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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR101279_c0_g1_i1
Scaffold_idBomo_Scaf222
NCBI non-redundant
(nr)		Uncharacterized_protein_OBRU01_21543_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0000979 F RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0070301 P cellular response to hydrogen peroxide
GO:2000772 P regulation of cellular senescence
Transcript
Level		FPKM:8.10 TPM:10.79
ORF EntryO_BomoN4EE51596_complete:A_BomoN4EE_TR101279_c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
AATAAAAATGTTTTGTCCAAATGCACAGATTGCCACCTTTGATAATAGACGACTCATATA
CAGATAAAAATGAAATTCTCACTTATGACAAGTTCTCTGAAACTATCCACGCGATAGATT
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GCCAAAAATCATTTTAATTTAATAACATTTTTTAATTAAATCAATTAAAAGTTCACATTT
TTAACACATCAACATGATAACCATGGCCAAAAATGGCTGTAAAACAATTTATTTATCTTA
AAACAACCAGATTACATTATTTAAATACACTATACAGATAATGAGACATTTAAATAAACT
GATAAATCCTACTATTTTTTTATTGCTTTGGTGGGTGGGGGAGCTTACGGTCCACCTGGT
GTTAAGTGGTTACCACAGCCCATAGACATGAAAAGTCACCACCCATTTGCAGACCAGAGT
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GTGGACTCATATGGACTCACAGGATGTCCTAACATTAGTAATTATGTTAATTATAATTTT
TACAGGTTAAATTTTTATTACACGATCTTATTTCTTCAGCATGAAAGTTCTTTATCAATA
TTTGTTGGATACGTAATTCATTTGAAATACTAGTAACTGGCTGTGGGATTCCATCACTGA
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TAAGATTCCTTCTACCTTTACGCAAAATCGACGCATTTCAAGTCACTCAGGATTAGCACT
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TATAAGGTTAAGCTGAAAGTTCAATTCATAATTCAATTCAATCATCAAGTACTGCTAGTG
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TTGGAAAATAATATTCAGGTTGATCCCATCTATCTCGACTCAAGGTCATATGTTTTTTCT
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CAGTCCATTCTGACCATTCTGGGTCGCTATCCACATTTGAATCACGTTCATATGCATTCT
GATTTGTATTCCTGTTTGTTATATTTTTTTTTGTCTTGATCACCGATATAATTAACTAAA
AAGTATTTATCATATTCTTTGTTCTCAGCATTGATTCGTTTGTGACCTTTCTTTCTCATG
TGCTCCTTTAAGACTGACCTATCATTGAAATGACCTTCGCAATAAATACACTGCAACTTT
TCCAGTTTCGAATCAAGAGTGTTGATTAAATCATCGATGAATATTAGGTTATCTGGTTTT
GCTATATGAAAATTATGTTTCTCATACAAATGGCTTAGATAATGCACTCTTGTCGTGTTG
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TCTGGCAGAACGTCACTTAGTAAATAATATTTTTCATCTTTAGATTTTGTCCCATCGGGT
TTGTTATCTAGAAGCATTGTGGTGCAGTAAAACGGAAGGCTGTTATCTTTGAACCGAAGT
CGCCAATATCGCAAGTATTCTTTCAAATCAGCTATCTGATTAACATCGGCTATCACTAAC
CGGTGCTCCATAAACAGATGAGTTAGGAACTGCTTCTCACGTTCGGGAAAAGTAAACTTC
TCCTCACACAGCACACAAGAGCATTCTACAGATTCGTCGTTTTGGAAAATCGTGGGTTTT
AAATTATTTTGATGCAATGTCAGAGGCCCGAAGAATTTTTTTTGACAATTAGACATTGTG
ATGATTTAATAATATTAACAGGTCACTTTGAAAACTATTTTTTTAAACGGATATCTTCAA
TTCAACAGCTACACATTGGAAATCAATTTAAATTAGGTCTATGATTTAAATGCCTTTTTT
ATTTTATTAAATCAATTCTTTTGATTGATCGTTATAATGTCGTACGTCAAATTACTGCCT
GTCTGCTAT
(2469 bp)

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