SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp39726_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr8
NCBI non-redundant
(nr)		UPF0453_protein_C12orf44-like_protein_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0000045 P autophagosome assembly
GO:0000407 C phagophore assembly site
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006914 P autophagy
Transcript
Level		FPKM:3.35 TPM:2.65
ORF EntryO_BomoMG14443_complete:A_BomoMG_comp39726_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GGAAAAGACAACTAACATTGGGCCACAATAAAATGAAATTTACACTTTAAACTTAATCCA
GTCCTCTAATTCAATTTGTTTTAATGGGAAATTCGTATAATAAGAATAGTCAGTACAAAA
ACCAAAAGATTTCCACATATGCAGATCGTGAAGGACAGGTTTTAACTAGTCAGATGGAAT
GATTCAACTCTAAAAAATCCTCTTGAGGCAAGCAAAACTGCTTGGCCGGTTGCTCACAAA
GAGTCCATATTTCTACCTGAATTCCCCATCAAAACTGATTTACTTCAAAAGGACTTTCAA
ATACAACACACAATAGCCAAGGGTGCCTTTGGAGATGTGTACAAAGTGAAGAAAGTCAGT
GAAAACAAAGAATATGCCCTGAAAGTCCTTAGTAAAGCTAAGATCGTAAATGAGAATGCA
GTTCGTCAAGTGAAAGAAGAAGCTAAAATACAGACTGCCTGCGGTCACCATTCATACATA
GTTGGTGCAGTATCTCGTTGGCAAACTAAGAAGAGAATATACATTGTTTCAGAATACATT
CCTGGAGGTGAATTGCTGGGCTTGATAGAAAAGTATGGAAAGCTACCAGAGGAAATCGTG
AAGATTTTCGTCGCCGAAATAGCTATTGCAATAGATTTTCTCCACAACGCCGGTGTGATA
TACCGCGATTTGAAGCCAGAAAACATTTTGTTGGATGCTGAATGTCACATTCAACTCATT
GACTTTGGCCTCTCGAAGTGGCTGTCCATAGGATCGCGTACGACCACGCTCTGTGGTACA
CTCAACTATATGGTGTGGAACTTGATACGTTCAAACTATAAAATGGCAAAGTGCATCGGT
CGCTCCGTTTGCGTTTTCTCTATGGGAGTGTCGGGTGGGCAGTGACAGGACAAACCTTTA
GTGATTATGTCGATAGTGATAACAAGTGAACCGGGGCCGGGACACTGACGGCGGGAACAT
GAACGCTCGGACCATCGCGTTCGAACTGTCGATGGAGGGGAGGCAGGTGGACGAGGTCGT
CGCCAGCATCTTCCACACGGTGCTGTTCCACCGCTCCAGCGGCAAGTTCACTTACAACAG
CGAGGAGAGCTACTCGATCCGGACTGTCAGTTATATCGATGTGGACTGCGATTTTATCGA
CTTCACGTACGTGTGTTGCGAGTCTGAGTTGCTCGGGCGGAACGTGAAGCGCGAGATCGC
GGACTTCTCCGAGCTGCTGCGGACTGTGGACGGCACGTCGGCGCCCCCGCGCGGCTCCAT
CAGCCTCGAGTTCTTCCAGAAGCGTCGGGCGCGCTGGCCCTTCCAGCCAGAGTGCGTGCC
GTGGGAGGTCTGGACGGTGTTCTGCGAGATAGCGGAAGCACGCAACGAGCACGACATGCA
CGCCAAGCACGAGAACGTCGTCGAGATGCTGCAGGACAAGATCATGTACATCACCGAGAT
CATCAATCGTCACCAGTACGTACCCAAGATGCCGAGCCGGTCGGACGCGGATCTTATATT
CGATACGTCGTACCCGGACATCCAGCCGTATCTATTCAAGATACATTACAATTTGTCGGG
AGCTCCGCAGACCACCGTCGGTAATACGGTCCGTAAGATATTGCGGGAAACTCTGTCGTT
GTGATTTCAAAACTATAACCCATCTCTAATTTAAACAATGATGATATGATGATGTTTTAA
CACCAATAGCATACTTTGGTACACTTTAACAATTAAAGATGTTACGTACTTTTTAAAAAT
ATTCATTCACTGTTCAATGCTGAATTCTATTAATCTGAAACTTAATTTGAAACACCGAAT
TTAAAAAGGTATGTAAATTGCTACAAAAATTAGAGATACTTTTTTGTACGCTAGCTTTAT
TGTACTTAGAGCGCTAATTATATTTCTTAATTATTTTTTTTGTCAATTTTGATATTATCC
GCTGACTGTTATTTTCTATTGTATTTGCGTTTTATTATTTGGACGCGCGAATGACATAAA
TTTAAATATGATTAATAATTTTTTTATTCTGTGTTTTGTTTAGTGTTTAATTATATTTTA
ATATCAGAGTAAGTCCTCTGATGGCTGGTTAATGAGTCCATTCATTGTAACGAGTTGAGA
CTACGGTCTTATTTAGTTTTATGTCTTTATTTTATTAGGAACTAGACTAGCTAGAGTAAT
TTCGATTGTCAATGTTCTACAATGCAATTTGATTTTTAATATGTTTGTATTAATGTCGGT
AGTAATTAGAGTGGATTTTATTTTTGTCAATGAGGAATTACGTTAGCAGTACATATCGCA
AGGGAAGCATGAAGTCGCATCTAGTTTTCGGAAAGAATGATTTAATCTGAATCACGTAAT
ATTTTTTTTCACTTTTCCTTGGGGTCTTGAACATACGTAAATATATAATAAAGCACCATT
TTTTCGGTTGCAAGTCATCCAATTTATTTATTTTTGCTTTTTGTATTAACGATTTTTAGT
AGTCGCTAAACCTTTTTATTATTGGAAATAGTTTTAACAAAAGAAAAATGTAGTACATAA
AGGGATTCAAATTGTGAACAACAAAAGAGAAAATGCAGTACATAAAGGGAATCTAAATGT
TGAGTTGTCTGTGATTATAGTTGAATTTCAATCACTAGCCTTAATATAGGTTAGTTGAAA
ATGATTGCTGTAACAACTGATGCTCTGATGAGCAGATTACAAGTTAAATTGTTCAAATTA
AAAATTTCAAAGAAATCATGGCCATCTGGTATCTAATTTTGACATATAATGGAATATAAT
GGAAAAATTGCAACAGGTTCACAGTTTAGTTTCTGCACACGGTTGCTTGAGATATCTGTG
TTTTTAGTTTGTTCACAAAGCAATTTTTTCTTGATATTTAACTCCTATTCACAATGTTCA
TGTTGAGAGGACGAGAGAAATATATTTTTACGATGCAGCTCTTTGAAGTGTGTTTTTTTA
GTAGCGTTTCCAGTTTCTTTGTGTTTATATTAAGTGACATATGAACGACAATGATGCATG
TATGAACAAAAGGAATAATAGATTTTTTAAATGAAGATCAACCATGATTAGTTTTACTTT
CAAACAATACGGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGTCGGAAAACATTATCAGGTTT
CTATTTTCACACTATTATATATAATTTTATTCTAAATTATTTTAATACAGGGAACGTAAA
ATCACTGAGATATGAACAAGGTCGCAATTCATAACGTTTGTTTACTAAATAGTGACGTCA
CTAAATGGTGAACAAATCTAGAAAGTTTTCAATTTAAGCAATATTGAACGGAAACTTGTT
TGTTTAAGATATAAGTTTACGTTAGTTACAAATTCATTATAAAATCA
(3347 bp)

- SilkBase 1999-2023 -