SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp41107_c5_seq17
Scaffold_idBomo_Scaf006
NCBI non-redundant
(nr)		S-phase_kinase-associated_protein_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0006511 P ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0019005 C SCF ubiquitin ligase complex
GO:0031467 C Cul7-RING ubiquitin ligase complex
Transcript
Level		FPKM:0.11 TPM:0.08
ORF EntryO_BomoMG25164_complete:A_BomoMG_comp41107_c5_seq17
Sequence
(Nucleotide)
TGTCTTCTTCGGTCGACCTCTTCGCCCTCTACCTTGCACTACCATTTAATTGAACTTCAG
TTAAGCTTACCCCGTTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATATACTCTACTACGCA
CCAAAATACAATTAACATTAAAATATCAGTCAACAAGCAGATACATATTTTGTACTATAG
TTCGAAAAGCTGAAGAAGTCTTTGTTTTTAAGCTATTGCATAGTTTTTATCATGGGCTTT
GAGCGCGGCAATCGAATCAAGAAATTCCGTAACGAAAATAAAACCTAACACCCCCACTCC
GCCTACCATGTAGCTCGCGTTCAACACATTCACACGTTGCGCTTGTGTAGTGTTTGTGAA
TAAGCACGTGGCGTGACGTCACACTGCATGCGCATCCTGAAAAGTCTGCCCATCTCTCTC
TCGCGCGGTCTAGCTTATGAGTGTGAAGGGGACAGTTAATGTTTTGCTTTTATTAATGTT
TAATATAGCGTGGTCTTGTTTTATTATTGTTTTAATATTAAATTATCATTGTCTAATCAT
AATTGCATAAGTTGATAAAAAATGCTATGCTATAGCTTTACCGGGGCAGTTCCCGAGTGC
CACACGTTTTTTTAATTAAACTCAGTCTGTGTGATGTCCGAATCCATTTTAAAGATTATT
AACATCAAACAATAATAGCATACACACAGACTGTTATAACTACACTGATTTAAGAATTCA
AGAATTTTTTTACGGAAAAATATGTTTTATAATATGTAAAAAAAGTTTTAATTATTTCTA
TGACGCGCGAATACTGAAAATAGGATTAGTAAGTGCGTTGACAAGTATTGTACGCTTCCC
TTCAAAATCTTTATAAATTTTAAAAGCCCTTTCCCATTTAGGACCCTTACGAAAATATTT
CATGCAAATCGTACATTTGATCAAATCATAATCATATAAGTTTAAGAGCTATAGCTAATT
AGGTTTCTAATAAAAACACACAAAAACCATGCTTTTAATGTCACAGTGGCGCTACGCTTG
GTCCCAATGATTTTTTATACAACAGATATGTTATCTTCATAGTAACTGACTCTTCAAATC
TGATCGCGCCATATACAGTCAAACCTGGATAAGCGAGAGTTCAAGGGAGCACAATCTCAT
ACTCGCTTATAGAGGTTTCTCACTAACCCGAGTTTCTCGCTAATGCTCCCTGTGAATTTC
ATTTCGCGATTTTCCGGTTTCAAAGGCGTTCATTATTTTAAGTTTATCACTTAATGGCAG
TATTTTAATTTTCCGTTTTGACATGATGCAGAACAGAACGTTTCTTCGCAATTGATTAAC
GATAAACTGAGTAAGTCCGACAAACAGGACGGTACAGAGGCACACGTGTCCACTCGAAAA
GAATGCGATAAAATAACAACGTTATTTAGTTCCACCAAATAGAACAGGTTCAATATTGAC
GAGAAAACAATACAAAAACAATGGTAAGAACTACCACGAAAGTCAAGAATGAGTCATAAA
ATAGCAGATGTTAAATTTGTAATTTGTTTTGTCATTTGTTCTTCCTAAATAATATAAATA
AATAAAGCTCGACTGTCGTTTATAGAGGTATAGATATAGCAGTCTCACTTACGGAGGTCC
ATGAGGGAAAAACGACTCTCTCTTAAAGAGGTTTCTGTTTCTGGCTAATAGAGGTTTTGG
GAGCTTAAAATGACGGGTCCTGGCTATTACTCTCACTTATAGAGTTTTCTCACTTATCCA
GTTCTCACTTACCCAGGTTTGACTGTATATCTACATACCTACCGATATAGTGCACACACA
TGTTGACAAGTAGCATTAATGAAGAGTACAAAAGATGGGATAAGCGCGTGAGTAAAAAAG
ATAGCTATAATTGGAACGATTGCACTTGTTTTATTATTATTGCATTTGTTTAGACGCGAC
TAAAGACGAAACGTCCCAATTGGCCTGTTTTCGAGTCTTCACTTGACGTGCGCTTGAAAC
GTATCTGCTTCTTTTTACATATAAAATATCATTGCTTGGTCCTAAGAACTTATTTTGTGT
AAGTTAATGTTTAGAGCAAATTTTTGTATGGCTTATTACAAGAACGCATTATTAAGCTTC
AAAATTAGACAAGCAAACCGCTTAGTCGATGCTAACTGGTCGTAGGATTATTTAGTTCGC
AAACAGATTGAACTTTTAAACTAAACTTGAATCAATTAAGCTACACAATTAATACTTACT
TATTCACGCTTACTTGAAGTTACATTTAAGCGAATAAAGACAACAGTAAAATTTTAGAAT
AATATCGAGGGGTTTGGTTTAAGCAACATTTTTGCAACTCTACAGGAGAGCCATTTAAAG
TTTAAAATTTAGAAAAAATTATAACAAAGAATTGCAACTCTATAGGAGATAGTTATAGCT
ATAGGAGATAGGAAGCTGGTGCAAAAACTGGACCAAGGTGGTCACGACCCTCAGCAATGA
GGAAACGACAGAGAAGAAGAAGAAGGAGATAGTTAAATGGTTCTGTTTGAAATTTGGAAA
AAATGTTATAACAAAAAAAAATCTTCTGCTATTTTGAATGAAGTAAACTTAATTAAAGTT
CAATTAAAAACATCGAACTGTTGATGCTGATGCCGAATAAAACGGATCTTTAATTATAAA
GATAAATGTTGCTCAAACCTAATAGTTTCACCTCTAGATATGCATCTATATACATAATTA
GAATTAAACTCGATATCGGCTCGACGTAAAGACTAAAATGACTGCCAGTTTTATGCAGAA
TGGAGACCATTGAATTCCGTTTTAAGCTTTGTGCCAGCGGTTCTCAACCACCGTGTCGTA
AACCCCTATAAAGTGTTCCGAGATTTACAAACTCAATATTTTTATATGGGAAACATTTGT
ATATACAATTTTTTTTGTACAGTCAAAATCTGTTATAACGGCATCGAAGGGACTGCTCAT
ATTCAGTCGTAAAAACCGATAGTCGTAACAACCGGTGATGTTTAATGTGTATCGTGCAAG
TACAAACAAATCGGTAGGGAATTATTGGAAAAATATATTTGCATAATACGCGATTTTTCT
TCAATATTAATTTGTTTTCTTTTTCTTTGCGACATTTTGAAAGTTTCACGAATAACTCCA
CAAAGTTTTGGTGCGTCTTGTGTATAGATAAGTAACAAACTAACTGCAGAGATATGAAGA
AGCGGGCTTTGACTACCGCATGCACGTGTTTTGTTTCTAAGAATTAGAAAAGACCCTACA
CTAAACTAAATCCTATTGTTTTCTTTCCTGATTTTAAAAGCCATTGAAGACAAATGTGGA
TACCTATTCAAATTGTTTACAATACAGCTTAGCCGGTCGTTGTAACAGATCTAATTCTCC
GAAATATTAGTGGTCGTTTTATGAGGTATGTCGTTATTACCAATGTCGTAGAAAGCAATA
TTTTTAATAAGGCGGTCATATGGCATTCAGCCGGGACCTTTGTTCTTGGTTATTATAACC
AGCATGTTGCTCAAAATGATGTCGCAGTAAACGGTTGTGACTGTATATTTATTTACTTTT
TGTATTGACATTGATGGTGACAAACTTATTTTTGTGGTTTAACATTGCAATGGATACTGG
CAATTTCTGGACACAATCAAGACTACCCACACAATTAGTTAAAAAATAAGCAGATGACAA
AAATTTAAGTCAGTGATTTATGCTAATTATTTCTATTTCATAAAGTAAATTTTCCAATAA
ATATAATACAATTAAAGTTAAATGAAAAGTAATTTAAATGATAATATGAAAATTTAAATT
TTATTGAAAATCACAATGACATGATGTACCTATTTTTATATAATTTACAACACAAACAAA
TTTACTTGGTTTAAATTAATTATTCTTTATTGCCATGGGAAAAATAGTTTAATGTTGCAT
ACATAGTGATAATACATAAAGATGCTTGCAAATAGCATTTATTATGGTTTACTTTTCTTC
ACACCATTCATTCTCTTTACGAACCTGATCTTCTTCTGCAGCAGTGAAATCATTCTTAAT
GTTGAACGTTTTACGGATTTCTTCAGGAGTCTTTCCTTTGATCATGTTTGCTACAGTTTT
ACATGTGACATCTAATAAACCCTTGATGTCCAAATAATTTGCAGCTAATATTAATTCAAA
GAGTGTGCCTTGGTCAACTTTCAAAAAATCAGCATCCCATGATGATATGTCATCAGTCCT
CTTTTCCTTGTTTTCGTCATCTTCTGGTAGCGGAGGATCGTCTTTATGATAAGTAGCCCA
CTGAATAACTTTTTTGAGTATTGCAGAATTGACATTAGGTAAAGGTACAACTTCCTCTTC
ATCCTCTTCCATGCCTAAGTCTTCTAGCATAGTTTTGATAGTTACGGAGCATTTGGCGAT
TTCAACATCAACAACGAAGACCTCGTTGTCTGATGATTGCAACTTAATATTTGGCATCTT
GTTTTTTCAAGTATTTGAATGTTCACAATTAAGTGAAATTTATTTATCTTCAAACGAAAA
TGCCCTTATGTTCTGGAGATTTTTCCTTAAACCCAAACAGTGAATCAATG
(4550 bp)

- SilkBase 1999-2023 -