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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMSG_c14358_g1_i1
Scaffold_idBomo_Chr25
NCBI non-redundant
(nr)		viral_IAP-associated_factor_homolog_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006915 P apoptotic process
GO:0008479 F queuine tRNA-ribosyltransferase activity
GO:0008616 P queuosine biosynthetic process
GO:0043281 P regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
Transcript
Level		FPKM:27.81 TPM:14.47
ORF EntryO_BomoMSG3826_complete:A_BomoMSG_c14358_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
GTTAAGTCTATGGAAAAAATATCTGGTGTCAAATTTCCTGAAAAGCTGGAGCAAGTTTAT
GTATTTCAACTATTAGAATTTTAATTGTTAATTTAATAAAATGCAGAACCCCAATGAAGA
TACAGAATGGAACGATACCCTTCGAAAGATGGGTATTATACCGCAGAAAGAAGCGGAGTT
TTCGGAGGCCGATATTGTGAACATGATAGAGGACACAATACAGCAAAAGGAAGCTGAAAA
ACAAAAACAATTATCTGAGTTAGACCTTGATGGATTGGACGAACTTGAAGATTCAGAAGA
TGAGGCTGTTATAGAAGAGTACCGCAGGAAACGATTAGCAGAAATTAAGAAGCTGTCTGA
GAAGCCTAGATTCGGAGAAGTGCGAGAAGTCTCTGGTCAAGATTATGTGCAGGAGGTTAA
CAAGGCTGGTCAAGACATTTGGGTGGTCATTCATTTGTACAAACAGGGAATACAACAATG
TGCACTAATAAATCAACATCTACGAGAATTAGCAGTCAAGTTTCCCTACACAAAATTCTT
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TGTTTACTTTGAGGGCGAAATGAAGCAGCAGTTTGTGGGGTCCCACGAACTAAGGGGCAC
CAGTTTGACTTGTGATGAACTCGAATACATACTCGGTAAGGTTGGAGCTGTCGAAACGAG
CATAACAGAAGATCCCCGACCAAAGATCAAAGACAAGTTGTTTACTGACCTTGGAAGTAA
TGACTGGTGATTTTAGAATATTAATTTATGTTAAAGTTAATTTATATTTTATGTTACATC
TAACAGTATGTTTTTTTTTTAAACTGTATTCTGTCGCTTTACTTATCAAAAGCTTCTTAT
GTGAACTGTATTAAATTAATATATTAAGGTTTGTGCTAAATGAGCATCATTATCAAGTGA
ACTTGTGTTGTTATATAGGACCCCGTTGTAAAAAAAAATCTATAGTAATGGCGTATATAC
AGAGACCGGTTAACCCATGTCTGATGGCAGTCTTTTTGTGGTAATTGATTCAAATAAAAA
TTAAAACTTCTTTAGTCGCAAACAATTGATATAACTAGATTTAATTGTTACAACAAAACT
TGCGAAAGTATGTGACTGTATGAAATTCAAGTCATATATTTTGATTTAAACGGTCAGGTC
AAAGGGCATTTGTTTATTTAATCCTTTGAAAAAAAAAAATTTGCTCACTGACCTCTTATA
AATGAGGACAAATAAGCCTCGCGTCGCAGCGCAGTTGGTCACTCACACAGGGCTACAGGT
TTTAGTTCAATAATATAGTAACAAATATATTTTTATACAAATGTATTGTAGATGAGACTA
AAAGAAATGAATTTGTAATTTTTTTCGTTCAAACATACACTAGGGCCTATCCAAAACTTT
ATAACGAAGGCGGGAATCATGTCTGTCTTAATAGAATGAAATTATTTATGAAAATATGAA
TATATTTTTGCCTTATTGTATTTATAAAAGTTATATTGAAAATTTTTGCCTTCTGGGATG
TAGTATTACTAATTTCTTGTTTTTAATGCACAATGTTAATTTATTTGTTTATTTACTCAT
TGTCCATAAATACAATTCGTAACCGGATGCTAATAACAAAATAGTCTGATTAGTACTTCA
TCAAGCGCATACAGTTTGTATACCCAGTTATGGGACTTTTTTGGGGTTTTAATGCTTCAT
TGTATTTCTAGCTTTCGTGGAGTAAATGCTATTCTATATGTTTAAGTACTCTTCCCTGAT
AACTAAGACTTTGATCCAATTTGTGCACATCAATTCATAGTATGAGTATTCTACCAGCGC
CTCATGCTTTACGTTGACAATTACCCTATACGACATTATAATATGTGGTTAATCATTGTG
TATTTATGTACAATCAATGTCAGATCGTAGTATGTATAGATCTAAACTGATAAGTGTAAC
GAGGAATAGCACTAACACAAGAGCGGCTCGGTTACCTGTTGTAGCATAATTGATTAAAAC
CTTTGTTTTAAGAAATTATGAAGAAATGAAAAAAAATGTTAAAATTTTTTTTGTTCCATG
CAACACTTTAATGTCAATTACATGTCATTTAATTTAAATACACATATACCAATATATAAT
TACTAAAATAAAACGAAG
(2178 bp)

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