SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp41107_c5_seq4
Scaffold_idBomo_Scaf078
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_vanin-like_protein_3_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006807 P nitrogen compound metabolic process
GO:0008150 P biological_process
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016810 F hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds
GO:0016811 F hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides
Transcript
Level		FPKM:1.21 TPM:0.95
ORF EntryO_BomoMG25159_complete:A_BomoMG_comp41107_c5_seq4
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTTTGAAAATGTTATAAAAACTTTATTGAATACCACATGCATAAAACTAA
TATCACAGGGATCAGTCAGTGAACGCAAACCGGATGAAAACAGCAAGAGGGAACCATTTG
ACGTAATTCTTTAAATCTCAAATTAATCACTACATAGTATAAAACAAAGTCGCTTTCTCG
GTCCCTATATCCCTATGTATGCTTAAATCTTTAAAACTACGCAACGGATTTTGATGCGGT
TTTTTTTAATAGATAGAGTGATTGAAGAGGAAGGTTTATATGTATAATAACATCCATTAA
ATAGTGGAGAAATCAATAATAAATTACAGTTTCCGAAGCGAAGCGAAGGCGGGTCGCTAG
CAACACATAAAAGCGCTGAGCTCCAGCTGGATTAGTTATTGGTTCCCTCTCGCTCAAACA
CATCCGATTGGTAATATTTGATTTAAATATATTAGTTTACAAAACGAACGATTAATGGTT
TTTTTTGGCGATCAAGAAAACTCACCGAACTAAAATAAATAAAGTTCCAAAAATCAGTTC
AGTTCTTCGAAGAATATATACATAATATTAATATAAATGAATAAAACGCATACACCTTAA
CTTTATATTAATAACTTATTTTATGAAATAAAGAATACGTTACTTGAAAATAATTCCGTT
GTTTGATTCTAAAAGATCAGTGTTCTTTTTAAGCTATGCATAGATTTTATCGCGGGCCTT
GAGCGCGGCGACCGAATTCATGAAATTCTGTAACGAAAAAAACCTTACACCCCTCACTCC
GCCTACCATGTAGCTCGCGTTCAACACATTCACACGTTGCGCTTGTGTAGTGTTTGTGAA
TAAGCACGTGGCGTGACGTCACACTGCATGCGCATCCTGAAAAGTCTGCCCATCTCTCTC
TCGCGCGGTCTAGCTTATGAGTGTGAAGGGGACAGTTAATGTTTTGCTTTTATTAATGTT
TAATATAGCGTGGTCTTGTTTTATTATTGTTTTAATATTAAATTATCATTGTCTAATCAT
AATTGCATAAGTTGATAAAAAATGCTATGCTATAGCTTTACCGGGGCAGTTCCCGAGTGC
CACACGTTTTTTTAATTAAACTCAGTCTGTGTGATGTCCGAATCCATTTTAAAGATTATT
AACATCAAACAATAATAGCATACACACAGACTGTTATAACTACACTGATTTAAGAATTCA
AGAATTTTTTTACGGAAAAATATGTTTTATAATATGTAAAAAAAGTTTTAATTATTTCTA
TGACGCGCGAATACTGAAAATAGGATTAGTAAGTGCGTTGACAAGTATTGTACGCTTCCC
TTCAAAATCTTTATAAATTTTAAAAGCCCTTTCCCATTTAGGACCCTTACGAAAATATTT
CATGCAAATCGTACATTTGATCAAATCATAATCATATAAGTTTAAGAGCTATAGCTAATT
AGGTTTCTAATAAAAACACACAAAAACCATGCTTTTAATGTCACAGTGGCGCTACGCTTG
GTCCCAATGATTTTTTATACAACAGATATGTTATCTTCATAGTAACTGACTCTTCAAATC
TGATCGCGCCATATACAGTCAAACCTGGATAAGCGAGAGTTCAAGGGAGCACAATCTCAT
ACTCGCTTATAGAGGTTTCTCACTAACCCGAGTTTCTCGCTAATGCTCCCTGTGAATTTC
ATTTCGCGATTTTCCGGTTTCAAAGGCGTTCATTATTTTAAGTTTATCACTTAATGGCAG
TATTTTAATTTTCCGTTTTGACATGATGCAGAACAGAACGTTTCTTCGCAATTGATTAAC
GATAAACTGAGTAAGTCCGACAAACAGGACGGTACAGAGGCACACGTGTCCACTCGAAAA
GAATGCGATAAAATAACAACGTTATTTAGTTCCACCAAATAGAACAGGTTCAATATTGAC
GAGAAAACAATACAAAAACAATGGTAAGAACTACCACGAAAGTCAAGAATGAGTCATAAA
ATAGCAGATGTTAAATTTGTAATTTGTTTTGTCATTTGTTCTTCCTAAATAATATAAATA
AATAAAGCTCGACTGTCGTTTATAGAGGTATAGATATAGCAGTCTCACTTACGGAGGTCC
ATGAGGGAAAAACGACTCTCTCTTAAAGAGGTTTCTGTTTCTGGCTAATAGAGGTTTTGG
GAGCTTAAAATGACGGGTCCTGGCTATTACTCTCACTTATAGAGTTTTCTCACTTATCCA
GTTCTCACTTACCCAGGTTTGACTGTATATCTACATACCTACCGATATAGTGCACACACA
TGTTGACAAGTAGCATTAATGAAGAGTACAAAAGATGGGATAAGCGCGTGAGTAAAAAAG
ATAGCTATAATTGGAACGATTGCACTTGTTTTATTATTATTGCATTTGTTTAGACGCGAC
TAAAGACGAAACGTCCCAATTGGCCTGTTTTCGAGTCTTCACTTGACGTGCGCTTGAAAC
GTATCTGCTTCTTTTTACATATAAAATATCATTGCTTGGTCCTAAGAACTTATTTTGTGT
AAGTTAATGTTTAGAGCAAATTTTTGTATGGCTTATTACAAGAACGCATTATTAAGCTTC
AAAATTAGACAAGCAAACCGCTTAGTCGATGCTAACTGGTCGTAGGATTATTTAGTTCGC
AAACAGATTGAACTTTTAAACTAAACTTGAATCAATTAAGCTACACAATTAATACTTACT
TATTCACGCTTACTTGAAGTTACATTTAAGCGAATAAAGACAACAGTAAAATTTTAGAAT
AATATCGAGGGGTTTGGTTTAAGCAACATTTTTGCAACTCTACAGGAGAGCCATTTAAAG
TTTAAAATTTAGAAAAAATTATAACAAAGAATTGCAACTCTATAGGAGATAGTTATAGCT
ATAGGAGATAGGAAGCTGGTGCAAAAACTGGACCAAGGTGGTCACGACCCTCAGCAATGA
GGAAACGACAGAGAAGAAGAAGAAGGAGATAGTTAAATGGTTCTGTTTGAAATTTGGAAA
AAATGTTATAACAAAAAAAAATCTTCTGCTATTTTGAATGAAGTAAACTTAATTAAAGTT
CAATTAAAAACATCGAACTGTTGATACTAATCTTATCTTTATATATATTAATTACGTGTC
ACGTTGTTTGTCCGCGATGGACACCTAAACTACTGAACCGATTTTAGCTTTTTTTTTTGT
TTAATATGAGTTTTGTTCCAACTTAGGCCATAGGATGGTTTTTATTTCAATTAATGGTCG
CAATATTTATTAATTAACAATAAAATGATTTCTGATGTTGATTATTGTTATTAATTGTAA
GTTTCATAAGTATAAAACAGATGGCGCCTTAAATCAGTTTCCACAGACAATTGTAATACT
GTCTGACGTTAATATTTCATAGATGGCGCTGTGTTAAAATACCAACGTTTCATATAAGCT
ACAACTTAATGGCATAAACACCACGTGTTGCTGAGGCTATAGTATAAGTGAAATTCATTT
CATAGTAAACGGGATACTGTGAAATCCAATTGTTTTTACTTTGTTAATTTTTGGTATTGG
CATAGCCAGTCACGTGCTATTTAGAAACAAAAGCCTTAGCCACAGCAACATGAGGCTGGG
TCTCCTAGTACAAAATAAAACGGACCTTTAATTACTAAGATAAATGTCGCTTAAACTAAT
TACCCCTCGATATGATTTTTTTTAAATATAAATAAATAAATAACCGATTATTCCTCTTTT
GTTGTCATCCTTGTAAAGTAACAACAAACTCAGTGTGGATGTTTTTTTTTGTTTTTTTTA
ATTCGGAAAAAATCGATTATTCATTTCTAATAATTACTCGGATTATTTGTTTAAATCATT
TCCAAAATGTAAATAGAGACGACGAAAATCAATATCCTGAGCCTGATCCAGACGTAATCG
ATTATTCCGAGCACGTCATCATTGAAGATGTAATCGTAGAAGTTTGAATAGGCATTGTTC
TCGCCAGTTGATTTAGTGTTCGCATCTCTATCGAAGTCCCTGCCGAAGATACCAGCGCTG
AAGACTCGGGCTTCGGTAAGCTCGATGCTGGCGAGCTTCTGGTCCGTGACTTTCGTGTCG
AACTTAAAATTATCCAATGGAACAGTATCAGCCGCCACCACCATCGGGTACAGCGCTGTG
TTGCTTTTCGAGAAATTTCCACTGATGTTGATTTGCTCAAAGATCACGTTCAGTTCGCCC
CATTCGATCTGAGTGACACAAGTGTCTCCGTCCGGACCGGGACACGCGAAGATGGCGCAG
CTCTGGACACCGACACGTTGTCCCCGGGAGAAGGCGCGGTCTCCTCTGAGCGCCGCCAGA
GAGTAAGTATGCAAAGGCTTCGTTCCTGTGAGTTTCGTTTTAATCTTGAATTGACAGCAG
AGTTGGCCGTGACAGACGGTCTCCTGTAGTCCTCGCGAAGCCGATTCCAGGTCCAGAGGT
TTCACTGCGTAGAGACTGAGGTCTTCAGCAGGCGAATCCTGAAGCTGCGATGGACTCATG
ATCGGGGGAGACGCGGGGTCAGCTCCTTCCTTATTAAGATCAGCGACGATCATTGCGTTC
CCATTGTTCGCAGCGGACCCAGACGCGTAGATCCCGGCGGGAGATATGATATTAGCTCTG
TTCACGTACGCCCAAGACTGCAGCAGCTGAGGACCGCCCAAAATAGGTATTTGAGGAACG
AAGCCACCGAGGACCAAGAAATTCTTTAGCCCCCCAAAAGTCTCTGGCTTGTAGAGCGCC
AAGTCCTCTCCCATTAAAAGCCCGAACGTAACTCCGAAGTCGGTCTTGAAAGACCCTTCC
GAATCCACGCTGGTGCAGTTGGTAAGATTGTTCATTGGCTTTTTGTAAACGGAAACAGTT
TTGCCTTCTCTATCAAAGACGATGTTACTCCTCACGATTTCTTTTTTGTTTTGGCACTGA
ACTCCCTCGTACAGGTGAGCTGCGATATATAAGCCAGCTTTTTTTGCAGCATCCGATATA
TTCTTGACGGCCTCCTCATATTTATCTGCAGATTCGGTTTTCTCCTGGGCTGGCAGAACA
AGAATATCCACGTCCGATTTACCAGCTTCCACTATGAGAGGCAGGTAGCTATTAAAATCG
ACGTTTTCATTAGCGGACTTAATCGAGGCAGCTTTGTATGAATCCTGAACACAAAGCACC
GTCCCGAAAGTAAGAAACACCAATAAGTAAACGAAATTCATATTTATTACGATCGTATCG
ACACTGTTTGAAAACGCGCCCAACTTCGCCGACGGCTCACGACCGAATGACAAACACCAG
AGAGAACAGACACTAATGAAAACGCGCCCAACTTCGCCGACGGCTCACGACCGAATGACA
AACACCAGAGAGAACAGACACTAA
(5364 bp)

- SilkBase 1999-2023 -