SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR28456_c0_g5_i5
Scaffold_idBomo_Chr2
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_ced-6_protein_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006909 P phagocytosis
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0016319 P mushroom body development
GO:0016322 P neuron remodeling
GO:0043277 P apoptotic cell clearance
Transcript
Level		FPKM:2.23 TPM:2.98
ORF EntryO_BomoN4EE10750_complete:A_BomoN4EE_TR28456_c0_g5_i5
Sequence
(Nucleotide)
TGAATAGGTTTGACGTACGTCGATAATTATTATTAATTGCGGCCTTGAGCTGACGTACAG
CCGTGATGGATCGTGAATAAAGCGCTAAATGCACCGTGCATCGTGCATGGCCTTGGCGGG
ACGTACAGCAAGATGGATCGTGAATAAGGCACTTAAAGCTTCCTCGCAACGGACGCACTT
TTTAGCTCACAAAGCTACATCTACTCGACGCAACGCTTTTAGAAATTTCTAATAAATTCT
ACTATCACTGACGCACAAATATTCGTGACCAATAGCGATGGCAACACTATAACGATGCGT
TCGCACATAATTTAGTTTAAAAACTAGTTATCTAACTAAAAATACATTGTTTCTTTTATT
AGTTTTGCATAGTTTTTTCGATGGTCCCTAGAGTGTGTGTCAATATAAATATTGTTATTA
TTTCTGGCTGGATATTACACGTTTAATACAAATTTGACTTTAACGTTAATGTGCGAATGA
AATTTAAACACATAATTCAAGATGCAGACAACAATGAAAGCGTTAACTGTTTAAAAGAAG
AAAAAAAAAACATCATGGCTGCACTGTTCTTCCTATCAAAATTAATCCGTAAGCTTCGTT
AACTAAAACTCAATTTCTTTTTTTCTATTTTAGAACCTCTTCACATAATATGACCCAGCG
AAAAACAATTACAGGAATTGTGGTAAATTTAACTTCAGTTAAGGCTGTACAGATTATCAT
TCAAGGGCTTGCTCTAAATACGTCAATATTCTCGTGACATTTCATTAATTTGACGTTTCA
TTAAAATGAAGTAGGGTTTCACTCACTAAAATTCAAATTAGTGTATTTCGTGTATTAATG
ATTTGTGTAGACTTTATCTATATTATTAAAAAATTAGCAACACAGAGCTATAGGAAACGG
CTCAAAACGAAAGTAAATTGTTTTTTGTATGTATTTATGTTAATGTAAATATGATAAGTA
TTTATGAGCTTAATGTGAATAAGATGCCTTTAGTAGAGGACACTTTCAAACTCTCATGTC
TCTCAAATTATATATAAATTATAAATCAAAGTCGAATGTTTTTTTTTTATTATGTTGCAT
TAAATTATGAAATTTGACATACGCATAAACGTCCAAGCTATATTTTATTGTATTCAATAT
CAAAACTTGTTTCATGCTTTTATTCATACAGGGACCATCGATTTAATATAAATATTAACG
CACAGTAGGCTTGCTAAAATCGTCAAGCAAATTATTTAACAAAAAAAAACATAGGCATTT
TAGATATGTTCCCTATGTCTTTTCAAATACATTCCTAACATCGCATTTTATTAAATTATT
TTTGTGTTTTCGTTTTTTTAATTTAAATTATATATTATTTATCGTTCTTTTAATTTTTCT
TTAAAGGATCGAGATTGTCTATTGAGAAATCGTCGTTTCCGAACGTTATGCCCCTCGTGA
ATCCGTCCTTCATCTCCGATATGGTCTTATCTAGGAACCCGTTGAAGCTGCTGTTCAATT
CGACCGTCTGTTTGTCGCTCAGATTCCCGAAGCCGGCGAACGCGTTCGCGTAATCGTTCC
CGAATATGTTCGCGCCCGTCTTCTGAGCTTCGAACGGATCGTAGCCGGTGAGGTTCGCCG
TGAACACCGACGTTTGGAGGTTGAAGTCGCTTATGTTGTAGTTGGGCGTCGGCGCGAACG
GAGCTTGCGCGGGCGTAGAGCTGTGCACGAACGGCGCCGAGCCGAACAGGTCGCTCGGGT
TCGCGGCGGGCGCTCGCCGCGGCGTCGTCGGCTGGTGCGGCGGCGTCGCCGGGTTGTGCG
GCGGCGTTTGACGTTTCGACGCTTTAGGCGGCGGCGCCAGTAACGGAGGCGCCGGTGACA
CCGTGCTGTCCATGGTCAGACCTGGGTAGCGGAGGACGGGGTCCGATTCGTGGGCGCGAG
GATCAAAATCGCTGTCCGAATCTGAGTTGAGTATCAGCTCCTCAAGTCTCGGACCTACGA
CGGGATTCTTTGGCAGATCGAGGAGTCCCTTACCGGCGCTCATCTTCCCATTGTGTGTCG
GGGGCGGCGTGGGGAGAAGCAGATTGTTGTCGCTTGAATTAAACGTGTCCGTTGAGTTGT
TTGATGTGGAGTCTGTGCCGATTTCAGGGGTCTTGTTCCCGTTCATGGCGCTGAAGCCGT
TCGCTAAGGTCAGCGAGGCGAGCTGCTTCTCCAACTCCTGGGGTACCTTGAACTCTGTAA
TCTCGGAGAGACTGTTCCTGGCCAGGTAGGCGGAGAGGTCGTCTTTATACGTGACCTTCG
ACAGCTCCTGAAGTCTAGTCCTGTACGCTTTCATTTGCAGTTCAAGCTTTTTGTTTTGCA
ACGAAAGCTTCTGCATTTCGATGTATTTGCCGTTGTCGTTTAAGAATCTCCTGTAGGCCA
GATCGAAGGCCTGTCCGATGGTGAGCGTGATCTCGGACGCGAGCTTAGTAGAAATGAACA
CGAAGCACTCGTGCCTCTCGGTGTTGCCAGCGTCGTGGCCGTTGACCCCGTTAACGGTGC
TGCCACCTTTCGCGATGAACGAGAAATATTTCTTGGCGCCTTTGTCGTCCGCGCAGTACG
ATATCCGGTGGAGAGGGAACTGGTACATTATGTTGTTTGAACGTGGTTCCTGTATGGCAA
CACCGTCCACAGATATCGTTATTTCCACTTTCTTGCATTTCGCGCCATCTTTCGCTTCGG
ACTTCTTCAGTTGCTGTGTGAACTGTAGTTTCTTGATTGCATCTTTGACCACCTCGATGC
CTTTCGGCTGGTCTACTTGGGTGCAGCCGAGGAACTTAACGAGATAGGCGACGTGGCCCT
TGACGAGCGAGTCCGGAGCGTGGATCCAGTTGCGGCCGTTCGGTGCCCCGTTCCCTTTGC
CCTTACCCTGCCAGAAGAGCAGGGTCGACATTCTGATTCCGCTTCTGTTTGCTCGATTTC
ACACAAAATAATATAACAAAAAGAAATCTTCAAAAACAACGTAGTTTTCTAAACACTTTT
TCGTCTTAACTCACCCGGTGTGGTGGTTAGTGCGAAACAACTTTATATAACTGTTGCTTC
GTCTAACCGGTTTTAGTTCGTCGTAAACTAATGAATAAAGTATTTCGAAAACACACAACG
AGTTTCGTTTCTTTTAAAAACAATCCCGTATTGATTAATGTTGTCGAAAAAACAACTTAA
GATTCAATTGAATATTTTGCGATTTTTTTCCGAAACGCGTTTCGTGAGACGTCTTTCCCG
TGCAGCCCCCCGC
(3253 bp)

- SilkBase 1999-2023 -