SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp40964_c3_seq28
Scaffold_idBomo_Chr5
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_atlastin-like_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0005525 F GTP binding
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0007029 P endoplasmic reticulum organization
GO:0007030 P Golgi organization
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0042802 F identical protein binding
GO:0051260 P protein homooligomerization
Transcript
Level		FPKM:0.00 TPM:0.00
ORF EntryO_BomoMG23067_complete:A_BomoMG_comp40964_c3_seq28
Sequence
(Nucleotide)
AAATCCCACCCCTCCTGGCTGAGCGTAATAATAATGTTTGCCTTGTTTATTTGTTAGTAA
ATAATTCAAGGCATACCTTGAAGGGATTTACCAAAATAAAACAACAGTGGGTTCAGATTA
GTTCGAAACATAACCAGAATCTGTTTTTGTCTGTAATTACGGAATAAAAGTTCCAAGGAC
ACTCGGCCGATGGAACTTTCGAGGCGAAGAGGGAAGGCCAACAGCGAAGACCCTGAAACG
TCAGCCGTCTCGGTACGGCAGCCAGTCATGCCACGGGGATAGCGAAGTTGGTGTCCCGGA
GTTCCCCACTGGATAGTTATTTAGACCTGACTAAAACCTAAACAATTTTTTTTTGTTTCT
TTTGTCTATTTGTTGTTTATTCGTTTATTTGCTTTATTCGATCCGATTTGCGAAAAGTCT
CAAATAACTCCATTGGCTGGTAGAGGTTCTCTATGAAATATAATTAACTCGTGGCGACTA
AAAAGGATATTACCACATCTACGTAAAAAGACTTAAACATACTTGGAGGAAGTCGAAAAG
ACAGATGATCCACTGAGTTTCTCGCCAGATCTTCTCAGCGGGTTGCGTTTCCGATCCAGT
GGTAGATCCTGCGAAGCACTGCTAGTACTAGTGTTAGCAACGTCCTCAGGATAGAGACCA
GTGAACACATGGATTCGCTCGGTTACGTTGGCATAAGCCTCTAGGTTACCAGATTAGGTA
GGGAAAAAATACCCACAATACATTCCGGCTCGAACAGTCGAACGAGGCGGAGTTTTCTGT
TGGTGTACACTTGAAATTCAATAAATGGAATCTTATTTACTGTCACTATCAAAGTCAATG
TTGGAAATGGGGAAGGGTAATACTTTTTAAATATCAATATAAGCCTCTGATCTTATTCTG
ATCATCGGTTCTACTATAGCTTACAAATTCATACGATCTCGCCACGAAGCGAACTCTAGT
GAAGTTATTTTTAAACTGAGAATTATAGCAAAACCAAAGCAAGCGAGCAATCACTTTTCT
ATTTTGAACAAACAGAGTTTCTACTTACAATTTATCTCGAAATCGGTAGCAAAGTGAACT
TCGTGCTCAAGTTTTGGCTTTTAAAATATTTGTTCGCTCCAGCAGAGGCGAACGTCAACC
AACAATGACACTACCGCAGACTTATCAGGTGACTGTATGATAATAGTATTTTAAATGAGT
TGTAATAAAATTTTCCAAAACAATATTATAAAGTCGAATACTAATTAAGTCCAAGCTCTG
TGTTTACATAGGTAAAACTTAATGAGGATTAAATTTATTATTCTCTAATAGTTAATGTTT
GAATTTTTTTTATTGCTCTTGTAGCTGCTGCAGCTTGACTCTGCTCCTGGCATTGCTGAC
GTCCGTGTGCGATGGTAACCAATCACAATCAGGTGGACCGTATACTCGTCTGCCTACATG
AGTAATAAAAAAAAACAGTAAGAAGCTGAAAAAAAATATTTAAAAAATAGTGCAGTGCCG
GTGCCAAAAACGTTTGTGAATATTGTTTTAATCAATCGGCATAGAAAATTCTCGAATATG
TAAATTCAAATGTGCAACAAAGTGCTTCAGAGTGAGTCAAACAACTTATCTTTTTTCCCA
GTGCCAAAAGCATCAATCGTTTAAAAATACAACTAGCACTTGATCTTGTGTCTCAAAGTC
AACGGTTTAGTAACCATTTAACACCAGTGTGCTTAGTGCGAGTTTGTTAACTTCTCGTTC
GCGTAAAAGTTAGCCCAAATTTGTATGAAGTTGGAAAAGCGCCCCTAGCAGCAAACGCAG
CACTTCCTTTTTTCCAGTTCAAGTACGTTCAGCCGTTACGCAATAAATATTAATAATCAA
ATTTTAATTAATAACAATCATTAATAATTAGTTTTCGGAACAAACGTTATCGTTCCCAGA
TAATTTTAATGCCTGATATAGCACAAATTACTGTTTTAGATGTATAAATAGTTAAGTTAA
AAAAGTAAAGACCATTATAAGAGAAAATGCGTCAGTCTATAACGTTGGTGTTTTTAATTC
TTGGTTGGGCGAATGGTATGTAACAAAATACAGTTCTTTTTTTAAATTATATCCAAACGA
TGACTGATTTCCGTATTCCGCACAAGTCTGTATTTAAAGTATTTGAACGGTCTTAAATTT
TTAAATAAGCATAATAATCTCGATGCGAAACCGTAAGAGTACTTTCAGAAAAAAATGTTA
ACAGTAAATACCAGATTTGCGTGAAAGACGATATGTGAAAGAGGGGAGTGAGCTAAGAAA
TGGTATATGATAGAGGAGTATGGAAGGAAGAAGCATGTTGTGCCGGCCCCAGGTGACTGG
GAGAAGGGCTGGAGAATGATGATGATGAAATATGTTCATGTTCCACCTGGTGTTAAGTGG
TTTCCGAAGCTCATGGAGATCACACCGTGAATATCGCAGTTCATTTTAAAAATGAGGTCT
AAGTCTTAATTGTATAGTATTGCGACTTTCCCATCCTTCAAATCGGGCCACCGACCCTTC
AAATTACTGCTTATTATCATATTATTTGTTTTAAATTAGTTACGACTTAGCAGAATGTTT
TGAAATTAAATAAATATTAATGTATATTTCAGACAATAGATGGCAGCACATGTACTTTAT
CACGACTAGTCGTTTTCTTGGCATAAATTAACATCATAATTTAAATGCCGACGCCCGGAT
TGAATAATAAAAAAAAATACAAATTCAAATACAAAAAATTATAATCTAACACTTAAAATA
ATATTGCTATTTCTCAATTACAATTATTTGTTTTTTTTTACATTGATTGATACATTAAGG
ATAGGCGAGCATCAGTTATAAACATAAAATCTAAAAACATTGTGATTTGCTTTTTGTTTT
TATTCAAAAACGTTCAATAATAAAAAAAAACACAATAAGATTTCCGAATAAATATGCTAA
TACATCACAAATATCCCGAATATTTTTCTATGATGGCCAAACATCAATTACCACTGTCCT
TGTAGTCAAAAAATCAGTTGGGTGTTTCCGTATTATTTTTTTAATTGTTTATTTGTTTAG
TTGATGCCACTCCCAAATCGTCTCATATACCGAACTCACGAGTGAGTGCGTTCAGCGGGT
GACAATACTCATGAAAACCATCTTCCAGTTTAGATTCGAGGTCTGTTCTGTAACTGTCAT
CGGAACGGTAGGAGTAATTGCGTCTCTTGCTTCTGAAGTAATCCCATGCTGCGTTTTTGC
CTTCTTTATGATAATCTGGCAGACGTCTGATCACCTTGACCAGCCAAGGAACAATTAATA
TAGACAGGACCGACGGCTTACATTTCCCGTCCATATACCTGCAGTATTCGCGGTATGAAT
CGGCAACTGCCATATCGTTGGAAGCCGAGTTGATTTCTTTCAGTTCACTATAACGTCTGT
TCAATAGCTCAACGAGTTTTTGTTTATTGACATCACCGTCATCATCGTCATCACCATCAT
CATCAGCCGTCGTATTTCTGCTGTTATGGAATTCAGTCAGGGCCAATGCTTTATTAGTCT
CGTGGATTTTCGTTAGGTCTTGGGGATGGAAGCAGCTGGAAGGCGGTCCCCAGGCTGAAG
TCATGTGATTGTTGTAAGAGTATACTGCCTCTTGGATCGCAATCTTATTGGCGTTGTTGT
TCGCTGAACGAAACTTCTGGAATTCTTCTACGATGCTCTCTTGTAAAGAACTGATGTATT
TATCTTCGCTATGGTTTGTGGGGATGTTGCGATGCGATTTCAAGATTCCAATGGCCTTCT
TCAATGCATTTCTGTGGCAATTCTGCAATAATTCGTCAGAGACACACGATCCCATCCAGA
CGTGCTTCTGCATTAATGTCTCATATACCTTTCGGGCCTCGCTAATGAAGACTTTATTGT
TATAATCGTTTTTCAATCGCAAATCTTTGATATTACCTTCGAGATGCTTCATTAACGAAA
TCCTTTCAGGGTCGCTTTCCTTATCGGGAGTTCTTCTGTTGTTATCGAATAAATCTGCCG
CCGCGTCCACCGCCTTGTTGTGGAGTGAATCTAAGTCTAAGGGGTGCAGACAGAGAGGCT
CTCCCTTAGTCACCTTCTGAACTGCGTCATCGTAAGCTTGTTTCGCGTCAACCACGGCTT
TCTGAAGTTTCGCTTTGTTCAATGTCAAGTAATGCTGCAAGCGTGCTTCTAATTCCGTAA
TCAGCTTTTCGATATGCTCCTTGGCGTCCTTTTGTGAACCAATCCTCTTTTTACTCTCAA
ACGATTGACGAATAATAAGAACGGTTCTCTTGTGTTGATCTTCAAGCACGTTGTCTGGTA
CACTCGGCTGTTTGGCACCGGCATTCATTTCCATACGTTTTTCATACTGTTCCCTTGCAT
CCCTGATCGCAGATATCAATGCCACCTCAGATGTTGCCTTCAAAATGGTAACCGGAGTAG
GCAGCTCCTCGCTGTTGTAGATGTTCACGTAAGTCTTAAAGAAATCAAACAGGTCCCGAG
TTTTGATTTGGTGACCATTGATTTTTTTCGGCACCAAATTCCTAGATCCGAACATCGATG
GTACCAGATCTCGAAGCGCTTCTTTGAACTCAATACGAATGTCTGAAATGTTTATTGTAA
TTTTACTGGAATCGGGCAATATTAACTTTGTTATTGTCTCTAATGTACAAAGAAAGCCCG
CCTATTATTATGTGGTTCATAGACCACATACCATGAGATATGAAATCGTTTTCTCAGCTA
TATTTTATAACTGTATCACATTTGGGCGGGAATGCAAAACTCCATCGAGACGGAATAGGC
ACAATAGTGGCGCATCCATCCTAGGATTAGTAAACGAAATGGCAATATACAGGTATAAAA
TTCAGAAAACGCTATTGCCCAGTTTCCGTTGAGAACCAACTCACTGGAAGAAATTAGGCG
GTGTTATTCTAAAACGAACTATTGTCGCCTAACGTGATTTGATCTAAGAGGGTGAACAAG
GTTTCACGGTAAAAGGATGAAGCAATAATCTATTTCCCCCAATTAAATAAATTTATTGGT
AACCAGCTAGTTGTCCATTAAAGTTTTGCTCCGAAACCACGAACCCCGGGTGAGGCATCA
GGAAACAGGAGACCGATTTGAAACAAGAACGGATTCGCTCTCGTAATTCCCTCAACTCCG
CGTGCTGATTGTTAGTGATCTGCAACCTTTTTATAAGCAATTCTTCGCCTCCTTCCGCGC
CAAACGCGTGTTGATAAGGGTACGCCCAATCACGGACCAAGAACATGAGAACTTGGAACG
CTGCCTCATCATCATCATCGCACGCCAACCTTCCGTATTCCGTAAAAAGGTGTAAATGCT
GGAGGTCGTCTTCTTTGATGTTCTCTTTGAGGTTGTAGATTTGAATCGAGGAGAGTAACG
TGGAAAGTGCGAAGATAGTTGAACTGTCGCGAACCGTGCTGCTGTTGTCAAACGTGCCCT
GGGTGTCCATCAACACTACAGCCACCTTTTGATCGTTGAATCTGGTAACAATCGGTTCCG
ACCATAGAACGATACCAGTTGTCTGACGGTCGCAACCAGCCCGCCAAATGAATCCCGTCA
GCGGCTCGTCTTCCTGGCCCAGCCACGCAGCACTATCACGAGACGAGGGGGGCGCTTTTA
GGTATCTGAGGAAGAAGTCCAGCAAGAAGGACTTTCCACCGCGGTAGACGCCAGCGACGC
TGACTACGACCACAGGAAGGTCCTTGACCTCATCTCGCAGTAGGATCATCCGTAATGCAT
CCTCATTCAGCTGATACGTGTGGTCGTCGGTCACCTTCACCACCTCCACCCCTTTGGCTT
CACCGAGACTGCTCATGACTCCGCCGTTCAATATGGCAGTTAACTATTAATTCTTATACA
ACTTTAAACATATAATCGTTTAATTTTAACAACGCAAAACAATTTATATTAATCTACATA
AACATTAATTCCAACACAAGCACTCAGTTCACGCTGAAATTTTG
(5984 bp)

- SilkBase 1999-2023 -