SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp40548_c0_seq3
Scaffold_idBomo_Chr1
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_cold_shock_domain-containing_protein_E1_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005743 C mitochondrial inner membrane
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044822 F RNA binding
GO:0070937 C CRD-mediated mRNA stability complex
GO:0070966 P nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay
Transcript
Level		FPKM:13.69 TPM:10.81
ORF EntryO_BomoMG18933_complete:A_BomoMG_comp40548_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
CAAAACATTTATTTAAATGCAAGAAATGTATTTTTATATTAATACTTTTTTTTTTTTTTT
AATAAAATGTTTACAGAATTTTACGAGACGACTCTTATTTAATTTTATCTACAAATTACA
CGACACATTTGGATATTATCAGAAATAGTAAAAGTTTGTTTAATCAAGTCTCAAAAAACA
TTTGGCAAAGACGGTTCCCATTACGATTATATTCGAAGAATAAAAAATAAAAATATACCC
TTAGTATTATTCCAGAGTTTGTAATTCTGAAAGCTTAAATAATTTAACATTTCTTGTTTG
GTATTTCCGACCGAGAGGTTCTTTTAGGCACTGTATTTGACAATTGTTTTAGGTTCGCCA
AATTCACTGCTAGACACTTTGGTTTGAGTATAAACAACAGTTTACGTTGGTCAGATCTCA
CAAGACATTCATAGCATCTTAAATATACATTTTTCAAGTGAAAATAGATAATGTAAATAT
GTAAGACTAGTACATATTAATACCTATACCCGAAATAGCACGGGATTTAATTTCGTAAAC
TACAACACCAAATATTTTGATAATATTATTACATTACTATTACTATGTTATGGTTACATG
AGCATAAATATTACGATTCAGAATATCAAATCATCAAGATTAAAGGCTAAGTAAGCATAT
ACATTTGTTCAAAATTCCCTCGCTCAATAAATATGTACAAGCGAGAAAGCGATAACGGTT
ATACCGGTCTTAATTACATAGGATTCGCTTTTACTTACTTACAATTCACAATACTCACAC
TCCTAAACAGTTATACGTAATCGATCGTAAACGAAATTTAAGACATACCGCCATAGTCAA
AGACATTAAAATATTTAGAAATGTGATTTAAAAAAATTTGTTCATCTAGAAAGGCTTACA
GGAGGGGTATTAGATTACAGAGCACTAAAAAAAATTGAAGGGTAAGATCCGATATAGAAA
GAAAAAAAAGAAAAACTGGCAACACCTAAAAATACATTTAATAGCCTCCTACCGTTTCGG
GTTCTAGTCCGTTCAATTGAAATACGTTCAAAAATATTGTACACATCAAACAACAAGGCT
TATTTCACTAATCTTAACACGTTAAAAACGTGATATCAAAAAATGAGAAATCTATGATCA
CTTTGTACTTGTACTTTGAATTTCTTGTCGTAAAATTTATCACCTATCCGTTTCTTAGTG
TAATCACATTTAGCACTAAATCACTTACCACATCAAAACGCAGTGGCCCCGTCGAATCGT
ACGATTAAAAAAACGACATTTACACATTTACGGTTCATCATTGATCACAAAAACTGGTCA
GCGCGGCCAGGTATTATCACAAAATATGGAAATTTTATCAGAAATATCAAAATTCACATT
GGGCACGTTAAATATTTGAACACATTTTATTGCTCGTAATGAAAATATTATCTAAGATAA
TTATAAGTTTCCGTCTAAGACGAAGTCTGGTGTTGTTGTATAGATTCATTTCGTGTAACG
ACTATTTTATAGAGCCAGTGTGTAAATGACGCTTATCAAAACACCGGTCTTGCTTGCCCT
TTTCTAACGTAATTGTACCCGAGAGGCGCCTTCGGGATATGATATGCAGCTAGGCAAAGA
CAAGCTAAAGGAATTCTTCTAATATCGCTTTAACAAATTTTAATAATGCACAGTTGGTAC
TTTGTATATTAATTAAATGTATTATTGCTTTATATGCATAAGACGTTAGCCAGCTTCGGT
AGGTAACCTGAGAATCGATAGCTCAACGCAAGACAAGGATCATTTTGAACGTGATAACAA
TGGCGCATCAGCCGCCATCTTGTGAAAATCAATTTTTCATTTATTTTGGTATGATTAAAC
AATAAATTTCTGGAGGTCATATACGAAGCGTTGTTAACAAATAAATTTATAGAGATAAAT
TAGTAACAGAAATATGTATTAAATTAAATAAATCCGGTTGTATATCAAGATGATAAATTT
AAATATGACGCTCATGATAATAATAAATTTCAACGTCGTCAGGTGAGCAAAAAGACTACC
ATATTTCCAAATTTAAAATGATCTTAATCTGAAAAGACAAAAAAAATCTTTATAATTTAT
TAGTGGCAAAATGAGTGAAAGTATTTTAAGCGTCAACATGGGTTACATATAAACTAATTC
TCTGATATATATATTTTTTTTTGTTATTGGCAACACTGATGCGTCGGTAACGTCTCCAGA
ACCGACTTCGATCACATTCATAAAGATCCTTGTAGCACTATAAAGCTTTTTACGGTCGCG
TTACCTAAAGCCTAATCTCGGCTGGCCAGTGAGGCACATGTTGATTAATTCTACGAATAG
TTACGTGGATAGTTCCACGCGCTTCAGGAAATTATTATTATCACATCCTTATTGCGGTGT
AGTAAGACAGGTGTTCATAAAATATATATGTATGTCTGTACAATGCCAAAACTAATTTTC
TTAACCGAGCTAAATTCGATTCTTCGTCAGATACAAACATATTATGTACAATATTTTATT
ATATAAATATGAAAACAAGCAAAAACGTAATTCCGTACGTTTAAGCTTATATGAAAGGCA
ATACGTTTGTATTCTAATGTTTATTTATTTATTGTAGATTATGAAGAAAAAACATCTAAA
CTGCCACAAAATACTCGTACTATAGATATGTGTGCAACATACAATTAAATTAAATCTAAC
ACCAATCTTATTTACTCAAATGATTTTTTATTTCAGTCTTTGGTAAAAAAAATGTTGCAT
AATTCATAGCAAATGTATTGCTGTTGCAAGTGATTGTTCGTCGTACTGTTAATTATTGGT
AAATTACAAGAGTATTAATTTTCTGGCGACACATAGCATATGAAGTAAAATAACAATGGA
GAGAAAACACATAACACTAAAGGACTAGCAGAATTGTCCTGTAAGGACTTTGTATTTAAA
ATATTAACATTTTATTTTTGAAATTGATTTCACTTTTTGATTACATCATTGATAAAAGTA
GCTCATAATTCATTTCATAGTTTATTGCACGTAAATTTTACAAAATCACAGAACATGTTT
CGTATAACAGAGATCTCTTAAACAACATAACAGCAAGCCATCAAATAATAAATAACATTC
CATTTTTATATCCGATCTTCGCGAACTGTACATAAATATACAAAAAGTTTGTTTATCACT
TTGCAGACGTGGTCCAGTTTTGTTTCTTTTTTTTTTTCATATAATTATAAAAATGCTTCA
AAATTTTCAAAGCATATATTCAATACATATAAGAGAAGTATATTTAATGGACGTATATGT
AATACATGCGTTTTTAATTTTAATTCGACCTTCATTTGTTATGTGTCCGCCAAGTAGCCT
ATACAAATACATAATTGAACTTGGCAAACCGTAATATGCTACACAATAAATAGATAGTTG
GAATTTTGAACAACGTGTCTATGCGAAAAAGAACCTCTTATAAAAGAAAATTAAAAAAAA
AATAGCGAATAAAAAACGATATCAATAAACTTGATATGTTGAACTCCTTATTGATCATTA
AGCGACATAGGTGATACGCGAGCCGATCTATCGAAAGGGCCAAAGTAACGAATTATTTTT
CTTTTCCTTCGTCACCTACTTTTGACACAATTAACAAAACACAATCTAAATGCTGCTAAT
GAAAAGAGGATCAGTCAGTCTCTCACGAATACAATGAAACAATTTAAATCGAAAATCAAA
CCGATAGCTGTTTTTTTTAACTACGTACATAGCTGTAAAATGTTCAGGTCTTGTTGCGGG
TTGGTCGACCAAGACGTCTCACTCGGCCAACAATTCTGCGATGGGACGACGCGGACGGAA
GCCTCTCGATCCGTCGGGGCCGCGTGGAGTGCGCACAGCAATCACTCGAGGCCCTGCCGA
CTCCTCCAACGAAGCCGTCCGGAGCCGAGAGAGAAGCCGCTCTGGACGTTCACTTCTCAC
TTTACCCTTGCTCGCTATTTTAACGACATTGCAAGCAGAAGACTTCCCATTACGAGGATT
AGTAAGCATCACGAACTCAACAGTATCCCCCGACTGCAACTCGGAGGGATTACCTCGAAC
CTCAGACATGTGGAAGAACAAACGACGAGTATCTTCGCCGTCGACAGACAAAAAGCCAAA
AACACCTTTTATGGCGTCAACAATGGCACGTCGCTTCTTTCTAATTGGCACTATGTTACT
GGCCCGTCCCTCTATGTCAGCTTGAAAAGTTACTGGATCACCAACCTGCAGAATCTCACG
CTTGCATGATAATCCCATAATGCCAAACTCATAGCTTGTCCCACCTTCCACTTGAATCAA
ACCGGAATATTGGGCTTGATCAGGGTTCAGAGCCCGTAAGGTTCTCGTCACAGTTCCATT
TAGAGTTGGTTCTAGCGGCTTCGCAATAGGTATAGTACCTCGAGCCAAAACACGGACGTA
TTCAGCGCTTGCACAGCCCCCGCCAGAGCCGTTCAGGCGACCCAAACTATACTCGACTTC
GATGCCCAATTCCAAATTTTCCGGGCTACCTTCCAAATTACTGAAGTGGAAAAACACTTC
TTTGGTGTGATCTGATGTTTCAATAAAACCAAATCCATCTTTCAGAGCAGCTATGAAACC
TTGCATGATGGGACGGCTGCCGTTTCCATTACTCGAGTTGCCGTTTGTAAGACTGTGTTG
GACTTGTACTGACATCGCTACAAGCTCCTTTGTGCGTTTAACCTGGTATAAGTCGAAGGT
GACCTTGTCTCCAACACGGGGTAGCATTTTTGATTCGCATTTTTTGGCCATAAAAGGCAG
AGATTTCTTAGTCTGATTAATCTGACAAGAGATTAGTCCATTTGTATCCGGTGGAGGCTG
TCGGGTCGGACTGCCGGTGTTGTTGTACACTTGAGCTTCCTTGGTCACAACACCTCTGAC
GCCGCGCTCGATCAGAGTCTCGAACTGAACCGTGCCCGGCGAGAGATGCTTGATGCGAAT
AGCTGATTGCCGCGTGTTCATGTTCGAGAATGTCGATAAATGGTCAACGGTAAACTCCAC
CTCATCTCCAACGGTGAGATCTTGTCCTAAGCGAAGAACCTCGGCGAAATGAAAGAACAT
AGTCTGTTCTCTTTCCACGCAACGGATGAATCCGAACCCTTCCCGCAGAGAGCACACGAG
GCCTTGCTCCCGCCGTTCGCCAGATACATAAAAAGATTCATCGAGGAGAGAAATATTAGT
GGCGCGCTTGAGCTGATCACGACGATCGGTTGCAACTTGAAACTGCACCCAATCTCCGTG
TCGGAGCGTAAACTCACCACACTGGTCTTTATCTCCAAAGGGGACCTCAACTTCAGAATG
ATCTGCAGCACGGTATCGGATGCGCCCAGGGAGAGGATCGTTCTGTGTTGCACGCACCAA
GTTACCGCGTTCCAAAGGCTTCAACACCTGACCACGCATTATTTCAGGACTTACATCTTC
AAACACAACTGAACCACTTGGTAACTTAGTAATGTTACATGCCACTTCTTTGCCATTTCT
AGTTTGTATAATAAACTCGACATCATCACCGAGAGTCAATTCTTCTTTACATTTAGTTTC
AGAAAAATGAAAGAATATCTCTTTTACAACATCGGCACGTTCAATAAAACCAAAATTTTC
TTTCATGGAGCAGACAACTCCATGATATTTAACTGGATGTACGGGGTTCTCAAAACGTAT
ATGACAAGCACCTAATGTTCCTCTTTGATTAGTTGCAATTTGAAAGCTGACAGCATCTCC
AGTGCGTAAAGTGACATTCCCTTCAACATCATCTTTTGTATAGGGCAAGAAGAAACATTC
TCCACGAGTTTCATAGGATATTCTACCTGTATTATCACCAGATCCTTCACCTTTTACTTC
TGTTGTTACAGTGCCTGTGACTCTAGCTTCGCTTAATACCACTTCCGGTGCAATTTTAGT
GACTGTTGATGCAATTGGTTTGCCTGTTCGACGATCATAAGTCATTTCAAATTCCACAGG
GTCACCTATTTTAAGATGTTCAGTATTACCACTGAACTGACTGAAGTGGAAAAAAAGACG
GGCTTGCCTCTCACAGCATTGTATGAAACCATAAGAATGGAGAAGTTTTTCAATAATGCC
GGTCTCTCTAATAGGTGGGTGATTGACTGAGTCATATTGGGATGAACTGTTATTGGTTGA
AGAAGATGAATATGCTGAGTCACCCATTGGACATCCATCAGCATTGTATCCACCTGAGAA
TCGGTTTCCACCACTTGATTTGGAACCACCATTATAATTATCCCGAGGAGAACTTGGGTA
CTCACTGCTGTAGGTACCATTACGATACGAAGATTTGTGCTGCATGTTGGAGTGCTGGAG
ATCTAAAATATCTTGCAGGGGAGATGAGTGTGAATCTGGCGGTTGGAACATTTTCCACTG
AGGATTACTAGACATTATATTTTTCTTAGGTTTTTTGTATAAGAGTCAAAAATCTGTTTT
ATTACCAATATATCACAGTTAATTTTATGGTGTCACAATTTAATCTACAGCGATTACAAA
GCTTTAATCAAATCATATTTATAAAGTCTGCGTTCACGCGAACATAATGTACCAATGCGA
CTGTGACCATTTAATACACACCAAAACCACTATTGTTGCAAAATAAAATTATGTACTTTA
AATTGTGTTAAGCTAAATCCTCAGATGTCTTCAATGCTTGCTGAATCGGAGCTCCGTGAT
GCATTGGCTCGGTTGCAGACAATAATAAAATCGTGTTGCTATCTGCACGTTTGTAAGTCG
ATATTCACAAGCACGACACAGCATAGCACTGACGACATACCGCCATATTGAATGTCAA
(6838 bp)

- SilkBase 1999-2023 -