTATTGTGAGTCCGAAGAATGTCAGTGTCCATTC
GGTGCTGTCCACCATCGCCAATATCACGGTGAAGACAAATATGCACACTTCAATACACAA
TGACCAAACTATCCTCGTGGTTAAATTCCCGCCCAATTGGAAAAATATATTAAACCAGCT
GAACAGCAAATTCGGTATCTGACTCGCCCAGCCGATGTACGTGAGGAAGTTCTCGGACAA
GGCCGGCTCCGAGGCGAGTTTGTACGTCTCAAAATACGCTTTCGCTGTTATGAACATGTT
CCAGGCGGTCAGCGTTCCCAAGCCGTGAAGCACCAACGTCAGGTAAATGAGGTTCCATTT
ATCTTTCGGCGGCGTCAGGTCCATTGCTATACCTTTCAAGTTGAGCGTGTCATTGGGCAG
GTTCGTGGCCTCCCAAGCGGGTGTCAGTTTCACCGGCTCGTTACGTAGGAACGGAGCCTT
CTCGCCATCCTCCCAGCGTCCAGTCCGCTGGCCGGGCATGACGATGGCGCTCCTCTGGTC
ATGTCTTAGGAGGCTCTCGGCCTCCGCCCCACCTTGATGGCTCATCTCCATGTTTCCGAC
GTTGGCCTATATCATAAATGTGATACGGACATCTGTGCAAGGCACCGGCTTCGGAGTTCG
TCCTAATTTTACTGTGTCCTAAATAAACTTTTCAAGAAATCTATTAAGTTTTCACTATAC
ACAAACTTTTTACTATTAATAACTACACTTTTATTTTTAAAGGGTTAAGCACGTCCAACA
CGCGCGCGTCTCAATGTTTCCTTAACACTTG
(3931 bp)

- SilkBase 1999-2023 -