SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR30128_c2_g1_i4
Scaffold_idBomo_Chr5
NCBI non-redundant
(nr)		hypothetical_protein_KGM_15356_[Danaus_plexippus]
Ontology
GO:0016491 F oxidoreductase activity
GO:0042843 P D-xylose catabolic process
GO:0047115 F trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase activity
GO:0047837 F D-xylose 1-dehydrogenase (NADP+) activity
GO:0055114 P obsolete oxidation-reduction process
Transcript
Level		FPKM:1.05 TPM:1.40
ORF EntryO_BomoN4EE12712_complete:A_BomoN4EE_TR30128_c2_g1_i4
Sequence
(Nucleotide)
CCCAATTTACCCCATGTCATGGTACTACTTCGATAATTGTTAAACAAATTTGAAATTTCG
TACCGACACTACATGCAGTAGAAAACTTTAGTTTTTCATTGCAGTTTGATAATTATCTTT
ATTTCTGGTAATCAAACTTATACCTAGACTAAATTCTGCATAATTGTACTCATCGCAAAA
TAAATAATTTTGCTGACTTTATCCTGTTTGTTAGATAGATCAGTGTCTTCTAAATCTCAT
TCTACGCCTGTGGCAGTTACTGCTCTGAAGCTCAGTCTTATAATGTAGACACATCAATAC
AATACTTTAGACTATTTTTTATTAGTCTAAGTGAAATACATCTGTAAAGTAGTATCGTAA
AATGCCTGAGATGATTGAGATGCAGTTGAAATGGGGTATAGCAGGCGTGGGAATGATTGC
CCATGACTTCCTGACAGCATTAGACACTTTACCTCCGGAACAACACAGGGTTGTTGCAAT
AGCCGGCAAAGATGTAGATCGCGTTCAACGATTAGCAACACTGCACAAGATCAACACAGC
GTACGAAGGTTACGAGCAACTGGCGCGTGATGCTTCTATAGACATTGTTTTCGTGAGTGT
TCTGAATTTACAGCACTACGAAATTACAAAGTTAATGCTAGAAAACGATAAACATGTACT
CTGTGAGAAGCCAATGGGTATGACTTACAAACAGACTAAATCATTAGTGGACTTGGCGCG
TGAGAAGGGTCTGTTCCTTTTAGAAGGAATGTGGTCGAGGTTTTTTCCAGCTTACGACGC
ATTAGAGAAACATATAACCACTGGCGGCCTTGGTGAAGTCTATCACATCAACGTTCAGTT
TGGGGTTCAAATTAACGACATTGAAAGGAATCTGTAAGATGTTTTTACAAATTAGCACTT
AACGCCTGTTTGCTTTCAGGAGGCCCGCTCTTTAGATTATCAATGCTTGTCTCACGCAAA
TCATTAATTCTTTCATGAATCATGAACAATTGCTTGCGCGGTGTGTTCTTTAATGTATTT
TATTGTTCATATTCTTGGCTCATTGAATTTTAATTGTTGATTTATGCTAACGCTTTTTAA
ACAAATTACCTCGAAACTTTTCTTATTTAATTTTATGTAAATCGTGCGATAAAAAAGTGT
GAAACGAAAATCACTAAAGATTGTTTTGTTGTTACCTCAATTTGAAATATCCAATTAAAC
TACTTCGGATACTTTATTTACCGTTACAAGAAAAAAAAAAATATAGGATTATGGCTAGAT
GTTCTAAAAATAAGTTGTCACCAAAATCCAGGAGTAGGAAACTAGTATTCTCTCGTCAGC
AATCGTATAAACGATAATTATCACGTGACTTCTCTGGTCTCATATTCTCTTAAACAATAG
TATGACAATTTCAGGATGAAGGACCTCGGTGGTGGTGCGGTTTTAGACCTAGGAGTGTAC
ATGTTGCAGCTAATAAACTTCATATACAAGGAACCGCCAGTGGATGTAGTGTGCACGGGG
CATTTAAGCAAAACGGGAGTAGACGAGTCCGTGTCGTGTGCTTTGAAGTATAAAGACGGA
AGAACGGCAACAATGGCCGCCCAGACCCGTGCGACCATGACCAATAAAGCGGAGATTATT
GGTACGAAAGGAACAATCTCTTTGGAGTACTTCTGGTGTCCAACGGTATTACACATCTCG
GCGGCTAACAGCACCGAATGGACATTACCGAAGGGCAAATACAAGTTCCACTTCCACAAC
AGCGCTGGACTTAGCTACCAGATACAGGAGTGCTGGGATTGTATTAACAAAGGTATTGTT
GAGAGTCCAAAGATGAGCTTAGATGAAAGTATTCTCTTATCCAAATTGACGGACACTATG
AGGGCGCAACTAGGAGTACTTGAATCGGAATTATAAACCAATCGATTGATTATTTTTATT
GTACAATTTACATTTTAAATATGGCACGATAGAGTTCAGAACTCTCGTAAAAGTTTTGGG
ATCTATGGAAAAAAAGGATAAAGATTTTTGCTTTGTTTAAAAATTATTTGAATGAAGATT
CAGTATTGTTTTTATTGTTTAAATTAATTATACTTGCATTTAAAATTTCCTAGGTCCACC
GCGTTTTTGGGTAGCTGTCGCTCCTCATAATTTTATTAGTAGGTAGTTCCCAATTGTTTT
TAACCTTAACAGTTTTAATTGTTTAACTATTATAGTTTAGATCGTTAAGTTTTTGTTGAT
CGCTACTATTGACATGAAAATTGAGATCTAGCGCGCACTAAGAGAGTGCAAATGTGACTT
GAACCTAATGTTTACAAGTGGAAGGTGACCGATGGGACTTTTTCTCCATAAAAAATCAAG
ACCGACTAAAATACAGGATATAATATTCATAAAGCAGGGTGTTTATACAGCACAGACTAT
AATGTTTTTGTGTATTTGTAAAAGTAATGATTGTATCATTGTAATTTAACAAAAACGTTT
TAAAGCTTAAGATCTTGGCTGTATGGACTACGTTCCTTTTGCGTGTCTGAGTAGACGAAC
AGAACCAAAAAATCTATAAATATTACACTTAATCTTATGAATTCACAAATAGTACCTATA
TACGTAGTAAGTATATCCTACCAATCAGTATTTAAAATGCCAGTATGAAACAAAATATAA
TTTTGGCTTTAAAGTTAAGAATGTTGAACAAGAGCTTCGTGTTGTGATATTTATGCGTAT
TTAATCGATACAGTATAGTCTGTTAGTTATCTTACATATACTATAACGGTGAAATTTATA
AAACGGTATTTTACCTCTACTAACTGTGATTAAGAGAGTCGTTGTGAGACGGTTGTTATT
TATTCAAATTAATAAAAAAGTGTTATTCAAATTTGTTTTATTTTGATTGTAAATATATGT
TCACATTTCACAATAAATATATGTGCTTGATATCCATAGGAATTGTGTGTAAATAAAATT
AATTATTCGTTTCTAAATCTACACTATAAATATGTATAAGTATGCAATCAGGTTTGCCAC
TCGTACTTTATAATTACGTAAATACACGAAAATACTTTATTTCGCATGATTTAGTTTCTT
TGGGATATTGAAAAGTTTAGTCATTTGTATTTTTTCGTTAACGCCACATCACCTAATCTC
AGGTTAGAGATCTTAACCTCAAATGTCAACAATGTCACTGTCATTAATTGTCACAATTTC
TTGGTTAATTTGTTCAATTAAAATAAAAA
(3209 bp)

- SilkBase 1999-2023 -