SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoMG_comp39660_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr3
NCBI non-redundant
(nr)
Sentrin-specific_protease_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0006508 P proteolysis
GO:0008233 F peptidase activity
GO:0008234 F cysteine-type peptidase activity
GO:0016787 F hydrolase activity
Transcript
Level
FPKM:2.36 TPM:1.87
ORF EntryO_BomoMG14168_5prime_partial:A_BomoMG_comp39660_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
ATTGAAATTGCTAGGACATACCTAAATAGTCCCTAGGCGCATTGACTTGTAGATGTCGAA
ATAATTGATAAACATTCACTTAAAGTCATTGTAATGGGCTTACACATTTTTTAAGTAGTG
TGGTGTGAAAATAGTTACTGAACAGTTTAAAAAAATATAACTACCCAATGCCTGCTTCCG
CAAATAAAATCGACTAAAACCAAGATCAAGTAAAAGAAGTTGGGTGAAAATAATTAGAGC
GAAATTATTTCTAAATTATACAAAAATGGCAAAAGCATCTGTTGTGTTAAGTTTTCATGA
TATATTGCTTCATCGGTCTGATATAGAATTACTGGAAGGTCCGCATTGGTTGAATGATAC
GATAATATCATTTTACTTTGAATATCTCGAAAAAGTTGTGTTCAGTAAAGAGAGTGATCT
ATTATTTGTGTCTCCAGAGGTAACACAATGTATAAAAATGGTTCAAACAGAAGAAATAAA
GACTTTTCTAGAACCGCTTGATGTGAACTTGAAGAAGTTTGTGTTCTTTGCCTTGAATGA
CAATAATACTCCAGATATGGCAGGTGGCTCCCATTGGAGCCTACTTGTTTATTCAAGGCC
AGAGAACTGCTTCTTCCATTTAGATTCTTCACAAGCAACAAATCATGATGTTGCTTGGGA
ATTTGCAAGCCATATAATGTCATATCTTGCCAAAGGGGGTTCCATTAACTTTGTCGACAA
GGAATGCATTCAGCAAAGTAACGGCTATGACTGTGGAATTCATGTAATAATCAATGCAGA
GAGGCTTGCTGAATACTCTTGTATCCATAGAAATATGGGTAGTTGCAATATGTTAACCAA
AATTAATCCTAATGCTAAAAGGAAAGAAATCAAAAAAATAATACAAAACCTATCTCACTA
ATTTATTATTTCTTGTTGTTGTTGTTTACATTTAACCTATTTTAATTTTATTTAAAGTTC
TTTTTAATTTTTTGATGTTGTAAGTTTTGATTATGCTAACGTAATCAAAACTAGAAGCAC
AAATGCTTCCTATTTAAAAATCTAAATATTCTAAATCTAAATTCTTATTTAAATAAAGAA
ATTATTTTGTGAATAAATTTGAAAAGTGCTTCCAATTTGCCTAAAAATAATTTTGGCTTA
TTACTGAATCTATAACAACACTTTGGAAAACATCCATCTACACATGAGCAAACCAAATGG
TATTGCACTTAATATAAAGGTGCAAAATATTAAATTACACAGCATAGTCTCTGAAAGGGT
TTTAGAGTAAATGACATCTTGCATAGAGCTGGTGAAATTGCTCAGTAAACTGACAGTCAA
GAATTTTTGTAACTAGTACAAATATATGCAAACTTATCTTGAACATATAGTTAGTGAAAT
TCAGGTATCTGTCAAATATCTTGTGTTTTATGATAGCTACCGATACAAAAGGGTAACCCC
ATTAACCAGGTTTTTTGAACTGAAAACACTTAAAAGAGATCACTAGAATAAAACACTTTT
ACATGGCTTGTATATTGTGGTATTGCTTATAATTAAAAAATGAAATAAATATGAAAAAAA
TTCTAGAAAACCTCCATAAAAACACTTCAACATTTAATCGAAATTGTCTCTTGTTAGAGG
ATGATGTCTTGAGTTTAAACATTAAATCAGGTGATGTTACCATGTGTTAAAAAAATGAAA
TAATTCATAGTCTAGAAAATCAAATCCCTAAATTTTCTATTTATACTAAAGTTAAATCTA
CATAGACATGTTAGTCTGGGAATGAATCTGGACAAAATTAAGGTTATGTTAAAAAACCAT
ATCATTCTTGGACCGATAGTAGGCGAATCCACGGCACTCGAAGCTATGTCTGAATACAGA
TATCTAGACAAATTGTTCTGCTAGGCAAGGGTCAACTTCGAGAAGCTGATAGGCGCATAC
AGTTGGACGGCTGTATATGGGATACTCCGTCATATCTTCATCTCAGCAATCCCGCAATGT
TTAAAGACAAAAGTCTTCAAAGCTTGCGTGCTACTAATAATGATAAATAGCGCTGAAACG
TGACAATGGGCCGGACATACATGTCGCAGCGTTGGGCGTCCCCGTGCCCATGCCCCCCTG
CGATGGGCCGATGACTTACAGCGATATGCTGCAAAAGATTGGATTCGAAAAGCGGAGGAC
CGTTCGTTGAAGCGGACTATGGGAGAGGCCTACATCCAGTAGTAGAGAGATACAGGTTGA
TGATCATTGTGAGACCACAAGCATCGATACTACTACCATTCTGTCTGTCTCATGCAATCG
TGGGTGTATCGCTCGAAGTGTATCATTAGGTAATCCTGTCCTCGTTTACGATCGCAGAAC
TCAGCAAAGTTTATCCCTATTACCGGGAACTACTGCATTTATCACAATGCGTATTCTTAT
TTCCACAGGCTCTTGATTGAACTCTTCTTAGTGCTGCTCGATCGCTATAATGTGTCCATC
TTCAAACAAGGTGTAACAGTAGTGACCCCCTGATATTGCTAGTATGCCAAAGTGATGATA
ACCATTTACAATCAGTTAGGTGATAGGTTCATTCGTCGTCATCCTATAGCAATAAAAAAA
ATTCCCTACCTATTTATTAATTTCCGGAAACATAACGCTAACTTAAAACTTAAGATCTTT
GTGGCTCTATCCAACCGCCGAAAGCTCTATCTAATTCTTCGGCAACTGCGAAACATAATC
TGTCATTGTTATGATTTGCAATAACTTGCATACCAATAGGTAGTCCATCTCTGCCTAAAC
CTAAAGGTATTGTTGTCGCTGGCAACCCTAAGCTATTAATTATTGCGGTGTATGAAAAGT
TGAAGGCCTTTACTAATGGTTCGTTGTGGTACGGTGCTGTCGTTGGATGTGACGGATACA
AGAAAACTCCATCGTCACCAAGGATATTCTTAAATACATTTTCTAGATCTTCACGGTGTT
TTAAATATTGTTGGTATTTTTCGTCTCCAAATTTAACACCAGTGTAATCGAATAGAGCAG
TAACTAGGCCGATGAATGTGTTACCAGAGAGTCCAACGATATTTTTAAGTATTTCTAGCA
AAATAAGACCTACGCTCTCTTTTTTCATGATTAATTCGCCAAATTTTCTCTGTGTTTTCA
TTGTAGTTAACCATATTGCTATGGATTTTCGTAACTTATCTATTTTCTTTTCTTCCGCTT
TTATATTATGCTGCTTTTCGAAATATTCTACTACTTTATGCATAACTGAAACTAT
(3235 bp)

- SilkBase 1999-2023 -