SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoMSG_c26213_g1_i2
Scaffold_idBomo_Chr14
NCBI non-redundant
(nr)
zinc_finger_CCCH_domain-containing_protein_11A_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000346 C transcription export complex
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0006810 P transport
GO:0016973 P poly(A)+ mRNA export from nucleus
GO:0044822 F RNA binding
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0051028 P mRNA transport
Transcript
Level
FPKM:19.31 TPM:10.05
ORF EntryO_BomoMSG18707_complete:A_BomoMSG_c26213_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
CTACCACATCTTCCATCTCGTTGTGACGTTTGAATATAATTTTGTGTTTCAAAAATTGTT
ATTTTCTATAAACTACTTTCACGAACTAAAGGTTAATTAGTGTTTTAAAATTTGCTCGAG
TCCGGATAGCGAAAAATACCATGGAGTCTCCACGTAAATTCAACGATTGTTACTTTTATT
ACTATTCCACATGTACAAAGGGAGATAATTGTGTGTTTCGCCATGAGCCGTCAGCCTTAG
GCTGTGAAACAATGTGCACAGCCTGGCAACAGGGGAAATGTACTGATAAACGCTGTAAAC
TACGTCACATGGAGCTTAGGAAAAATCGTAAACAAATTCCATGCTACTGGGAGAACCAAC
CTGGTGGCTGCCGCAAGATTCACTGCCCATTCATGCATAAGAACCCCGAGGCACGTACTG
ATGGAATTGCTCCAAGTCAGCCTGCCCCACCTGTTCATGCTTGCCTAAACGAGAGTGTGG
TGGAGCAGCCACCGATGGGAGCCATCCCGCCCCCTGCTGTGCCCGCCCCGGTGCCGCTTC
TGTGGCAGCAACAAAGACAAGTGGTGCTGGATAGCACGTTGCTGGGTGTGCCGCGTCACG
ACGCTGGCGCTCCGTTCGCGCCGCTGCCCGTGGACCCCCTCGTCGTCAACTTCGACGAAG
GTATGCGTCTCTACTGAAATTACATGTACTAAGCCCCCTGCCGACACTTATTGTATTGGG
ATAAGAATTAATATCCTCTCAAGGTCTCTTCGATTACGCATTTACAATGTCCTCGGTCAT
ATCACACAATAGATAGATACCGAAGGCTGGTTCCAGCTGATCCTTGTTATCTGTGCTTGA
CATCTACAAATTCCATTCCGATAATTTATAGTATAAACCGTAGCTACAAGTATATTAGAT
TGAAACGCATTTATTAACATGAAAATTTAAATGTATCATCCGAGTAACACATTAACGGTC
CTTCATTTTAGTAGTTGTGGTTAACTGTAGTAGTTTAGTAAGGGTCCTTAATTAGTACAG
CAAGTTTGAAAGGCACAGTTTTTATTCGTAAAGTCATATAAAGTTTAAAATTTGATTATG
TATGATGAGACTGAAAAATTTTCTATCAGCCTTCTGTACTATTTATGTGTATGTACTAGT
GTGACCGAGGCTTGTCACTACTACAGCAAGATATGATTGTAGGTCCAAACTCCAAGTGAA
GATTTGATGAATGACTTTCGAATCGATAATTAATGTTGATAATTAAGATTGTGTGTTACA
TAAATGCATATATTGGGTGACCTTGAGATAATATTGATTAATGTTAAATAATTTTTCATT
AGGAGACCTGTAAAGTTTCTCGAAGATTTTGTAGGATGTTTTTTTTTTATATTTTGTATT
AATTGATTATTGATGGGATAAATTGTTTATCAAGCAGATTGTTGGACAAAATCTTCGGAA
CATTTCTGTGCTTTTCTTTTGAAATGTTTTATGTAAAAAAAAAAAAAAACTTCCCAATAG
GCAGGTTCGGGCTTAGGCTGTGTTTCAATGTAATCTGAATGTTGAAAATACAATACTACA
AATAAAAAAAAAAAAAGAACTCCACGCCTTTAATTGATAACCAGTGGAGGTTTAGTGTTT
TTGTTCATTTCATCAGCAATAGCCCAAAGTGTTTTAACGTAGTTTAGTTCTATGCGAATC
CAAAAGGAGCGTTGTTTAAGATAAAGTTTTGATTTTAACAATAATGTTATATTGGGTGAT
GTTCCTTTTATGTGTTTGTGAGGTCGCAGTGGATCTGCGGCGAGTTTCTCTTCGTATTAG
TATTTTCAACACTCGGAACCGAGGGATTATTGAATGTAACGGCCAAATAATAAAAATAGA
ATTAGGAAAAGGTTCTTTGATAAAATTAAATTATTCGCTCGCTCTTAACGACACGTTGTA
TCCGAAGAGTTTGAGCTAGCTTCGTTTATGGGATGAAATATATTTTAGGGCGAGGAAATG
TAAATGGAATATTAAATGCGAACAGCGTATAGAAACATGCCTAGTTCAGAACAGGGTTGG
ATAATAATGAATGGTTTTGTTTTTCGTTGGTTCGCTTATTGCGGGAGATGTAATGAAATA
CTATGATATGAATTATTCGTGGGCTCCGTGAAATTGCTGTTTGTTGTTTGTTGCATTTAA
TATTCTACTTTCGAGGTTTTTTTTTAATAACCGACGCGTTGGATTTAGGGGAGGTATGGA
AAAGAAAAAAAAAAATGTAATGCAAAACGGAGGAGAATTTTAAGTTTTAGTTAAAATTTT
GGAAGTGTGCTTGTGATTAGATAGCGCGCTGGTGAGGAAGTTTTCCCGACACATTATCGC
CATTACCAACATATCTCATACTTTTGAAGCCAACGATGATGAGGTTATCATTTTGGTGAA
GTTTTTTGTTTGCATCAACGAATTTGACCGGAGTGAAACGTAAAGCAATTTTTCAATCGA
TATATAATTGTATTACGACTCAGTCCGAGCTGATTGTGAGCGATAGTATGAGAAAAATGG
CTTTAGTTTTCCTCTCACACCCGGGATGCGTTGTGAATTTCTACGAAATAAGTTTTAATT
AGTGTCGTGTAAAAAGCGAATCCAACATTTTAATGAATCTGCGATGTTAATTCACATCGT
AAGTGATTTGAGGAGTCCTATGGTTATGAAAGTCCTTCGTGAGACTCGAAGGCGATTTGT
GCAAACGATAAGCAATATCTAAAAGCAGTCAAGGCTTTGAAGCCCTTGAAACGTTCTGAT
TTATATACGAGAACTGATAATTTCTATTTTTGGTGTTGGTTATATTATTCTATACGGTTT
TAAATGCCATTTCTTTTTTTTTTATTGATTAGATGAATTTACGATTTCGAAGCTGATTCG
ATTTCACTACTCTAGAGGTTTTCGTTCGTTTACGCTAAAAAGTACCTTATAATGATAGCG
GTTTTTTTTTTTTTAAATGAGATTTAATATTTAATGGATTTAAAATAATGCTTAGGTTGT
AATAACGATACGGTTTCTTTTTAGTTGTTCTTTTTGTTTTTTCGGCCGTCAGAAGGGGCA
GTTTTAGTTTTTGTATACTTTAAAAAGATAAAAATATATATATATTCGAAGAAATATCAA
TCGAGCTCTCTCACCGTGAAGAAGTCGTTTGTAAAGTGTCTTTCTCATTTTTATACCTGC
ATGTAGTTAGGGAGCCACAAGATCTTTTCATATCCTAGCTAGAAATTATGAAAAACAATG
CTTTTCCATTTAAAATTAGCATGTAGGCGTTATATTACACATAAAATTCTCTGTTATTAT
GTATGTGTAAATTGAACGTGTTGCAGTCTAATTGTGTTTGAAGATATCTTCACTAATGAC
TCCAGCTAGCTCCCTCTAC
(3379 bp)

- SilkBase 1999-2023 -