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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR29266_c0_g1_i3
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_tRNA-splicing_ligase_RtcB_homolog_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003972 F RNA ligase (ATP) activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0006388 P tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
GO:0006396 P RNA processing
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0008452 F RNA ligase activity
GO:0016874 F ligase activity
GO:0022008 P neurogenesis
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0072669 C tRNA-splicing ligase complex
GO:2000237 P positive regulation of tRNA processing
Transcript
Level		FPKM:0.89 TPM:1.19
ORF EntryO_BomoN4EE11103_complete:A_BomoN4EE_TR29266_c0_g1_i3
Sequence
(Nucleotide)
AATAAGAATATAAAAATTAAAATGACGACCTAAAGGTCTTAGTTACCAGGTCATAAAATT
AAAATTCCTTTAAAAAATCTTGTTATGTATGTACATATGTACCTATGTACATATAGATAA
AAGTATATTTAATTATTATTATATTATATATTGTAGGTATTCAAATTCTTTAGTACCCTA
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CTTTAGTGCAAATGGAGAAAGCTATGAAGAGAGATAACATAGAAACTAATGATAGACAAC
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CTCTGTCTAGAGCCAAGTCTAGAAGAAACATAGACTACAAAGAAGTTCTAAACAAACTTG
AAACTATGGGTATTTCCATTAGAGTTGCATCTCCAAAACTAGTAATGGAAGAGGCACCAG
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AAACTGTTAAATTAAGACCAATTGCAGTTATAAAAGGATGAACTCACTTTCCTAATGTGA
TTATTAATTATCATTCTTTTTAAAAACTGTTAAGACAGTTCATATATTGATTGAATTATC
TAATTATACTATAATAATATGTAATGGATTTCCTAAAAACTTGTGAAGAATTTGTAAAGT
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GGAACTCATATATCTAGGTGGGTGGCGGTATTTACGATGTAGATGTCTATGGGCTTCGGT
AACCACTTAACACCAGGTGGACTGTGAGCTCGTCTACCCATCTATG
(4846 bp)

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