SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp39795_c0_seq3
Scaffold_idBomo_Chr18
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_nuclear_RNA_export_factor_1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005515 F protein binding
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0005635 C nuclear envelope
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006378 P mRNA polyadenylation
GO:0006406 P mRNA export from nucleus
GO:0006810 P transport
GO:0007616 P long-term memory
GO:0016973 P poly(A)+ mRNA export from nucleus
GO:0030534 P adult behavior
GO:0031965 C nuclear membrane
GO:0044822 F RNA binding
GO:0047485 F protein N-terminus binding
GO:0051028 P mRNA transport
GO:0051168 P nuclear export
Transcript
Level		FPKM:3.86 TPM:3.05
ORF EntryO_BomoMG14735_complete:A_BomoMG_comp39795_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
TTTTGTTTCACATTGAAAAAGAACAGGTTTAAGATTCACAAGAGAGACGCTATTTAGTTT
TTGGTGATTAATTTTGGAAATATTTGGATTGCTAATAACGTCCAAATATATAATTTAACT
AACCATACTTAAAATTTATTGAGTGTAGGGTAATTTTACACCATCAAAGTTGTTTAACTC
TTTTGTAATTTGCGTTGTTAATTAAAAAAAGCTATTATTCAATTATCATTGGCTTTATCT
CAGTTAACTATTCTACACGCATGTGAGAAAATAAGGAAACCTTAAAGAACTACTTTCACG
GTATTTGTATACTGGTGATTAAAGCTTCTTCGACACGATGCCAAAACGTGGCGGTGGAAG
GAATAGAAATTGGAAGGCTGATACTGACCATTTTGAACACGATGACCGTGTCAATAGTGT
GCCGAGACATGTCAGTTTTAAACCTGGAGCTAAAGGAAAAAATAAATTTCGAACTTGGAA
AAATCCTTTAGCCCTCCTTGATGATGATATTGACATGGGTAGTTCTGCTCTTCAAGGACC
GGTCCGGAAAAGTTCTTTCAGGGGACGTGGGAGAATGTACTCTCCAGCTCCGCAAGGAAG
CCACGGACACACTAAAAAGAAATTTATTCCTGGTGTACTGCCTTGGTACCAAATAATCAT
TCCATATGGAGCAAAACATGAAAAAGATGTTATCCTCCGAGCCTTGTTGGGTTTTCTTTC
ACCCGACATATTCATTCCACATTACTATAAAGTCAATGGAAATGCTGCAGTATTCTATGT
TGATGATGTCAAAACAGCTGAAAAACTTTATAATGCTGATAGAAAGATCACTATGTCAGA
TGGTTTTAAGTTAATTGTTATTGTGAGGAATGCTGTTCCAAACATGGCCATTGACGCTGC
CATGAAAGAGAAGATGAAATTGACAATGGCGAAGAGGTATAATGCTACAACTAAGGCATT
AGATTTAACAAAATTCCATGCTGATCCAGATCTAGAAGATATATTTTGTGCACTGTTCCG
TCCAATGATAATGTTGGCTGCTATAGATATAATAGCAGAGAATATTCCAGACATAGAAGC
TTTGAACCTAAATGATAATAAGCTTCATGGTTTGCAGCATCTCAAGGTTTTGTCTTCAAA
GCTCAAGAATTTGAAAATATTGTATATGGGCGATAATAGGATTCCATTCCTTGGATCACT
GGACCCAATCAGATCATTACCGCTAGTTGAGCTATACCTCAAAGGAAACCCACTGGTGAA
CAGGTTTCATGATCACGAAATCTACATAAGTGATGTCCGGAAGAAGTTTCCCAAGCTGAC
AAGATTGGATGGCGCGGATCTTCCACCGGCTATTGGATTCGACGTAGCTGAAGATATGGG
ACTTCCCCCTCGGCAACAATCGTTCCTGGTAGACCCGGCGGGTCAGGATCTTGTCAGGGA
GTTTCTCACTCAATACTATGCGATATACGACTCGGAATCTCGGCAACCACTTCTAGAGGC
GTACCATGAAAATGCTACAATGTCGATGGCTGCAAATTATTTAACTAATGACAGCAGGAA
TTCTACGACAACTAGGTTAAACTCTTACATATCGAACAGCCGTAATTTAACCCGAATAAC
AGAAAGGGAGTCGAGAAGGCGTTACCTACGTACCGGAAAGCTGCAAGTAGTCTCCTTTCT
ATCAGATCTGCCAAAAACAACACACGATTTAATGGGTTTTGCTGTCGACTTACTAGTCTT
TACTCCGGCCATGATCGTCCTTACAATGAACGGTGTGTTCAAAGAAACGAACACTCCCAA
TAACCCGATGCGTTCGTTTCATCGGACGTTCGTGATAGTTTCAAATGCGAATGGCGGCTT
CTCAATCATCAACGATATGTTATATATCACGAATACTACTAAAGAACAGGAGGATAAGGC
CTTTTCAACGGGTACTGTAGAACCGATTCCACCTACTCCAGCGCCCACGCCTACTCCTAC
TCCCACGCTCGCAGCTGGGACGCCAGATGATTCTCAGAAGATGCAGCTACTCAACATGCT
TGGTCAACAAACTGGAATGAATGAGCATTGGAGTATCAATTGTCTTCAAGAAACTGGCTG
GGATTTGCAAAGGGCTATGTTCATCTTTAATCAACTACACTCCGAAGGCAAGATACCGCC
TGAAGCCTTTGTAAAGTGAATGAATATGAAAAACATTTGGAGCTTAAATTAGAACTTTGT
AAATAGTGAAAAGAGTGAAATAGTGAGATATTTTATAGAATTATCAGAAGATTATATGGA
ATTGAAAATGTTTTTGTTGGTGTTGGAATAAAAAATCTACACAACAAAGTGAATGGTCAT
AAAATGAGGAATGTATGTCTGAGTCGGCAATGGATATGCAGTTTATGTGAAGAGAATTAC
TTTAAGGAAGTACATGTTTGTGTACAAACTTTTTAGAAGAATAAGAAAATAATGGTTTAC
AGAAGAAAGTCAAGAATGCTTTTAAAAGATGGAAACAATACAAAACCGAAGAGTTATCTA
TTACCAAAATAAGTTTTAAATAAGTTTTTTTCTGTAATAGTTGAAATTTATGCTGAAACA
AATTACTGTAGAAATTATAGTACCAAATTATTTATCATCTGCAAAATGTTTGCCCCTCCA
TGGCATCCAATCTAAAATTTATGTTTTATGGTGGTTTGGATTAGACAAGAATTACAACAA
TTTCTGAGTAGATATTGGTGTCTACGATTCATTAATTAGGTTTTTTTATTTTTTATTTAT
CACAAAAGTATATACATATCATAGAAGTATATATACTTCTGTCAAATACAAAAATTAAAA
ACGAATGAACATGATCTCGATATTAGAACCATAAAATCGAAAATATCGCTTCACAAATAG
TCTTACGCGAAGCAGGGTTGAAAGAGAACTGTTGTTTTATTTACAATCGAATTCGATTTT
ATGGATCCGATTTCGTGATTACATTTTTATATTGTAAAGAGAATTTACGCGATCTTACTT
TTTTGAATACACCATTGAAATATTTTTACATACATTGCTCCTATTGTACCACTATAAATG
CATTATATGTAAAATCGTGTTAACTCTCATCAGTTACCTTATGTTCCATCTACATTGGGA
CAACTGTGTTTTCTTGCTGTAATTAAATACTTCGTATTACCTGTGCGTTTACCGTCTGAA
TTTATGCAGAATTGTATTCAAGCAAACACTGCTAAGTGGCGTGTGCAATAGTTGACTTGT
TAAATCTGAAAGCATAGTCCTCCATTGCGCAGTATTCTTTGAGCGCACACGTTATTGTTA
TTACCGTGCCTTGTTCTCTCTTGCCAAGTATAACTGCCCAAGTAATAAGAGATCAGTGAG
TTTGTATGATGCTTTCACGAATCGTAGCCATGAAAAAAGCCTTAAGGTTCATTAACGTCA
CGCTCGTAAACACATACTGTATTTGAATAAAATGAAATTGTGAAATGAACCCTAAGTGTT
TACTAAAGAAATTAAATTTGCTCTCTTCGTATATGGGCTTAAATAAAAGAGGCAATCTAA
TGCAATTGTATGTTATAATACTCTCATAAAGTGCAAAATTAATATACTAATCAAATTGGA
GTTTGAACAAAATAAGACTTGTCTAAATGCCTAATATTGAACATGTCTAAATAAAACATG
TGTAAGTTTAAAACACTAAACATTTTGTAGTATTCTGTATATTAATGTCATTCTAAAATA
CATTTGTATTCAATGAATATTAAAATAAAATTAAAAGAATATGTTGTTCTAAGAATGTTA
CTAAAGACGAAGTTTGTATAAGTTTTCAATTAAAATGCTAAAGTTTGGATTGAAAAAGAA
CATAGTGTGCCACCGATTGGCTGTTTGTAAGTTAATTCTGATATCTTTGATAGCATGAGA
GACGGAACTGATGTACCATTTTTACCAGCTCTTAACTTGAGCTAAAAAAACATCTAATCT
TATGGCGTTGACTTTAATTTGTAATAAATACATTTAATATCACCATGATACTTGTTGCTT
ATACTAATTAGATATTTTTAAGTTGTTAGTGTTAGCTTTGGTTCCGATGTACATATTACG
TAAATAGTTGTTCATCAGTGTATAAATTGTTGTGAATTTTAAATTTAATTCATTAAAAAT
AATGTGAAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAACAGATATTCGAAACTCGAATCTTGTATATACA
TTTAAATTTAGATTTGGGGGGCTACCAAATTATAATGGCGCTTCGTGGCGGTTAACGATT
TTTTTGCACAAACCGGCAGGCTGTCGCGTCGATTACATTGCTTGTTTTTCTTGCAAAGCC
AGCAAATAGTCCAGAGTGCGTGAAGCAATGGACACGGTTCAATGCGATTACGACGGAACC
CCTTAATAAATTATTTTGTGGGCTAGTCGTGTGGTCGAATGAATGTTATGTTTAGATCGA
AGACGTTTGACGCTTGGTCGTGTTTTGTTTGCGAACGCGCTGCCTTCTCGTGCGCTGTGG
GGGGAAAGCATAGGGCTACGATATAAGAATACGTTAAGAAATGCAGGGATTTATACGAAT
AAATCTATTAAAATTAAAAAAAAA
(4584 bp)

- SilkBase 1999-2023 -