SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMSG_c25318_g1_i2
Scaffold_idBomo_Chr3
NCBI non-redundant
(nr)		polypeptide_N-acetylgalactosaminyltransferase_5_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000139 C Golgi membrane
GO:0004653 F polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005795 C Golgi stack
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0009312 P oligosaccharide biosynthetic process
GO:0012505 C endomembrane system
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016757 F glycosyltransferase activity
GO:0030246 F carbohydrate binding
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:11.68 TPM:6.08
ORF EntryO_BomoMSG15892_complete:A_BomoMSG_c25318_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
CGAAGGCTGAATGTCGTCGCTTTGTCTCAGCAATTTATTTAATTGCAGTTCGCGGTTGCC
GCGAGCTAATAGTTTTATCTATCGCATTTTAAAGCCTCATTTAAAATATTTGTAAATGTT
TAATTAATGTAAAGGTGCCTTTTAAGTGAATCGTGATAAATTGAGCAATCGTAATCGTAT
CATTGGGTTGGATTGAAATTGTCAGAAGCCAGTGACCCGTGGTGTATTCGTTAAAATGTT
CCGAAGTAAAATAAGGATTCACACGTGTCGTATTATCCTGCTGACGTCCTTGGCTTGGTT
ACTGGTGGACGTTATGCTGCTGGCTATGTATTCGGACTGCTTCGGCGACGGATGTAATCA
GAAGACTGTTACTAGTGAAATTTCAATTGGGAAGGAGGCATACAAAGGGAAAAAAGCAGC
AATTGCTGCAGCACTTCAACAGGATGTAGGTGATGATGATACAAATTTAGAAGAGAATGT
ATTGGGCCAAGAGGTTGAGGATGATGGGGTTTTATTATCTCCATATCCAAGGTCAAGACT
CAAAAGGTGGCAGCGAGCACCTTCTGTGATACCCCAGGGAGAATCACCTGGTGAAATGGG
TAAGGCTGTGAACATTCCGATTGAGCAGGAGAAGTTGATGTTAGATAAATTCCAAGAGAA
CCAATTCAATCTTTTGGCCAGCGATATGATCTCACTCAACAGGTCACTGACCGACGTCAG
ATTCGAAAAATGCAAGGACAAGCAATATCCAGAGTTGATGCCAACGACGAGCGTAGTTAT
AGTGTTCCACAACGAGGCCTGGTCGACTCTAATCAGAACTATATGGAGCACGATAAACAG
GTCGCCGAAAGCTCTGCTCAAAGAAATTATTCTCGTTGATGACGCTAGTGAAAAAGAACA
CCTGGGAAAGAAGCTGGAAGATTACATAAAGACATTGCCCGTTTCGACTCGCCTCTTCCG
TACAGAGAAACGTTCCGGTCTCATCAGGGCTCGTCTGCTCGGAGCCAAACATGTACTCGG
TGACGTCATCACCTTCTTGGACGCACATTGTGAATGTACAGAGGGGTGGTTGGAGCCACT
GCTGGCGCGCATCGTGGAAGACAGAGCGACGGTCGTGTGTCCGATCATAGACGTTATATC
GGATACGACATTCGAATACATTCAGGCTTCCGACATGACGTGGGGCGGCTTCAACTGGAA
ACTTAACTTTAGATGGTATCGCGTTCCCGAACGCGAGATGTCACGACGCGGAGGGGACCG
TACAGCGCCACTTCGTACCCCGACCATGGCGGGCGGACTCTTCGCCATCGACAAGGAATA
CTTCTATAAAATCGGTTCTTACGACGAAGGCATGGACATTTGGGGCGGCGAGAACCTTGA
GATGAGCTTTAGGGTGTGGCAGTGCGGCGGGCGGCTCGAGATCGTGCCGTGCTCGCACGT
GGGCCACGTGTTCCGCGACAAGTCCCCGTACTCGTTCCCGGGCGGCGTTCAGAACGTTGT
GTTGCACAACGCGGCCCGCGTCGCCGAAGTCTGGATGGACGAGTGGGGAGATTTCTATTA
CGCCATGAATCCAGGTGCGTTGAACGTCCCGGTCGGTGACGTCAGCGAGAGGAAAGCTTT
AAGAGAACGTCTCAAGTGCAAGAGCTTCAGGTGGTACCTCGAGAACATCTACCCCGAGAG
TCAAATGCCTCTCGAGTACTATTACCTTGGAGAGATTCGTAACGCGGAAACATCGAACTG
TTTGGACACCCTCGGCGGCAAGGCTGGCCAGCCGCTCGGCATGGGCTACTGTCACGGAAT
GGGAGGCAACCAGGTGTTTGCTTACACGAAACGCAAGCAAGTAATGTCGGACGACAACTG
TTTGGATGCGGCGCATCCGCGTGGACCCATCAAGCTGATCCGGTGTCACGGCATGAGGGG
CAACCAGGAGTGGATATACGACACCAAGACGCGGACAATAAAGCACACGAACACGGGCAT
GTGTCTCGACAAGCCGGACGCGTCGGACGTGTGGAAGCCGGTGCTGCGGGCCTGCGACAA
GTCCCGGGGACAGCAGTGGCTGATGCAGGTCGACTTCAAGTGGCAGGCCAGGCGGAACCA
GAACAGCTAGTCCCCACTCGCACCGTGCAAGGTTTGACAACGATAGACCATACCAGTCTT
CCTATACTTTCATTATTTTATATCAGATCTTATTCCTAAAATAAAATTTATATTTACTAG
ATTTTAATATAACACACACGAGGTCCTATGAACCATTGACAATACATATTATTATGCTGT
AAATCACAATGAAAGTTGCTCAAGTAGATATTGTGTGTTTTGTTTGATGTTTTCGTGTAT
TCTATTCAGTGTCTATAGCGACTTACTTAAAAGAAATAAAAAATTATATTTATAGCACAC
ACAAAGGAAGGGCCTTACAAAATATATTTCAAGTTTAAAATCCTATATTAAATTTCATAT
TTTACTATTTGAATTTTTGTTAGCAATATGTTTTTTTTTTTCAATGTTCGCTTTTATGGC
TTTCCGAAGGGTATCAGCCAAAACATATTAATACAAAATCGGTTTGTAGCCTGTTTTAAA
ACATCAAGGCTATTAATAATTATAGTTATTCCATCACAGTAGAAATAAAACGAGTTTAAT
ATTATAATTAGATAATATTGTATAAAATTCCCACATATCTTTGCCCCTTTCGCTGATTTT
TTTAGTTGTCAGAGAAGTAGTATTCTAGAAATATTTTAATTATTTTTTTCCAGAACTGAA
TAGAATACACGGAAATAATGTAATTGTAATAAAGAAGAGAAATATATGTTTATAAATTGT
GTAATAATTCATTATTATTATAACTATATTTTTATGAGCTAGAGGTTGTATTTAGGTAAT
GTTCATTTGAAATTATTCTGTAGAGTCGTTGTATTTACACGATAGGTCATTAAATTTATG
ATTACAAAAAGGATGTATATGGCACTCCGCAATTTTATTCTATTTACAATTTATTAGAGT
TAGGAACTAGACAAATATTTTTGTTGATTTCACTCCATGGCAAGTAAGTTTGATATGTGT
TAAGAAGTGCACATTATATTCAAACCGTTGGCAGAATATCTATTGTTCATTATGTTGGTA
GATAACATAATGAAAGAAAGATATTGTTTCCAGCAGAATACTGGAAATAGCATATCATTA
CATATAATGATGACATTTATAAATATTTTGCTTTATTTGAATGTTTGCTTCTATTCAAAA
TATTTATACAATATGAACTCTTATGAAAATGTATATATGTATTCTCGTTAATTATCATTT
AAATTATATGTATATAGTCTGTCACGTTCGATAAAAAAAAAAGTTACATTTCCCCTGGTC
TAGCCATTTTTCATATAAAATGATGTTCTAATAGGCTCATTAGACGGTTACTCTTTTGAA
CGAATTTGAAACATTATTTCATATCTGACTTTACTAATGGATTATTTTGAAAATTATCTG
AACTTGTGAAATTCTGGATTTATTATGAAACCCAAAGAAGCGAGTTTGTTAACGTTATCG
ATAGCGTAAAAGTTAACTTAAATTTATATGCATTTGGAACAGCGCCCCTAGCGGCTAATG
TAGGCAAACGTCTTAAGACATGTGGCGATATCCACGTTATGATTTCTATTTTGCGATGAT
GATCTATGCTAGGGGTCGCGACCATGTAGGGATCGTCAGAAGGTTGTTAGAGGTCGCTAT
TGTTTAATTTTTCAGTTGATTTAGCAGCTCACAATACGCCCTCGCTAAATCTTTTCATCC
ACAGAAGGGGTCGTAGTCGAAAAAAGTTTGCGCTCTAAATAGAAACATTAAATTAGTAAA
CAGGTTTTTTCGAACGCTTTTCTTTGTGGTTTTGAAAATGTTTGCGATCCGTTATTTGTC
TTCGTTTTTGGCACACTGTGTAAGCTGTACATACTTTCACTAAATTATTATTTTTTTGTA
AGAACCTTCCATAAAGTTTTGGATTTGTATTTTTTTTAAAGTTTTAATTGAGTTAAAGCG
TACTTTACATTCAGGTAGCATTGTAGTATAATATAATGTTGAGAAAGAATATTGTCATCG
TTGATAGATCGTCTATAATAAATCAACAGTCATCCTATCTGTTGCCTTAGTTATTTGTAA
TCATTCACGTTATTCTTAAGTCATGTGTTAATAATATTTTAGTGTATTTTTAAAATACTT
ATTGTGTAGGTCTCGAAGGAATTGCCTGTAATTTTCTTATAGTGGAATTATATTAGATTA
GTCCCATTCGAATTCATTCCTTTGCATTTCAAAAACTTAGGATTGACCCGAACAACGGGT
CTTGTCATTTCACTTCTGTAGATTATACGTTTTCGTAACGATTAGGGCCCACTTATGATC
CTCTCGATGCCGAATTATTATTGTTGTAATTTTATTAAACAGTCTGCACCGGGCTCGAAA
TGAGAATATTCTAATAATAACTATCCTAATATATGTATGCGGAAAAAATATTCTTTGCGC
AGCATTAATTGGATACGTTTTTTTTTGTAACTGAATTTTGCTTCCCAGTAACAATTTTTT
TCTCTTCCTTACCCGATATCTAAAAATAAATTAATAACTTAACAAAATAAAATTTTTTTT
TATTTAAAACAAAATTTTCTAGCATATCACTATTATAATGTTGTAAATGAAATTTTTATT
AGGGATTTAAATATAATTGTTATTTATTGCAAATTGAACAATAATACATCACAGACACGT
TTTAGATTAATAGACTATAAAAGCATTGCATAGAGCGAACGAAATTAAATTGTGTATAAT
AATTGAATGAAGACGTCACGCCCTCTGTATGTTAAAGGAAGATTTAACTTTATTTAAATA
TATTTTTCAGATTTCTTTTTACGATGATGACTAATAGAAAGTTTTCAATTGCATTGTTTC
TTTGGTATTGGGACGTAAAATGACGTGTCGTCCAGCGATTTAAGGTTTATATATTGATCA
ATTGCGTTTTATTAAAGTTTACCAATATTTATTCAAGACGGTTTTCACAAGACATTAGTC
ATAGGACATTGAGGAGTAGCTCGAAGATTTAGCATGGTCTCGTTGAAATTATTCAATGGA
TTTTATTCTTTTAAAATAAGGCACTGTTTAGTCATCGAAGCTAATCGTTCTGACAGCAAA
AACATAGTTATCCAGGGTACGTCTTATTCGTTTTGTTACGCGAAATAAAGTGACCACTGC
CATTTCATTTTATATACACCATTATTTTATAACTAGTACAAAAATTTTAAGGACATATTA
GGGAAGACATTATTATCATATATGTGATGGAAAAATCTCATAATACCTTTAAATGGCAAA
GTTATTATCATTTGTTTATTGTAAAAAATCTCACTGAAATCATGGACATATTACTTTACA
ATCCATTCATTAGTTCATTGAACTTCATTGATGGTATTCCATCCTACTCATTCGCATTCG
TACTGTCGCACTTGTGACGTAGATGGCCTTAGACAATAAAATGAAACAAAAGAACATGTG
ATGTAGTTACCTACTTTATTTAATTTTCTAAATTCTAACCTCTCCTTCATATTCATCCGG
GCTTAGGACCGGCAAAATTACCTTTTTACAATTAATTAAATACGTATGTGATTAGAAAAC
AATAAACAAATATAACAATAAAATAAGGTATTCTGTACTAAAAGAAAAGAGAAATTTTGG
CATATTTATGAAGTTAGAATCAGGTGCTATTTACAATAATTATTTACATAGGTATTATTT
ACTAAACTTACAAGTATTTCAATTGTCCTTCGAAATGTCCGCCACTATTGTTAATACACA
GACGGGCTCGTTTCATTAAATTGTTTTTAACGAGAGAAGTACGCTTCTCTGTCTTTTCAC
TTCGTGAATAGCGTCCAATATGCGCTGTTTTAATCATTCGAGCCTAATTCGCTCGCTTCT
GTGCACACGTCTCTTAATTTCACTCCACAAAAAGAAGTCCATGGGCGTTAATTCTTGAGA
TTTCCTGTAGTGATATGGATGTAATGGAGCCTTATTAATAATCTTCCAGACACAGGACTG
GCTGATGTTAAGCCGTCGATCAGCGTCATTTGTACTCCGCCGGGGATCCTCTTCAAAATA
CGCTAGTACATCGTCGTACAGATTTTGTGACAACGCCGGTCTTCCTCGTTCTTGACGTAC
GTAGGTGACCGTGCGTGGAATGAACCGTGATCTAGTAAACGCTGGTAAGCATTTACCACG
GTTCGCACATTTGGCTGTCGAGCGTTTGGGTGTCTTCCCTGTACATACGTACAGCTGCAC
TCGCGTTTTCTCCACTCAAAAAGTACGCACGAAGCATAGCTACATACTCCCGTGATCTGA
ACTGATAAGCCATCGCGTCAGGGAAAACTTAAACAAACAACTGTTGCAACGAAAAAAAGC
ATGCGCACACTTCCGATAACAATTTAGCACTGTTTTTTGTCGTTGTTGCGTCGGGGCACG
GCGCGGGCGCAGAGGGACAAGGGGTGGTTGGTGGGCTTCGACTTGCGTTTCCCGGAATTT
ATCAATGGAGCAGCGCCCCGTAGGTACCCAAACCCCGCCGCACGTACCTACTATCGGTCA
TTGATTGATTTTTTTAATAATTATTTAGCATTTACCAGTTATTACGTATTTTTGTGGACA
GTTTTGAGACTTAGTGTTTTTTATTTTTTAACTACACAAATATGATTAGTTAAAGATACT
TAGAGACCAGTTAAATTTTTTGTATTAATTAAAAAATAGGGGTGTATATAATTTTTAAAG
TTATTTGAATTCTTAACAACTCTTAGTTTATGATTGATTAATTGGGAAACAGGTCTTCCG
AATTATGGGAATTTGTTTACTATAAGATCGCTGTAATGAACTACATAATCTTTTAAGCAG
TGTTATTTATAGTCTGTAGTTTGTAATCCTATTTGTAAATAAGTTGTTATTACGAAGATT
CGTCCGATTTACAACAAAATGTTATGTGAAAAGAGAGCATTTATTTTATCTGTTTAAGAT
TAGAATCTCAGTTTGATTTTTTTATGTAATTCATGGTCAAAGTGCCAAATTGATGATGAC
TTGTGTTTATATATATATATATGAGTTATAACAACCAATACA
(7122 bp)

- SilkBase 1999-2023 -