SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp41107_c5_seq48
Scaffold_idBomo_Scaf006
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_vanin-like_protein_3_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006807 P nitrogen compound metabolic process
GO:0008150 P biological_process
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016810 F hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds
GO:0016811 F hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides
Transcript
Level		FPKM:43.27 TPM:34.19
ORF EntryO_BomoMG25172_complete:A_BomoMG_comp41107_c5_seq48
Sequence
(Nucleotide)
GAACGACTCTTCACGGGAGGGCAGCAGTTGCGTTTGGGTACATTCAGTGTTAGGACGTTG
TAACGTTCTGGTTCGAAATACGAACGTCTGAGTTTGAGCGACACGTGTCTTGGAAAAACC
GAGACGGTTGTCAAAGCCGTCGGGAACGACTCTTCACGGGAGGGCATCGGCAAAGAAACA
AAACTGCCGCCCCACCAAGAACCCAACATGATAGTCGACATCGTCATCCCGTCGCTGCTG
ATAGCGGCCCTGTTCATCGGAAACGCGTTCATCGTACTCATCATCTATAAATACAGGAAA
CGGAAAAACGACGATTTGGAAGACGAATTCAACACCATTCCATTAAACGGGAACGTGCAC
AGCGCGGGATATGCAGTTTAGTCTCCAGCACACCAAATAAGTTTACGGGAATCGCAAATA
AACGATAACAAAAAAAAATACCTTCACTACATAGCATAAAACAAAATCGCTTTCTCGGTC
CCTATACCCCTATGTATGCTTAAATCTTTAAAACTACGCAACGGATTTTGATGCGGTTTT
TTTTAATAGATAGAGTGATTGAAGAGGAAAGTTTATATGTATAATAACATTCATTAAATA
GTGGAGAAATCAATAATAAATTACAGTTTCCGAAGCGAAGCGAAGGCGGGTCGCTAGCAA
CACATAAAAGCGCTGAGCTCCAGCTGGATTAGTTATTGGTTCCCTCTCGCTCAAACACAT
CCGATTGGTAATATTTGATTTAAATATATTAGTTTACAAAACGAACGATTAATGGTTTTT
TTTGGCGATCAAGAAAACTCACCGAACTAAAATAAATAAAGTTCCAAAAATCAGTTCAGT
TCTTCGAAGAATATATACATAATATTAATATAAATGAATAAAACGCATACACCTTAACTT
TATATTAATAACTTATTTTATGAAATAAAGAATACGTTACTTGAAAATAATTCCGTTGTT
TGATTCTAAAAGATCAGTGTTCTTTTTAAGCTATGCATAGATTTTATCGCGGGCCTTGAG
CGCGGCGACCGAATTCATGAAATTCTGTAACGAAAAAAACCTTACACCCCTCACTCCGCC
TACCATGTAGCTCGCGTTCAACACATTCACACGTTGCGCTTGTGTAGTGTTTGTGAATAA
GCACGTGGCGTGACGTCACACTGCATGCGCATCCTGAAAAGTCTGCCCATCTCTCTCTCG
CGCGGTCTAGCTTATGAGTGTGAAGGGGACAGTTAATGTTTTGCTTTTATTAATGTTTAA
TATAGCGTGGTCTTGTTTTATTATTGTTTTAATATTAAATTATCATTGTCTAATCATAAT
TGCATAAGTTGATAAAAAATGCTATGCTATAGCTTTACCGGGGCAGTTCCCGAGTGCCAC
ACGTTTTTTTAATTAAACTCAGTCTGTGTGATGTCCGAATCCATTTTAAAGATTATTAAC
ATCAAACAATAATAGCATACACACAGACTGTTATAACTACACTGATTTAAGAATTCAAGA
ATTTTTTTACGGAAAAATATGTTTTATAATATGTAAAAAAAGTTTTAATTATTTCTATGA
CGCGCGAATACTGAAAATAGGATTAGTAAGTGCGTTGACAAGTATTGTACGCTTCCCTTC
AAAATCTTTATAAATTTTAAAAGCCCTTTCCCATTTAGGACCCTTACGAAAATATTTCAT
GCAAATCGTACATTTGATCAAATCATAATCATATAAGTTTAAGAGCTATAGCTAATTAGG
TTTCTAATAAAAACACACAAAAACCATGCTTTTAATGTCACAGTGGCGCTACGCTTGGTC
CCAATGATTTTTTATACAACAGATATGTTATCTTCATAGTAACTGACTCTTCAAATCTGA
TCGCGCCATATACAGTCAAACCTGGATAAGCGAGAGTTCAAGGGAGCACAATCTCATACT
CGCTTATAGAGGTTTCTCACTAACCCGAGTTTCTCGCTAATGCTCCCTGTGAATTTCATT
TCGCGATTTTCCGGTTTCAAAGGCGTTCATTATTTTAAGTTTATCACTTAATGGCAGTAT
TTTAATTTTCCGTTTTGACATGATGCAGAACAGAACGTTTCTTCGCAATTGATTAACGAT
AAACTGAGTAAGTCCGACAAACAGGACGGTACAGAGGCACACGTGTCCACTCGAAAAGAA
TGCGATAAAATAACAACGTTATTTAGTTCCACCAAATAGAACAGGTTCAATATTGACGAG
AAAACAATACAAAAACAATGGTAAGAACTACCACGAAAGTCAAGAATGAGTCATAAAATA
GCAGATGTTAAATTTGTAATTTGTTTTGTCATTTGTTCTTCCTAAATAATATAAATAAAT
AAAGCTCGACTGTCGTTTATAGAGGTATAGATATAGCAGTCTCACTTACGGAGGTCCATG
AGGGAAAAACGACTCTCTCTTAAAGAGGTTTCTGTTTCTGGCTAATAGAGGTTTTGGGAG
CTTAAAATGACGGGTCCTGGCTATTACTCTCACTTATAGAGTTTTCTCACTTATCCAGTT
CTCACTTACCCAGGTTTGACTGTATATCTACATACCTACCGATATAGTGCACACACATGT
TGACAAGTAGCATTAATGAAGAGTACAAAAGATGGGATAAGCGCGTGAGTAAAAAAGATA
GCTATAATTGGAACGATTGCACTTGTTTTATTATTATTGCATTTGTTTAGACGCGACTAA
AGACGAAACGTCCCAATTGGCCTGTTTTCGAGTCTTCACTTGACGTGCGCTTGAAACGTA
TCTGCTTCTTTTTACATATAAAATATCATTGCTTGGTCCTAAGAACTTATTTTGTGTAAG
TTAATGTTTAGAGCAAATTTTTGTATGGCTTATTACAAGAACGCATTATTAAGCTTCAAA
ATTAGACAAGCAAACCGCTTAGTCGATGCTAACTGGTCGTAGGATTATTTAGTTCGCAAA
CAGATTGAACTTTTAAACTAAACTTGAATCAATTAAGCTACACAATTAATACTTACTTAT
TCACGCTTACTTGAAGTTACATTTAAGCGAATAAAGACAACAGTAAAATTTTAGAATAAT
ATCGAGGGGTTTGGTTTAAGCAACATTTTTGCAACTCTACAGGAGAGCCATTTAAAGTTT
AAAATTTAGAAAAAATTATAACAAAGAATTGCAACTCTATAGGAGATAGTTATAGCTATA
GGAGATAGGAAGCTGGTGCAAAAACTGGACCAAGGTGGTCACGACCCTCAGCAATGAGGA
AACGACAGAGAAGAAGAAGAAGGAGATAGTTAAATGGTTCTGTTTGAAATTTGGAAAAAA
TGTTATAACAAAAAAAAATCTTCTGCTATTTTGAATGAAGTAAACTTAATTAAAGTTCAA
TTAAAAACATCGAACTGTTGATACTAATCTTATCTTTATATATATTAATTACGTGTCACG
TTGTTTGTCCGCGATGGACACCTAAACTACTGAACCGATTTTAGCTTTTTTTTTTGTTTA
ATATGAGTTTTGTTCCAACTTAGGCCATAGGATGGTTTTTATTTCAATTAATGGTCGCAA
TATTTATTAATTAACAATAAAATGATTTCTGATGTTGATTATTGTTATTAATTGTAAGTT
TCATAAGTATAAAACAGATGGCGCCTTAAATCAGTTTCCACAGACAATTGTAATACTGTC
TGACGTTAATATTTCATAGATGGCGCTGTGTTAAAATACCAACGTTTCATATAAGCTACA
ACTTAATGGCATAAACACCACGTGTTGCTGAGGCTATAGTATAAGTGAAATTCATTTCAT
AGTAAACGGGATACTGTGAAATCCAATTGTTTTTACTTTGTTAATTTTTGGTATTGGCAT
AGCCAGTCACGTGCTATTTAGAAACAAAAGCCTTAGCCACAGCAACATGAGGCTGGGTCT
CCTAGTACAAAATAAAACGGACCTTTAATTACTAAGATAAATGTCGCTTAAACTAATTAC
CCCTCGATATGATTTTTTTTAAATATAAATAAATAAATAACCGATTATTCCTCTTTTGTT
GTCATCCTTGTAAAGTAACAACAAACTCAGTGTGGATGTTTTTTTTTGTTTTTTTTAATT
CGGAAAAAATCGATTATTCATTTCTAATAATTACTCGGATTATTTGTTTAAATCATTTCC
AAAATGTAAATAGAGACGACGAAAATCAATATCCTGAGCCTGATCCAGACGTAATCGATT
ATTCCGAGCACGTCATCATTGAAGATGTAATCGTAGAAGTTTGAATAGGCATTGTTCTCG
CCAGTTGATTTAGTGTTCGCATCTCTATCGAAGTCCCTGCCGAAGATACCAGCGCTGAAG
ACTCGGGCTTCGGTAAGCTCGATGCTGGCGAGCTTCTGGTCCGTGACTTTCGTGTCGAAC
TTAAAATTATCCAATGGAACAGTATCAGCCGCCACCACCATCGGGTACAGCGCTGTGTTG
CTTTTCGAGAAATTTCCACTGATGTTGATTTGCTCAAAGATCACGTTCAGTTCGCCCCAT
TCGATCTGAGTGACACAAGTGTCTCCGTCCGGACCGGGACACGCGAAGATGGCGCAGCTC
TGGACACCGACACGTTGTCCCCGGGAGAAGGCGCGGTCTCCTCTGAGCGCCGCCAGAGAG
TAAGTATGCAAAGGCTTCGTTCCTGTGAGTTTCGTTTTAATCTTGAATTGACAGCAGAGT
TGGCCGTGACAGACGGTCTCCTGTAGTCCTCGCGAAGCCGATTCCAGGTCCAGAGGTTTC
ACTGCGTAGAGACTGAGGTCTTCAGCAGGCGAATCCTGAAGCTGCGATGGACTCATGATC
GGGGGAGACGCGGGGTCAGCTCCTTCCTTATTAAGATCAGCGACGATCATTGCGTTCCCA
TTGTTCGCAGCGGACCCAGACGCGTAGATCCCGGCGGGAGATATGATATTAGCTCTGTTC
ACGTACGCCCAAGACTGCAGCAGCTGAGGACCGCCCAAAATAGGTATTTGAGGAACGAAG
CCACCGAGGACCAAGAAATTCTTTAGCCCCCCAAAAGTCTCTGGCTTGTAGAGCGCCAAG
TCCTCTCCCATTAAAAGCCCGAACGTAACTCCGAAGTCGGTCTTGAAAGACCCTTCCGAA
TCCACGCTGGTGCAGTTGGTAAGATTGTTCATTGGCTTTTTGTAAACGGAAACAGTTTTG
CCTTCTCTATCAAAGACGATGTTACTCCTCACGATTTCTTTTTTGTTTTGGCACTGAACT
CCCTCGTACAGGTGAGCTGCGATATATAAGCCAGCTTTTTTTGCAGCATCCGATATATTC
TTGACGGCCTCCTCATATTTATCTGCAGATTCGGTTTTCTCCTGGGCTGGCAGAACAAGA
ATATCCACGTCCGATTTACCAGCTTCCACTATGAGAGGCAGGTAGCTATTAAAATCGACG
TTTTCATTAGCGGACTTAATCGAGGCAGCTTTGTATGAATCCTGAACACAAAGCACCGTC
CCGAAAGTAAGAAACACCAATAAGTAAACGAAATTCATATTTATTACGATCGTATCGACA
CTGTTTGAAAACGCGCCCAACTTCGCCGACGGCTCACGACCGAATGACAAACACCAGAGA
GAACAGACACTAATGAAAACGCGCCCAACTTCGCCGACGGCTCACGACCGAATGACAAAC
ACCAGAGAGAACAGACACTAA
(5661 bp)

- SilkBase 1999-2023 -