SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMSG_c12692_g1_i1
Scaffold_idBomo_Scaf078
NCBI non-redundant
(nr)		putative_conserved_plasma_membrane_protein_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0005319 F lipid transporter activity
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005635 C nuclear envelope
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005768 C endosome
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0007041 P lysosomal transport
GO:0007165 P signal transduction
GO:0008158 F hedgehog receptor activity
GO:0008202 P steroid metabolic process
GO:0008203 P cholesterol metabolic process
GO:0008206 P bile acid metabolic process
GO:0015485 F cholesterol binding
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030301 P cholesterol transport
GO:0031902 C late endosome membrane
GO:0042632 P cholesterol homeostasis
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
Transcript
Level		FPKM:372.51 TPM:193.79
ORF EntryO_BomoMSG3055_complete:A_BomoMSG_c12692_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
GGTAGGTATTCATTATTGAATGAAAGATATTGGATAATTGCCCGTAGCTGTGGCAGTCAG
TACGGCCGGCAGTGCTTAGCTGCGTTCATATAGTACTCGGCAGAGATAACATCAGTAGCA
AGAAGCGGCGCGCGCTCTCCGCATGTCCGTGCCGCAGTAAACAATTAGCTCTCAAATAAA
ACAGTAATGCATTCTGAGTGTGTGATTGTGACAAGTGATTATTTATTTATTTTTTTACAT
AACATTATTTAGATATGTAATGTGTTGCGACTCTTTAGAAGTATATTTATGCTTACATTA
CAAAAACTATTTACGAAATCATACAAAATAAATATGGCGCGAAATTAAATCATACTCAAC
AAGTGCAGTGAATTGTTCCAAAATGTCAAAAAAGAAAAATGTCAAGACTCCACAACAGAT
ATGGGAAGGGGTGTCATCTGTTTCGGTGCATTTTGTTGAAAGCATTTTTTTTTCGCTTGG
CATCTTTGTGGCAAAGCATCCATGGCAAGTCATTTTTGGGACATTATTATTTGTTACTGT
GAGCTGTATCGGCTTAATACGGTTCCACATAGAAAAGAATCCAATGAACTTATGGGTCCC
GCCAGATTCAGATTTTTATCACGATACAAACTGGTATATCAAAACATTCGGCACAGGCCT
CAGACTTCAAAACATTATTTTCACCGCAAATGATATATTACACCCAGATGTACTCATAGA
AATAAACGACATTACTGAGAGAATAAGTGCCCTAAATATTAAGTATGAAAATCAATCCAT
TTCTCTTACTGATTTGTGTTACAAAGTTCCTGTTGTGAATTTTTTTGGCTCAAACTTTAA
TACAGGGTCAATTAAAACTAGTGATAAAACAAATAATTCAGCTAATAGTGATTACAGTGA
CAGTGTTTTTGAAGACCCGACTTTATGGGTTGATAGTGAATTCTATTGCAGTTTCTTAGA
AGAATTTGAACTAACCTGTCTCCAATATAATTTGTTAGACATATGGAAGAATGATCTAAA
TATAATAAGTAGTTTGAATAAACATGATATTATAGAAAAAGTTAATTCGATTAAGGTCAA
CCCTGTAAGCGGCCATCCATTTGATTATACCAAAATATTAGGAGGTTTAGAATACGATGA
CAAAGGTAAAATTATTTCTGCCAAGTCTGTATTACTCACATTTTATACAAAAGTAAATAT
GTCAGAAGTCAATTTAGATGACGTAGGTAACTTGGTAGGTACAGAAGATTGGGTAACTGT
TCCACTGGCGTCTTGGGAAAAACAATTTTTGGAAGCTTTAACCAGCATCTCTCTTAATAC
TAAATCAGTCAAAATATTTTACGAAGCAGGTAGAAGTTTCGCTGACGTTAGTGGCGAAAG
CATGTTTCACGATTTAGACAAACTCTTTTTGGGGATTCTACTAATGTTCGTTTACGTACA
ATTTGGTCTATCCCGTTTTAATTGGTTGGAAATTAGATTGACTCTCGGAAGCGTAGGTTT
ATTGTGTGTAGGATTAGCATACGTATCTGCCGTTAGTTGGTGTTCTATTGTTGGTATCCC
ATTTGGTCCGGTTCATTCTTCATTACCATTCCTTCTAATGGGTCTCGGTATAGACGATAT
GTTTGTAATGAAAGCCTGCTGGAAAAATCTATCGGAAAGTGAAGCAAAGAAAAGTCTCCC
GGTAAAAATTGGTTTGATGCTAAAACATGCAGGCGTATCAATCGTGATAACTTCATTTAC
AGATATAGTTGCTCTATTGATTGGAGCCATAACAATTCTTCCATCACTAAAATCTTTTTG
CCTATACGCAGCGACGGGCGTCTTTTTTATATTTTGTTTTTCCGTAACGTTTTATGTAGC
AGTCTTTACTTTGGATGTAATAAGAATTGAAAATAATTGCAATGGTCTTATTTTCTGCTA
TCAGCATAAGAACCAAATACAGATATCCACGAAAAAGACTTGTCTGAGAAATATTTTTGA
ATTCGTATATAGGAATATTATTTTTACGATTCCGGGAAAAATTATTGTAATTTTGTTCAC
TATAGTAATAACAGGATTTAGTATACAAGCTGTTTTCAAGTTGGAACAAAGGTTTGACCC
TAAATGGTTTATTCCTGACGACACCTATTACAAACAATATCTTGATACTCATGATCACTA
TTACCCCGAAAACGGGAACGACGCAATGGTGTTTCTCGGAAAACTCAATTACAGAAAAGA
GTTTCCAAACCTGTGTAAAATGATGGAAAGCATTGGTAATAAATCGTATGTGAGCGAGGC
TATGACATCGATTGAATATCTGCATAAATATGTTTTGATAAATTACAATACCGATCTAAA
AAATACATCCTCAGTAACTGATTTTGAATTTTATCAGTATTTATCACGGTTTCTATTTAG
CCCTGTGGGAGGGAAGTTTCAGGCCAACTTTAAATTTTCTGAACCATTATCATGCGGAGT
AGCCGCCCCAAGAATTTTAGCCACTTCAATTCCATTCAAATTTACAAAATTCCATGGTCC
TGAAGAATATATTCCCGCTATGCATGAGGTTAAGAACATTGTAAAAACAGCCAGCATAGC
AGGTGACGTTTACCGCAGTGTGTGGTCAAGAGTATTCGGAAATTGGGTAACTGACGAGGT
AATTGCAAACGAAGTTGAGAGAAACATTGAACTAGCTTTGATTTGTGTTATGGTTTGTAC
GATTATATTAATAACAAATCTTCAGATGTGTTTCTGGATTTTTATTTGTGTCTCGTTAAC
AATTTTGAACGTTTTAGGATGGATGCAGAGATGGGGAATGACAGTAGATATAGTTTGTTG
TATTGGTCTTGAATTAGCCATTGGTCTGTGCGTAGATTACGCAGCGCATGTAGGCCATAC
ATTTTTAACCATCCAGGACGGATCGCGACACGAAAGAGCTTACAAAACAGTAACGTCCAT
TGGCACAGCAGTGCTTTTAGGTGGTGGTTCCACTCTCCTCTCTCTGTCTTTACTTAGTAT
GTCAAAGGCTTACACGTTCCAATCATTTTTCAAAATCTTCCTTCTGGTTATATTATTCGG
ACTTTTTAACGGCTTAATATTTTTACCAGTGGTCTTGTCTCTAATAGGCCCTGGATCGTA
CAAAATAAAAGATCACACCGTCGACTGTCAATCTCATCAATATGAATTAAACGAAAAACA
AACCGACGATGGTTTGCATACAAATTAATTTTTTTTAGTAATAGTAACAAAAGAAAAGGA
TATTTTTTTAACAGAAGGTACCTATTTAATATCGATTTATTACCTTATTTCCTTCCTTAT
TTTTAGTCCTACTATACATTTTCAGCGGTCACGGTTGACTGATTATGGGAATATTTTACT
ATAAATATGCAATTTGAAACGTAAATCTTTCTTTTAATTACGCTATAACTCGTGAAATTA
TAAAAAATACATAACATTAAACATAATATTATGTACTAAAAAATTATGAATACAAATTAT
TATTGGTTGTACCAACTCACTGATGTATTATTACTTTTCCCTTCGTGTATCACGCTTAAA
TTAGTTACTAACTAAACTGATTTTGATAAAGCTATTGTCGAAAACGTCATAAAAATATTT
TAAGTCGCTACGATGCGGAGACTGATAATTTTTTCGTAACAAAATTCGATCTGTTTCGGT
GGAGCGGATATTTAACATCATTTATACCGAAGTCGGTATGCATAATAGGCGCGAATAGAT
CAGCCTGAAACTCATCGAAGTTTAATAATTATAATTATTTGTATATACCAAATTAGACTT
AGCGTAGCTAGGAGTTTGTAATCTGAATAAAAATGTAAAGACGATATGTAGTCTTACAGG
TATTTATAAAGTTGATGTATTTATATCTACATTTATCGCTGCAGATAATTCGATAATCGG
CACACTAAGTCATTATAAGTGTATTATGTACTGTATAATGTAAATACAATATAAACACCG
TTTTAATTAATAGTATTTACTAACAATAAACAGTTTCTCATAAATCGCAAAGATCCCTAC
ATAATGTGACAGGTATTTTCTTTGTACATTTGTTTAGTCAAATGCGTAGGCAAAAAGTAC
AATATATTTTAAATGACAGCAATGACAATAGCGTAACATTATAAGAGTACATAGTAGTCT
TTTGAATGTTGATGTAAAGAATATATTTATTTTTCGTATGATTAGTATTTACTTGCGTAT
TATCTAGTAAACCTATATACTTACTATCAATGCACTCCCAATAATAGGTCGAAGTCGATA
ACAAATCTTTTGGATGGCATGCAAGGTCATGACGCAGAATGGTTATCACAATGCACGGTG
TATTGTTTATAAATTATTGAAAATTCAAATCTCGTTAAATTATTGTTGATAATTAATTCT
CTACGAAATGATGTATAAATATTTTATCTTCTAATATTTGTGTTTAGTTTAAGCAACGTT
TCAATGTTATGTTAACATTATTCTTAATAAATAAAATATGTTTTAAATTACTGTAAACCT
ATATAGGTACTTATAATAGAACTAAGTTTTGCATAGTATAGTGAAAACCTTCCACGACGT
TAAATTAGAAATGTATTTAATGAATTAAGTTGTATCTTGGTGCATGGATGATACTTGTCA
TGAAACATCAACATGTAATCTCCATCGACAACAATGGTTTGAACTGTATATTTTTTTTAT
TTTTGATGTTAATGCACTGTCGATTGCACCTATAATTGAGGTGACATCTGCCATGAACTT
TTGTCAATTTGTCAATGTTTTGTATTGATGATCACTTTGTTGGTGCAACTTAATAAATAA
ATAAATAAATAAAACTCAATCGTAAGAACGATAAGCGAATGCTTAGAGCATATACAAACA
TACAACAAAGGCTACCAATGTGTTTTATTTAAGATAATACAACATCATTGTAACTATAAA
GAGCGAACATTTTTATCACCTATCTACGCGTCTTAATTTCGAGTCAAACTCATAAATGTG
AGACAATAAATTTATTTATTTCTTTTGTAAAGAGACTAATCCATGTTGTCGACAGTAGAC
AAGGCACTGTAAGGTAGGTCAATTGTTATCTTCGGATTTCTGAATGTTAAACTCGGATAA
GATAGGTAAATAAGAATTAAACAACTTGTTATATGAAAAAAAAAAAAAAA
(5150 bp)

- SilkBase 1999-2023 -