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Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoMG_comp40206_c1_seq1
Scaffold_idBomo_Chr15
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_tRNA_(adenine(58)-N(1))-methyltransferase_non-catalytic_subunit_TRM6_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005634 C nucleus
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0030488 P tRNA methylation
GO:0031515 C tRNA (m1A) methyltransferase complex
GO:0044822 F RNA binding
Transcript
Level
FPKM:3.61 TPM:2.85
ORF EntryO_BomoMG16758_5prime_partial:A_BomoMG_comp40206_c1_seq1
Sequence
(Nucleotide)
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CCTGGCTTTTTTGTTACTTTTACTTATCATTTTGAAAGTAGAAAAGTATCGACACCCCTC
AATGCCATTTAAATTA
(2836 bp)

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