SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp41089_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Chr8
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_RNA-directed_DNA_polymerase_from_mobile_element_jockey-like_isoform_X1_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level		FPKM:5.87 TPM:4.64
ORF EntryO_BomoMG24680_complete:A_BomoMG_comp41089_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
GTTTTCCTACAGATAGAGAAATGTCTGAAATCAGTCATGTAAGTAAAGTAAAACTTTTGT
TATATAATTATAAACGTTCACCAAACTTGAGCATGTGTCAGCTATGTATGTATTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTTTAGATAATTTGGCTCCAACGCCTTTGGCATTGATTTTGCCAATGTCA
AAGTATTTACAAAAATGACAGGTGCTTAGAGAGGGAAAAAATTACTAAATCTAAATACAA
GTAAATTTGGTCGGTTTTTCCATACGCGAATCTGTGGTTTTAAGAACAGCACAAACAAAT
ATATGTACTACTTTAGAGATAAATATTATTAGCAGATAAAAATTTACACAGAATATTTAC
ATGTTTAGAATAGACTAAAGTTAATAAACAATTAATATTAATAGGTCGGGGAATGTCATT
GGGAAGGATATCATAAAGAGGGGATACGATATTGGGGCAGTCGAAGAAAATGTGATCCAG
GGTACCCTCATCTAATCCACACTCACAAAGAGAATGGTCACGGACTCTAATTTTGGCAAG
AAAAACAGGGGAGCAAACATGGCCAAGTCTAAGACGGATTATAGCTGAGACAATTTTTTT
AGGAAGATGGCAGTGGGAGGAAAACCAAGGCTTAGAGGGCAGGGTCGGTTGCAAGTTACC
ATAATGCTTACCTACTGACTGACGAGAAATCTGCCAGCTTTCATTCCAAGATTGAAGCAT
ATCAGATTTTGCCAGAGAATGTAAATCTCGAGGAAAAATTTTGTTATACTTGTTACAGCC
CATAACAACAGCCTCCTTGGCACAGGAGTCAGCAAGCTCATTCCCACAAATTCCGCTATG
ACTTGGGATCCAGACGAGAGTGACATCAAGTCCGGAGCAGTGACATTGAAACAGAGTTTC
TTTAATTTTTAATATAATTTCAAAATTGACTTTTGAATGCGATGGAAATTTAGTTATGTC
TTGAAGACAACTTAAGGAGTCCGAAAAAATTACCGATTTACTTAGACCGCGGGTTTTAAT
AAAAAGAGCTGCTTCTAAAAGAGCAACAGCTTCACCAGAGTACACAGAGGAAGTCTGAGG
GAGTTTGTATTTTAGGGAGATTTTAAACTTGGGGATCCATACCGCAGCACCTACAAGACC
ATTTTGGGATAGTTTAGATGCATCAGTGAATAGGTGATAATGATTAGGCCATTGTAGTTG
TACTATGTTCTGAAATTGTAAATTTGCTCCTGGGGAGTCTTTATGGATCCCAATATTCAA
GAAGGTAGTGGGACGAAATAAAAGACAGTCAAAAGAGAAAAGAAAGAGGGGGAATTTATC
ATATTGAAAAATTGGAGAAGCTAAATTTTGCAGTTTCTTATACGAGTTGACAAGAGGAGG
TACAGATTTATGACGCCAGTATCTAGAGGTTTCGGTCAGTTGAGCAAGTTGGGAAAGTAG
AGCTAAAAGGGGGTGGTTTGAGAGAGAAATTACTTTGTAGAAAAATCTATCAGCTAGAAA
CTGTCTACGCAAGGCTAAAGGAGGTTCAAAACATTCAACTTGTAGGGCATTTATAGGGGA
AGATTTCATGGCGCCAGATATGATTCTGAGGCATTTTGATTGAATACGATTTAGTTTTGT
AAGTGCCATTTTATTACAAGGCTCCAAAACAAAGCAACCATAGTCAAAGTGACTTCTAAT
TAAAGCATTATAAAGAAGCTTCTGGCTGTAAGGATGTGAACCCCACTTAACACCGGAGAG
TGCGCGTAGAACATTGATGCTCTTCTCAACTTTATTGCAGATATAGTTTAAATGGTGAAC
ACCGGAGAGTTTAGAATCCAAGAGAATGCCCAAAAACTTAACTTTACTCAAGACTGGAAT
AGATTGGTTACAAATTTCAATATTTATTTCAGGGATAACTCTCTTACGGGAGAAAGCAAC
CGCAGAACATTTAGGGATGGACAGGGATAAGCAGTGATCATTCAACCAAGAATTCAGGTT
AAACAAAGCAGAATTTAGACAATTACAAGCTTGTGAGAAAGAATTAGATATGGTATAGAG
GGCAATATCGTCAGCATATTGGAGGATACGGCAAAAACGGTTCACAGTAGTATCTAAAAT
AGCAGTGTAAATATTATAAAGCAGAGGACTGAGAACAGAACCCTGAGGCAGACCTTTCCA
GGTCCGATGAGAAGAATTTTCACCTAAGATGCGAACTATAATAGATCTGTCATAAAACAA
ATTGAAGATAAAATTCACAATTCTAGGAGGCATATTCAGGTTAATAAGTTTTTGTCTAAG
TAAATGAAGGTCGACATTGTCGTATGCAGAGGAAATATCTAGAAAAACTGCTATAACATG
ACGATTTTGAGAGAATGCAACACGAATATCTGAAGTGAGGAGGCTCAGGCTGTCCAATGT
TCCGTAACCTCGTCTAAAGCCAAACTGACTATTAGGGAGAATAGACCTGTTTTCAACTAT
CCATTCTAGACGATTTTTTATCAAATGTTCCATAATTTTAGCTAGCACACTCGAGAGAGC
AATAGGTCTATATGAACAAGATTGAGCTGGATCCTTGCCTGGTTTTAGAATTGGGATTAT
CAATTGAGTTTTCCATGAGGCTGGAATAGAACTGGAGAGAAATATATGATTTAAAAGATT
TAGAAAGATTTTTTTAGAAGAGTCAGATAATTTTTTTATAAAAGAGTACGGGAAGCCATC
TATACCTGGGGCTGAATCTCGGAGGTTGTCAAGAACACAGCATAGTTCTGCAAATGAGAA
GCTGGAATTCATGGGGTCCTTAGAGGCGGAGGAGGGAATTAAGGGACAAGGTTTAAAAGG
CACAAAGGGTGGGCAGAGTTTGGAGATAAAATCAGGAAGCCAAGACAAGGAATTAGAATT
AATATTATTATCAGATTGTGATTTACGAAATGCTTTTATTTTTTTCCAAATCAAGGAGGC
AGGAGTTCTTGGGGAGAGAGACTCGCAAAAATTACGCCAAGCAAGAGATTTCTTTTGTCG
CAAAAATCTTTTAGAGATGGCCGAAATTTTCTGAAATTCTAGGAAATTCTCTAAAGAGAG
AATTTTAGAAAATTCAGACTCAGCCTCCTTGCGTTTTTGGACTATTTGGGAGCATTCAGC
ATCCCACCATGCTGGTGAGGGAATTTTATTTGAAGCTGAATTCTTTAAGGGAATGGTTAG
TTCGGCAGCGGAGGATAAAATGGAACAAAATTCTAGGTACAAAAATAGAGTATTTTCATC
ATTTGCATCAGGAAGAGATTCAAGATTATTTTGAACTAAAGATGAATACTTTTGCCAGTC
GGCCTTGTTAAGTCTGAATTTCAAAAGGGGTTCATATGGAATTGAAGATGGGATGGAAGA
ATCGGCTAGAGTTAGTAATATTGGAAGATGATCACTGCCATGGGAGTTGGACAGAACAGA
CCAAGAAATCGAGTTAACTAAAGAGGGAGAGGACAAGGACAGGTCTGGGGCACTTGGACT
TTGGGATGGGGATACTCTACGGGTGGGAGTTCCATCATTAAGTAGACACAAATTTAATTC
ATCAAGTTTATCAAGAAATAATGAGGAATTTGAGTCACATAACTCAGAACCCCACATTGT
ATGGCGTATATTAAAATCTCCTAAGACTAAGAGAGGACATGGAAGAGAGGTTAAGAGTGT
CGAAAATTCTTGAATAAGGTTACTGTTAGGGTGAGGGATGTACACTGAGACCACTGTGAT
GTTAAAGCAGCGAACTGCCACAATGTTAATTGCTGAGGAATGAGGAGGAAGGGTAATGCG
AGAAAAAGATATATTTCTTCTGACCAAGATAGCAGTTCCTGCCCAGCCGTCGTCTCTGTC
ATCGCGGAGACACGAGAACCCGGGCACCCTAAGCAGAGTATCCGGTCTCAACCATGACTC
CGCAACAGCAAAGAGGACAGGGTTATATTGATTAGACAGATAAATTATTTCTTGTTTTTT
ATTTCTGATACTACGACAGTTCCATTGTAGGACCTTCGTCATTATGCTTTGGTTGAGAGT
TGACGAGACTAGAGATTAAAGCGTGAATCTGAATCAAGACGTTGTTCGGTAGTATATCAT
TGAATTTTGATAAAATATTTAGAAGCAGCATTGACATTAATTCCGCGAGATTATCATTTG
TAGCAGGGGCACAGGGGGTGGGAGTGCTAAGAGCACAACCATTGGGTAAACAAGAGTTAG
GAGGGCTAATAATATCGTTGTGAGCATGACGATCATAAGACTTGGAAAGTATTGGTTTAG
ACGATTTTTCAATAAAAACAGTTTTTTTGTATGAAGTTGACGGAGTATGACGAGAAGATG
AGGGGGAGGAAGACGGGAGGGTATTCGAAGATGGAGCTGATCGGCTCAGGAAGATAGGTT
TTTGGGGAAGAGAAGAATTGGCAACATCGGCATAGGAGGTGCGGACTGAAGGAAATCTGC
GAGCTGCCTCAATATAACTAATATTTTCTTCAGACATAACCAACTTAATTGATCTTTGAC
GGGCATGTTCGGGGCATTTCGGGTCAGAGGCGGGATGACAACCAGAGCAGAACAAGCAGG
TTATGTTATTTTCTGAAACACTACAAGAATTACCTTCATGGGGGCCTGCGCATCGAGAGC
AGCGGGCTTGCGATCGACATTGATCACGAATGTGCCCAAAACGACAACACTTTAAACACT
GAATAGTGGGAAGAGTATATATGTTTACAGGGAGGGAAACGCTGCAACAATATACATGTT
TAGGAAGAACTTGCCCAAGAAAAGAGAGGACAACTGTACCCGTCGGTTCCCATACTGTTT
TTCCATCTATTTTCTTTTTCTTATTCATTCTTCTGGCTTTAATGACGGTGGTTGAAACAG
ACCGACACTCAATCCATGAGACTAGGTCCTCAAGAGACCACTCTACAGGAATTTGTCTCA
CGACACCCATCCTGGTAACTTGAAAGCGTGGAATAATTGCTGACAATTTGTTAGATGAAA
GTAATGGGTTTGTTAAAAATGAATTCGCTTCGTTATATGTTTTAAAAATAATAGCAGCCC
TATTTCTACCCATGTTTTTAATTTCATCTATCCCTGAGATCTTACCATTGTAAATAATTT
GAGCAATTTTAAGGGTACGGGTGTGGTTCGAAACTGGGGCAAAGTCACCATCTGAACGAG
ATACATGGACAACAAAAGGGCCAGAGTCAGTTTCAGAGTAATTAAGAACTGAATTGTTAT
CAAAACCTGGCCGGGTGTAGGTATGTTGATTAGAGGCAGCTGCCGGTAAATGTGGAGCTG
ATCTTTTTTCTGGGACGCTTAATACGTCTTCCGCAGGGCGTTTTTGTGAAGCTTTTACAG
GAGAATTAAGTATTAGAGAAAGATCGTCCATCTCTGAATCTAAAGAAGACCTCCCTCTGT
CCGGCGGGACATTTTCGCCCACCGAGGACGACATTGACATAAAAAATACACTTACCAGTT
AAATGAAACTTAAACTAATCCACCACCAACAAAAATAGGGCAACACAATTCTTAAAAACA
CAGAAAAAACGGGAAAAACACTAAAAATAATCGAAACGCGTGTGATCTGACAGATGTCCA
ACTACCCTCTCCTGCAACCTGACTTATAACATTACAAAATAGACATTGCTTAAATTATAA
TAATGAAACTCTATGAGTTCACTGTGCAGGCTCATGTCCATCTTGTCCCACAGAAAGGTA
CACAGGTGGGGGTGCCCTAGGCAGTATGTTTTATATATCACTTGCGTAATATATACAATA
CAGTAAATAAGTAGATAGATCTTAACATTTTATTGTTTTCAAAATGTTTCGTGTTGCACA
TGCATAATATGAGATGTACTACTATAAGATAATTGAAGTTAAACAAAAATAACCTTTATT
GAAACACCTAGTGAAATAAACCTACTGTTTGATCTTGTAAAATCGATCTTTTTTTATATG
ATAAATATTTCATTTCTTTATTGGATGTTATTTATTCACATTTAGCAGAATGGAACCTTA
ATTTCTGTTTTAAGTTGTGCTACTAATGAAGCAGCATAAGCACAATTATCTTTGTTATGA
ATAATTTAAACATCTGGTAATTTACAACCAATGATAGCTTAATTGAATAAGAAGGTAATT
TCAGACTTGTGTGTTCTTGAGAAAAATATTCCAGTTTACGGAATTAAAAAAAAAACGTAA
ATAATAGAAACAGCCAAGGATTTTATTAAAAA
(6212 bp)

- SilkBase 1999-2023 -