SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMSG_c26587_g1_i1
Scaffold_idBomo_Chr23
NCBI non-redundant
(nr)		MMS19_nucleotide_excision_repair_protein_homolog_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005819 C spindle
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0006259 P DNA metabolic process
GO:0006281 P DNA repair
GO:0006974 P cellular response to DNA damage stimulus
GO:0016226 P iron-sulfur cluster assembly
GO:0097361 C CIA complex
Transcript
Level		FPKM:7.41 TPM:3.85
ORF EntryO_BomoMSG20060_complete:A_BomoMSG_c26587_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CTGATTGGAAACATTACACACTGACCTAGGAACGTACCAATAAATTTGAAACTAAAATTT
TAGTGTTCACTCTTCAATCTATACATAAGTCAAAAGATCACTGATTAAATTTTAGGTTGT
ATGACCAGTAAAAGCTATTTGCATGTAATTTTAAACTGATTCTATTTGTAAATCAACCAT
GAATTCGATTTGGTTCAAGCCTGAACTTGCGGAGGAAATAATAAATAACAATGAAATATT
TGATCAAACGCAAAATGTAGTTACTGATATAATAACTCAACATATAGACCTAATAACTTT
AGTTGAAAACATGGAGGGTATTTTAACCAATAAAGAACCAGAAAGTCGTGAAAAAGGAAT
GAGATTCTTCACAAAAATCCTCACAGAGCTACCGAGAGACTATTTAACTGTGTCACAAGT
TAAATTCATATCAAAATTTTATATTGACCGGTTAAAAGATAATCATAGAGTAATACCGGC
AGTCTTACAAGGTTTTTCAGCTATTATTGAAATGAAGAATTATGATATGGAAACTAGTGG
AGAGTTTTTTTCGTTGCTTTTCAGAGAGGTTAATTGTCAGTCCCAAACAAGACAGGATCG
GTATAATATTTATTTTATTGTTAAGAAGTTGATGGAAAAAGATATAAAATATATGAAATC
TCTTGGTCCAGATTTCGTATATGGTTTCATAGCATCAATGGATGGAGAGAGAGATCCGAG
TAACCTGATCTTTCTCTTTAATTTCCTACCAGAATTCATACGTGAAATACCATTGGGGCA
TTTAGTCGAGGAAATGTTTGAAGTTATTTCATGTTATTACCCTATTGATTTTCATCCTGC
TCCTGATGACCCAGCACCGGTTACAAGGCAGGATTTGGCTACAGCTTTAAGTCCTTGTTT
GTGTGCAATACCAGAATTTGCGGAACATTGCTTGGTCTTATTGGTTGAGAAGTTAGATTC
AAGTTTAAGGTTGGCCAAACTTGATTCATTGAGACTATTGACGGATAGTTGTAAAATTTT
CAAACCTGAATCATACACTCCATTTCTGAAAACATTATGGTCATCAATCCAAAGGGAAAT
ATCACACAAAGCCGACGAAGAACTGAAATTTGCGGCACACGAGGCCTTATCCGCTTTAGT
GTCAATACTATCAAGGACTGCTAACACAGACCAAGCATTCGAAAATTTCGTCAAAGGAAT
CCTTATATCCATGCAAACAGCTGTTGCGGAAGCCACCACTGTAGCCCAATTTGTACATGC
AACCAAAGTTCTACTAACAGCTGCGAATGGTTCCAAAGAATCATGTGCTATAATAACCAA
AAGCATGATACCGGCAATATTAGCTTATTACGATTTTAAAACGTCTCCAAAATTGCAGAT
CGCTAGTCTGGACTTTTTAGGGGATCTGTATGATTTGGCCAAACATTGGGATGTATTGGA
ACAAACAGCGGTTCAAGTCAATGAATTACCGCAGTTGTGTTTGACGGTTGTCAGTCAACC
GATTAAAGATTTCCAAGTTGCCGGCTTTAGAACATTAATTAGAGTTATGAATGTTTTACA
AACAGACCTTGTAGTGCCTTTTGTTGAGGTCTTAATGTATAATGTTCAACATTCTCAAGA
CGATGAACTCTTGAAAGTCAGCATTGAGACTATTCACGCAATAGCGAAAAAATATCCAGA
AATAATAATGCAGCTGCTTGTCACAGGAAGATGTGATATAGAAAATTTGACGCAAGACAA
AACTGCTTTGATCAAAAGACTGAATTTGCTCTCCAATTTAGCCAGTATCGATGAATTCAC
TAAAGTAATCATAGAGGAAATGTTAAAGGTGGTGTCAGCGCATGACGAAGAGGCTCCTAA
AGTGATTGAAGCTTTGAGCGAATCAATGTCAGATATAAGTTTGTTTACAGAGAAAAAAAT
AACTGAAATTGATAGTGATCATGGCTTGGTGGACTCAGTTGTTGAATGGATATTAAGAGA
GATAAATAATTCGGTGGATGTGTCAAATGGTTTTGTTTTAATTGCTAATACAATTGCAAG
CTTACCAGCTGATAAACAAAGAAATTTACTAGCAAAACATACAGATAATATATTAGACAA
ATGTAAATATAATGATAAATATTATTTAATTTTAGAAAGTTTGTACATATCTGTTCATCA
GACCGTATATGAATCGAGTTTTGATGATATAATGAAGCTATCTCTAAAGTTAGCTTTGAA
TAGTGAATTGGACAGCGTCAGAACGAAAGCTTGTATTTTAGTGGCACATTTTCTT
(2275 bp)

- SilkBase 1999-2023 -