SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMSG_c11821_g1_i1
Scaffold_idBomo_Chr17
NCBI non-redundant
(nr)		KDEL_endoplasmic_reticulum_protein_retention_receptor_2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005046 F KDEL sequence binding
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0006621 P protein retention in ER lumen
GO:0006810 P transport
GO:0006890 P retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016192 P vesicle-mediated transport
GO:0019233 P sensory perception of pain
GO:0030140 C trans-Golgi network transport vesicle
GO:0046923 F ER retention sequence binding
Transcript
Level		FPKM:131.03 TPM:68.17
ORF EntryO_BomoMSG2788_complete:A_BomoMSG_c11821_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CCTCATTATGTTATTGACATCAAATACGTCGTTTGTCATGTCAAATGGCCACGTCATTTT
GGCTTGAATGAGAGGCATACGCGGCGATCTTATAATTAATTGTATAACGAACAAATAATA
GAAACATGAATATATTCCGTTTGCTTGGTGATCTATCCCACCTGTTAGCTATAATAATAT
TGTTATTAAAGATTTGGAAATCAAGATCATGTGCAGGGATATCAGGAAAGTCTCAGATTC
TGTTTTCAGTGGTATACACGACACGTTATTTGGATCTACTTACAACTCATGTGTCCCCGT
ATAACACTGTCATGAAGTTGGTGTTCATCTTTACCTCCTATGCAACTATTTATTTGATGT
ATGTCAAGTTTAAGGCCACCTATGATCACAACCATGACACATTCAGGATTGAATTTCTAC
TGATCCCCACCTTTATCTTGGCTTTATTGATAAACCATGAGTTTACTGTTTTGGAGGTAT
TGTGGACTTTTTCCATTTATTTGGAATCTGTCGCTATTCTACCTCAACTGTTCCTGGTTT
CAAAAACAAGAGAGGCCGAAAGCATTACCTCTCATTATCTGTTTGCTTTAGGTTCATATA
GAGCTCTGTACCTCTTGAACTGGGTTTACCGTTATGTTGTGGAGTCTCACTATGAGTTGA
TAGCGATTATCTCGGGTGTTGTGCAGACAATTCTGTACTGTGATTTCTTTTACCTTTACA
TTACGAAAGTGTTGAAGGGAAAGAAACTACAGTTGCCAGCTTAAGTTTTTTGATAATATC
TGTTTAAATGTTTTTGGTGTGAACCAATAAATTACCTAAGATTTAGTTTGTATAAACTTT
GTCTGTTTTGTGCTATTGTGAAATTGTTTATTAACTAATCACAATGTATGATTGTAATAC
TGCAACAAAATGAATGCAGTCACAAGCAATAAATAATTATTATATGGTATTTAGGATTTT
TTAATTTGGTACAACAAATGTAAAAAAGGATAAAATTATTACAAGAAAATTCCTAGGATT
TCTTATGTATGTTTGAAGTACTATGGACTAATATGTATTTAAAATTATAATTACGTAAGT
GGTGGTACTTGAGGTAAGAAAAAATGCAGTCAGTAAGTATATACACAAGTGTAGTTCATT
AACATCAAAAGTATGGCTGTTTGTGGCATTCCATTTTTAACTTCCTGTCCTGATCATTAA
ATTCCCTAAAGTGGTATGTACCATATTATTTTGCCCTAATAATCGATAATTCAGAACTTG
TCTGTTTTGTAAGTGTTTAAAGACACTTTAATTTTCGTATTCTGTATTGGAATAAATTTA
TAGAGTCATAATTGTTTTATTTTTTATAATTGAGCCATTTAACGAGAAATTACTAGGTAG
TAGTTTTCAGTTTGCCCTTAAAATCTATAATAAGTTTAGTAAATTGGACTCTGTAGCTGT
GACATTATTGTATGTGACTGCTTTTACATTTTACGTAAATTTAAATAAATGAGTACTTTC
GTATTAGATTGACGAATAAGTTCAAAATATTATGAATACCTTCAATTATGACTGGTTTTG
CCAATATTTATTTCTTATAATTACACAGGGTCAATTTTTAGTGGTGAATCAAATATTTTT
CTTAGTTGATCATACAATTACTTTCACTGGTAGTTAAATAATTAAAATTTTGTTATCTAA
TTTATTTTGAATTATTGGCAACATTTCATTAGGTTTCGCGTTTATCACGACCACGACTAG
AATTTTGCTGGCTGCATTTTGTTTTGGTGTGAACAAGATTTGGTGTGGTGTACCAAGAGC
AGCAAAGTACTATTTTTTGTATGTAAGTATACAAATGTAATTCCGACGAGTTAAGTGATC
CGACTGCGGGACCATGGAACACAACAGTAACACTGATAGTATTTCTTTTTAATAATTAAA
TAGCTTATTGATTGTGACCAATGTAAATGGTTCGTCTTTGACTTTATTGCGAAATGCAGC
TTCGATTCACCATTAAACATTCACCCTATATAGGACTTAGATATAGGATGAATCCATTAT
AAACAATTAAAAAAAATCGCGTCTTCTAAATCAAAGTAACATTAATTTAGACTAACACAA
TAATATGTATGTATAAGGTAGAGCCGACTAGAGCCAAATTTAGTATTATAATATATTTTT
TATGTGTATGAATTTCATATTATTTGTTGGATTTGGTGTGCCTATAAATGATAGGCAAAC
TACATAATAGGTTAATGTATGGAAGATTTCCTATCGGTAATTTCTTCCATACATTGATTT
AATACAATATAGTTTAAATAAGGATACGTTTTACTGTGTGCGCGTTTATATTTTTCATTT
ATTACTTTAAAAAAGAACGTAGCCAGTTTCGGGCGTGTTTAATTTTAATAAAAGTAATTA
ATAAAAAAAAAAAA
(2414 bp)

- SilkBase 1999-2023 -