SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoN4EE_TR100049_c0_g2_i1
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_GTP-binding_protein_1_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0000177 C cytoplasmic exosome (RNase complex)
GO:0003746 F translation elongation factor activity
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0005525 F GTP binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0006414 P translational elongation
GO:0016020 C membrane
GO:0044822 F RNA binding
GO:0061014 P positive regulation of mRNA catabolic process
Transcript
Level
FPKM:44.38 TPM:59.12
ORF EntryO_BomoN4EE50635_complete:A_BomoN4EE_TR100049_c0_g2_i1
Sequence
(Nucleotide)
CACCGATCACACAAACATTCGACTTATTCTCCGCGATTTCGTCCATAGTCCATTGCTGTC
CATAGATAACACAATAACACATCATTATTTTTGTCGTTTTCGGTTTTGTGATGGTAAAGA
ATCTACCTACTTTTTTACGTACCTAGGTTTATGTGTTTAATAACCATAATCTAATAAATT
TATAAATTAATAAACAACGTACGTATAATAAAATCTGTTACATAATAAGCAAGTGAAAAA
TTGTGCTTAAAATTTGTACAATGGAAAACAACACAGATCATTCAGAACAGACGAACTACA
GTCCCCTGACTGTTGAGGATGTAGATGTAGACTTTTTACCGATTGTATACGATATAATAC
GAAGCGTGGAGAGAGATTTTCACGACAACGCGTCGAAAATACGCGAGTCCCACGAGTGCA
GTCATAGAGTTCTTGAATTACAAAAGAGGCTAGAAATAGCTAAAGCTCAGATCAGGAGGC
TCCCAGGTATAGAATTCAACAAACACGACCAGCTGAAGCAATTTGAACTGCTCCGCACTC
AGCTGAGATTAAAGCGTGAACTCTTACAGAAGTATCGGAATATGTGCTCATTTGAGACAT
CATTCAAGTGAAGATGCCTCTACGTGCGCTGCTTAAATACTTAGCCAATAATGAACGAAT
TGTACAGAAGATTGCAGAGTCCTACCCTGTACGAAGAGCAGCTCAGTTAGCTGTCTCAGT
ATTTTACAGAGGGAAGGAAAAGCTCTCTGATGTTGATCCACAGAAAGTTAATAAATTTAT
AGAGTTTTTAAAAAGGTTCAGTGCAAATTTGAAGGAAGGAGTACAGGATGCAAAAAAACA
ACTGAAAAAATAATAATAGTTCCTTGGATGTTTTTGGCTAACCATGGATTAGTTGCTGTT
GATTGTAATTCACTATCAGTAGTGTCCTTTACATAATATAACTACTAAATTAGATAATAA
AAAACTGTAACATAGTTAGAGCTATTTTTATTTCACTCACTCTGAACAAATCAATAAAAA
TATAAACTTTACTTAATTCTAAGAAAAAATCACAATATTGCAATGGTATTCATTGTAAAT
GTCAAAATATTGAAAATATATTTACTTTTAGAAAGCAGCTAGCTTCACTAATTTTATTGC
GATTATAAGGTTTTCAGAGTTAAGGCAATGATGATTCAAAACTCTGATCTCATTAACTTT
AATTTTTATTTTTAAGTGTTCAAATATTTTAAGTGACCCTAAAAGATTAAGCTTAGTGCT
GTAAAAATATATACTTGAGTTTTAATTAGTGTTATAAGAACCTCGAGGTTATTAGTGATT
TAACTTGCGAAAATATGCCGACCCATTGTGACAGGTGGATTAGCGGTATGGCTTGAGGCT
GTCTAGATTAATCAGTGTCACTACGTCCCCAGAAAACGACAGGAGTTCTACCCTTGGTAG
TAAAACTACTAAATTGTACTATGCAACAATCACTAGAAAAACCTTTAAGTTAGATAAAAA
GATCAATATAGATTTTAGATTAATTTGAATAGTATGTGCCACTTTCCAGCCAGTCATTTT
AGAGCAATAGTTTTGTATTAAAAGTAAAATATAGTTGTTTTACATTTAATACAGATTCTT
CTCCGAATATTTGTAAAGTTATTTATCGATTGAATTACATTCTTAAAGGCGATTGCACAG
TATTAGTATATTGAATAATATAATTTCGATGATAATGTATCTAGCAAACTTCTAGAAGTC
CTAATTATAACTGTCCTCTGTGGACAAATATTAATATATTTTTTTTAATATTTAAAGAAA
GAATTCAGATACGTTAAATTTACAGCCACTATTTCACAGAAATTAGTAACTATTAAAGTT
GACAGACTTGATTAAGCTAAGTCTACCAAAAAATGTTTCTTTTTTCAATGTACATTTCTT
GTACTTTTTGTGCCTATCCTACTTAAATGGTAAAAGGAAAACATTTTCAACCTATACCTA
CCGTATTTATGTAAAAATGAACTATAATTCTGACATTTGACGTTCAAGCATTTTTATTGA
ACAAAAAACTTTATTGGCATTTTCATCAAGCGCCCTTCATACCAAAATTGAAAAAGTTTA
AAATGAGAGAAAAAACCCCAAAAATTATAATTTTCTTCTAGATTAGTAACACTGTCGTCT
TGACTGCAGCGTGTATTAATTAGCCGCAGCGACGGTCGGTTGTGTGGGTTCGGGCGGCTT
GTCGTGTCTCTTCCGACCACGACGCCCCCCTCCCGCCCCTCCGCCTTGGACGCGCTTGTC
CGCTTGGATCTCGAACGGAGAGTCCATTGCAGTCACGTCGCTCTCTTGCACGTGCTGCGA
ATCACTCTCATCGGCTGCGTGGTTGTTGTGCTGCGGGTTCCGGCGGTCGTGCCGGGCGGG
CTTCAGCGACATCGGCTCCGGACGTAGCACGTTGCCCACGGCTTTTGTACGACCCTCACG
GAACACCATTCTCTGTCCCCTCTTGAGATACTCCGGATGTTTGATGAAGCGGAACTTGAC
TAAAGCTTTGTCCCCGGTCCGAAGGCAGTCCCTGGACATCGACAATATGGATGCTGTCTG
TCTGATACTGCCGCAGTGCACCATGGCTTGGTAACGCGAGGAGATGGTGGTCGGGTGGTG
CAGCACGAGGATCTCCCCCTCGAACTGCCAGCACGCCTGAGGGTTCAGCGACGGAGAGAC
CATCACCATGCCCTTGCGGATTTGAGAACGCTTCACCTTCTTAAGCGCGAAGCTGGCCGT
CTGTCCGCCGCGCACCTCGTGCACCGGCATGCGCTTGCGGTGGATGGACTTGACGGCGAC
GGGGTGGAAGCGGCCCAGCGCGTCCGGGCCCAGCGCCAGCGTGTCGCCCGCGCGCACCAC
GCCCGCCAGCGCCGTGCCCGACACCACCGTACCCACGCCCGGCACGGAGTATGTGTCGTC
TATCTGGAATTCGGCTGGCTTGTCTTCGTGCGAGGGCATCCTCGTCTTCAATAGGTTCAG
GAACATCGTCAATAGCTCGAGGTTCTCCCCACTCACGTTCGAAACTTGGAATATTGGGCA
CAGCCTTTGCGAAACGAAGTTGGTGGCGCTGACAATGACATCGTCCTTCGACTTCACCAT
CACCGGAACCTTCCTGCACCCCGATGACTTGAGGATCCTGATGAGCAGCTTGAGATTGTC
TTGCAGAACGTTAGGCGGGCACATGTCAATCTTGGTGACGACAACGAATACTGGCACTGA
CAAGGCAAGAGCGAGCCCGAGGTGTTCCTTGGTCATTCCTACTATACCCGCGTTGGCTCC
GATCATGAGCATCCCAAAGTCGGGAGCGTGTCCCGTCATCCCAAAGACCGTAGTTTTGAG
GTACCTCTCGTGTCCAGCTAGGTCTATAAACGTTATCACTTTGGAAGACTTCTCGCAGAT
CTTCACCCAGTCAAGAGTGCCGTGATCTGGCTTATTCACAACATTACCCATATTATCAAA
GCCCAATATGTCGTTCCCCACGGAGCTGGTCCTCCCGCTCTCCATCTCGTGTTTGTGGCG
GAACAGCCTCTGTCGTGCATACCCTCGACCGTTGTCCAGTTCTCCGTGCGTGAGGACCCC
GAGCAGCGTGGACTTGCCAGCGTCCACGTTACCCACCACAGCCACTCTAATCTCCATAAA
GTCATTATTGTCAAGCTCCGTCCTAAGGAGGTATTGGCCGGTGAGCCCACTTCCACACTC
CCACCTCCTCAGCTCAACACATGACACTCTCTCACTTGCCACCAATGAATGAAGCGTTGC
TAGGGACGCATTGTATTCATCCTCTGTTAAGCCCCGACCATCTTCTCCAAGTCCAATATC
GTAAATGATCTCGCCATTTCCAGCTTCAAGCCTTTCCAATAGCTGTTTACGGAGTAACTC
ATACTCATCAGCATTTGGACTCACCATCACCATCTTTCCTCTAATACTGGAATAATCTGT
TTCGCTTTCTACGAAGGCTTCATCCTCAGTTAAGGGACTCGCCTTAATCGGAGATTCTGG
TACGCTGTCCATTTTTACTTTCCAAATTACTTAAACTCAGTCAGAACCCTTGAACTTCAC
TGCTATTCACTGCATTATGTCATACGTCGGCATAAGGGGAAACAAAGAACGACCTTCCGT
AATGTAAGCTATCTTCTATTTTACTAATAATCCGAATGACAATGTTGTTGGCTATAGAAT
TTTTGACAAGGCTTAATAAACGAAAGGTAATTTATCTTTCGGTTACAAACACAATTTTGT
AGTTTCTCAGTGTCAACACTCACATTGATATGATTTTATAATTTTTTCTGACTAAACTAA
TGTTGTTTAAGGTTTTAATTCATCATTTCAATGAAAAAAATTATATTCTGGCATTTTTTC
CTTTCAGTACTTGTAAGTATTTTGGGAATTAGCAAAATCAAAACCAATTTAACAGATGGG
ATAAATGCCAACTTTTTGACAACAGATCGG
(4470 bp)

- SilkBase 1999-2023 -