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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR30582_c6_g1_i12
Scaffold_idBomo_Chr8
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_CBP80/20-dependent_translation_initiation_factor_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000184 P nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0003674 F molecular_function
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006417 P regulation of translation
GO:0006446 P regulation of translational initiation
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
Transcript
Level		FPKM:1.77 TPM:2.36
ORF EntryO_BomoN4EE13066_complete:A_BomoN4EE_TR30582_c6_g1_i12
Sequence
(Nucleotide)
GCATAATTTACATTTTGGAGTCGCGCCAAACACCAATAATGTGACCTAAAACAAAAATAA
GTGGCTTGTATTGTGTGCTCTATGATCATTCGTCGTCATTATCGCCCTTTATTTTGGCCC
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ACACGGGAATTTGGCATAAGAGCTGTTTGGTACCGCATCGAGTGACGTTTAATTTTGATA
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GGCACCTGGTCTCGCGCGCAGTGGAGTCGCCGCGGTACGCGCTGCCGGCCGCCCGCCGCT
GCATCGCCGTGGTTGAGCGCGAGCAGACGGAAACCTTCCTCGAGTCGCTGCTTAACACGT
GCCAGCAATGGTACCACGATAGGGACAAGCTGTTGGGCGCGATGATCGGCGGTGGTCGAC
CTCGGTTGATGGCGTTCCTGTCGTTCTTGCTGGAGATGTACTGCCAGCTGCGGCGCCGGG
CCATCCAGCGACGGGGAGCCAGCGCCCAGCCCGGGCACGTGCTGCTCGCGCTCATCTGCA
AGTGCTGCGAGGACTGCATCAGGCAGCCGGTGCCTTCTGCTAGTGATACTGAGAATCTGT
TCTTCGTACTGACGTACATAGGCCGAGACTTGGAAACTCAGCTACCTGGAGATTTGGAGC
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GTACTTTACTGCAGCTTATAGAGCTTCACGCATCCCGGTGGCAGTTACCAGGATGCGCAG
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TTTATCGTCACTTTCATGCAACAAATTTTAATAAAAATATTGAAAGTGTGGTAAAGTGTA
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TTGTGATATTATAAATTTAAGGTTTCTGGTATATTTTTTCTGTCCTAACCAAAGACTGTA
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GCGATTTAAGTTAAAAATACGTTTGTAGAAAAAAGTTGAAATTAAAAAAATGATGCTAAC
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TTTTTTGTTACCGCTGTAGTTTTTGTATGAATAAAGCACTTAAAGGATTATAACAATAAA
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TGCACTAGGACGACTTGCACAAATAAACTACCCCCACTCAGTACTAATAATGTATGCAGG
TGTCCTGATCGGAAATAAAACCTAAGTTGCCTTTAGGGCAGCGTTCTTTCATTTAAATTT
GGATACACGTATTTAACGGATACACCCAAAATTTTGTTGTTTAAATATTCTATAGATGAA
CTATATTCTACAGCTGAGAAATATTTATTACCTATTGCAAAACGTTTTTGTGCAATTTGC
TACATATGGGCTGAATACTATGAATTAGACTCGTTGCTGTAATAGTTAGCACTCCTGAAT
ATTGCGCCGGCGGTCGTCGGACAAACATGCGATGATTAGATTAATTTGCCTTTTAACTAT
AAATGGCTCTCCTGTAAAGTTACAAGAATGTCACTAAAACCAAGTAGCCTTTCATCCCTC
GATATCATCATCATCAGCCTGCGGCAGTC
(2789 bp)

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