SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoOtmSK_comp13551_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Chr9
NCBI non-redundant
(nr)		GTP-binding_protein_SAR1b_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0005525 F GTP binding
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0006810 P transport
GO:0006886 P intracellular protein transport
GO:0007264 P small GTPase mediated signal transduction
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016192 P vesicle-mediated transport
GO:0032580 C Golgi cisterna membrane
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:2.02 TPM:2.18
ORF EntryO_BomoOtmSK10518_complete:A_BomoOtmSK_comp13551_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
AGAAAATATTTTAATGAGGTTTCGGTCATATTACCCAATTCAATAATCCTGCTGCGTTTT
ATATTTGTCTAGTCGTGTGTGACGGCATGGAGGCTATAAATTAAAAATCTTGTGGTTAAT
TCTAGCTCTTGATGCTGTTACGCAGTTGAAACTAAAAAATATTTGCAAGTCATTACTATT
GTGCCTTAGTCTTTGTAAGAAAGGTGCAAATCCTGAATGTATAGTTGTTACGTTACGTTC
CAGATTCAAAAATGTTTATCCTCGACTGGTTCACTGGAGTGTTGGGATTTCTTGGTCTAT
GGAAAAAGTCAGGCAAGCTCTTGTTTCTGGGACTTGACAATGCAGGGAAGACAACACTCT
TACACATGTTGAAAGATGATAGACTTGCTCAACATGTACCTACTTTACATCCTACATCCG
AGGAACTGTCAATAGGCAGTATGCGCTTCACGACGTTCGACCTCGGTGGGCATCAGCAGG
CGCGTCGTGTGTGGCGCGACTACTTCCCCGCGGTGGACGCCATAGTGTTCCTGGTCGACG
CGTGTGACCGGCCACGTCTGCCGGAATCCAAGGCTGAACTCGACTCGTTGCTCACTGACG
AGACGCTCAGTAACTGCCCTGTGCTGATTCTCGGCAACAAGATTGATAAACCCGGTGCTG
CCAGTGAAGACGAACTACGTCACTTTTTCAATCTGTATCAGCAGACCACTGGAAAGGGAA
AAGTATCGAGGTCCGAACTTCCCGGTCGGCCGCTGGAGCTTTTCATGTGCTCGGTGCTGA
AGCGTCAGGGCTACGGCGAGGGCTTCCGCTGGCTCGCGCAGTACATCGACTGAGCGCGTT
GCATCCGCGTCATCAAGCTTCGTCAACGTAGCTGCATATTTACTAAGACCGATACTTTAT
TTTACAATTTTATTCATGAAAAATATATTCCTGGTAAGATATTAAAAAAACGAGTACTGT
GAACTTACCTGTCGTGTTATATGATAAAACAGAGTAGATACATCTTCTGGAGCACTAATT
ACTGGTTTCAAAGTTATTGTTAGTGATGAATACTAAGTATGGCTCCAGAAGGTGCTTCTC
TCTGCCTTTTTTTATTTCAACAAACATTTAAGGAAGACAAACGGGACTTTTGGTTAGAGT
CGATTTTTAGAAAACTAAACAGATTATCTCGAATTTTACGAACCGTAGTAGTCTCGATAG
AAATATTATAATAGTATAAAACTGAATTAAAAGACATTTGAATGTTTCCAAATGTTATGA
AAAATTCTTATCTTAAGTTTACAAGTAACATTTCTAAAGTAATGTATCACATTGAAGAGG
AAACACTGTAATAAATGAAGTTGTAATCAGCTTAAAATAATTTAAAAAAATCTATCGAAA
TGAACATGAGAGGAGACTAAAGTATGTACCTGTTTAAAGATTCATCGACATTGAAATGTT
TTAAAATTTTAAATTTTATAAATGCAGAAAAATTAGATGATAATATGTTCTTAATGAATT
TAAATATGTTTAGTGTTGTAGTAAGGTAAGTAGCTACGTTTACAAGTAACATTTTAAACT
TCATTATAGTCTTAACGCGCAACGCTTACAGACAGACTCCTTCTCTTGATACCAGCGCCT
TCACTTAAACTTTATTGTCTTCATAGGGCCGATTCTACTCCGCTTATAAATAGTATGTAT
TGTTTCATTGTTATTTTCGTCCTAAAATCTTATGTATAATCACGATTCAGTCAGTTTTCA
TTTAGATGAATGATTTTCATGCGGTCAATGGCTTAAGTCAACATGTGGAACAAATAAAAT
CATGTATGTATGATTTGTTATAATATTCTTATCTGTAGTCTAATATTTAGACCAGAGTTT
TTATCAGCTAATGTCGTATAGATGATATATGGCATATCGATAAATAACCTTCTGTCGGCG
TTACGTATTATACTCGTTTTCCAGTAATGTTTGTGTTTGAAGTACTGCTACCACTAAGTT
CTGTAATGCGTATAAGATTTTGTGACTAGATTACACTAGACAGGTGCCATGTTTCTCCAA
CATGTTTATTACTATTTTTTATGTTGTGATTTTCTTATGAAAGCTCAATGTTACAATGTT
TTCGACTTAATATCGTGAAGCGTATCCGAGTGCTGTGAAAACAAGCATTCCTAGAAAGCG
AGTTAGTGATATTTATAAAATGTTTTGTGCCCTAGTTTGGTCTGTAAGTATTCGTAATTC
ATATATTGAATCATTAACCTTAAATCTAAAGGATGAAGGTTTATTCTTGTAATTCTTTAG
GTTTATGAAACCTTGTTTTTCTTTTTAATTTGGGCAATGGTGCAAAGCATGTCCAGCCAG
ATATATCCTCATGATGGGATATTAATAATATTTATATTTGCGAATTCGCGTCGCGTTCAA
TTAAGCAGATTTTAAAAATTCTCCTGGTATGTTTATTTGTCATTATAATTTATATTATGT
ACGTATCGTCTTTGGATTCAAACTGTATAAAATAATAAATAATAATTAAAATGACATTAT
ATTTATTTTCTTGATTTCATTCCAACATTGAGTGATGGGCGTTCTGCAAAACTTCAAATC
GTAATTAATGTTTTTGTAAATTATTTTCTTGTATTTTTTGGGCTTTGTATTAGAACGGTT
AGTCTGAATACTTAACGGCTATTAATTATGTAATTGTAAGGATCATCTCAGTGTGATATA
ATAGGGTATGTGACTATTTAAATTATTGTTCGTTTAGAGGCCTCAAACTCTTGTGACGTC
ACACGTTGGTGAGCAGACTGTGACCTCGTCTGACCTTGTTTCTGTCCAAAAGTATTTTTA
TATTTACTGTTATGTTACGTCACAAACATCACGTGACTAGAAACAATTATTTGGGTGGTT
TAATAATAGATACTTAAGTACAGATTTTTGTTGTACTAAATTTAAGAAGCTACAGACTTA
CTGATTTAAATATTGCATTCCCTTCTCTTCTCAAATTTATTTTCACTCATACAAGGCGGG
GATGCCGTATGACCATACATATAAATATGTACTATAATACAATTATTGGCTTTACTAAAA
ATAAGATTTATTAAAGTAAAAAAAGGGAAGCAATGTTGAAAGCTATTACATGTATTTTGT
AGCGATTTCTTATAAACTGCTCAGGCGAAGAATCATCAAATGGAAAATATATTCCCGTAT
TTTAGTTATATTAATTTAAATGAATTATTTTGCGTGTGCGGCCTCAAAACTTTGCAATAC
ATTACTTTGTCACATCTAAGGTGATACCGTGTGCCCCACCCGCAGTGTAACGTAAAATAG
TCAAGTACCCTATATAGTTATTTTTTTTGTTTTTTGAACATCACATGTGTCTGTCGAGTT
GGCAGTATTGGTGGGTTGGTAGACAAGCCGTTCTTGGTTCATTCGCGTTCAGCTGGCTTC
AGCGCTGCGCCCTGCGTCATCTATACATTTGTTTCGATAATCTGCAGTTTGTCTTAAAAA
CAAAGTTTGTAATAAAATTTGTACGAAATATTTGTTTTGTTTTAATGTTGTTTTTAGTTT
TTATACAAATACATTGCGATACATACTATATGTATTACTTTGATTTTTTTAATTGAAACT
ACG
(3603 bp)

- SilkBase 1999-2023 -