SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoN4EE_TR100102_c0_g2_i1
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)
EcRB1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0003707 F steroid hormone receptor activity
GO:0004884 F nuclear receptor activity
GO:0005496 F steroid binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0035076 P ecdysone receptor-mediated signaling pathway
GO:0043401 P steroid hormone mediated signaling pathway
GO:0043565 F sequence-specific DNA binding
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level
FPKM:3.45 TPM:4.59
ORF EntryO_BomoN4EE50738_complete:A_BomoN4EE_TR100102_c0_g2_i1
Sequence
(Nucleotide)
GGCGGCGGCAACTCACGCGCGTTGTTTCGTATCCGAAATCTCTCTCGGCTCTCTGTTACG
CTTCTCGCAGTACACCTGCTAGCATTCAGGCTTCGGCGGCTCTCACGCTCGAGAGCTCGG
AGGTCATTACGTCCTCGCTCGGTTTCGGCCCTCAGCGGTTTCACCTCGCGCCGCGTTGAC
AGCGGACGTCGACGAACTCGCTGCAGCGGTGGCCACTGACTTTTCGAAACTGTGCTGGTG
CGCGCCGTAACTCTGGCGGGCCGTCCGCCTGTGGTGTGACAGTGAAAACGTGAATATTGC
TAACCTATGCGGATGTGCAGTGACGGATGAGTAGACTGAAGAATCCAACGTCAACAAAGT
TTTGAGCAGCGAGCGAGAGCGGGTCGTCAAAATTGAGTCCAAACTGTATTTAGATTACAA
CGCTGCCCCGCTGTTCGCCTCTGAAAACGCCTCCAGTGAAGTGTGGAGTGCGGGCGGCGG
GGCCGGCGGTGGGACAGCATGCGGTAGCACCGGCATGGAGCTGAAACACGAGGTGGCGTA
CCGCGGCGTGCTGCCCGGCCAGGTGAAGGCCGAGCCTGGCGTCAGTCACAACGGCCATCC
GGTCAACGGACACGTCCGGGACTGGATGGCGGGGGGAGCTGCGGGCGGGGGTTCGCCCTC
CCCAGGCGCGCCGGGACAACCGCAGCCCAGCAACGGATACTCGTCGCCACTATCCTCAGG
CAGCTACGGTCCGTACAGCCCTAATGGAAAAATAGGTCGAGAGGAACTTTCGCCGGCTTC
AAGCATAAATGGCTGCAGTGCTGATGCTGACGCCAGACGGCAGAAGAAAGGTCCTGCACC
TCGACAGCAAGAGGAGCTATGTCTTGTCTGCGGCGACAGAGCCTCCGGATACCACTACAA
CGCACTGACGTGTGAAGGATGCAAAGGATTCTTCAGGCGGAGTGTCACCAAAAACGCAGT
ATATATTTGTAAATTTGGACATGCCTGTGAAATGGATATGTACATGAGGAGGAAATGTCA
AGAGTGTCGATTAAAGAAATGTCTAGCGGTAGGAATGAGGCCTGAATGTGTCATACAGGA
GCCCAGTAAAAATAAAGACAGGCAAAGACAAAAGAAAGACAAAGGAATATTATTACCTGT
TAGTACGACCACAGTCGAAGACCACATGCCCCCGATCATGCAATGTGATCCACCTCCGCC
CGAGGCCGCCAGGATTCACGAAGTCGTCCCGAGGTATCTTTCGGAGAAGCTGATGGAGCA
GAACAGGCAGAAGAACATACCACCATTGTCGGCGAATCAGAAGTCTCTGATCGCGAGGCT
CGTGTGGTACCAGGAGGGATATGAGCAGCCCTCCGACGAGGATCTCAAAAGAGTAACGCA
GTCGGATGAAGAGGACGAGGAATCCGATCTACCCTTCCGCCAGATCACGGAGATGACGAT
CTTAACGGTCCAGTTGATCGTCGAGTTCGCCAAGGGTCTACCGGGCTTTTCGAAGATATC
ACAGTCTGATCAAATCACCTTATTAAAAGCCTCGTCCAGCGAGGTGATGATGCTGCGGGT
GGCGAGGCGATACGACGCCGCGTCCGACAGCGTGCTGTTCGCCAACAACAAGGCGTACAC
GCGCGACAACTACCGCAAGGCGGGCATGGCCTACGTCATCGAAGACCTCCTACACTTCTG
CCGGTGCATGTTCGCGATGGGCATGGACAATGTGCACTTTGCACTGCTCACGGCCATCGT
TATATTCTCAGATCGGCCCGGGCTCGAGCAGCCGTCGCTGGTAGAAGAGATCCAGAGATA
CTACCTGAACACGTTGCGAATTTACATCATCAACCAGAACAGCGCGTCGTCGCGCTGCGC
CGTGATCTACGGCAGGATCCTGAGCGTGCTGACCGAGCTACGCACGCTCGGCACGCAAAA
CTCCAACATGTGCATCTCGCTGAAGCTGAAGAACAGGAAGCTGCCGCCGTTCCTCGAGGA
GATCTGGGACGTGGCGGAGGTGGCCACGACGCATCCCACGGTGCTGCCGCCCACCAACCC
GGTGGTGCTATAGCCTCCGCCCGCCCCAGGAGAGAACGCTCATAGACTGGCTAGTTTTAG
TGAACGTGCGCTGATCCGTATTCGGTGACAGATTAGTGATTATATGTGTTGTTGAACGTT
TGGAGAGTATATATATAGTGTTGACGGCGAGGCCCGTCCGGCCCCGTACTTGTTTCGTTT
CTGACCGGATGCTGCGTCGGTCGCGCCCTTGCGACCACGATAAGACTACTTTCTATAAGT
ACGTCTCTAAATTGAGGCCCCAAGAACCGGAAGCCTAACTAAGATACGACGGTTTATTTT
ATCACAGAGGAAACTGAAGTAATTAATATATTAACAGTTAACACAGGTTCAAAGCAGTTA
GGCCGCTCCGGACTTCTCATGGTCTCAATAAGGCGGACGTATAAGAGTTACATAGAGAAT
AAAATAATAATATATGAAGAGATGTTTCTATTGGATGGAATGAGTGATGTAAAGTTGATA
GTTATTTTTATTTACCAAATTAATGAAGAGTCGGGTGTAGACCTTTTGTAAGTGATGTGG
CGAGGAGTGGATCGCAGTGTCGGCCGCGTGCTCTCAGCAAAAGCGTGCGGTCGACGCTAA
TAGTGCGATGGTTTTGGAATATGTTTGTTTATATATAGTTTATGTGTGAGGTGTTATCGT
GTCCCGTCAATTTTAATTTCGATTCGCGTTCATTCGTCCTGTGCTCGCTACTCAGATTAA
AAAAAAATTATCGTTACTGTGATTTAGAACACGCTGTATCTAATTTCATGATGAGAATGT
GCGAAATGAAAATTCACGTGTAACTAAAACTGGATAAGGTTTATGATAAATTTCTTTGAG
TACAATATAAATGAGTTGTCATCGGTGACTGGGCCACAGTACGACCTGATTATATTCACA
CGCATATGAAGACAGATATTGATTAATAAATGTTTAGATACATCGCGGTGTCCTCAATAA
TTTCTTCATTATATAAATCTTCAATAAATAATCTTTTTTATATTATGTTTGCAACGTTGT
TAGCGTGTTCGATGGCAACTAGATTGGATATTAGATATGTATATAGACGTCGCGCCATCT
GTATTCGTTTAGGTTAAACATTAAAAGTACAAAAGCAGCTAATTTATCTATATGATGTTT
TCGTTCTAATAGCAAAGTTCGGGCGAGCTTACTGTGGGAACAAACTTAGTCGAGAGTGGT
AGATGACACGCAAGCAACGTTGCCCGGCATCTAGATGTCTTCATTAGTTTTGTTAATGAA
CTATCTGACTTGTGACATTCACATAAGGTTTAATTTGATTTGTACTAAGTACCAGTCAAT
ATATTTTCAATAAAAGCATCATTGGCAAATCTCTTTGTCAGCTCGCCGCGGTTCGAAAAG
TGGACAACCAATATTACAGTACAAATTTGAGACTTCAACCTCATGTCTCAAGAAGGGCCG
TGAGCTCGTTTGCCAATCTAAAAAAGTTAATCAAATAAAAACAAAAGAACAAGATTAAAA
ACATCGTGTCTAACAAATCTACATTGGCGTGACGCCAATGACTTATTTACCTAATATTAC
TAAATATTTTTTGATACATTTTTGGGAAAAAATCTAACGCGATTTAAAAGTGTTACAAAC
GATTCTAAACAAACTACCCTCAGATTTCGTATATACCAAATCAAGACAAACACAAAACAA
CTTATTTAACTGAAATAATCACAAACGAAACTGTACCGTAACGACGCTAAAATACAGTTG
TTTTAGGATCAGCTAATTGTGTCTACGCTGTTGATGAATGGAAATATAGTAAATAAAATC
TAAATTTAATCGATCTCATTTACCGGTAATCGTGATAAGCACGTATTGAGTTCGTAATCT
GAACTCGTTTAGAGCACTATATGAGTCACTCAGTACTCAGTGTCCGTCTCGAAGCCTTCT
GTCTCCCTCTAACATTACATAATTGTAATTTATTGTCACACCATATCGTTTTCTCGCTCC
GTATTCACGCTAATATCTCGTCATCTGTAAACTTCGCGATAAATATGCTAATAATAAGTG
TCTGTTTGGCGTGTTCAATGTGTTTAGCGTACCGTAATTTGTGTGATTGTTGTTTATGAA
ATTCATTTCTGTACAGGATGTGAGCTCCCGAAGTCGAAAGCTACAAAATATATTTATTAC
CTTAACTTAAGGAGGAAAACAATCGTTTGGTGCTTGAGCCCGCAATGCGTGCGAGTGACC
GCAGTACGAATCACGTAAAAATCATGGAACAAAAACCGCAATGGATTCTGTACGCGTTCC
ATTGAGGGCTCACTAAACATGAGACATTATTATCAAATGAATAGCGGTCTCCGTTTCGGG
AGAATTATCCTGTATGTAAATATATACAAGCGCGTCACGATCGAACCTGCACCGAGGACC
GTGCTAGTTCGCTTAGAGATAACTCTTCGATTTAACTTAGCATTAGTCGTACATAGCACA
AATTATCACTGGAGTGTCTTAAGCCTCCACGGTTTCAGAGGCGCATCGATAACACACACT
GCCATTACAAACGTATAATATACACGGTGCGATCTCGTATGCGTGATCATAAATTCACAG
TTTTTATCTAAAGTCGATGAATCTTTCATACGTCGCGATTGTAGTCTTTAGATGTTAATC
GATCATGGAAATATTAGCTACGATACGTTGCCTTATTAGTGCGGTGCGATCGTGGACAAC
GTTAGGATTCGCTCCGCGTTCGCATTTCGCCTTCGACAAATATAACTGCCATACGATAAG
TAATAAATGTTATACGTCGTTCGTCGCGTAGGTCTCATGAATAGCTTCATAGGATCCGGC
TTCCGTCGGTGCACGAGCGATCGTGTTTGTCGACGTTATAATCATCGACAACGTAATAAA
TAAACTGTTAGTATTTAATAATCTCGAACGAGAAAATAATAATAACTACCATAAAATTAA
TTCGTGTCTTAGCTGATAATGAGAGAATATGATAGTTGTGTGTCTGATTGTGACGACGGA
GAGACGGCACACGCGAGCGACCACGTGCGCGTAGTTGAGTACAGTGAAGTACAGTCGAAT
ACAGTGTGGAGTACAGTGCAGTACAGTCGAGTACAGTTGACTACAGTCGGAATGGACGGT
GCGGAGCCGGCGTTGCCGGTTGGATGCCTTCGAGAGTTTTGTTTGAGGTGGACCGGTCGG
GAGTCTACCGCTTGTCCATTAACTTGTACATAGAGACCTATAGATCCTATTGTCATATGT
TTGACATATGTACCTTTAGTTTTATTCATCTAAGAAGTACAGATGGCTGTTGTTATTTTT
ATATTATTTGGGTATATTTTTTTTTTTTTGTAAATGACCTCTGTATTTATCTTTTGTAAG
CTTTGTAAGCCATAGGGACTTAGAATAGTGTACGAGCTGCGAACATTGTGATTGCTGTTT
TCTCTAATTTCGTATTTTATTGAGACAATTCGTTCTGCGTATGTATTCTTCGTTTCGACA
AATATTTCTTAATATTTTTTTTTTTTTGTTATTTCAGAGTGCAATATGTACAAATATTTA
CATATTAATTGTACAGTCAATTTTTAGTTTTAATGTGTCAACGCAATATACTAGTGTTCG
TTCGTTGAATGTACACGAAATGCATAATAATATAATAATTCGAAATCACAAGTGAGTTGC
GATGTGACGTATTCACTCTCAATATTGTGTTTTTTTTTTTTTAAATACTTAAGGGAATAA
TTTTATAATAGAAAGACTAAACTAAGCGAACTTTGTATTTAAACTATTTTTTTTTTGTAG
CAGATTAGATTTGTTTACATAAGACGAATAATGTACATTTTGAATTAATTTTAAAGTGAT
TTAGTTGTTATTTAGTAACGAATTTTCTTATAAGGTGTAACTGGCAGCCCCGCGGTTTGG
CTAGAATATTGATACCAGTGCTATGTGTGCAATCTCTGTTAGTGGATAGCCGCTTCCTAC
ACAAGTGACCATTCCGTGTACACTTGATTTATATTATGTTATTTTATTTAAACGTGACAT
AAACTTGTTTCCCTCCTAATGTATTTGTTTTGCATTGATTATTGTCTGTGTTATGTTTAA
CGACAGCGGTGAAGCGAATTAGTTATAGGGATATAGACATGACGATACGTTTAAAAACTT
TATAGAGTCAACTTTTATAAAATGATAATAACCAGAGAGACAAAACTAAGAAGGTGGGTA
CAAAAACGAGGAAATTTGTATGAAATATTGTTATGCGAATAAACTTACACCTCAAGG
(6297 bp)

- SilkBase 1999-2023 -