SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp49440_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr3
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_serine/threonine-protein_phosphatase_2A_catalytic_subunit_beta_isoform_isoform_X1_[Papilio_polytes]
Ontology
GO:0000775 C chromosome, centromeric region
GO:0000922 C spindle pole
GO:0004721 F phosphoprotein phosphatase activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005694 C chromosome
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0006470 P protein dephosphorylation
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0046982 F protein heterodimerization activity
GO:0051321 P meiotic cell cycle
Transcript
Level		FPKM:38.26 TPM:30.23
ORF EntryO_BomoMG27178_complete:A_BomoMG_comp49440_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TGACGTCACGCAAACGCCATTTTGTAAAGTGTCCGCTTTAGTCAATTTTTTGAAAAAGTG
TAAAATAGTTATTTCGCATGATTTTGTGTACATTAAATACCTAATAAAAGCCAAAGTTTG
AATTAACGTCTTGTACGTTAATCACACACATAATTATAATGGAGGACAAGGCGTCGCTTA
AAGAACTAGATCAATGGATACAACAGCTAAATGAATGCAAGCAATTGACAGAAAATCAAG
TTAAAACGTTATGTGACAAGGCAAAGGAGATCCTGACGAAGGAATCTAACGTCCAAGAAG
TAAAATGTCCGGTGACCGTATGCGGCGACGTGCACGGTCAGTTTCACGACTTGATGGAGC
TGTTCCGCATCGGGGGACGTTCTCCGGATACCAACTACCTGTTCATGGGCGACTACGTGG
ACCGCGGCTACTACAGTGTCGAAACGGTCACATTGCTCGTTGCGCTTAAGGTGCGTTACC
GCGAGAGAATAACCATTCTGCGAGGAAATCACGAATCGCGTCAGATTACTCAAGTGTACG
GCTTCTACGACGAGTGTCTCCGGAAATACGGCAACGCGTCCGTCTGGAAGCACTTCACCG
ATCTATTCGATTTCCTGCCCTTGACGGCGCTCGTAGATGGACAGATATTCTGCCTGCACG
GTGGACTCAGTCCGTCAATCGACACCCTCGACCACATCAGAGCTCTGGACCGTCTGCAGG
AAGTGCCCCACGAAGGACCCATGTGCGATCTCCTCTGGAGTGATCCCGATGACAGAGGTG
GATGGGGCATATCTCCCCGTGGAGCCGGCTACACGTTCGGACAGGACATCTCGGAGACGT
TCAACCACAGCAACGGGCTCACGCTCGTGTCCCGCGCCCACCAGCTCGTCATGGAGGGGT
ACAACTGGTGCCACGACAGAAACGTCGTCACTATATTCTCAGCGCCCAACTACTGCTATA
GATGTGGTAATCAAGCCGCCATAATGGAATTGGATGATGCACTCAAGTATTCATTCCTGC
AGTTCGACCCCGCCCCGCGCCGCGGCGAGCCGCACGTCACGCGGCGGACGCCAGATTACT
TCATGTAGGCTGCCCAAAAGGCGCATATCAAGCAGGAGCCGTGCCAGAGGCCCCCTGCCC
CCCGCCGCCTCGCCGCTTCCCCGCGCGCCCCCCCGCCACGGCTCCGCCACCACTACTCGC
GTTCTGCACGCCGTCACCCTACTCAACACAAACACTATAAACCCGTTTACACAGAATATG
ACACAGGACCATTCGTCTACTTACGTTCTTTTAACATTTTATTGACCGTAATCGAAGGGC
ACAAGGGCGTACGTAACAAGCCTTGTCATTTGTCGAATTGGCAATGGTATTATACATATT
GTTAAAATTTAACAAAGACCTTAAATGCTTTTTATAAGATCGCGCACGAGCGTGTCAAAC
TATAAAATGCATATTGCGAAGATTAGTACAAGGTTTTTTTAAATCGTCATTTTTGTACTG
CTCATTCTTGCCCGCGGGGTCCATCGATTGCGTTCCTGCAAGTTCGATCTTCGCGTGAAT
GTGTGCGTGTGTGATGCGAAGTGTGTTCTGTACGCGGACTTATTCTGGTGCGTTTTGAAA
ATTCGTTTAAAGTGCGCGTATATACAAAACGTTACGAGAATAAGGCCCCTCTGCTGTTCC
ATTTTTTAAATCCTGTACGTGCGAGATTGCTAGTCAATGTGTGATTGGAATACGTTATTG
TTGTACACACACACTGCAACCGGTGTAGTAGTGGAACGTTTTGTACCTTCAACGTGTGCT
TTAAATTCGAAACTTGGTCTAAATTGTGTCAAATAGTAAGTTGTGGTCGTACTACGCGGT
GTTGTCTTCAGCGTCAGAATCGCGCGAATATTAATGTCAAAATTATAAAAGCTTGGAAAC
AATCGGTGCTCTATGTATATTGCAAACGATTATTAATCTATGTCCGTACATAATTATAGA
TTTATCTTTGGTAATATAGATAGAGTATCGTTGAACGCATGTTTCGTATCGAAAACGAGC
AGTCCAATATAGAGAGATTGTAAAGTTTTAAAGGTGATTGTGTAAAATGAACTAAGAAGC
TTTATAGCGAATTTGGGTAACGTCTGATGAAAGTATTTGCGTAAAGTTTTCTTGTTACAT
TTTCTGCGTGACGGTTAAATGTCGCGCGTCATGTGTGACTAGGGTTCACGTTAGTAGAGG
AGGGCGGGGCCAACTAATTGCCCCTTGCACGGCTTCACCGGACAGTATTTGTTGGATGAG
AAATTCTAAACTAGCCTTACCTGACTGACTGGCTTCAAGTTTTGGCGAGATCAATTGAAA
TTTTTTGTGACCAATATGTGACAAATACATGTTAACACGATATAATGCTTTTGTGTAATT
TCTCATCAGCAAACATTGTCTCGTGGAGTCGCAGACGTGCGGGCGCGCGCGTTATGCTGG
TATGTTCATTAGCAGCCGAAAACAAAATGTATTACAACAATATGTATCAAAGACAATTAG
ACCTCATTAAACGGCGTTCATTTGCTAACAACGTAGTTTTATTTCGCATCCGCAAGTCAC
CAACGAATGAACAATGGACATACCATCATAATTCATCATTGGTGACTCTCATCAACTCAC
AGCTCACTCGGGTCTGACTAGACGCAGAGCTACAAACGCATCGTTGGTCTGCATGCTAAC
CGACGAAGCTCAATAATGTATTTATACGCTTTTTATCTACTCAGGTCCGTGTTTCAGTAA
AGGGCCGCGTCTTCGATAGTCCGATCTTAACGTGTTCGATAGCGAACAACTGACAATACG
TATATAATAATAAAATTGGTGTTTGAATAGAACCCACTATCGCTGAGACGCTGTCCTTTC
GTGTAAGTCTATAAAGAACGTACAATGGATGCACTTTTATATATATATTATGTAAACTTA
TCGATTCGTATTTACATTCTTCAATCGAACAATTCAATAAATAATACATTAGAATAAGAA
CTGTTAAAGTTATTCCACTCAGTAGTTTTGAATTTTTGCAAACATTACGTTACACAATTA
CAAGCGACCATCTCATTTTTATTATTTTTTACATAACCATCGTTGTACACTTTGTTCAGC
GGCGCGCATTTAATTTTATGGCAGAATGGTATTTTTTATGTTTAGTATAATTATTATATT
TAATTATGAATGAATCGCCCGACTGTAAGTCTTATAGAATATTAGTTATTAATGTATTCC
CAGTGCAATCGTTCTGTCATAAAATGTCGAAAAGTGCATTAATATATTGTTTATTCCATT
AAAGATTCAATTTTCTTTTCGAGTGACCAGTACCTGTAAAAGATGGAATAGTGTTTCACA
ATAGTGGAGCTTTAAGTTGGTATAATTTAATTATTTTAGGTAATTGTGTAAATACCTAAT
GATGAAGGCATTAAAATAGATTTTTTTATCGTTAAGTGTATGTTTGGAATGTCTCATTTG
GTTAAACACTTGACACGGCACCGGAGCGAGGTAAGTAAAACTATTAAATTTTAATTGCGA
TGTCATTACCATAGATGATAGAAGTAAGAGGATATGCAATGATGTTGACAACCAATTTGA
GCCACCATTATTATATACGCAGATGCAATTTGATACAAAACTTCCTCTGAAATGATTGAC
CTTTGATTTATCGATATAATATTATGCATGTTCGTTATTTGTTAACAATATTATTTATTG
TAATATTTAACACTTGTTGACAATAATGCGTTCCTTACATTGTGATGCTATGTTATACAC
TCAATATTATTCACATATTCGTGACATGATAACTTCCTAATAAGTTTTCCAGCAGAAGAA
GCTGAAACGCATGTTATTTTTCAACTTTCATGAGGATCCAGTGCTTCATACTATGCAGAA
TATCATAGTCGGATTTAGAGATTAAAGAACCGAAATGTATGAATTTTTTGATATTTTGTT
GTTCAGTGTTACTACAACATGCCTCTTGTCACGCATCCCCTCTTACTTCAATGGAATTTA
TTCAAGTTTGTAGTATTTTGACACGGATAAGTCATTACATAAGTGTGGAGGTGACTTTCT
ATATAACGTCCTATCAATGTTATCACTCACATGCATGTAAGACCTTGTCGACCTTTTTAA
ATATTTGAACGTTTTGGTCTTTTAAAGTATTCTAAATTCTTTATCTTTATTACATAATAA
AATCATTCTTTTATTTGTAGTGTTTGAACTGACAAAAGTAATAGTCGAGTAAATGTCTCG
AAATGAAAACACAAAACACTTTTGTTGGTGCCATCAAATTAATTTAAGAAAATTAATTCA
TTAGATTTCAAAAATAATGAATTTGATTTCCAACTATTTGTTTTGGAAACGCGTGTGTCG
TAAAATATACAAAGAGTATGCCCACCAACGACACCTGAAGCCACACGTTTCATTGATCTT
AAGTATTAAGTATGTAAGTTGTAGGTAAAATAAATAATAATAAAAAAGTGAAAAAATACA
AAAAAATTTATTAAATATATAATGATTCTGAGCGTCTCTAGCGTGGAATAAAAGTATAGT
ACAATGATAACTTGTTCGGTTCTAATTATTTCACACTAAAGACACTTGTATAAATAATTA
AGGCTTTCCTGGAAAATGCATAGAAACGCGAAGCCACTGTTGGAAAACAAATCTTTTTGT
ACCGGACGCCGCTAGAAGGTGTGCCACAAGTAATGTTCTCGACTAGTTCAACTCTATGGC
AATAATAATATGTAACAGATCCGTTAAAATAATTTATTCTTGAACTCTGTACTATGCCCG
TTGATAGGAAAATAGATAATAAATAAAATTAAT
(4833 bp)

- SilkBase 1999-2023 -