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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp41016_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Scaf005
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_LIM_and_SH3_domain_protein_Lasp_isoform_X4_[Papilio_polytes]
Ontology
GO:0003779 F actin binding
GO:0005515 F protein binding
GO:0005829 C cytosol
GO:0005925 C focal adhesion
GO:0007279 P pole cell formation
GO:0007283 P spermatogenesis
GO:0007291 P sperm individualization
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0014881 P regulation of myofibril size
GO:0015629 C actin cytoskeleton
GO:0030018 C Z disc
GO:0031672 C A band
GO:0045214 P sarcomere organization
GO:0045856 P positive regulation of pole plasm oskar mRNA localization
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0070864 C sperm individualization complex
GO:0071689 P muscle thin filament assembly
Transcript
Level		FPKM:18.67 TPM:14.75
ORF EntryO_BomoMG23665_complete:A_BomoMG_comp41016_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
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GTTACGCGACCGATCTGCCTTGACTGCTGATGTTGTGTTTGATGACTGCTACCCACTATT
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TCTGCCACCTGTGTGAATTTCCCTTTACTCCTCTCGAAGTCGGCGTGGTACTTCACGTTG
CTCTGTAGTTTCGTGTTTTCGGCGATCCGTTTCAATTCAGGTGTTTCGGCCATTGTCGTC
GGTTTCGCTTTCGGTACGTGAGCTTCACAATAAGGCAGCTTCCCGTAGCCCTTGTACGTT
CTCATGTTCAAGGTCATACTGCACTCTTGGCATTTGAAGCAGCCCTTGTGCCAAACCTTG
TCCAAACATTTCAATTCCTCGGTAGGATAAACTGTTTTCTCGCACCTCGCACAAGTTTTA
TTCATCTTGAACGGTTTTAAGCCAATAGCACTTAAATAAAATAAAAGCACTACACTTTCA
CAGAGCAACACAAGTAATCACGATTCACGAACAAACTTTAGATATAACTTTTTTAAGGAA
ACACTCCGGAGCACGATTTTCGTAGCATCCCCGT
(2974 bp)

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