SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp40968_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr23
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_LETM1_and_EF-hand_domain-containing_protein_1,_mitochondrial_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005509 F calcium ion binding
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0005743 C mitochondrial inner membrane
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0043022 F ribosome binding
Transcript
Level		FPKM:1.16 TPM:0.92
ORF EntryO_BomoMG23090_5prime_partial:A_BomoMG_comp40968_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTATATCGATGTTTATTATCTTAATCTTAAAGATCAACA
GATTAATATCGAAGAGCAGACAATAAATAAGATACTTATCAACATGGGAATTGTGAACAA
AGACTAATATATATATATTTTTTATAAACAAATTTCCACCTTTGTTCTATTAAGTACCCA
GTGAAATTCTTCAAAAAAATGTCACCTGTAACCTCCTTCTGCATGTAATGTTCTTTTTAT
AATAAAATAAATACAATCTGCTAGTTGTTTACAATTCAACTACTGTTTTACGCAGTTATC
TAAATATATCTATCTTATTTTGTCATGCCAATTATGTGACAGATGATTTCATCAACTTTG
CATTAAAAGTCAAACAGTTTATGCTGACTATTTTTATACAGAAAAATAAATAATAATAAA
AAAAAGTAAAATATTGATCACAGAAATGCATAAACAATTCAACATCTGGAATTAAAATGA
TAATAACATTATAAATATTTTTGTACGAAAGTTAAAGTTAGGGTAGCATAAAATTATCAG
AGCGCAACAAAAGAATGATAATTGTCAACATAGTAACTACGAAAACTATTTACCGTTTTT
ATAAACTGCGTTATTTCTATTGTGTTGGTTTTATTTAATATCCCAAAAGCGTTCATAGCC
GCCACTAACTTGTGAAGTTAAATAATAAAAAATAAAAAAAAGCACAATTGCAAATTATTT
AAATTGCATTGTAATTTACAACGAAATATAAAAACTGGGCACCACTGAGTTCAGTGGTGG
CAATAGTTATTGCTCTCTCATTATTACGAATAATTCAGCTTAATAATTATTTGTTAAATT
ATGTTTTATATTAAAGTAGGATTTTTCAATGTTCTATGAAGTACATGCCAGGGAACAATC
AGTACTCCAGAACCCAAACACCAAATATCCTCAACAGAAATACTGATTGATGAGGACACG
GTAGCCAGTCAATGGCCACTAGACAATGAGATGATCGAATTAACCAGTACTAGCTGGTAA
ATAGCTAACTACAACACATTTGCATGACCGTAGTTATTTCATTTACAAAATCACATTTGA
ACAGCTACGAAACAGTCAATTGTAAGCGCTACTTGATTTTAGAGACTGCTATGACATTAT
TAGCTATAAATTTAACAAATGTTAGTAAATTTGTTATTTTATATTATATACAGAACAGAA
CATGGAAAATTTTCGGAAACGGAATTAAAATATCATCACATTTTAACATTTTTATTCTAG
ATCAACAGTCAATATATATTCAATTACTATAATCTGATGTAACGTGAACACGTGGCACAC
TGTAACGTCACATACAACGGGCTACTCGAATTACTCAAAATAAGTAACTATTGTTTTGAT
AATTTTTATTTTTTAAAGACTTTGTTAAAGTATTGTTAAAGATATAAACATTCAATAAAG
AGAGACAATAAAGTGATAACAAAATAAAAAAAAGGTCCTAGTTTACCATAAAACTATGGC
GGACATAAAAAAATATATTCCAATATTACGGATCACACACATGAATTTATGCGATGCAAC
CCACCGAGACCCTCATGTGAGGTTACAGTTCTATTTGTTTCGGATATGACCTATGTCCTA
TCATCCTTACATAAACGAATTAATACTACAGCTATGGGTGAAAAACATAGGCTGTTTACA
ATGGAGCCCTTTTAATTAAACGATGTGCCCATAGTGTCTATGGTATCACGTTGCATGTCA
CGCTACAAGTACCGTAACGCCACTAGCGCCATCTGTGCCAATTTACCGCGCACTAAACCG
ACAGGAAGGCATACCGCATATTTACACATTTCGCTAAACAAATCGATGGCCTCCTCATCA
GTGGCTCTCCGGCCGTTTACTGCTCTCCTCGGTTTTCGCGATGACGTCACTCTTAGGGAT
ATCTCCTTGTTCTCCGAATTTCTCGACTGCTTTTTTCATTTCTCTTCGCTTCTGGGCCTC
CCTTATGATATCGAATAGACTCTTTCCATCGGATTCACTGTTCTTGTCCTGTTCTTTGGC
GGCACTGGCGGCTTTATCTAACGCCTTCTGTATCTTGCTTTCGACCTCGAGAATCTCCTC
TTTGTCGAGTAGTTCGATTAATTCGGCCATCTGTTTCTCTGATAGATTCACGTTTTCGTT
ACCGATTATTTCGAGCATCTTCAAAACATCATCAATCTTCAACTGTCCATCAAAGTCGTC
GTCTAGCCTGCCCAGTACGTCTTGAATTAACTTCAACTTAGCCTCATCGGGGACTTTTTG
TAAGCTCTTAATGGAATGCATCAGTTCGTCGATTTGGATCAACTGTTCTTTAGCTTTCTG
TGGTTCGGACTTGGTCTGTTCTAGTGTCGTCTTCAAGGCTTTCTCTTTGCTTTCAAGCTC
CACCAGGGCAGCGTCAAGTTTGCTTATCATGTTATTGAAAGCAAAGAGAAAGCCTTGGTC
TGTTCTAGTGTCG
(2473 bp)

- SilkBase 1999-2023 -