SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp41035_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Scaf078
NCBI non-redundant
(nr)		putative_conserved_plasma_membrane_protein_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0005319 F lipid transporter activity
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005635 C nuclear envelope
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005768 C endosome
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0007041 P lysosomal transport
GO:0007165 P signal transduction
GO:0008158 F hedgehog receptor activity
GO:0008202 P steroid metabolic process
GO:0008203 P cholesterol metabolic process
GO:0008206 P bile acid metabolic process
GO:0015485 F cholesterol binding
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030301 P cholesterol transport
GO:0031902 C late endosome membrane
GO:0042632 P cholesterol homeostasis
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
Transcript
Level		FPKM:49.89 TPM:39.42
ORF EntryO_BomoMG23950_complete:A_BomoMG_comp41035_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
GGCAGTCAGTACGGCCGGCAGTGCTTAGCTGCGTTCATATAGTACTCGGCAGAGATAACA
TCAGTAGCAAGAAGCGGCGCGCGCTCTCCGCATGTCCGTGCCGCAGTAAACAATTAGCTC
TCAAATAAAACAGTAATGCATTCTGAGTGTGTGATTGTGACAAGTGATTATTTATTTATT
TTTTTACATAACATTATTTAGATATGTAATGTGTTGCGACTCTTTAGAAGTATATTTATG
CTTACATTACAAAAACTATTTACGAAATCATACAAAATAAATATGGCGCGAAATTAAATC
ATACTCAACAAGTGCAGTGAATTGTTCCAAAATGTCAAAAAAGAAAAATGTCAAGACTCC
ACAACAGATATGGGAAGGGGTGTCATCTGTTTCGGTGCATTTTGTTGAAAGCATTTTTTT
TTCGCTTGGCATCTTTGTGGCAAAGCATCCATGGCAAGTCATTTTTGGGACATTATTATT
TGTTACTGTGAGCTGTATCGGCTTAATACGGTTCCACATAGAAAAGAATCCAATGAACTT
ATGGGTCCCGCCAGATTCAGATTTTTATCACGATACAAACTGGTATATCAAAACATTCGG
CACAGGCCTCAGACTTCAAAACATTATTTTCACCGCAAATGATATATTACACCCAGATGT
ACTCATAGAAATAAACGACATTACTGAGAGAATAAGTGCCCTAAATATTAAGTATGAAAA
TCAATCCATTTCTCTTACTGATTTGTGTTACAAAGTTCCTGTTGTGAATTTTTTTGGCTC
AAACTTTAATACAGGGTCAATTAAAACTAGTGATAAAACAAATAATTCAGCTAATAGTGA
TTACAGTGACAGTGTTTTTGAAGACCCGACTTTATGGGTTGATAGTGAATTCTATTGCAG
TTTCTTAGAAGAATTTGAACTAACCTGTCTCCAATATAATTTGTTAGACATATGGAAGAA
TGATCTAAATATAATAAGTAGTTTGAATAAACATGATATTATAGAAAAAGTTAATTCGAT
TAAGGTCAACCCTGTAAGCGGCCATCCATTTGATTATACCAAAATATTAGGAGGTTTAGA
ATACGATGACAAAGGTAAAATTATTTCTGCCAAGTCTGTATTACTCACATTTTATACAAA
AGTAAATATGTCAGAAGTCAATTTAGATGACGTAGGTAACTTGGTAGGTACAGAAGATTG
GGTAACTGTTCCACTGGCGTCTTGGGAAAAACAATTTTTGGAAGCTTTAACCAGCATCTC
TCTTAATACTAAATCAGTCAAAATATTTTACGAAGCAGGTAGAAGTTTCGCTGACGTTAG
TGGCGAAAGCATGTTTCACGATTTAGACAAACTCTTTTTGGGGATTCTACTAATGTTCGT
TTACGTACAATTTGGTCTATCCCGTTTTAATTGGTTGGAAATTAGATTGACTCTCGGAAG
CGTAGGTTTATTGTGTGTAGGATTAGCATACGTATCTGCCGTTAGTTGGTGTTCTATTGT
TGGTATCCCATTTGGTCCGGTTCATTCTTCATTACCATTCCTTCTAATGGGTCTCGGTAT
AGACGATATGTTTGTAATGAAAGCCTGCTGGAAAAATCTATCGGAAAGTGAAGCAAAGAA
AAGTCTCCCGGTAAAAATTGGTTTGATGCTAAAACATGCAGGCGTATCAATCGTGATAAC
TTCATTTACAGATATAGTTGCTCTATTGATTGGAGCCATAACAATTCTTCCATCACTAAA
ATCTTTTTGCCTATACGCAGCGACGGGCGTCTTTTTTATATTTTGTTTTTCCGTAACGTT
TTATGTAGCAGTCTTTACTTTGGATGTAATAAGAATTGAAAATAATTGCAATGGTCTTAT
TTTCTGCTATCAGCATAAGAACCAAATACAGATATCCACGAAAAAGACTTGTCTGAGAAA
TATTTTTGAATTCGTATATAGGAATATTATTTTTACGATTCCGGGAAAAATTATTGTAAT
TTTGTTCACTATAGTAATAACAGGATTTAGTATACAAGCTGTTTTCAAGTTGGAACAAAG
GTTTGACCCTAAATGGTTTATTCCTGACGACACCTATTACAAACAATATCTTGATACTCA
TGATCACTATTACCCCGAAAACGGGAACGACGCAATGGTGTTTCTCGGAAAACTCAATTA
CAGAAAAGAGTTTCCAAACCTGTGTAAAATGATGGAAAGCATTGGTAATAAATCGTATGT
GAGCGAGGCTATGACATCGATTGAATATCTGCATAAATATGTTTTGATAAATTACAATAC
CGATCTAAAAAATACATCCTCAGTAACTGATTTTGAATTTTATCAGTATTTATCACGGTT
TCTATTTAGCCCTGTGGGAGGGAAGTTTCAGGCCAACTTTAAATTTTCTGAACCATTATC
ATGCGGAGTAGCCGCCCCAAGAATTTTAGCCACTTCAATTCCATTCAAATTTACAAAATT
CCATGGTCCTGAAGAATATATTCCCGCTATGCATGAGGTTAAGAACATTGTAAAAACAGC
CAGCATAGCAGGTGACGTTTACCGCAGTGTGTGGTCAAGAGTATTCGGAAATTGGGTAAC
TGACGAGGTAATTGCAAACGAAGTTGAGAGAAACATTGAACTAGCTTTGATTTGTGTTAT
GGTTTGTACGATTATATTAATAACAAATCTTCAGATGTGTTTCTGGATTTTTATTTGTGT
CTCGTTAACAATTTTGAACGTTTTAGGATGGATGCAGAGATGGGGAATGACAGTAGATAT
AGTTTGTTGTATTGGTCTTGAATTAGCCATTGGTCTGTGCGTAGATTACGCAGCGCATGT
AGGCCATACATTTTTAACCATCCAGGACGGATCGCGACACGAAAGAGCTTACAAAACAGT
AACGTCCATTGGCACAGCAGTGCTTTTAGGTGGTGGTTCCACTCTCCTCTCTCTGTCTTT
ACTTAGTATGTCAAAGGCTTACACGTTCCAATCATTTTTCAAAATCTTCCTTCTGGTTAT
ATTATTCGGACTTTTTAACGGCTTAATATTTTTACCAGTGGTCTTGTCTCTAATAGGCCC
TGGATCGTACAAAATAAAAGATCACACCGTCGACTGTCAATCTCATCAATATGAATTAAA
CGAAAAACAAACCGACGATGGTTTGCATACAAATTAATTTTTTTTAGTAATAGTAACAAA
AGAAAAGGATATTTTTTTAACAGAAGGTACCTATTTAATATCGATTTATTACCTTATTTC
CTTCCTTATTTTTAGTCCTACTATACATTTTCAGCGGTCACGGTTGACTGATTATGGGAA
TATTTTACTATAAATATGCAATTTGAAACGTAAATCTTTCTTTTAATTACGCTATAACTC
GTGAAATTATAAAAAATACATAACATTAAACATAATATTATGTACTAAAAAATTATGAAT
ACAAATTATTATTGGTTGTACCAACTCACTGATGTATTATTACTTTTCCCTTCGTGTATC
ACGCTTAAATTAGTTACTAACTAAACTGATTTTGATAAAGCTATTGTCGAAAACGTCATA
AAAATATTTTAAGTCGCTACGATGCGGAGACTGATAATTTTTTCGTAACAAAATTCGATC
TGTTTCGGTGGAGCGGATATTTAACATCATTTATACCGAAGTCGGTATGCATAATAGGCG
CGAATAGATCAGCCTGAAACTCATCGAAGTTTAATAATTATAATTATTTGTATATACCAA
ATTAGACTTAGCGTAGCTAGGAGTTTGTAATCTGAATAAAAATGTAAAGACGATATGTAG
TCTTACAGGTATTTATAAAGTTGATGTATTTATATCTACATTTATCGCTGCAGATAATTC
GATAATCGGCACACTAAGTCATTATAAGTGTATTATGTACTGTATAATGTAAATACAATA
TAAACACCGTTTTAATTAATAGTATTTACTAACAATAAACAGTTTCTCATAAATCGCAAA
GATCCCTACATAATGTGACAGGTATTTTCTTTGTACATTTGTTTAGTCAAATGCGTAGGC
AAAAAGTACAATATATTTTAAATGACAGCAATGACAATAGCGTAACATTATAAGAGTACA
TAGTAGTCTTTTGAATGTTGATGTAAAGAATATATTTATTTTTCGTATGATTAGTATTTA
CTTGCGTATTATCTAGTAAACCTATATACTTACTATCAATGCACTCCCAATAATAGGTCG
AAGTCGATAACAAATCTTTTGGATGGCATGCAAGGTCATGACGCAGAATGGTTATCACAA
TGCACGGTGTATTGTTTATAAATTATTGAAAATTCAAATCTCGTTAAATTATTGTTGATA
ATTAATTCTCTACGAAATGATGTATAAATATTTTATCTTCTAATATTTGTGTTTAGTTTA
AGCAACGTTTCAATGTTATGTTAACATTATTCTTAATAAATAAAATATGTTTTAAATTAC
TGTAAACCTATATAGGTACTTATAATAGAACTAAGTTTTGCATAGTATAGTGAAAACCTT
CCACGACGTTAAATTAGAAATGTATTTAATGAATTAAGTTGTATCTTGGTGCATGGATGA
TACTTGTCATGAAACATCAACATGTAATCTCCATCGACAACAATGGTTTGAACTGTATAT
TTTTTTTATTTTTGATGTTAATGCACTGTCGATTGCACCTATAATTGAGGTGACATCTGC
CATGAACTTTTGTCAATTTGTCAATGTTTTGTATTGATGATCACTTTGTTGGTGCAACTT
AATAAATAAATAAATAAATATTATTTGTAAAAAAGATATGATTATTGCACAGGGGTCCGC
TTCAGCACCGGAGGTGACACTACTGAACAAACACTCGTTTTTAAAAGGGAGGGACGTCCT
TCTTGAGCACTCTTAGTTAATGCTGGAGTCGTCCACTTCGAGGTCGTGCGTGAAGCCGCA
CTTCGTCCTCCACTCGTCCTCTTCGAGCACGTAGCGGGAGGTGAGCTGCTGAAACTCTTC
CAGGTCACACAGCAGCGCGCTGCAGCCCTCCACCTGCAGGTACTGGATCTGCTCGTACGG
AGATCTTAGATAAACGGGCAAAACTACATACTTCCCGGTCGCGGTGACCTTCCTCAGCTC
GAGGGAGAATACGGAGCCGTACTTGGGCACTCCTTGTCGCGGACTGATCCTGGAGACGGC
CATCAGGGAGTACACGTTGTAGTCGTGCGCGGAGTACACGTGCACCCGCCGCGCGCTCTC
GCCCCCCACCACCGCCGCCGCCGCCTTCAAGAACTCATTCAGCAACACTCCCGCTTGTAG
CGCGATGTAGTTTTCATCTCCGAACACGACGTCGATGGCCGCCCCGGCCGCCGCTTCGAT
CTCGGGGAACTTCTGCGCCGTGGCCTCGTCCAGCGGGACGCCCAGCCCGAGCTGAGCAGT
GTATACGTCGTAGAACATGTACGCCAGGGCGGGCATCTGCACGAGGTCGAAACCGAGAAT
TTCAGACCATCTCGCCAGGAAGTCGCGGTAGGGGGCCATCTTCTCGGAAGGTTTCATGAA
CTGGTCGTAGTAGAACGAGATGAACTCCGGACAGTTGAGGTTTGCCAGGTTATGGTCATA
TTTAGGTGGGACGGTGGTGTAGGGCACGGGGGTCCAGTGAATCTCTGAGCTCCAGTTGTC
TTCAGGAGGTGGGTAGACAGCGGCCATCGCGGTCAGGACAGTCATCTTCGTGCGTGTCGA
GTCCGTGGACCGGATGAAGATCTCGGAGGCGTTGTATCGGTCCGAGAGCAGAGCGCCGTA
ACGTGACTTGATGTACTCTCCCACTTTGTAGCTGGTCTTCTTACCGAACTCAGTGAGTTG
TCCAAAGCCATAGGGAGCCGCGGCCTGCTCCAGCGCGGCGGGGTCCGTGGACATGGCCAG
GGTGATCTCCACCGGCGTCCTGTCGCCGTGCCGATGTACCAAAAAAGTTGAAACCAGTTC
GGTTCCGTCTGTAGCGTCGCCAGCCCTGACGTGCTGGGCCAACGCAGCCAAGACGCCTAC
AAAGTACACGACTCGCATGTCGGCTGAGTTAGTCCTCGGCACGGC
(6045 bp)

- SilkBase 1999-2023 -