SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR30049_c0_g1_i3
Scaffold_idBomo_Chr13
NCBI non-redundant
(nr)		endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:0.31 TPM:0.41
ORF EntryO_BomoN4EE11836_5prime_partial:A_BomoN4EE_TR30049_c0_g1_i3
Sequence
(Nucleotide)
GTATATTCAATATTTGGTAATAAACATACTTATATATTAATATAATAAGCCTTTATCGCT
GTTAAAATTTACAATACTTATATCTAAATATTATATATATATATTTTAATGCTAGGAAAC
AGCTTGTCTCTCGACATAGGCCTCCTCTAATGTTTTCCACAAGGTTCTGTCCTTTGACTT
TCTCAGCCACTCTCCGCCAGCTATTCTTTTGAAATCATCTTCCCATCTTTGATTTTTTTC
TGCCTTTACTTCTATGGCCATCTCTTGGGTACCATTCCGTTACATTCTTTGTCCACTTTT
CTTGTGTCTCTCTTAACATATGTCCTGTCCATCTCCACTTTTGCATTTTATGTACCTTTT
CGACGCTTTTTAATTTTGTTATATTTTTTACGTATGTTAGTCTAATTTTATCTTTTCTCT
TAATTCCAGTGATACTTCTTTCTATATTGTTCTGACATATGTTTATTTTATTTAATTGTT
TTTTTGTCAATGCCCATGTCTGGCATCCATAGATCAGGCATGGTAGAATGCACGTATTGT
ATACTTTTCGTTTGTCTTTCATAGGCATATCTTTATTTTTCATTATTTCACTGAGGGACC
AGTATCTCTTCCAAGTATTGGCTATTCTCCGATCGATCTCTTTTTGCATAGTGTCACTTG
GCGATATTAACTGCCCCAGGTAAACATACTCTTCCACATATTCGATTTTTTCGTTGTTAA
CGGTGATATTATAGGTCTTCGTAGAATTGGTCATAATTTTGGTCTTAGCGGTATTCATCG
ATAGCCCTGCTTTTGCACTTTGATCTGACAGTTCTTGTAGCATATGCTGCAGTTTTTCCG
GGCATTCAGAAAAGAGGACCAGATCGTCCGCAAATCTTAAATGGTTGAGATTTTCACCGT
TGATGTTAATGCCATTTTTTTCCCAATTTATATTCCGGAATATGTTCTCCAAAACAGCCG
TAAATAGCTTAGGCGATATAGGGTCTCCTTGACGAACCCCTCGTTCTATTGGGAATTGTC
TACCAGTTTTTTCAAGCCGCACTTGTGCTACACTTCCACAATATATGTTTTGAAGAATTT
TTATGAATTTGGCCTCCACTCCTTGACTCTGTAGTGCTTGCCAAATAAATGAATGTTCTA
GAGAATCGAAGGCTTTATTAAAATCAACGAATCCTACATAAAAGGATTTATTGTATTCTT
TGTATTTTTGTATGATTTGTCTTACAACGTGTATGTGATCTATCGTTGAAAATTTGCTTC
TAAAGCCGGCTTGTTCCTTTGGTTGGTTTTCATCAAGTGTAGTTGTAATTCGCGAGAGTA
TAATTTTAGAAAATACTTTATACACATTGGACATCAAACTAATTGGGCGATAATTTCCAA
TGTCTCCTTTGTCTCCCTTTTTGTGTAATAAAATTATAGTTGATTTTGTCCAATCGGTGG
GTATATCTTCAGTCTCAATAATGTCATTAAACAGTTCAGTCAATATCGGGGCAATGGTCG
ATGCAACCGATTTTAGTAGTTCGTTGGTTATTTGGTCAGATCCAGGAGTTTTGTCTATTT
TTTGAGAATTGATTGCTTTCATTGTTTCCTCCGTCAAAATTGTAGGTGTGATATTAGTTC
CTACAGATTCTAGTTCATTTATTTAAGCTCTTCCGCTCTTGTTGCTTTTATATAGTTTCT
TGTAATAATCTGTAGCCAACTCCAGTATTTCTGGTCGTTTACAAGTGTAGTTATTTTTGT
CAGTCTTTACTTTTGGCATCCAGTCCTTTTTTACTGTTAGTTCTTTTATAGCCTTTTTAA
TTCCACCTGTCTTCTCTATGTGTTTTTTCATAGTGTTGTCCCGTTTAATTTTTCTATCTT
TTCTAATTTGTTCATTTATTTTCTTACTAATTTCTGATATTTTATATTTATCCTCCTTTC
CTTTAATGAGGTTTTTCCTTTCTTGAAGTAGTTCCTGTGTTTGTTTTGAAATCGCTCTAT
TATCTTCTGTATTAGTCTTTCTTGTCGCTTCTTTTAATATTTGTATGAACTTATTGTATT
TTTCTTCAATGGATAAATCTTTATTGAAGTGTTGGTTCTTTGCCAATAATTTGAGATTCG
CTGAGAGTGCTTCGCTTTCTCCCGTACACACTATCCTTGAATTATTGATAAGATACTTCC
TTGTCCTTTTCATAGGTATCCCAGTCAATGCAGCACGGACCATTTTATGATCAGAGTGGA
AATTTAAGTTGTGGATAATTGACACATCCTTGAAAAACTTAGGATTATTTGACATGACAA
AATCGATTTCGTTTTTATGAATGCCATTTGGGGATGTCCATGTCCATTTTTTGTTTTTCT
TCTTTTTGAAAAAACTATTAAGAATACTGAGTTTATGTTGTAAGGCAAAAGTCACTAATC
TCTCTCCGTTATTAGTTCTT
(2420 bp)

- SilkBase 1999-2023 -