SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp40750_c0_seq6
Scaffold_idBomo_Chr25
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC106718363_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0006313 P transposition, DNA-mediated
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level		FPKM:0.48 TPM:0.38
ORF EntryO_BomoMG20824_complete:A_BomoMG_comp40750_c0_seq6
Sequence
(Nucleotide)
AAATCACACAACTTCACCTCTCGCGTTCCCGCCAAAAAGTCTCATAACAATCCATACCTA
CATCAGTATCATAGATTATACTAATGAACTGATAGAGCCACCGTGTTTATTTCTGTACTC
TTTATTTTCTGTCACAGTTGTTCTGTCGTGGAAATGTCTGTCGTAGAAAGTTTGGAGGTG
GATTCGTACAGCGATCTTTTAATCGCCAATGCATTAATTTAAGCAAGTAAACAAAATGAT
AGAGTAATAAAACACCGGTAAGTGTTACGAAATTTGTTGCGTTGGTTGCACACCACAATA
TTAATGGTTTCATTTGTTTTTAATATGTTTAAATTTATTCAAGTGTGATCGGAGTTGATA
AAACTTGGAAAAAGGTGATTTGTTGTCCTATTTTATGGACAAAACAAATAGATTTAAAGA
TTTCTTATTTTGGAATATTATTGCTTTACACAAACCTTTATGTGGGTAATTTTAAATTAA
TTTACGTCATTTTGAACAAATGGGTTTTTTCAATTCTGCAACTTCATAAACAATTTTAAT
ACCCTATCCAAAAAAGTTGTGATGTGGGAATTTAACCTTTTTTAAATAATTTAAAACATT
AGACAAGTCTTTGTGTATAACTAGTAGCATGAAAAACGCGGGAAACCTTTGAATTTGGCG
GGCGCGGTTTTTGTTTGAATTTGTTGAAAAATATTTTTTTTTAATCTATTAAGTGATCAG
AATAGTTAAAACTTGTATATATTTGTAATTTTTATTATTATTTAAATTTTTTTGTATTTT
ATTCTTTTTTTCTTCGAGTTGGGGTAAGTTTTTTATATTTATATGAACGAGCCTCCGGAC
CCGGGGGGCACAGCGCCCCCCGCGGTTGCATTTGTCACAATCTCCAACGAATCCGGAATG
GATTCTGACTGCTCTTTGGTGTCTAAAAGGAAGCTGAAGCGTAACCAGCTCCACAAAATT
TGTAAAAATTGTAACAAAAGGAAAAGAAAAAATAATACAGAAACATTTAAACAATCGGAC
TGTCAATGCAAAGACGAATTTACTGAGAGCACTATTGATTTGCCTGCACCTGGTCCTTGC
ACTGATACATCTTCAAAGCCCGTTCCTCCCACTGATATGTCTCATAAAGCCTCCACACAA
ATTGGTAGGGCTAGTTATGATGCCAATGACCACGGCCCGTTTGTGGTACACGTGCAGAAA
ATACAGTCTGCTGATGATGATGGTACAACATTACACCCAGTTGTGTTTGGCAGATTTTTA
AAAAAAAATTTTTTCAAAAATATTGTTAACGGAAGTTTGAAACGTATTGGCCGAAATAAA
ATGACACTTTCTTTTTCTGGAAATTCTGAAAATTAGAAGACTAAACTATAAAGTCATGAT
AAACAACACACCCACATGGAAACCTTCGCAAACAGTCGTGTTTACATTTGATGGACAAGT
TTTGCCCAAACGTGTATTTATGTGTTATAATTCTATGCCTGTTAAATTGTATATATACCC
AACCATCCAGTGCTTTAATTGTTGCCGCTTTGGGCACACCAAGGTCCAATGTAGGTCAAA
GCCCAGGTGCTTCAAGTGTGGTCAGGGCCACACTGGAGATACTTGTAATGTGGAGGAAGA
CTGTGTATCTTGCTGCTTATGTTCTGGGCTGCACTTTGCTTCGAGCAAAAAGTGTCCAGA
GTACGTGAGACAAACAGATATTAAAGTAACAATGGCAGAGAATAGCTTATCCTATATTGA
AGCGTCAAAATTACATCCCCCCATTTCTAAATCATTTGCTGATATTGTATCCTCTCTCCC
AACTAAATCTGTTCCTGGTGGAAATACAGTATTGCCTGGTTCACCATCCTCACGTACAAT
ATCTTATAAAAAAACAGTCTTCACTAAACCCAGAACTCCTCCTCAACACAGTAAAGGTTT
TGATCATGTAGCACATGAGTCTCTTGTAAGGGACTACAATATGCCAGAGCCTTCTAATGG
ATGTGCATTACCATCCTCGTCTAATGCAAATTCACAACAGACAATAGCAGAGTTAATTAC
TATATTGATCAAATTACTTTCTGAACCCAATTTATCTATACCGTCCCACGCTGCTAATTT
AATTCGTACTTATACTAATATTAATAATGGCCAACATGGACAAGTTAGTTCAATGGAATT
GCCGCAGTATTATAAACAAAAAGCATGAAATTATACATATTATAAATACTTTTAATCCTT
TTATATTTTCTCTATCTGAAACCTGGCTAAAGCCAGATTTTGTATTCAAAATCCCTGGTT
ATTCGTGCTTAAGAGAAGACAGGGCTGATGGATATGGTGGTGTATGCCTACTCATCAGAA
ACTCTAGCACCTTTTCTTCCTTCCCTCTCCCTTCACATAGTAACTGCTTTTCTGTCATTG
CAGCTATTGTTGATGGTATCTGTTTTGTCTCTATCTATGTCCCTCATCCCTCCTTGCAAA
TCTTCAATGAAATTAAAAACTTAATTTCAGTTCTTCCTCGGCCTTTCATGATTCTGGGTG
ATTTCAACTCTCATCACACATCTTGGGGTAGTTCAGTATCTAATAGTTATGGTTATGAAT
TATTAGATATCTTAGACATGTATAGCCTGTGCATTTTAAACTCGGGTTCTCCTACTCGCC
TCACAAAGCCTGGTGAAGTAATTAGTGCC
(2669 bp)

- SilkBase 1999-2023 -