SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR30574_c1_g1_i6
Scaffold_idBomo_Chr25
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_zinc_finger_protein_OZF_isoform_X4_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:9.70 TPM:12.91
ORF EntryO_BomoN4EE12959_complete:A_BomoN4EE_TR30574_c1_g1_i6
Sequence
(Nucleotide)
AAATCTAATCAAGTGTCAAGTGTTGCCTGCCATTACATTTAATATACAAACTCCAACAGG
TCGCCCCCCAGGATCCAAGAACAAAAAACTCAAGTCAAGCAACGCAGATCAATCAATAGA
TATCAAACAAGAAGTAAATTCTGGACGAGTTTATGTTTGTACAATGTGTAAAAAGTCCTG
TGATGAGGACAAGTGGGAGAGTCACGTAGAAATCTGTCGTATCAGTTCTAATATTAAGCA
ACAATATTGCTGTAAAGAATGTGGCAAGAAGTTTAAGTTCAAAAAGAGCTATCTTCAGCA
CATAGAATTGAATCACTCCACATTACCTAATAGTGTTGCTTGCACAAAAAGTAAAATATG
GTGTCCAAATGAAACTGTTCTGAAGGAACACATAGAGACAATACACAAAAGAGCTTCGTA
TGTATGCCCAGAATGCAACAAAGAATTTGTAAGACGTTCTCATGTAACTCGTCATATGAC
ACAGAGTGGCTGTAATGGTCATCAGTTAAATTTGTATCCTTGTGAATGGAAGTAGATCGT
GAACATTTGTTAACTACGTATTTCATTAGACAAAATTGGTACCCGACTGGGATTCGAATC
GTATCCTTTAGGCCACAATGATGACAATATGTGGGCAAGAGTGATTGATTACATATGAGC
TTGTCTAACATGTTTACATGGAGAATAGTCTTAATTCAATTTGCAACTCAAAATTCACAA
GGAAAGATAATTTGATCGTACATCTCAGAACTCAACACATACATAAAAGTGATAAATACT
TTTTTTGCAAGTCATGTACTTTTGAAACTAAAAACTTTTCTAGACTTGTAAATCATTGGC
TTTTAAAACATTCAGGTACACCAAATTATTATGAATGCTATCATTGCGGTAAATCTACTG
GTTCCCGAACAGCAATGGCCAAGCATTTAGAAATACACGGAGAAAAAAGCTACACCTGTG
AAGTGTGCGGCTATGCTACATACACGGTAGAAGTAATGCGGCGTCACATCTTAACTCACG
TTACGGATAAACCTTACAAATGCGAGCATTGTAACAGATCGTACATAAAGAAATCACAGC
TCCAGCGACATTTAGACAATCATGATATGCAGAAAATGTGCCTTAAATGTGGAGAAACTT
TCTCTACAACATGCCAATTGTTAGACCACAAAAACGTACACAAAGGAAATAGCAAATTCG
CTTGTCATTACCAAGATTGCCGTTTCTCTAAGAAACCATTTTTAAGTGAGGCTCAATTGC
AGAAACACGTAAAAGTTCACCTCGAAGATAGACCATACGAGTGCGAAGTGTGCGGCAAGC
GGTTCGCGGTGGAGCTGCACATGCGGCGGCACCTGTCCACGCACACACTGGAGCGGCCGC
GGCGCTGCATGTACTGCGTGTCGGCGCGCGCCTACGTGCGAGGCGAGAAGCTCGTAAAGC
ACGTGCGCGTGCACCACCCCGCCGTGTTCGGCGCGCACCTCAAGCACGTGCGTGCGGTCC
TCGGTATCGAAGCGAATACGGTGAGAGTGAAGAAGTCGGAACTAGAGTGTATATTGAACA
TGTTGGACGCGGAGTCGGATCGGATCATGGACGGCTACGGGGGGACCGGCGTGTTGTACG
GCGGCATGCAGGAACAAAAAGATGTCAACGAAAACAGTGACGAAAACATCTCTACGCAAA
ACGATAATGGACCTTTGATGACAGAAGAGGAGCTTTTGGACAACTTAGGGAAAATGCTGT
TCAAACTGATTGATTCAGACACACTCGAGTGTTTCGGTTGGCCCGACGAGCCAGTTGATG
TGGTGTTAGAGAAAGTGATCGAGCACTGCGGAGCTAAACCAGCGGATCGCACGATGTGGA
CGCGCATGCAACGCCTCCGAGAGAACACGAAGCATCTCTTCCTGTACGTGATAGACGACA
AGAACATCGCCCGCATGCTGGACACGCACACCATAGACCAGATCGTCAAACATATACTCG
CCCAAGTCAGCGACACCGACAAATGATTATGTTCGACTTCAACAGTGTGCCCCTTAACTT
ATTGAAGTCGATGGAGAATCCGCGGCATTGTCATACAGTACACGCGCGTGTCTCGTGGTA
GGACCTCTTGTGAGTCCGCGCGGGAACACTATCAATCGATGGGTTGTGACTTCAATAGAG
CGCTTTAGGTTGAAATAACGAATTATTTCAATTTGCATTTTGCTTATAAATTTGAGTATA
GTAACACATTTATTTTATGCAGTTGTATATCATATAACAAAACGTGATGAATATGTGAAG
TGATATCATATTATTATGTAGTATAAGGGGGATCGGGTAGACGTTACTGGACTTAAAATA
AATAATAATAACTAATCCAAGGTCAGGAATGAAAGATATTAGTGAAAACGTCCTATAGAA
CATTTATGATGGACCCTTCTAAATCAGTCTATTAATGAGCGTACGTCGAAGGGTTATTAA
TTAAAAAAAAAACTATAATATTCTTATGAAGCTTCGATAACTCTTATGAATGAGAACATG
TTTTTTATTATTATTACTGTAATTAGATGAGTATACGGCTCGATTAGGGATTGTGGCGTC
ATGTAATATTTGTTGGTGCACACAACATGAGTTGAGGCCGGGGTCTTAGCTTGATTTTTG
CGAGTCCACCATCTCCCGTAACGGGAGAGGGAGAGCTCTTCTTCCCCCAGGGCGTCGTGC
CACGTCGTCGACTATCGCCTCGACGACCCGTCGATCGGGCGTCCTCGGGGTGGCACCGCG
AATCTGGCTGTAGTGTTGACCGCGGGAACCGCGCACCGTTTAGTGCGATAGAACCCTAAC
GTCCTTGGGTCCGCGGTGTGCTTCCAACATCTGCAGATCGTCAAGTCCCGCACTCCCCCT
AGGCGCCTACCTCGTATGAGGTTCGGCCCGAAAAAAAATGAGTCTTAGCTTGGTCAATTT
GCGTTCCGAATGTTGTATTTAGGGCTTGTTTAAGCAAACTTTTTATTAAACCCCTCGAGA
TCTTTCATACAGGATGCTGCATCAATGAACAAGGATAGAGCTGATGTTATTTATGCCACT
TCCAAGACTCGGGACGCTGGCCGGCTCCGGACCCTCTCTGGCACCCAGCGGCTGCACGTA
GGGTCGTTTTACGTATTGGTAACGATTGAACTTTGAAATATTTCCTAATTCTCGTTCAGA
TATTATAAAATCTATCCGTTCGATTATGTACGCTAATCATCCCAATTAGCTATACCAATT
TGGATGTTGTAATATTATTTGCGTTAATTGGATTTGCGTCTTTAATTATATCTATCGATT
ATCATAGTAGTTACTATGGAATACGTGCTCGATCCTATTCCCTATCTGAAAAGCTGGGAG
TGTAAATCATAATTCTTAAAAATCATGTATAAATAGACCTTATAATATGTTCTATGTAAT
TTGCATAAATAGATTTTTATAATAAATGTAAAAAAAGTTTGAACAAATTTAATGCATTTT
AAACAGGATGTTATAAATCGATCAACAGTTTATTTTAGATCATTAAAGGTATAAAGGTAG
TGATGATACCAAATCAATTTAAAGTTATTTGTAATTACATTATGTACGGAAGTTGTTTGT
TTAATTTATTTAAGGCTTAAATATCGAATATATAGTGACTGAATTAAATAGAGCATGTGA
CAAATCAAACTTCTACTAATAATAGTAATACTCGTACATACTATGCAGAAATGTAAAAAC
TATAAAAAACTATAAAAACTATAGCAGGATTTCGCCTGTCGTCTGTTGCTTGTTTATAAA
AATAGATTTTAAGTCTTTTTAATCATGTTATCTTATGTTATACCTAAATATGTTTTAGAT
TGATTCAGCAAACCTTTGTTAATTTTTAAGATGCGTGATTGTTATATAATTCATTTAGGG
ATGCGGTAAATTATTAGGCTATGATAATTATAAAGAAACGAATTAGTATTAAGTGCCTTA
TAAACTTTCTATTTTTATCTATTACTTCGTTACTATTGTATAAATTGATTTTTGATCATT
TGATTTTTTTTTAAATCTTCATTCTTTTTTTAAATTGTTTTATAGCTTAATTTTTTATCC
GCTAATATATTAGTTAAGATATATAAACTTTGAAAATGCATATTTTATAAATATTGTTTG
ATAAATATGTTTTTGATGTTATTTCTTATTTAGTAGTTTAGGTCGGTTATTTATTAAAAG
CGGTATAATGTACTTGAGTTGGTGCTTTCCATATTTAGAGAGAAGGTATAATATCAAATT
TCACGATATCCCACAAATGTTTTTTTTTATTAATTTTACTACGAAAACCTTACACAGTTT
TACAACATATTTCACGGATATGACAAAGGAAACTTAAAGAACACCCTTGAATAAAATACA
AGCATAAATAAAATTAA
(4397 bp)

- SilkBase 1999-2023 -