SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR30572_c0_g3_i1
Scaffold_idBomo_Chr12
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_Down_syndrome_cell_adhesion_molecule-like_protein_Dscam2_isoform_X10_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0007155 P cell adhesion
GO:0007156 P homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0042802 F identical protein binding
GO:0048812 P neuron projection morphogenesis
Transcript
Level		FPKM:1.98 TPM:2.64
ORF EntryO_BomoN4EE12857_complete:A_BomoN4EE_TR30572_c0_g3_i1
Sequence
(Nucleotide)
GTTAAAAACAATAAATGCAAAGTAAAATCTAATAAACATTTGTTTACATTTTTAAAGTCA
TAGCGAATGCTTCTTTCAGAACGTACATAATCGGCAGTGTGACGTTAATCGATGCGAAGT
GCCAACTTAGCTTGGTGGAGTTGTAAATTAGTACAAGAAAATCAAAAAGATCAATAGATA
GAGTAAGCGCATTTCGTTTAACCGTGGGTCTATAATTTATAATATAAAATCAAAACTCAT
TTGACGCTCAAGTAGTTTATTAAACACATTTCAAACACTTTGGTACAATTAGATGCGGGT
AGCCATATCGCTGTGTAATACTTCCGATAAGCGGGCAAAACTCACATTATTTAGTGAAAA
CCTAATTCCAAACACATTTCCAGCGCGTTATCAATACCTATAGGTTAATTTTATAAATAT
TATTTAATTAAAACATCAGATTCGAATATTTCAATTTAATTCACATTAAAATTTCGTAAA
TCTTATTCCGAAAGGTTCAATTGGAAGTTTAAGAGAAGATATCGTTTACTAGGAAGTAGC
GAGAGCCTAACTACAAGCCTACGTTGCGATGCTCGACGACATTGCGTAACATTTACGAGA
AACATCTAGAAATAGACGAATGTCTTTCAACTAGACTTATAATAGAAGAAGAAAGTTACG
ATTATAATCCATAAAATACATCTTACCGCTAGAATAATAATATGAAAAAGTATTTAAAAT
TCCGTGTAGCAGCAGTAATTTTATTTTTGTGTTCCATGTATTCTGTGTCATAAGGACCGG
TCCTATAGTCCATATACATATTGCATAATTGTGAGTACGTTTATTTGTTGTGACAGTTAC
GATTACTATCCTAAAAATTGATTAATTTCATATTATGATCATATTGAGTAACATTAATGA
CTAACTAGCTACAGATTACATATTTCTTTGACAAAAAAGTTGATTAATAGTATCAAATTA
TAGCTAATCTTAATCTAAATAGTATATGCATAAATGCGAGTGAAAACAATATAACTAATA
AATGACACATGTTGGCAATAACGTAAATGGTAAAAAGCGCCAAGAAATATAACATTAAAG
AGGAAGCATTGTAACAACCTGTAAGTTGTGGTACATAATATTAATTTAAATAATGATCGC
GTTAGTATGTATGTACCTAGCAAATAAAAAGGGAAAATTAAAATATCACATAAACACCTA
AATGTTGAGCTTAATTGAAATCAGTATAATTCCGAGAAAAAAAATTTTACTCCGAAATCC
GTCTTTTGTAGTCTGACAATCTGTATTAAAATTAAGCTAAACAAATAAGACAAATTAATC
AGGTTAACTCAACACAGTGATCCTATAATAAATATGCCTCAGCCAGGTTCGTAGGATGTG
TGAGCCTATTGGGTTGGGTAAAAAAACACGCCACCTAATTACATATTTATGCAAATATAA
AATTTGAAATAACTACCACAACCATGATTTTCAGATGCATATGGTAACCCTAAATTGGTG
ACGTGTTGATGTCTACAGAGGGAAGGTGCTAATTTGTACATACCTCAGCCTGGGCAATGT
TTATTTAGGTCAACTAATTAAACTAACAATATGTAATTGGCACAAGTGTGCGCGTCGAAA
TTATTACAACTAAGAAATACAGTTCCAGCCAACTAAGTTGGGATAATCAATGACAAACAT
AAACCAGTGCGACACACGAAAGGTAGATTTGGCACTACGATTACCATCTTGCTGATAGCA
TGAAAGTCTTCTATAGCAAAGCATACTTTCTAGAAAAAGCAGGTTATATGAGGTGAAAGC
TATATGATAATATCGACTAGTATCAGCAAGAAGGTAATGGACCAATCATGTAAAAAATGA
GAGTAGAACGTGTGTCGCGTCGCATGGGAACTGTGACGGTTTACAAATTACACTGCCACA
GTATCGTAGGCTGTGAGTCCCCCCCGCCCGTGGACTGCTTGCTGGGGGATTGGGGTGGCT
GCTTCTGGTCCGGATAGTTTCGTGGCTGGTCGCACTCTGCTTCGGAGATCTCGTTGGAGT
CCTTGCTCTCGTTGAAGGAGGAGGAGCAGTTGTTGTCGTTGTTGGTGTTGCGGGGCGGCG
GCGGCGGGGGCTCGGGGGAGCCACACTTGCGGGTGCCTGCGGGGTTCACTGTTCCTACAT
AATTCACTGTCACTACTACTGACCCAAGATTCCGATGCCCTACTATTATATGCGCGCGGA
GTTTCGAGTTCTTTGGACACATCACCAGAAAGAGAGGTGACAATTTGGAAAAGCTAACAG
GCAAGGTATGCCGAAGAAGGCCCAAAGGCAGAGGTCCAATGCGTTGGTCGGACCAGATAC
CCTCAATACTTCAGTCCACGTTGCTATCCATGCCAGCCGAGAATAGGCAGGAATGGCGCA
GGAAAATAGAGTAGAAAATTGTTAGAGGAGGTTACGACCCTCAGCATTGAGGATTATCGA
TGCAAGGAGAACTACTGACCCTGGACAGGGTCTCATTTAATCATCAGCGTGACGGTAGCC
GTCACCGTTTTTACGCTCCGTCTCTTTCCCACCTTGTCCCTCTCTTGCGTTTGAAATCGT
CTCAGTATTTGCCCTATAAAGGTCTGGTACTATTTTCATACGAATGTATTTACGGCTCAT
GACAAAAATAGTGAGATACTTTTTGAAGCTCTTAATAAAAAATTTTTGATATTTGATATT
TAAAATAATGAGGTTTTTGTCTGAAATACTCGTATGTATATTTAAATATAACTTTTATTA
TTGCCTTAGATTTGTAGACGAGTGTACGAGCAAGTGAACGTCCTGATCATTAGTGGCTCA
TGGACATCAGCAAGCTCTACGGGATTTTTCGGAAACCTCTTTTAATAATGTTACTTATAA
AACTTGTTGTGTTTGTTCATATGAGAACTGGATGGAAATAACGCTATTTTGGGACGCAAT
GTAGATGCCCCGCACGGGCGGGTCAGACGGGTCGTGCGATGACAAACTCTGACAGTGGGG
TAACTTGATGGTTCATGAGGCTATGGCTCACCAATGCTGGGACGGGAGCCGTAGTGGTCA
GAGTAGGGCGTGCCGTATGCGCCGGTGTACTGCTCATCCTCGGGGGCGCAACAGGCGGGC
TCGTCGTATTCCGGGCCGCACGCGTACATCGGACGCGAGTAGCGGGCTCGGTATTGGTCC
TCTTCAGCGCAGGTGGCCGGGTCGTCATATTCGGGAGCGGTGGAGTAGATGGCGCTCTGT
CCCCCTTGCGAGTTCTTGCGGGCGTAACGGCTGTTGGCGCGTGGCATGCTCTGGGATCCA
GCTCGTGAGTGCGCGGGATGGTGAGGGTGAGGGTGAGCGAGAGTGCCGGCGTGAGCGGGG
TGGTGATGGGGGAACGCCAATGCCTTGCTCGGGTCCATTTCCTCGCGGAAACCTAGCAGG
TGGAACGTGGCGTATGGGCAGATTTCATCTTCCATGCTGATGACGGCCTGTCGCTTGACG
CGGTCGCACGTGTTGTAGTTGGAGCCGGGCACGGGGGGCAGCTTGCGGTTGGGGGGCGCG
ATGTAGCCCAGCTCGTCGCGCAGCCCGCCGCGCTTGTCCAGCGTGCCGCCCGCGCCGCCG
CCCAGCGCCGCCTGCGACGCGTTGTACACCGCGTCATAATACGCATCCTTCTGACCTCGC
AGACGGTGGGGAGTGTTCCTGCGAGCCAGAGTGAGACAGATGACCACGACTCCCACGACG
AACACGACGATGGTGGCCAAGATCGGCACCAGGACTTCAGGCTCCAGCCACGCCCGCACC
CAGGGCGGGAGTTCCTTGTCGCCGTCAGCATTGCCCGGCAGCGGAGCGATGGTGCCGCCA
GTCATCGTTAGAGTCGCGAATTCGTATTCAGCCACATTGAAGCCAGCGTTGTTGTGAGCC
GTGATCCTAAGCACGTACCAAGTGGCCGGTTCCAGGTCGAGTACGACAAAGTTTCCTCCT
GGCTTCACGGCGTTCGAAATCTGGTTCCATTCGGCGGCGCCTTTCTTCTTGTTCTCGACG
ACGAAGTGGCTCATGGGGCAGCCGCCGTCGAGCCACTGCTTGAGGTGCAGGGTGACGGAG
GAGGAGGCCACCTCGATGAAGTCGGCGGCGCGGGGCACGGGGGGCTTGGAGCCGCGCGTG
CGGGCGATCACCACGTCCGAAGCCTCGCCAGTTCCGATACCATTGTAAGCTGTGACGTAA
AGCTGATATCGTGATCCGCAGAATAAATTCTCAAGAGTGTACGTATCGGTGCTGCTCGGG
ATCTGAACAGTTTCCCAGTCTCCGAACTCCTGTTTGTAGTGGATAGTGTAGCCGGCGGCG
GGGGACTGGTCCACGTCGGCGGACGGCTTCAGGCGCAGCGTCAGGGACGACACGGACGAC
GACGCGATGCTCAGCTGCGGCGGGAACGGGGGAGCGAGTACAGACAGAGTGTGGGTGACG
GTATCGGTGCCGAACTGGTTGTCGACGTGGCAGGAATACTCCCCGGCGTCCTCGCGAGCC
ACCCCGGCGATCTGAAGCGAACCTTCCGGCAGCTGGCGGACACGCTCCGACGCGTCCAAG
AGTTGACCTTTGACCTTCCAGATAATATTAGGGGACGGCACACCGACAGCAAGACAAGGC
AACTTCACATCCTCTTTGTAGGTCGCGGTGAATGATTCGTCAAACGAAGCGATCTTAGCG
GGTACTTTGTCGCTGGGGCTGCAAGAGGCGGTTGCTGAGGGTTGTCCTTCGCCGATGATA
GTTGAAGCGGTTACCCAGAAGTCGTATCGGCCGGGCTTCAGTTCAGTTGCGGAGTAACTA
GTTTGACTGGCTGGTACCTTATTAGGATGAGGTTCTGCGTTCTGTGCTTGCGTGTACACG
TTGTAGTGGGTGACAACTCCGTTAGGTTGCGCGGGGGCTCTCCAAGAAACAAGGATAGAA
TCCTGTCCCATTACAAGAGCTTTGACGGCACGCGGGGCCTCGGGTACGTCTTGTTCAGTC
TGACAGTGGATGGGTACAGATCGCACTCCGTCTCCGCCGTTAGTGGTCGCAAGCACTTCC
ATAGAGTAGTTAGTGAATTTCTTGAGTCCGTGGAGAATAGTTTCGCTACTGGCCGTGTTT
TTGGTGTCTTTAGTTTTTTCATCGTACCAAGTTTCGCTGGGTCCGTAAATCACTTTGTAC
GCCTTGATCAGACCATTGGCAGCAGCCAGTGGGGGCGACACCCAGGAGACGCGGATGGTT
TGTGCCGTGAGGGTGGTGCATAAAACGTCTTGAGGGGGAGCAGACGGGGCACCTTCGGCG
GTATAGGCGCGAACTTCAGCGGACACCGGGCCCGATCCCATCTTATTGAAGGCTTGGACT
ACGACAGTGTACTGGGTGTAGGTCTTCAGATTTTGAATGTCCAAATGGTGTTCCTTGCCA
GATTCTTTGGAAATGTCGACGGTTTCGAAAACGAACGATTTGTTGCTGGAAGCCAATTTG
TATCCAACGTAGTACCCCTGCAGTTCACCATTCCAGTCTTGGGGCGCGGGAGGTTTCCAG
GTAACGCGAAGTGTGTGCTTGTCCGCCGCGTCAACCTTAACGTCTTGTGGGGGCCCGGTG
GGTGCCTCCTCGGCCGTGATGATTGTAACAGTTTCTGAAGGCTCTGAAGTTCCGAGTTCG
TTTTCGGCGACGATCCTAATGTGGTAGGCGGTGGCGGGTCTCAAACTAAATACGCCGGCT
TCAGTAGCGTCCCCTGGTACAAGAACTCTGTCAATATCCTTTTCCCAGTTACCCTTAGCG
CGTTTGTATTCAATAAGGAACTTCTTTATGGGCGAGTTGCCGTCATAAGGAGCTGCCCAA
GACAGTTGTACTGTTCTACCAGATTTGTCCAAGACTTTTAGACCATATGGAGCTTCGGGA
ACCTCCTGGATGATCATGTTGATGCTGGTATCGTCCGAACCGAAAGCGTTAGTTGCCACG
CAAGTAAACAGCGCACTGTCCGATCGTTCAGTTCTTCTAATGCTCAGGTCAGATACAACT
CCCCCGAGGAGAATCTCTTCGCGGATGGTATATCTTGGGTCGGATTTGGGTTCGAGACGT
TTGTTGTTCATGTTCCAGATGATTCCGATAGGCTTCTCTCCTTTAGCTTGGCACTGAAGT
ACAGCAGGTTCACTTTTGCGAGCAGTCTGATTCCTCATTTTAATCTCGAATTGGGGTGGT
GCCTGTACGCTAATAAGAATCAACGCAGACAATCCGGATCCAATCCCGTTAACGGCTTCG
CAAAGATAATAGCCCTCATTTGTTTTCTGAATATTTGAAATAGTCAATGTGCCGTCCTCA
ACTTTAACATTTGGGTTGTTAGGCTTAAGGTCTTTGTAATCGCCAAGCGTATCCCCTTCA
GCCCTTTTCCAAGTAACTTGAGGCTTGGGGAAGCCGTCGGCTTTACATTCAACTTTAGCA
TCAGAGCCTTGGGCAAAAGCTTTATCAGTTGGCTCAAGAATCCAACGTGGTGGAAC
(6476 bp)

- SilkBase 1999-2023 -