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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR29266_c0_g1_i1
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_tRNA-splicing_ligase_RtcB_homolog_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003972 F RNA ligase (ATP) activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0006388 P tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
GO:0006396 P RNA processing
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0008452 F RNA ligase activity
GO:0016874 F ligase activity
GO:0022008 P neurogenesis
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0072669 C tRNA-splicing ligase complex
GO:2000237 P positive regulation of tRNA processing
Transcript
Level		FPKM:11.57 TPM:15.41
ORF EntryO_BomoN4EE11097_complete:A_BomoN4EE_TR29266_c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
AATAAGAATATAAAAATTAAAATGACGACCTAAAGGTCTTAGTTACCAGGTCATAAAATT
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AAGTATATTTAATTATTATTATATTATATATTGTAGGTATTCAAATTCTTTAGTACCCTA
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GTAGACCTGGTATGTCAGGTGGATTCCTTCCTGGTGTAAAACAGATAGCTAATGTTGCAG
CTTTACCGGGAATTGTAGGCCGGTCAGTGGGATTGCCTGATGTTCATTCTGGATATGGGT
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TGGGTATGGACTGGTCTCTAAGGGAAGGTTATGTTTGGGCCGAAGATAAGGAACACTGTG
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GAGGTCTACCTCAACTGGGCACACTAGGAGCTGGAAATCATTATGCAGAGATTCAAGTTG
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CCAATTTTGCTTGGGTGAACCGTAGCTCAATGACATTCTTGACCCGTCAAGCTTTTGCGA
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TAACTGGTCAGCCTGTACTTATTGGTGGTACAATGGGAACCTGCAGTTATGTACTAACTG
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TGTCTAGAGCCAAGTCTAGAAGAAACATAGACTACAAAGAAGTTCTAAACAAACTTGAAA
CTATGGGTATTTCCATTAGAGTTGCATCTCCAAAACTAGTAATGGAAGAGGCACCAGAGT
CATACAAGAATGTAACAGATGTCGTAGATACATGTCATGCTGCTGGTATTAGCAAAAAAA
CTGTTAAATTAAGACCAATTGCAGTTATAAAAGGATGAACTCACTTTCCTAATGTGATTA
TTAATTATCATTCTTTTTAAAAACTGTTAAGACAGTTCATATATTGATTGAATTATCTAA
TTATACTATAATAATATGTAATGGATTTCCTAAAAACTTGTGAAGAATTTGTAAAGTACA
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ACTCATATATCTAGGTGGGTGGCGGTATTTACGATGTAGATGTCTATGGGCTTCGGTAAC
CACTTAACACCAGGTGGACTGTGAGCTCGTCTACCCATCTATG
(5443 bp)

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